Human Acid-Sensing Ion Channel 1a (hASIC1a) is a complex, multi-state membrane macromolecule whose rapid desensitization limits its application as a natural biosensor. To manipulate these structural dynamics, we designed and applied an integrative computational approach, combining protein residue network analysis and a machine learning-based functional site model, to identify functionally important positions governing hASIC1a desensitization. Focusing on structural communication regions, we pinpointed novel regulatory positions modulating the channel's conformational dynamics involving the des
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Actin-like 7A (ACTL7A) is considered to play an important role in acrosome formation, fertilization, and early embryo development. Several single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in ACTL7A have been reported to be associated with male infertility. However, the functional consequences of the most non-synonymous SNPs (nsSNPs) in ACTL7A remain largely unclear. Here, a total of 489 nsSNPs in the ACTL7A gene were retrieved from the Database of Single-Nucleotide Polymorphism (dbSNP) and systematically analyzed using a series of computational tools. Among these, 44 nsSNPs were predicted to be potentia
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of highly active de novo enzymes that catalyze new-to-nature reactions is becoming increasingly possible. Here, we identify the features underlying the catalytic efficiency of a highly proficient de novo enzyme, from the original computational design to an optimized catalyst obtained through two rounds of directed evolution. Computational, spectroscopic, and biochemical studies reveal successfully designed features, including precise alignment of catalytic residues, transition state stabilization, and environmental tuning. In the most evolved enzyme, binding of a transition sta
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study elucidates the non-covalent interaction mechanism between hemp seed globulin (GLB), a plant protein rich in arginine, and tannic acid (TA) via combined multispectral analysis and molecular simulations. TA adopts an amphipathic binding mode within a defined GLB pocket, driven mainly by hydrophobic forces and supplemented by hydrogen bonds and arginine-mediated cation-π interactions, which collectively drive an entropy-favorable spontaneous binding process (ΔH > 0, ΔS > 0). TA binding drives localized secondary structural adjustments and enhances conformational compactness of GLB. The
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vitamin K-dependent (VKD) carboxylation, mediated by γ-glutamyl carboxylase (GGCX), is essential for the maturation of VKD proteins involved in critical physiological processes such as blood clotting, vascular calcification and bone metabolism. Here, we present cryo-electron microscopic structures of human GGCX alone and in complex with VKD proteins, vitamin K, and inhibitor anisindione. GGCX specifically recognizes diverse VKD substrates through high-affinity propeptide binding, while substrates like osteocalcin utilize a secondary exosite to enhance interaction. GGCX employs a conserved dipe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Iron fortification with food supplements remains the primary dietary strategy for improving iron deficiency anemia (IDA). This study used Antarctic krill protein for fibrillar design to form an Antarctic krill protein amyloid fibril (AKAF). The results indicated that peptides generated by proteolysis were a prerequisite for fibril assembly, forming elongated fibril structures and cross-linking upon heating. During this process, hydrogen bonds were rearranged, forming ordered β-sheet conformations (49.36 ± 0.21%); π-π stacking interactions among aromatic residues contributed to fibril formation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to explore the potential of garlic proteins for producing multifunctional salty peptides. Three novel salty peptides (SNDPGR, SASDPNF, and ASTCMAR) were identified through simulated hydrolysis and in silico screening. Sensory evaluation and electronic tongue analysis confirmed their potent saltiness, with dose-dependent salt-enhancing effects further validated by the electronic tongue. Among them, SNDPGR exhibited the strongest activity. These peptides predominantly adopted random coil conformations, with varying proportions of α-helices and β-sheets. Molecular docking and dyn
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ordered assembly of α-synuclein protein encoded by SNCA into filaments characterizes neurodegenerative synucleinopathies. Lewy body disease (LBD) shows predominantly neuronal and multiple system atrophy (MSA), predominantly oligodendrocytic α-synuclein pathology affecting subcortical brain structures. Based on cryo-electron microscopy, it was reported that the structures of α-synuclein filaments from LBD differ from MSA and juvenile-onset synucleinopathy (JOS). The rare atypical MSA subtype shows abundant neuronal argyrophilic α-synuclein inclusions in the limbic system. Current concepts i
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human leukocyte antigens (HLAs) are pivotal in antigen processing, presenting to CD4+ T cells, and are linked to autoimmune disease susceptibility. In celiac disease, HLA-DQ2.5 and HLA-DQ8.1 bind gluten peptides on APCs, some recognized by CD4+ T cells, prompting inflammation and tissue damage. While extensively studied experimentally, these alleles lack comprehensive in silico analysis. To explore peptide-HLA preferences, we used molecular docking on peptide libraries, deriving quantitative matrices (QMs) for evaluating amino acids at nine-residue peptide binding cores. Our findings tie speci
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
All enveloped viruses enter cells by fusing their envelope with a target cell membrane while avoiding premature fusion with membranes of the producer cell-the latter being particularly important for viruses that bud at internal membranes. Flaviviruses bud in the endoplasmic reticulum, are transported through the TGN to reach the external milieu, and enter other cells via receptor-mediated endocytosis. The trigger for membrane fusion is the acidic environment of early endosomes, which has a similar pH to the TGN of the producer cell. The viral particles therefore become activated to react to mi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The essential eukaryotic chaperone Hsp90 regulates the form and function of diverse client proteins, many of which govern thermotolerance, virulence, and drug resistance in fungal species. However, use of Hsp90 inhibitors as antifungal therapeutics has been precluded by human host toxicities and suppression of immune responses. We recently described resorcylate aminopyrazoles (RAPs) as the first class of Hsp90 inhibitors capable of discriminating between fungal (Cryptococcus neoformans, Candida albicans) and human isoforms of Hsp90 in biochemical assays. Here, we report an iterative structure-
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
4-HNE-modified ankyrins have been described in diseases such as diabetes, renal failure, G6PD deficient, sickle cell trait, and P. falciparum infected erythrocytes with different AB0 blood groups. However, effects at the atomic level of this carbonylation on structure and function of modified protein are not yet fully understood. We present a study based on molecular dynamics simulations of nine 4-HNE modified residues of the ZU5-ANK ankyrin domain with β-spectrin and their binding energy profiles. Results show that 4-HNE induced local conformational changes over all protein systems evaluated,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein misfolding cyclic amplification assay (PMCA) and real-time quaking-induced conversion (RT-QuIC) are two amplification techniques based on the ability of PrPsc to induce a conformational change in PrP allowing the detection of minute amounts of PrPsc in body fluids or tissues. PMCA and RT-QuIC have different ability to amplify PrPsc from sporadic, variant and genetic forms of Creutzfeldt-Jakob disease (CJD). PMCA readily amplifies PrPsc from variant CJD (vCJD) tissue while RT-QuIC easily amplifies PrPsc from sporadic CJD (sCJD) patient tissues. In terms of diagnosis, this implies the po
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Influenza pandemic is a constant major threat to public health caused by influenza A viruses (IAVs). IAVs are subcategorized by the surface proteins hemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA), in which they are both essential targets for drug discovery. While it is of great concern that NA inhibitor oseltamivir resistant strains are frequently identified from human or avian influenza virus, structural and functional characterization of influenza HA has raised hopes for new antiviral therapies. In this study, we explored a structure-activity relationship (SAR) of pinanamine-based antivirals and
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During the past century, several epidemics of human African trypanosomiasis, a deadly disease caused by the protist Trypanosoma brucei, have afflicted sub-Saharan Africa. Over 10 000 new victims are reported each year, with hundreds of thousands more at risk. As current drug treatments are either highly toxic or ineffective, novel trypanocides are urgently needed. The T. brucei galactose synthesis pathway is one potential therapeutic target. Although galactose is essential for T. brucei survival, the parasite lacks the transporters required to intake galactose from the environment. UDP-galacto
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nitroxides as stabile organic radicals were used initially as spin labels in spectroscopy of electron paramagnetic resonance (EPR) with respect to parameters such as pH of an intercellular environment, oxygenation of cells and tissues, fluidity of biological membranes, conformational state and topography of proteins. Nitroxides have also been used in biology and medicine as contrast agents in magnetic resonance imaging (MRI). When their antioxidant activities were discovered, an era of research on the potential utility of these agents began. Nitroxides can modulate the redox state of the cell
Аннотация на английскомСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gaseous anaesthesia has been a great boon for medicine. These drugs form a foundation from which modern surgery has sprung, yet their mechanism(s) of actions remains poorly understood. Inert gas narcosis is a limitation of deep sea diving, and its mechanisms also remain poorly understood. In this review article we summarise what is known about the mechanisms of both gaseous anaesthesia and inert gas narcosis, including both lipid-based biophysical models and protein-based biochemical models, as well as explore some striking similarities between the two. These two phenomena may, in reality, be
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In prion-related encephalopathies, microglial activation occurs early and is dependent on accumulation of disease-specific forms of the prion protein (PrPSc) and may play a role in nerve cell death. Previously, we found that different types of PrPSc (i.e. type 1 and type 2) coexisted in approximately 25% of patients with sporadic Creutzfeldt-Jakob disease (CJD); and a close relationship was detected between PrPSc type, the pattern of PrP immunoreactivity, and extent of spongiform degeneration. To investigate whether microglial reaction is related to the biochemical type and deposition pattern
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Four synthetic peptides which comprise the immunodominant linear epitopes of the EG95 recombinant protein, were investigated for their ability to induce host-protective immunity against Echinococcus granulosus in sheep. Sheep were immunized with either free peptide or peptide conjugated to diphtheria toxoid and challenge infected with E. granulosus eggs. All of the peptides elicited specific antibody, but these did not kill the parasite in in vitro culture assays, nor did the peptides induce protection against challenge infection. In contrast, anti-EG95 antibodies affinity purified against eac
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An odontogenic keratocyst (OKC) is a benign cystic lesion of the jaws that occurs sporadically or in association with nevoid basal cell carcinoma syndrome (NBCCS). Recently, the gene for NBCCS was cloned and shown to be the human homologue of the Drosophila segment polarity gene Patched (PTCH), a tumor suppressor gene. The PTCH gene encodes a transmembrane protein that acts in opposition to the Hedgehog signaling protein, controlling cell fates, patterning, and growth in numerous tissues, including tooth. We investigated three cases of sporadic odontogenic keratocysts and three other cases ass
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования