DNA methylation is an ancient molecular modification found in most eukaryotes. In plants, DNA methylation is not only critical for transcriptionally silencing transposons, but can also affect phenotype by altering expression of protein coding genes. The extent of its contribution to phenotypic diversity over evolutionary time is, however, unclear, because of limited stability of epialleles that are not linked to DNA mutations. To dissect the relative contribution of DNA methylation to transposon surveillance and host gene regulation, we leveraged information from three species in the Brassicac
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Typing of nosocomial pathogens is necessary to determine the source of an outbreak. The aim was to determine the genomic variability among Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) by random amplification of polymorphic DNA (RAPD) and enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC) methods.
METHODS: Fifty P. aeruginosa isolates were obtained from the hospitals. The source of these isolates were burn wound and urinary tract infections. After detection of P. aeruginosa by biochemical methods, chromosomal deoxyribonucleic acid (DNA) was extracted by a DNA extraction kit. ERIC-PCR
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report here on the genome sequence of Yersinia similis 228(T) isolated in Germany. The genome has a size of 4.9 Mb and a G+C content of 47% and is predicted to contain 4,135 coding sequences. Annotation of the 60,687-bp extrachromosomal element predicted 67 coding sequences and a G+C content of 47.8%.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infection by the Gram-negative pathogen Burkholderia pseudomallei results in the disease melioidosis, acquired from the environment in parts of southeast Asia and northern Australia. Clinical symptoms of melioidosis range from acute (fever, pneumonia, septicemia, and localized infection) to chronic (abscesses in various organs and tissues, most commonly occurring in the lungs, liver, spleen, kidney, prostate and skeletal muscle), and persistent infections in humans are difficult to cure. Understanding the basic biology and genomics of B. pseudomallei is imperative for the development of new va…
СтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In August 2011, an anthrax outbreak occurred among Hippopotamus amphibius hippopotamuses and humans in Zambia. Here, we report the draft genome sequence of the Bacillus anthracis outbreak strain CZC5, isolated from tissues of H. amphibius hippopotamuses that had died in the outbreak area.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacillus cereus sensu lato organisms are an ecologically diverse group that includes etiologic agents of food poisoning, periodontal disease, and anthrax. The recently identified Bcp1 bacteriophage infects B. cereus sensu lato and is being developed as a therapeutic decontamination agent and diagnostic countermeasure. We announce the complete genome sequence of Bcp1.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In August 2010, Pakistan experienced major floods and a subsequent cholera epidemic. To clarify the population dynamics and transmission of Vibrio cholerae in Pakistan, we sequenced the genomes of all V. cholerae O1 El Tor isolates and compared the sequences to a global collection of 146 V. cholerae strains. Within the global phylogeny, all isolates from Pakistan formed 2 new subclades (PSC-1 and PSC-2), lying in the third transmission wave of the seventh-pandemic lineage that could be distinguished by signature deletions and their antimicrobial susceptibilities. Geographically, PSC-1 isolates
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As in most bacteria, topological problems arising from the circularity of the two Vibrio cholerae chromosomes, chrI and chrII, are resolved by the addition of a crossover at a specific site of each chromosome, dif, by two tyrosine recombinases, XerC and XerD. The reaction is under the control of a cell division protein, FtsK, which activates the formation of a Holliday Junction (HJ) intermediate by XerD catalysis that is resolved into product by XerC catalysis. Many plasmids and phages exploit Xer recombination for dimer resolution and for integration, respectively. In all cases so far describ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Little is known about the genomic abnormalities of squamous cell carcinomas (SCC) of the vulva and how they correlate with gene expression. We determined the genomic and expression profiles of 15 such SCC using karyotyping, DNA ploidy analysis, arrayCGH, and expression arrays. Four of the five cases with clonal chromosomal aberrations found by G-banding showed highly abnormal karyotypes with multiple rearrangements. The imbalances scored by arrayCGH mapped to different chromosomes with losses being more common than gains. Frequent losses were scored from 3p and 8p whereas gains were frequent f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The let-7 microRNA (miRNA) regulates cellular differentiation across many animal species. Loss of let-7 activity causes abnormal development in Caenorhabditis elegans and unchecked cellular proliferation in human cells, which contributes to tumorigenesis. These defects are due to improper expression of protein-coding genes normally under let-7 regulation. While some direct targets of let-7 have been identified, the genome-wide effect of let-7 insufficiency in a developing animal has not been fully investigated. Here we report the results of molecular and genetic assays aimed at determining the
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Previous studies have shown a high prevalence of syndromes in children with cancer. We described four patterns of co-occurring morphological abnormalities indicating new tumour predisposition syndromes. These patterns were named after their key-abnormalities: blepharophimosis (BP), epicanthal folds (EF), asymmetric lower limbs (LLA) and Sydney creases (SC) pattern. The purpose of our study was to identify structural genomic variants possibly involved in these tumour predisposition syndromes.
PATIENTS AND METHODS: In 49 probands (13 from BP, nine from EF, 20 from LLA and seven from
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic periodontitis (CP) is a common oral disease that confers substantial systemic inflammatory and microbial burden and is a major cause of tooth loss. Here, we present the results of a genome-wide association study of CP that was carried out in a cohort of 4504 European Americans (EA) participating in the Atherosclerosis Risk in Communities (ARIC) Study (mean age-62 years, moderate CP-43% and severe CP-17%). We detected no genome-wide significant association signals for CP; however, we found suggestive evidence of association (P < 5 × 10(-6)) for six loci, including NIN, NPY, WNT5A for se
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite the family aggregation of severe teenage acne, the genetic basis of this common skin condition remains unclear. We conducted a genome-wide association study (GWAS) on severe teenage acne in 928 European Americans. The SNP rs4133274 on chromosome 8q24 (72 kb upstream of MYC) revealed the most significant association with severe teenage acne (p value = 1.7 × 10(-6)). The variant allele of this SNP (G allele) was associated with an increased risk of severe teenage acne with odds ratio of 4.01 (95 % confidence interval = 2.37-6.82). Upon further replication, our findings suggest new geneti
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tuberculosis (TB), caused by Mycobacterium tuberculosis (Mtb), which claims approximately two million people annually, remains a global health concern. The non-replicating or dormancy like state of this pathogen which is impervious to anti-tuberculosis drugs is widely recognized as the culprit for this scenario. The dormancy survival regulator (DosR) regulon, composed of 48 co-regulated genes, is held as essential for Mtb persistence. The DosR regulon is regulated by a two-component regulatory system consisting of two sensor kinases-DosS (Rv3132c) and DosT (Rv2027c), and a response regulator D
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The domestication of dogs was an important episode in the development of human civilization. The precise timing and location of this event is debated and little is known about the genetic changes that accompanied the transformation of ancient wolves into domestic dogs. Here we conduct whole-genome resequencing of dogs and wolves to identify 3.8 million genetic variants used to identify 36 genomic regions that probably represent targets for selection during dog domestication. Nineteen of these regions contain genes important in brain function, eight of which belong to nervous system development
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Asthma is a common respiratory disease that is characterized by bronchial hyperresponsiveness and airway obstruction due to chronic airway inflammation. Atopic asthma is a typical IgE-mediated disease in which the enhanced production of IgE is driven by the activation of Th2 cells, which release a distinct pattern of cytokines, including interleukin 4 (IL4) and IL3, in response to specific antigen presentation. To evaluate the methylation status of the whole genomes of bronchial mucosa tissues from subjects who lacked or had sensitization to Dermatophagoides farina (Df) and Dermato
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The only known albino gorilla, named Snowflake, was a male wild born individual from Equatorial Guinea who lived at the Barcelona Zoo for almost 40 years. He was diagnosed with non-syndromic oculocutaneous albinism, i.e. white hair, light eyes, pink skin, photophobia and reduced visual acuity. Despite previous efforts to explain the genetic cause, this is still unknown. Here, we study the genetic cause of his albinism and making use of whole genome sequencing data we find a higher inbreeding coefficient compared to other gorillas.
RESULTS: We successfully identified the causal gen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: The advent of high-throughput whole-genome sequencing has the potential to revolutionize the conduct of outbreak investigation. Because of its ultimate resolution power for differentiating between closely related pathogen strains, whole-genome sequencing could augment the traditional epidemiologic investigations of infectious disease outbreaks.
RECENT FINDINGS: The combination of whole-genome sequencing and intensive epidemiologic analysis provided new insights on the sources and transmission dynamics of large-scale epidemics caused by Escherichia coli and Vibrio cholerae,
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The entire genome of the mouse-adapted rabies virus strain CVS-24 (challenge virus standard 24), was sequenced. The overall length of the genome was 11,927 nucleotide (nt), comprising a leader sequence of 58 nt, a nucleoprotein (N) gene of 1353 nt, phosphoprotein (P) gene of 894 nt, a matrix protein (M) gene of 609 nt, a glycoprotein (G) gene of 1575 nt, an RNA-dependent RNA polymerase (RdRp, L) gene of 6384 nt and a trailer region of 70 nt. There was a TGAAAAAAA (TG7) consensus sequence at the end of each gene, except the G gene which had an AGAAAAAAA sequence at the end, and the L/trailer re
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer is the most common malignancy in women. Its estimated annual incidence is about one million cases worldwide. A number of risk factor have been identified, among them early menarche, late menopause, nulliparity and positive family history Moreover a number of highly penetrant breast and ovarian cancer susceptibility genes, such as BRCA 1 and BRCA2, have been identified. Recent findings suggest TopBP1 to be a breast and ovarian cancer susceptibility gene. Moreover; TopBPI protein may be an important prognostic marker of breast cancer TopBP1 protein is involved in DNA replication, m
Аннотация на английскомСтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования