Deafness means partial or complete hearing impairment and is one of the most prevalent sensory defects in humans. It can be due to genetic or environmental causes or a combination of both and may be Syndromic (associated with additional clinical features) or nonsyndromic (no other recognizable abnormal associated phenotype). The overall impact of hearing impairment is greatly influenced by the severity of hearing defect and by the age of onset. If defect is severe and presents in early childhood, it has dramatic effect on speech acquisition and thereby cognitive and psychosocial development. T
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
After metabolization, erdosteine (a mucoactive drug) produces an active metabolite (Met I) with an SH group that is capable of opening disulphide bonds, including those of pilin, a protein of bacterial fimbriae. This induces stereochemical conformational changes that interfere with the binding of bacterial adhesins (fimbriae) to receptors on eukaryotic cells. At subinhibitory concentrations, the macrolide clarithromycin inhibits the expression of adhesins on bacterial cell surfaces. The addition of 5 and 10 microg/ml of Met I to 1/8, 1/16 and 1/32 MIC of clarithromycin potentiated the inhibiti
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The occurrence of new variant Creutzfeldt-Jakob disease and the experimental confirmation that it is caused by the same prion strain as BSE has dramatically highlighted the need for a precise understanding of the molecular basis of prion propagation. The molecular basis of prion-strain diversity, previously a major challenge to the protein-only model, is now becoming clearer. The conformational change thought to be central to prion propagation, from a predominantly alpha-helical fold to one predominantly comprising beta-structure, can now be reproduced in vitro, and the ability of beta-PrP to
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heterodimeric capping protein (CP/CapZ) is an essential factor for the assembly of branched actin networks, which push against cellular membranes to drive a large variety of cellular processes. Aside from terminating filament growth, CP potentiates the nucleation of actin filaments by the Arp2/3 complex in branched actin networks through an unclear mechanism. Here, we combine structural biology with in vitro reconstitution to demonstrate that CP not only terminates filament elongation, but indirectly stimulates the activity of Arp2/3 activating nucleation promoting factors (NPFs) by preventing
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emerging evidence suggests seeding and prion-like propagation of mutant Superoxide Dismutase 1 (SOD1) misfolding to be a potential mechanism for ALS pathogenesis and progression. Immuno-targeting of misfolded SOD1 has shown positive clinical outcomes in mutant SOD1 transgenic mice. However, a major challenge in developing active immunotherapies for proteinopathies such as ALS is the design of immunogens enabling exclusive recognition of pathogenic species of a self-protein. Ideally, one would achieve a robust antibody response against the disease-misfolded protein while sparing the natively fo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The purpose of this study was to identify incidence and survival patterns in conformational neurodegenerative disorders (CNDDs).
METHODS: We identified 2563 reports on the incidence of eight conditions representing sporadic, acquired and genetic, protein-associated, i.e., conformational, NDD groups and age-related macular degeneration (AMD). We selected 245 papers for full-text examination and application of quality criteria. Additionally, data-collection was completed with detailed information from British, Swedish, and Spanish registries on Creutzfeldt-Jakob disease (CJD) forms,
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein conformations change among distinct thermodynamic states as solution conditions (temperature, denaturants, pH) are altered or when they are subjected to mechanical forces. A quantitative description of the changes in the relative stabilities of the various thermodynamic states is needed to interpret and predict experimental outcomes. We provide a framework based on the Molecular Transfer Model (MTM) to account for pH effects on the properties of globular proteins. The MTM utilizes the partition function of a protein calculated from molecular simulations at one set of solution condition…
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The H1N1 Eurasian avian-like swine (EAsw) influenza viruses originated from an avian H1N1 virus. To characterize potential changes in the membrane fusion activity of the hemagglutinin (HA) during avian-to-swine adaptation of the virus, we studied EAsw viruses isolated in the first years of their circulation in pigs and closely related contemporary H1N1 viruses of wild aquatic birds. Compared to the avian viruses, the swine viruses were less sensitive to neutralization by lysosomotropic agent NH4Cl in MDCK cells, had a higher pH optimum of hemolytic activity, and were less stable at
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The COVID-19 pandemic has resulted in 198 million reported infections and more than 4 million deaths as of July 2021 (covid19.who.int). Research to identify effective therapies for COVID-19 includes: (1) designing a vaccine as future protection; (2) de novo drug discovery; and (3) identifying existing drugs to repurpose them as effective and immediate treatments. To assist in drug repurposing and design, we determine two apo structures of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) main protease at ambient temperature by serial femtosecond X-ray crystallography. We employ deta
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The discovery of the phosphatidylinositol 3-kinase (PI 3-kinase) pathway was a major advance in understanding eukaryotic signal transduction. The high frequency of PI 3-kinase pathway mutations in many cancers stimulated the development of drugs targeting these oncogenic mutants. The PI 3-kinases are divided into three classes and Class I PI 3-kinases, which catalyze the phosphorylation of phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate (PI-4,5-P2) to generate phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate (PIP3), are the main subject of this review. The class I PI 3-kinases are made up of p110α, p110β, p110δ
