Serogroup A of Neisseria meningitidis is the organism responsible for causing epidemic diseases in developing countries by a pilus-mediated adhesion to human brain endothelial cells. Type IV pilus assembly protein (PilF) associated with bacterial adhesion, aggregation, invasion, host cell signaling, surface motility, and natural transformation can be considered as a candidate for effective anti-meningococcal drug development. Since the crystal structure of PilF was not available, in the present study, it was modeled after the Z2491 strain (CAM09255.1) using crystal structure of chain A of Vibr
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Arthropod venoms are invaluable sources of bioactive substances with biotechnological application. The limited availability of some venoms, such as those from ants, has restricted the knowledge about the composition and the potential that these biomolecules could represent. In order to provide a global insight on the transcripts expressed in the venom gland of the Brazilian ant species Tetramorium bicarinatum and to unveil the potential of its products, high-throughput approach using Illumina technology has been applied to analyze the genes expressed in active venom glands of this
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Strains of Escherichia coli cause a wide variety of intestinal and extra-intestinal diseases in both humans and animals, and are also often found in healthy individuals or the environment. Broadly, a strong phylogenetic relationship exists that distinguishes most E. coli causing intestinal disease from those that cause extra-intestinal disease, however, isolates within a recently described subclass of Extra-Intestinal Pathogenic E. coli (ExPEC), termed endometrial pathogenic E. coli, tend to be phylogenetically distant from the vast majority of characterised ExPECs, and more closel
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Celiac disease (CD) is sustained by abnormal intestinal mucosal T-cell response to gluten and it is strongly associated with HLA class II molecules encoded by DQA1*0501/DQB1*02 (DQ2) or DQA1*03/DQB1*0302 (DQ8). The in vitro stimulatory activity of gliadin increases after treatment with tissue transglutaminase (tTG) which catalyses the deamidation of specific residues of glutamine to glutamate that can serve as anchors for binding to DQ2 as well as to DQ8 molecules. We modelled the three-dimensional structure of the DQ2 dimer protein, the most frequent in celiac patients, by using a homology mo
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new approach to the molecular modelling of homologous serine proteases is adopted, by including a set of 21 buried waters known to be preserved in enzymes sharing the primary specificity of trypsin, in the homology modelling of rat submaxillary gland kallikrein. Buried waters--water molecules sequestered from bulk solvent within a protein matrix--appear to be integral conserved components of all serine proteases of known structure and should be incorporated into serine protease models built on the basis of sequence/structural homology to this family. The absence of such waters might induce e
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The snake venom protein echistatin contains the cell recognition sequence Arg-Gly-Asp and is a potent inhibitor of platelet aggregation. The three-dimensional structure of echistatin and the dynamics of the active RGD site are presented. A set of structures was determined using the Distance Geometry method and subsequently refined by Molecular Dynamics and energy minimization. Disulfide pairings are suggested, based on violations of experimental constraints. The structures satisfy 230 interresidue distance constraints, derived from nuclear Overhauser effect measurements, five hydrogen-bonding
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Organic micropollutants (OMPs) undergo direct photolysis in UV processes for water treatment. Quantum yields and photoproducts are important for understanding the photochemical behavior of OMPs and optimizing UV technologies. Here, we evaluated time-dependent excited-state molecular dynamics (TDESMD) as a computational approach for estimating wavelength-dependent quantum yields and photoproducts, using ibuprofen (IBU) as a model OMP. We performed TDESMD simulations at 254 and 222 nm. The estimated quantum yields were 0.077 and 0.20 at 254 and 222 nm, respectively, similar to the experimental v
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The role of MKP family dual-specificity phosphatases (DUSPs) in oncogenesis, together with their potential as therapeutic targets in precision oncology, is now well established. These enzymes dephosphorylate both phosphotyrosine and phosphothreonine residues on extracellular signal-regulated kinase ERK1/2, thereby attenuating mitogen-activated protein kinase (MAPK) signalling. DUSP6/MKP3 acts as a context-dependent regulator with tumour-suppressive or tumour-promoting roles across cancers. Glioblastoma (GBM), an aggressive primary brain tumour with dismal clinical outcomes, has shown limited r
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
When a chemical system of interest contains heavy elements, it is important to obtain a balanced description of relativistic effects and electron correlation. The exact two-component (X2C) Hamiltonian includes both scalar-relativistic and spin-orbit effects with a reasonable computational cost. By using the spin-orbit X2C Hamiltonian in state-averaged complete active space self-consistent field (SA-CASSCF) calculations, it is possible to obtain equivalent descriptions of the states with different spin characters. For molecular geometry optimizations within this framework, the nuclear gradients
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 31-year-old woman was referred to the Oral and Maxillofacial Surgery department with a hard swelling in the right floor of the mouth which had the clinical appearance of a salivary calculus. Plain radiography did not demonstrate a radiopacity; however, subsequent ultrasound examination supported this finding. Three months after the initial consultation, while waiting for removal of the calculus, the patient re-presented with mobility of the lower anterior teeth and progressive swelling, prompting repeat orthopantomography and an urgent computed tomography scan of the mandible. These revealed
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Predicting how missense variants alter protein function is central to resolving the genotype-to-phenotype equation, a task now addressed by numerous computational predictors. The most accurate are increasingly opaque, however, limiting both their mechanistic value and their adoption in the clinic. Here we present QAFIsplit, a redesign of the Quantitative Assessment of Functional Impact framework that models variant effect in two interpretable stages: the mutation tolerance of a position, and the deviation introduced by a specific substitution. Framed as the prediction of a molecular endophenot
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enteric‑type thymic adenocarcinoma (ETAC) is a rare subtype of thymic carcinoma. It shares highly similar histological and immunophenotypic features with intestinal adenocarcinoma, and is therefore prone to being misdiagnosed as metastatic carcinoma of gastrointestinal origin. Herein, we report a case of advanced ETAC with axillary lymph node oligometastasis. Positron emission tomography/computed tomography (PET/CT) and gastrointestinal endoscopy were performed to rule out primary gastrointestinal malignancy. The patient underwent median sternotomy with extended thymectomy, which effectively r
СтатьяКлинический случайАннотация на английскомПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell resolution spatial transcriptomics provides a great opportunity to explore the complex cellular contents in different tissues. Here we introduce SpatialZoomer, a spectral graph-based method that applies a set of low-pass filters to efficiently extract spatial molecular features from spatial transcriptomics data at multiple resolutions or scales, including the single cell scale, the niche scale with dozens of closely interacting cells and the domain scale with spatially organized cell contents. The corresponding critical scales can be automatically identified by partitioning a cross
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Combination pharmacotherapy remains a fundamental strategy in contemporary clinical practice. However, the concurrent use of multiple drugs substantially increases the risk of harmful drug-drug interaction events (DDIEs). Developing reliable computational methods for DDIE detection is therefore essential, yet existing approaches still face notable limitations in modelling interaction-relevant chemistry, relational context, and interpretability. In this study, we propose DSCrisk, a deep‑learning framework that employs graph neural networks (GNNs) to encode a dual-view representation comprising
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hydrophilic perovskite quantum dots (PQDs) have emerged as promising materials for biomedical diagnostics due to their exceptional optical tunability and high photoluminescence quantum yield. However, their instability, toxicity, and degradation in aqueous and biological environments remain critical barriers to practical applications. This review integrates predictive modeling and bioinspired stabilization strategies to provide a comprehensive understanding of the mechanisms governing PQD instability and the design of robust, biocompatible nanostructures. Multiscale computational approaches-in
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Morphogen signaling pathways orchestrate cell fate and tissue patterning during embryo development through intricate intercellular communication. While much is known about the molecular components of these pathways, the underlying regulatory logic shaping their integration remains unclear. Here, we develop a computational framework to uncover higher-order network structures, hypermotifs, that link gene regulatory circuits within and between cells via morphogen signaling. Applying this framework to single-cell RNA sequencing data from human intestinal development, we identify recurrent hypermot
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The chemical stability and performance of non-fullerene acceptors (NFAs) are critical for achieving high power conversion efficiency (PCE) and device stability. This study presents a novel computational design strategy for addressing key stability challenges. The photochemical stability is improved by removing the vinylene bridge between the core and end groups, which often causes degradation and photoisomerization. All-fused non-fullerene acceptors (AFNFAs) are designed by directly fusing high-performance end groups with core units such as Y6 (FY6) and ITIC (FITIC). Density functional theory
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
New experimental and computational methods use genetic or gene expression observations with single cell resolution to study the relationship between single-cell molecular profiles and developmental trajectories. Most tissues contain spatially contiguous regions that develop as a unit, such as follicles in the ovary, or tubules and glomeruli in the kidney. We find that existing approaches designed to use time series spatial transcriptomics (ST) data produce biologically incoherent trajectories that fail to maintain these structural units over time. We present Spatiotemporal Optimal transport wi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel TBM-based chemosensor exhibiting multi-stimuli-responsive photophysical behaviour has been designed and systematically investigated through combined experimental and computational studies. In solution, the sensor displays distinct intramolecular charge-transfer (ICT) absorption and emission, with aggregation-induced emission (AIE) observed in mixed solvents due to restriction of intramolecular motion. Pronounced acidochromic behaviour upon protonation and selective recognition of HSO4 - result in enhanced and red-shifted absorption. In the solid state, TBM exhibits bright yellow emissi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many fusion genes have been recognized as biomarkers and therapeutic targets. However, the lack of knowledge on protein structures and targeting approaches made it challenging to develop effective targeting therapeutics. To fill this, we developed a computational pipeline, FusionTarget, which annotates the genomic DNA breakage to RNA and protein sequences, predicts the 3D structures of fusion proteins, and performs comparative virtual screening, comparative molecular dynamics simulation, and quantitative analyses to identify the fusion protein-selective small molecules by selecting drugs with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования