In the present study, we investigated the relationship between rheumatoid arthritis (RA) and knee osteoarthritis (OA) using bioinformatics, aiming to identify the differentially expressed genes (DEGs) of RA and explore the possible mechanism of RA. The GSE55584 and GSE153015 microarray datasets for RA and OA gene expression profiles were acquired from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. The DEGs of the two datasets were obtained by R language processing and analysis. The intersecting DEGs were obtained using the Venny 2.1 platform. Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopaedia of Genes an
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute respiratory distress syndrome (ARDS) is a common cause of death in ICU patients and its underlying mechanism remains unclear, which leads to its high mortality rate. This study aimed to identify candidate genes potentially implicating in the pathogenesis of ARDS and provide novel therapeutic targets.
METHODS: Using bioinformatics tools, we searched for differentially expressed genes (DEGs) in an ARDS microarray dataset downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Afterwards, functional enrichment analysis of GO, KEGG, GSEA and WGCNA were carried out to investi
Систематический обзорСтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Increasing evidence has indicated that abnormal methionine metabolic activity and tumour-associated macrophage infiltration are correlated with hepatocarcinogenesis. However, the relationship between methionine metabolic activity and tumour-associated macrophage infiltration is unclear in hepatocellular carcinoma, and it contributes to the occurrence and clinical outcome of hepatocellular carcinoma (HCC). Thus, we systematically analysed the expression patterns of methionine metabolism and macrophage infiltration in hepatocellular carcinoma using bioinformatics and machine learning
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Psoriasis is a prevalent condition characterized by chronic inflammation, immune dysregulation, and genetic alterations, significantly impacting the well-being of affected individuals. Recently, a novel aspect of programmed cell death, ferroptosis, linked to iron metabolism, has come to light. This research endeavors to unveil novel diagnostic genes associated with ferroptosis in psoriasis, employing bioinformatic methods and experimental validation. Diverse analytical strategies, including "limma," Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA), Least Absolute Shrinkage and Selection Op
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: Recurrent implantation failure (RIF) is now disturbing numerous infertile couples accepting assisted reproductive technology (ART). And the endometrial factors are crucial causes of recurrent implantation failure. However, its mechanism is still unclear. Thus, the aim of this study is to identify altered biologic processes in endometrium that may contribute to recurrent implantation failure. Methods: We recruited two microarray datasets (GSE103465, GSE111974) from Gene Expression Omnibus database (GEO), which contain endometrium from RIF and normal women during implantation period.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hashimoto's thyroiditis (HT) is a common autoimmune disease, and its prevalence is rapidly increasing. Both genetic and environmental risk factors contribute to the development of HT. Recently, viral infection has been suggested to act as a trigger of HT by eliciting the host immune response and subsequent autoreactivity. We analyzed the features of HT through bioinformatics analysis so as to identify the markers of HT development. We accessed public microarray data of HT patients from the Gene Expression Omnibus (GEO) and obtained differentially expressed genes (DEGs) under HT. Gene Ontology
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ewing's sarcoma (ES) is one of the most prevalent malignant bone tumors worldwide. However, the molecular mechanisms of the genes and signaling pathways of ES are still not well sufficiently comprehended. To identify candidate genes involved in the development and progression of ES, the study screened for key genes and biological pathways related to ES using bioinformatics methods.
METHODS: The GSE45544 and GSE17618 microarray datasets were downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Differentially expressed genes (DEGs) were identified, and functional enrichment a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Postmenopausal osteoporosis is a systemic metabolic disorder typified by an imbalance in bone turnover, where bone resorption supersedes bone formation. This imbalance primarily arises from a decline in bone mass induced by estrogen deficiency, and an elevated risk of fractures resulting from degradation of bone microstructure. Despite recognizing these changes, the precise causative factors and potential molecular pathways remain elusive. In this study, we aimed to identify differentially expressed genes (DEGs), associated pathways, and the role of immune infiltration in osteoporo
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Immune targeted therapy has become an attractive therapeutic approach for patients with dilated cardiomyopathy (DCM) recently. Genetic predisposition and gender play a critical role in immune-related responses of DCM. This study aimed to perform a bioinformatics analysis of molecular differences between male and female samples and identify immune-related ceRNA network in DCM. Methods: The gene expression microarray and clinical features dataset of GSE19303 was downloaded from the GEO. The raw data were preprocessed, followed by identification of differentially expressed genes (DEGs
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Linked deoxyribonucleic acid (DNA) hypermethylation investigations of promoter methylation levels of candidate genes may help to increase the progressiveness and mortality rates of juvenile myelomonocytic leukemia (JMML), which is a unique myelodysplastic/myeloproliferative neoplasm caused by excessive monocyte and granulocyte proliferation in infancy/early childhood. However, the roles of hypermethylation in this malignant disease are uncertain.
METHODS: Bone marrow samples from a JMML patient and peripheral blood samples from a healthy monozygotic twin and an unrelated healthy d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: There is currently a lack of economic and suitable animal models that can accurately recapitulate the oral submucous fibrosis (OSF) disease state for indepth study. This is one of the primary reasons for the limited therapeutic methods available for OSF. Based on the underlying logic of pan-cancer analysis, this study systematically compares OSF and the other four types of organ fibrosis from the aspects of molecules, signaling pathways, biological processes, etc. A comprehensive analysis of the similarities and differences between OSF and other organ fibrosis is helpful for resear
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dandy-Walker malformation (DWM) is a common prenatally diagnosed cerebellar malformation, characterized by cystic dilatation of the fourth v … sum (ACC); 7 presented with extracerebral abnormalities. Chromosomal abnormalities were detected by microarray analysis in 4 of 11 fetuses with DWM, using amniocentesis. Volumetric analysis revealed that the cortical plate was significantly larger in fetuses with DWM than in controls (p = 0.040). Even without ACC, the subcortical parenchyma, whole cerebrum, cerebella …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bioinformatics analysis has been playing a vital role in identifying potential genomic biomarkers more accurately from an enormous number of candidates by reducing time and cost compared to the wet-lab-based experimental procedures for disease diagnosis, prognosis, and therapies. Cervical cancer (CC) is one of the most malignant diseases seen in women worldwide. This study aimed at identifying potential key genes (KGs), highlighting their functions, signaling pathways, and candidate drugs for CC diagnosis and targeting therapies. Four publicly available microarray datasets of CC were analyzed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aims to identify the clinical and genetic markers related to the two uncommon nutritional statuses-metabolically unhealthy normal-weight (MUNW) and metabolically healthy overweight/obese (MHOW) individuals in the physically active individuals. Physically active male volunteers (n = 120) were recruited, and plasma samples were analyzed for the clinical parameters. Triglycerides, HDL-Cholesterol, LDL-cholesterol, total cholesterol, C-reactive protein, and insulin resistance were considered as markers of metabolic syndrome. The subjects were classified as 'Работает' (0 metabolic abnorma
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Rheumatoid arthritis (RA) is one of the most prevalent inflammatory arthritis worldwide. However, the genes and pathways associated with macrophages from synovial fluids in RA patients still remain unclear. This study aims to screen and verify differentially expressed genes (DEGs) related to identifying candidate genes related to synovial macrophages in rheumatoid arthritis by bioinformatics analysis.
METHODS: We searched the Gene Expression Omnibus (GEO) database, and GSE97779 and GSE10500 with synovial macrophages expression profiling from multiple RA microarray dataset were sele
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cancer-induced bone pain (CIBP) is one of the most severe types of chronic pain which the involved mechanisms are largely unknown. LncRNA has been found to play critical roles in chronic pain. However, its function in peripheral nervous system in CIBP remains unknown. Identifying the different lncRNA expression pattern is essential for understanding the genetic mechanisms underlying the pathogenesis of CIBP.
METHODS: The model was induced by injection of Walker 256 cells into the rat tibia canal. Behavior tests and X-ray microtomography (MicroCT) analysis were performed to verify
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Early ducts of breast tumors are unequivocally acidic. High rates of glycolysis combined with poor perfusion lead to a congestion of acidic metabolites in the tumor microenvironment, and pre-malignant cells must adapt to this acidosis to thrive. Adaptation to acidosis selects cancer cells that can thrive in harsh conditions and are capable of outgrowing the normal or non-adapted neighbors. This selection is usually accompanied by phenotypic change. Epithelial mesenchymal transition (EMT) is one of the most important switches correlated to malignant tumor cell phenotype and has been shown to be
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alopecia areata (AA) is a common inflammatory disease characterized by cellular infiltration of T cells targeting the anagen-stage hair follicle. Lack of efficacious treatment for AA may be due to little knowledge about its exact cellular mechanism. Studies have demonstrated that microRNAs (miRNAs) play an important role in the regulation of inflammatory skin diseases such as atopic dermatitis and psoriasis. However, little is known about the role of miRNAs in AA.
OBJECTIVE: The present study aimed to explore the blood miRNAs alterations in patients with severe active AA.
METHODS
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) is a complex inherited cardiovascular disease. The present study investigated the long noncoding (lnc)RNA/microRNA (mi)RNA/mRNA expression pattern of patients with HCM and aimed to identify key molecules involved in the development of this condition. An integrated strategy was conducted to identify differentially expressed miRNAs (DEmiRs), differentially expressed lncRNAs (DElncs) and differentially expressed genes (DEGs) based on the GSE36961 (mRNA), GSE36946 (miRNA), GSE68316 (lncRNA/mRNA) and GSE32453 (mRNA) expression profiles downloaded from the Gene Expr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE/BACKGROUND: Long non-coding RNA (lncRNA) play important roles in many diseases. However, their roles in sporadic thoracic aortic aneurysm (STAA) are unclear. Therefore, the objective of this study was to construct an lncRNA-mRNA network and dissect lncRNAs that might contribute to the pathogenesis of STAA.
METHODS: Differentially expressed lncRNAs and mRNAs between four ascending aortic specimens derived from STAA and four controls from patients who had undergone coronary artery bypass graft (CABG) were identified by microarray analysis. Gene Ontology (GO) enrichment and lncRNA-mRNA…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.