OBJECTIVE: Variants in PRKN and PINK1 are the leading cause of early-onset autosomal recessive Parkinson's disease, yet many cases remain genetically unresolved. We previously identified a 7 megabases complex structural variant in a pair of monozygotic twins using Oxford Nanopore Technologies (ONT) long-read sequencing. This study aims to determine if ONT long-read sequencing can detect a second variant in other unresolved early-onset Parkinson's disease (EOPD) cases with 1 heterozygous PRKN or PINK1 variant.
METHODS: ONT long-read sequencing was performed on EOPD patients with 1 reported PRK
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The changing of microbiome could precede the development of coeliac disease (CeD). We compared the bacterial profile of microbiota of tissues collected simultaneously from the stomach and duodenum in newly diagnosed patients with CeD. Biopsies were collected from 60 children and adolescents aged 2-18 years: (1) 40 patients with CeD; (2) 20 children as control group. The evaluation of the bacterial microbiota was carried out by sequencing the V3-V4 regions of the 16S rRNA subunit, using next-generation sequencing (NGS). The composition of bacterial microbiota was correlated with clinical and bl
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Improving the therapeutic management of HIV-positive persons is a major public health issue and includes better detection of drug resistance mutations (DRMs). The aim of this study was (i) to explore DRMs in HIV-1-positive persons presenting a blood viral load (VL) < 1000 genomes copies (gc)/mL, including the analyze of cerebrospinal fluid (CSF) and HIV-DNA from peripheral blood mononuclear cells using ultradeep sequencing (UDS) and (ii), to evaluate how these DRMs could influence the clinical practices. For each patient (n = 12), including five low-VL patients (i.e., <1000 gc/mL), HIV-1 UDS t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Li-Fraumeni syndrome (LFS) is a rare syndrome characterized by an increased lifetime risk of cancer development in multiple organ systems, typically caused by de novo or inherited germline pathogenic variants in the tumor suppressor TP53 gene. LFS is more classically associated with solid tumors; however, it is also associated with hematologic malignancies such as therapy-related acute myeloid leukemia (AML). We present the case of a female patient with a strong family and personal history of cancer who presented to our institution with therapy-related AML with next-generation sequencing showi
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Next-generation sequencing (NGS) has become widely available but molecular profiling-guided therapy (MGT) had not been well established in the real world due to lack of available therapies and expertise to match treatment. Our study was designed to test the feasibility of a nationwide platform of NGS-guided MGT recommended by a central molecular tumor board (cMTB) for metastatic solid tumors.
PATIENTS AND METHODS: Patients with advanced or metastatic solid tumors with available NGS results and without standard treatment were enrolled. The cMTB interpreted the patients' NGS reports
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aquatic decomposition, as a forensic discipline, has been largely under-investigated as a consequence of the highly complex and influential variability of the water environment. The limitation to the adaptability of scenario specific results justifies the necessity for experimental research to increase our understanding of the aquatic environment and the development of post-mortem submersion interval (PMSI) methods of estimation. This preliminary research aims to address this contextual gap by assessing the variation in the bacterial composition of aquatic biofilms as explained by water parame
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: This study aimed to analyze the clinical and genetic characteristics of 6 Chinese patients with foveal hypoplasia (FH) caused by the variants of solute carrier family 38 member 8 (SLC38A8), and to describe the genotype and phenotype of SLC38A8 variants from previous literature.
METHODS: All subjects underwent comprehensive ophthalmic examinations. Optical coherence tomography (OCT) was performed to evaluate the structural grade of FH. Pathogenic variants of SLC38A8 gene were identified using panel-based next-generation sequencing and direct Sanger sequencing techniques. Further, all
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acquired cystic disease associated renal cell carcinomas (ACD-RCC) are rare and their molecular and histopathological characteristics are still being explored. We therefore investigated the clinicopathologic and molecular characteristics of 31 tumors. The patients were predominantly male (n = 30), with tumors mainly left-sided (n = 17), unifocal (n = 19), and unilateral (n = 29) and a mean tumor size of 25 mm (range, 3-65 mm). Microscopically, several histologic patterns were present, including pure classic sieve-like (n = 4), and varied proportions of mixed classic sieve-like with papillary (
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: KIT p.D816 mutation is strongly associated with systemic mastocytosis (SM). Next-generation sequencing (NGS) is now routinely performed in almost all bone marrow sample and KIT mutations are detected from patients who are not known or suspected to have SM. Therefore, we wanted to assess if KIT mutations in this patient population are associated with unsuspected SM.
METHODS: We searched NGS result in our institution with positive result for KIT mutation from patients with known/suspected myeloid neoplasms. Patients with previously documented history of systemic mastocytosis were ex
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Endometrial serous carcinoma (ESC) and tubo-ovarian high-grade serous carcinoma (HGSC) are characterized by late-stage presentation and high mortality. Current guidelines for prevention recommend risk-reducing salpingo-oophorectomy (RRSO) in patients with hereditary mutations in cancer susceptibility genes. However, HGSC displays extensive genetic heterogeneity with alterations in 168 genes identified in TCGA study, but current germline testing panels are often limited to the handful of recurrently mutated genes, leaving families with rare hereditary gene mutations potentially at-r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The somatic BRCA1 or BRCA2 Pathogenic Variant (PV)/Likely PV (LPV) from Next Generation Sequencing (NGS) is the most important biomarker for PARP inhibitor use and maintenance-targeted therapies. A discrepancy in the detection rates of BRCA1 and BRCA2 PV/LPV was identified among the NGS platforms. The objective of this study was to compare the somatic BRCA results from two distinct platforms using the same cohort and to identify the causes of these differences. Patients with epithelial ovarian cancer who concurrently underwent tumor NGS using two different platforms between January 2022 and Ju
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Treacher Collins syndrome (TCS) is a rare congenital craniofacial disorder with variable penetrance and high genetic and phenotypic heterogeneity. It is caused by pathogenic variants in the TCOF1, POLR1D, POLR1C, and POLR1B genes, and its major characteristic features are malar and mandibular hypoplasia, downward slanting of the palpebral fissures, and conductive hearing loss. In this study, five patients (two males and three females, age range from 2 to 29 years) with TCS were tested by Next-Generation Sequencing (NGS)-based sequencing and clinically characterized. Genetic analyses detected t
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The aim of this study was to compare the detection performance of mNGS against that of conventional tests (CT) in patients suffering from infection after kidney transplantation.
METHODS: A total of 138 samples from 85 kidney transplant patients with acute or chronic infections were simultaneously analyzed using mNGS and CT from July 2021 to August 2023.
RESULTS: Compared with CT, mNGS demonstrated a higher sensitivity (95.96% vs. 27.27%) but lower specificity (48.72% vs. 84.62%) in pathogen detection. Moreover, mNGS exhibited significant advantages in detecting mixed and rare i
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Типичные клинические симптомы пситтакозной пневмонии включают лихорадку, сухой кашель и охлаждение. Внезапная сенсорная потеря слуха является относительно необычным заболеванием пневмонии, вызванной хламидией пситтачи. В этом исследовании мы сообщали о редком случае, когда пневмония хламидии была представлена как потеря слуха. КИСЛОТА: 65-летний мужчина попал в нашу больницу с внезапной потерей слуха, кашля с слюной и лихорадкой последние три дня. Вычисленная томография грудной клетки выявила воспаление левого лёгкого и слабую реакцию на антибиотики широкого спектра. Метагеномическая последова
Клинический случайСтатьяОбзорПолный текст не найденМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chemoprevention plays an important role in malaria control strategy. Perennial malaria chemoprevention (PMC) using sulfadoxine/pyrimethamine (SP) is a WHO-approved strategy to combat malaria in young children and may lead to drug pressure. Introducing SP-PMC may therefore be compromised due to the emergence of Plasmodium falciparum resistant to SP, particularly mutation at K540E of the dihydropteroate synthase (dhps) gene. Molecular surveillance of resistance markers can support assessment of antimalarial efficacy and effectiveness. High prevalence of 540E is associated with reduce
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The growing number of long COVID cases has drawn clinical attention to severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), which has been spreading worldwide since winter 2019. Its symptoms are not limited to fatigue and shortness of breath but also affect daily life. We report the use of metagenomic next-generation sequencing (mNGS) to detect coinfection with SARS-CoV-2 and influenza A virus in a patient with long COVID. The patient was admitted with fever, expectoration, fatigue, and shortness of breath. The PCR test was negative due to possible clearance of SARS-Cov-2 in the upper
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
GFPT1-related congenital myasthenic syndrome (CMS) is characterized by progressive limb girdle weakness, and less prominent involvement of facial, bulbar, or respiratory muscles. While tubular aggregates in muscle biopsy are considered highly indicative in GFPT1-associated CMS, excessive glycogen storage has not been described. Here, we report on three affected siblings with limb-girdle myasthenia due to biallelic pathogenic variants in GFPT1: the previously reported missense variant c.41G > A (p.Arg14Gln) and the novel truncating variant c.1265_1268del (p.Phe422TrpfsTer26). Patients showed pr
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RATIONALE: Norrie disease (ND) is a rare X-linked recessive disease characterized by bilateral congenital blindness and auditory impairments. According to the previous studies, Norrin cystine knot growth factor (NDP) gene have been found to be responsible for ND. Herein, we report a case of ND with a novel mutation in NDP and elucidate the clinical and molecular characteristics of this patient.
PATIENT CONCERNS: A 2-month-old Chinese male infant presented with gray-white opacification in the bilateral cornea. Vitreous opacity and retinal detachment were observed on ocular ultrasound. Furtherm
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: An inherited basis for presumed sporadic neuroendocrine tumor (NET) has been suggested by evidence of familial clustering of NET and a higher incidence of second malignancies in patients and families with NET. To further investigate a potential heritable basis for sporadic neuroendocrine tumors, we performed multigene platform germline analysis to determine the frequency of hereditary susceptibility gene variants in a cohort of patients with sporadic small intestine NET (SI-NET).
METHODS: We performed a multigene platform germline analysis with Invitae's 83-gene, next-generation sequ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alzheimer's disease with a causative genetic mutation (AD-CGM) is an uncommon form, characterized by a heterogeneous clinical phenotype and variations in the genotype of racial groups affected.
OBJECTIVE: We aimed to systemically describe the phenotype variance and mutation spectrum in the large sample size of the Peking Union Medical College Hospital (PUMCH) cohort, Beijing, China.
METHODS: Next-generation sequencing (NGS) was carried out in 1108 patients diagnosed with dementia. A total of 40 Han Chinese patients with three AD gene mutations were enrolled. A systemic review of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.