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Huntingtin polypeptides (httex1), encoded by exon 1 of the htt gene and containing an expanded polyglutamine tract, form fibrils that accumulate within neuronal inclusion bodies, resulting in the fatal neurodegenerative condition known as Huntington's disease. Httex1 comprises three regions: a 16-residue N-terminal amphiphilic domain (NT), a polyglutamine tract of variable length (Qn), and a polyproline-rich domain containing two polyproline tracts. The NT region of httex1 undergoes prenucleation transient oligomerization on the sub-millisecond time scale, resulting in a productive tetramer th
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schistosoma mansoni, like other trematodes, expresses a number of unusual calcium binding proteins which consist of an EF-hand domain joined to a dynein light chain-like (DLC-like) domain by a flexible linker. These proteins have been implicated in host immune responses and drug binding. Three members of this protein family from S. mansoni (SmTAL1, SmTAL2 and SmTAL3) have been well characterised biochemically. Here we characterise the remaining family members from this species (SmTAL4-13). All of these proteins form homodimers and all except SmTAL5 bind to calcium and manganese ions. SmTAL9, 1
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Characterizing protein families' structural and functional diversity is essential for understanding their biological roles. Traditional analyses often focus on primary and secondary structures, which may not fully capture complex protein interactions. Here we introduce InteracTor, a novel toolkit that extracts multimodal features from protein three-dimensional (3D) structures, including interatomic interactions like hydrogen bonds, van der Waals forces, and hydrophobic contacts. By integrating eXplainable Artificial Intelligence (XAI) techniques, we quantified the importance of the extracted f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathological inclusions of the C-terminal domain (CTD) of TAR DNA binding protein-43 (TDP-43) are neurodegenerative hallmarks in amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and frontotemporal dementia, yet CTD's aggregation propensity complicates structural characterization of native TDP-43. Here we propose structural models for the physiological multimerization of TDP-43 CTD's conserved region (CR) essential for TDP-43 RNA processing. Using NMR spectroscopy, we establish that the native state of TDP-43 CR at physiological conditions is α-helical. Hydrophobic residues drive CR helix-helix assembly, ph
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TAR DNA-binding protein 43 (TDP-43) is a nucleic acid-binding protein, and its aggregation represents the defining pathology in amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and related proteinopathies. Recent studies implicate cytoplasmic stress granules (SGs) as hubs that may facilitate TDP-43 aggregation. Here, using cellular fractionation, biochemical analyses, and histological assays, we show that TDP-43 targeted to the cytoplasm has multiple fates. Whereas a TDP-43 subpopulation is indeed recruited to SGs, mature aggregated TDP-43, produced with aggregate-prone TDP-43 variants or exposure to oxida
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Consensus interferon (cIFN) is a wholly synthetic therapeutic protein which is used to treat hepatitis C/B and certain types of malignancies. It has short serum half-life, therefore, to maintain its therapeutic level in the human body it requires thrice-weekly administration. Various strategies like PEGylation and micro-encapsulation have been developed during the last few years to enhance the pharmacokinetics of small therapeutic peptides. This study executed the human albumin-fusion technology, a simple and flexible approach to extend the serum circulating half-life of cIFN, because human se
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toll/interleukin-1 like receptors (TLRs) are membrane-spanning proteins crucially involved in innate immunity. On activation, the cytoplasmic toll/interleukin-1 receptor (TIR) domains of these receptors undergo homo- or heterodimerization. Brucella sp. are bacterial pathogens that affect the immune system by suppressing the TLR signaling pathway. They enact this by encoding a TIR domain-containing protein, TcpB, which suppresses NF-κB activation and proinflammatory cytokine secretion mediated by TLR4 receptors. TcpB has been shown to target the Mal-mediated pathway to suppress TLR signaling. T
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This work was devised to unravel, along replica-exchange molecular-dynamics (REMD) simulations, the conformation in solution of the TM1 and TM2 transmembrane domains of the homotrimeric cASIC1a ion channel. This includes the head of TM1 and tail of TM2 that had previously defied X-ray diffraction analysis in the crystal. The structure of the open-channel complex of cASIC1a with psalmotoxin 1 (PcTx1) was chosen here as a basis, although, to make the simulations affordable, the procedure was limited to the missing portions, including a few adjacent α-helical turns. The latter were held fixed dur
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Infertility, as a major human reproductive health problem, affects approximately 17.5% of the global population. The emergence of assisted reproductive technology, particularly in vitro fertilization (IVF), has resolved the reproductive challenges of most infertile couples. In IVF, there exists a group of women who are unable to retrieve oocytes from typically developing follicles despite a positive response to ovarian stimulation, a condition clinically referred to as empty follicle syndrome (EFS). The pathogenesis of EFS is still unclear, but increasing evidence suggests that gen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Post-translational modifications (PTMs) frequently alter protein structures and drug-binding affinities, yet a systematic dataset is lacking. To address this gap, we curate the experimentally validated PTM-mediated Ligand Activity Change (PLAC) dataset and find that the interaction-affecting PTMs usually occur spatially closer to ligands than the interaction-neutral ones. To accurately characterize the PTMs' effects on protein-ligand interactions, we evaluate end-point binding free-energy protocols (MM/GBSA) with varying molecular dynamics (MD) simulation times and dielectric constants. Our re
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.