BACKGROUND: Migraine patients show choroid plexus (CP) changes, impairing the blood-CSF barrier. The CP regulates circadian rhythms, but links between CP circadian genes and migraine are unexplored.
OBJECTIVE: This study examined CP circadian gene transcriptome changes in a chronic migraine rat model versus controls to identify migraine-related pathways.
DESIGN: Chronic migraine model: Sprague Dawley rats (3 females, 3 males) received nitroglycerine (NTG) every other day for 9 days; controls (3 females, 3 males) got saline. CP from the 4th ventricle was collected 2 hours post-final injection
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Polycystic ovary syndrome (PCOS) is a pivotal cause of anovulatory infertility and the pathogenesis remains elusive. Cellular senescence and sphingolipid metabolism disorder are closely intertwined, and both have been demonstrated present within the granulosa cells of PCOS, while research on the combined impact of senescence and sphingolipids on PCOS-related anovulation is scarce.
METHODS: Here, we leveraged four datasets of PCOS and executed differential gene expression analysis, engaged in WGCNA, and harnessed machine learning algorithms-including RF, SVM-RFE, and LASSO-to deepl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alfalfa (Medicago sativa L.) has the benefits of high yield and nutritional value as a sustainable forage. However, the water de … ch as Rubisco, FBA, PDH, α-KGDH, and SDH, as well as reduced ABA and IAA content in alfalfa leaves. RNA-Seq and bioinformatics analysis suggested that endogenous NO-responsive DEGs primarily relate to carbon metabolism and hormone signal transduction. In further studies of these DEGs, we speculated that GH3, SAUR, SnRK2, and ABF genes and FBA, GAPDH, SBP, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Studies have indicated that cystic lesions play a crucial role in the repair processes of steroid-induced osteonecrosis of the femoral head and its subsequent collapse. Here, we employed single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) technology to investigate the transcriptomic landscape and repair mechanisms of cystic lesions in SIONFH.
METHODS: We applied scRNA-seq combined with computational approaches to characterize distinct cell subsets and their molecular signatures within cystic lesions from three SIONFH patients. Additionally, histological assays were conducted to observe patholo…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Various strains emerged in B. pertussis re-emergence, the pathogenic characteristics and mechanisms remain elusive. We aimed t … n and immunity of clinical strains were compared in a BALB/c mouse aerosol challenge model. In vivo RNA-seq analysis was performed in NSG mouse model to describe the transcriptome during infection, and verified by detecting biofilm formation and paraquat tolerance.
RESULTS: The partial pertactin-deficient strain BP-L2 was first reported. It showed signif …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Craniopharyngiomas (CPs), particularly Adamantinomatous Craniopharyngiomas (ACPs), often exhibit a heightened risk of postoperative recurrence and severe complications of the endocrine and hypothalamic function. The primary objective of this study is to investigate potential novel targeted therapies within the microenvironment of ACP tumors. Cancer-Associated Fibroblasts (CAFs) were identified in the craniopharyngioma microenvironment, notably in regions characterized by cholesterol clefts, wet keratin, ghost cells, and fibrous stroma in ACPs. CAFs, alongside ghost cells, basaloid-like epithel
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peroxisomal biogenesis disorders (PBDs) are a heterogeneous group of genetic diseases. Multiple peroxisomal pathways are impaired, and very … making the diagnosis of these patients challenging. In the present study we used a combined WES and RNA-seq strategy to diagnose a patient presenting with retinal dystrophy as the main clinical symptom. Results showed the patient was compound heterozygous for mutations in PEX1. VLCFA were normal, but retrospective analysis of lysosphosphatidylcholines (LP …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
1. Ammonia is a toxic gas and an air pollutant of great concern. The effects of ammonia-induced damage in ducks are rarely reported. 2. A to … .05). Haematoxylin and eosin staining of hepatocytes revealed severe fatty degeneration. Results of RNA-seq analyses revealed that eight genes were significantly up-regulated in the HA group, which were involved in catalytic activity, single-organism metabolic processes, oxidation-reduction processes, and carbohydrate metabolic processes. 4. These results …
СтатьяRandomized Controlled Trial, VeterinaryПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: We describe a patient presenting with pachygyria, epilepsy, developmental delay, short stature, failure to thrive, facial dysmorphisms, and multiple osteochondromas.
METHODS: The patient underwent extensive genetic testing and analysis in an attempt to diagnose the cause of his condition. Clinical testing included metaphase karyotyping, array comparative genomic hybridization, direct sequencing and multiplex ligation-dependent probe amplification and trio-based exome sequencing. Subsequently, research-based whole transcriptome sequencing was conducted to determine whether it might
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Precursor T-cell lymphoblastic lymphomas (T-LBL) are rare aggressive hematological malignancies that mainly develop in children. As in other cancers, the loss of cell cycle control plays a prominent role in the pathogenesis in these malignancies that is primarily attributed to loss of CDKN2A (encoding protein p16INK4A). However, the impact of the deregulation of other genes such as CDKN1C, E2F1, and TP53 remains to be clarified. Interestingly, experiments in mouse models have proven that conditional T-cell specific deletion of Cdkn1c gene may induce a differentiation block at the D
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the cellular pathways activated by elevated intraocular pressure (IOP) is crucial for the development of more effective glaucoma treatments. Microarray studies have previously been used to identify several key gene expression changes in early and extensively injured ONH, as well as in the retina. Limitations of microarrays include that they can only be used to detect transcripts that correspond to existing genomic sequencing information and their narrower dynamic range. However, RNA sequencing (RNA-seq) is a powerful tool for investigating known transcripts, as well as for explor…
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A substantial number of mutations have been identified in voltage-gated sodium channel genes that result in various forms of human epilepsy. … , Dsm1 located on chromosome 5, was fine mapped to a 9 Mb region using interval specific congenics. RNA-Seq was then utilized to identify candidate modifier genes within this narrowed region. Three genes with significant total gene expression differences between 129S6/SvEvTac and [129xC57BL/6J]F1 were identified, including the GABAA receptor subunit, Gabr …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Deepwater Horizon oil spill (BP oil spill) in the Gulf of Mexico was a unique disaster event, where a huge amount of oil spilled from the sea bed and a large volume of dispersants were applied to clean the spill. The operation lasted for almost 3 months and involved >50,000 workers. The potential health hazards to these workers may be significant as previous research suggested an association of persistent respiratory symptoms with exposure to oil and oil dispersants. To reveal the potential effects of oil and oil dispersants on the respiratory system at the molecular level, we evaluated th
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues are indispensable for clinical- pathological assessment, yet widespread nucleic acid degrada … ipt capture and total transcriptome analysis, single-nucleus imRandom-seq outperforms traditional snRNA-seq and probe-based 10X Flex, with enhanced gene detection, reduced nuclear loss, and biologically reasonable cell-type annotation. Validated in difficult samples with high enzymatic activity and fragmented RNA, this in situ microfluidics-driven workflo …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recurrent spontaneous abortion (RSA) impacts 1-5% of women of reproductive age, constituting a significant health issue. Despite … ssues in RSA vs. control samples.
MATERIALS AND METHODS: In this bioinformatics study, we analyzed RNA-seq datasets GSE113790 (decidua) and GSE121950 (villus) from the gene expression omnibus database using illumina-aligned count matrices. Rigorous batch correction was performed using surrogate variable analysis, followed by differential expression analy …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diabetic corneal epitheliopathy is a significant ocular complication of diabetes whose pathogenic mechanisms remain incompletely understood. This study aimed to elucidate the cellular and molecular mechanisms underlying diabetic corneal epitheliopathy and to identify potential therapeutic targets using single-cell RNA sequencing (scRNA-seq).
METHODS: Corneal epithelial tissues were processed into single cells and clustered based on marker gene expression. Integrated bioinformatic analyses were performed, including pseudotime trajectory, cell cycle, gene set enrichment, hdWGCNA, an…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Tumor differentiation grade was reported to be a prognostic factor in gastric cancer (GC). Here, we identify a novel tumor differentiation grade-related genes prognostic signature and provide new biomarkers using single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) in GC. Methods: ScRNA-seq profiles of GC were analyzed by 'seurat' package. Tumor differentiation grade module was identified through a weighted gene co-expression network analysis (WGCNA). Hematoxylin and eosin (H&E) were performed to classify differentiation grade. The effects of tumor differentiation grade on prognosis were explore…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long non-coding RNAs (lncRNAs) can regulate metabolism-associated genes and cooperate to activate obesity-related pathways. However, the role of lncRNAs in obesity-related diabetes is not clear. To address this, we analyzed the hepatic transcriptomes of diabetic and non-diabetic Cynomolgus monkeys (Macaca fascicularis) using next-generation sequencing (NGS). Our findings demonstrate that coding and non-coding RNAs exhibit distinct patterns of expression, with coding mRNAs notably enriched for metabolic pathways and particularly lipid transport. At the same time, the expression of genes related
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nano- and microplastics (NMPs) have become a serious global environmental threat that causes damage to mammalian organs. In this work, we investigated the potential molecular mechanism underlying the development of liver fibrosis induced by long-term exposure to three different sized polystyrene (PS)-NMPs (80 nm, 0.5 µm and 5 µm) in mice. Liver fibrosis levels were evaluated in mice after chronic exposure to PS-NMPs. Liver inflammation was mainly increased in chronic exposure to 80 nm and 0.5 µm PS-NMPs. Liver lipid deposition was significantly enhanced after PS-NMPs exposure. However, oxidati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Age-related hearing loss (ARHL) is a gradual, symmetrical sensorineural disorder. Exploring the pathogenesis of ARHL from a biological perspective is important for its treatment. In this study, we analyzed the circRNA expression profiles of 2-month-old miR-29a+/+ mice and miR-29a-/- mice by transcriptome sequencing to investigate the role of circRNAs in ARHL. We identified 12 differentially expressed circRNAs in the two groups. Our focus was on circRNAs predicted to regulate miR-29a, with novel_circ_0004013 identified as having a targeted binding relationship with miR-29a-3p. Dual luciferase a
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования