Soil was collected in July 2013 at a site where a cow infected with anthrax had been the month before. Selective culturing yielded Bacillus anthracis strain Tangail-1. Here, we report the draft genome sequence of this Bacillus anthracis isolate that belongs to the canonical A.Br.001/002 clade.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Anthrax is a zoonotic disease that occurs naturally in wild and domestic animals but has been used by both state-sponsored programs and terrorists as a biological weapon. A Soviet industrial production facility in Sverdlovsk, USSR, proved deficient in 1979 when a plume of spores was accidentally released and resulted in one of the largest known human anthrax outbreaks. In order to understand this outbreak and others, we generated a Bacillus anthracis population genetic database based upon whole-genome analysis to identify all single-nucleotide polymorphisms (SNPs) across a referenc
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Here, we report the genome sequence of Yersinia pestis strain Cadman, an attenuated strain lacking the pgm locus. Y. pestis is the causative agent of plague and generally must be worked with under biosafety level 3 (BSL-3) conditions. However, strains lacking the pgm locus are considered safe to work with under BSL-2 conditions.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Escherichia coli and Shigella species are closely related and genetically constitute the same species. Differentiating between these two pathogens and accurately identifying the four species of Shigella are therefore challenging. The organism-specific bioinformatics whole-genome sequencing (WGS) typing pipelines at Public Health England are dependent on the initial identification of the bacterial species by use of a kmer-based approach. Of the 1,982 Escherichia coli and Shigella sp. isolates analyzed in this study, 1,957 (98.4%) had concordant results by both traditional biochemistry and serol
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent advances in genome-wide association studies have stimulated interest in the genomic prediction of disease risk, potentially enabling individual-level risk estimates for early intervention and improved diagnostic procedures. Here, we review recent findings and approaches to genomic prediction model construction and performance, then contrast the potential benefits of such models in two complex human diseases, aiding diagnosis in celiac disease and prospective risk prediction for cardiovascular disease. Early indications are that optimal application of genomic risk scores will differ subs
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptomyces ambofaciens ATCC23877 is a soil bacterium industrially exploited for the production of the macrolide spiramycin which is used in human medicine as an antibacterial and anti-toxoplasmosis chemical. Its genome consists of a 8.3 Mbp linear chromosome and a 89 kb circular plasmid. The complete genome sequence reported here will enable us to investigate Streptomyces genome evolution and to discover new secondary metabolites with potential applications notably in human medicine.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The diarrhea-causing protozoan Giardia intestinalis makes up a species complex of eight different assemblages (A-H), where assemblage A and B infect humans. Comparative whole-genome analyses of three of these assemblages have shown that there is significant divergence at the inter-assemblage level, however little is currently known regarding variation at the intra-assemblage level. We have performed whole genome sequencing of two sub-assemblage AII isolates, recently axenized from symptomatic human patients, to study the biological and genetic diversity within assemblage A isolates
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic hepatitis B is widespread and represents an important cause of morbidity and mortality due to the evolution to cirrhosis and hepatocellular carcinoma. This study was designed to improve the national laboratory surveillance of hepatitis B virus (HBV) infection, focusing on genomic analysis of isolates from Romanian patients. Sera from ten patients with HBV were collected and analyzed. Phylogenetic analysis was conducted on a DNA fragment spanning almost the entire genome. The occurrence of mutations was assessed for each open reading frame in the viral genome. Phylogenetic analysis reve
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-throughput molecular and computer technologies have become instrumental for systems biological explorations of parasites. Investigating the genomes and transcriptomes of different developmental stages of parasitic nematodes can provide insights into gene expression, regulation and function in the parasite, which is a significant step toward understanding their biology as well as host interactions and disease. This article covers aspects of a talk given at the MEEGID XII conference in Thailand in 2014. Here, we refer to recent studies of the genomes and transcriptomes of socioeconomically
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Candida auris is a multidrug resistant, emerging agent of fungemia in humans. Its actual global distribution remains obscure as the current commercial methods of clinical diagnosis misidentify it as C. haemulonii. Here we report the first draft genome of C. auris to explore the genomic basis of virulence and unique differences that could be employed for differential diagnosis.
RESULTS: More than 99.5 % of the C. auris genomic reads did not align to the current whole (or draft) genome sequences of Candida albicans, Candida lusitaniae, Candida glabrata and Saccharomyces cerevisiae;
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite the wealth of information regarding genetics of the causative parasite and experimental immunology of the cutaneous leishmaniasis, there is currently no licensed vaccine against it. In the current study, a two-level data mining strategy was employed, to screen the Leishmania major genome for promising vaccine candidates. First, we screened a set of 25 potential antigens from 8312 protein coding sequences, based on presence of signal peptides, GPI anchors, and consensus antigenicity predictions. Second, we conducted a comprehensive immunogenic analysis of the 25 antigens based on epitop
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
About 40-60% of patients with late-onset Alzheimer's disease (AD) develop psychosis, which represents a distinct phenotype of more severe cognitive and functional deficits. The estimated heritability of AD+P is ~61%, which makes it a good target for genetic mapping. We performed a genome-wide copy-number variation (CNV) study on 496 AD cases with psychosis (AD+P), 639 AD subjects with intermediate psychosis (AD intermediate P) and 156 AD subjects without psychosis (AD-P) who were recruited at the University of Pittsburgh Alzheimer's Disease Research Center using over 1 million single-nucleotid
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Cryptococcus gattii is a fungal pathogen of humans, causing pulmonary infections in otherwise healthy hosts. To characterize genomic variation among the four major lineages of C. gattii (VGI, -II, -III, and -IV), we generated, annotated, and compared 16 de novo genome assemblies, including the first for the rarely isolated lineages VGIII and VGIV. By identifying syntenic regions across assemblies, we found 15 structural rearrangements, which were almost exclusive to the VGI-III-IV lineages. Using synteny to inform orthology prediction, we identified a core set of 87% of C. gattii g
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Site-specific genome editing provides a promising approach for achieving long-term, stable therapeutic gene expression. Genome editing has been successfully applied in a variety of preclinical models, generally focused on targeting the diseased locus itself; however, limited targeting efficiency or insufficient expression from the endogenous promoter may impede the translation of these approaches, particularly if the desired editing event does not confer a selective growth advantage. Here we report a general strategy for liver-directed protein replacement therapies that addresses these issues:
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The duration of viral shedding in the patients from two outbreaks and four sporadic cases of norovirus (NoV) infections was investigated. The longest period of viral shedding into feces was for 173 days in an inpatient from one case of outbreak. The VP1 sequence from two long-term viral shedding cases in the outbreak revealed four synonymous and one non-synonymous mutations in one inpatient at 26 days from the onset of illness, and nine synonymous and two non-synonymous mutations and a deletion, 10 synonymous mutations and a deletion in other inpatient at 29 days and 54 days from the onset of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Astyanax mexicanus, a teleost fish that exists in a river-dwelling surface form and multiple cave-dwelling forms, is an excellent system for studying the genetic basis of evolution. Cavefish populations, which independently evolved from surface fish ancestors multiple times, have evolved a number of morphological and behavioral traits. Quantitative trait loci (QTL) analyses have been performed to identify the genetic basis of many of these traits. These studies, combined with recent sequencing of the genome, provide a unique opportunity to identify candidate genes for these cave-specific trait
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The polycystic ovary syndrome (PCOS), characterized by hyperandrogenism and chronic anovulation, is a common endocrine disorder in women. PCOS, which is associated with polycystic ovaries, hirsutism, obesity and insulin resistance, is a leading cause of female infertility. In this condition there is an imbalance in female sex hormones. All the sequelae symptoms of PCOS gradually lead to cancer in the course of time. It is heterogeneous disorder of unknown etiology so it is essential to find the exact cause.
MATERIALS AND METHODS: In this study both invasive and non-invasive techni
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Atopic dermatitis (AD) is a heterogeneous chronic inflammatory skin disease. Most AD during infancy resolves during childhood, but moderate-to-severe AD with allergic sensitization is more likely to persist into adulthood and more often occurs with other allergic diseases.
OBJECTIVE: We sought to find susceptibility loci by performing the first genome-wide association study (GWAS) of AD in Korean children with recalcitrant AD, which was defined as moderate-to-severe AD with allergic sensitization.
METHODS: Our study included 246 children with recalcitrant AD and 551 adult control
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in the rhodopsin gene cause retinal degeneration and clinical phenotypes including retinitis pigmentosa (RP) and congenital stationary night blindness. Effective gene therapies have been difficult to develop, however, because generating precise levels of rhodopsin expression is critical; overexpression causes toxicity, and underexpression would result in incomplete rescue. Current gene delivery strategies routinely use cDNA-based vectors for gene targeting; however, inclusion of noncoding components of genomic DNA (gDNA) such as introns may help promote more endogenous regulation of
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования