Ubiquitylation is a crucial posttranslational modification that regulates cellular homeostasis and has been linked to a range of diseases. Identification and analysis of ubiquitylated proteins and ubiquitylation sites have historically been successfully performed by mass spectrometry from in vitro and in vivo samples. However, to address some of the challenges and improve the efficiency of ubiquitylation analysis by mass spectrometry, computational tools have been developed and are becoming increasingly popular. In this chapter, we summarize the available computational tools for predicting ubi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammation-associated tissue injury is driven by complex interactions among inflammatory mediators, oxidative stress, and apoptosis, creating a need for therapeutic strategies capable of targeting multiple pathological processes. Plant-mediated zinc oxide nanoparticles (ZnO NPs) have attracted increasing interest because of their favorable biocompatibility and pharmacological potential. This study comprehensively evaluated the phytochemical composition, physicochemical characteristics, and anti-inflammatory efficacy of Frankenia hirsuta-derived biofunctionalized ZnO nanoparticles (FH-ZnONPs)
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This paper is an extension of the keynote address and another talk at the Symposium on the Use of Toxiciological Information in Drug Design. The symposium was organized by American Chemical Society's Chemical Information Division at the 220th National Meeting of the American Chemical Society in Washington, DC, August 20-24, 2000. We outline an approach for meeting the scientific information needs of the U.S. Food and Drug Administration (FDA). Ready access to scientific information is critical to support safety-related regulatory decisions and is especially valuable in situations where availab
НовостьПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Modern achievements in genomics and cancer biology have provided an unprecedented body of knowledge regarding the molecular pathogenesis of lymphoma. Genome-wide association studies and modern computer technologies demonstrated that various histological and immunomorphological subtypes of lymphomas differ at the molecular level, and result from various oncogenic mechanisms. It is clear that the variability of clinical symptoms presented by patients with lymphomas is based on the heterogeneity of tumor cells and features of the molecular pathogenesis. Based on data obtained, strategies for the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Resonantly stabilized free radicals (RSFRs) have been contemplated as fundamental molecular building blocks and reactive intermediates in molecular mass growth processes leading to polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) and carbonaceous nanoparticles on Earth and in deep space. By combining molecular beams and computational fluid dynamics simulations, we provide compelling evidence on the formation of benzene via the cyclopentadienyl-methyl reaction and of naphthalene through the cyclopentadienyl self-reaction, respectively. These systems offer benchmarks for the conversion of a five-membered
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present report regards a computational study aimed at assessing the conformational profile of the four stereoisomers of the peptide Ace-Pro-c3Phe-NMe, previously reported to exhibit beta-turn structures in dichloromethane with different type I/type II beta-turn profiles. Molecular systems were represented at the molecular mechanics level using the parm96 parameterization of the AMBER force field. Calculations were carried out in dichloromethane using an implicit solvent approach. Characterization of the conformational features of the peptide analogs was carried out using simulated annealin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) remains a significant global health challenge, highlighting the need for novel dual inhibitors targeting acetylcholinesterase (AChE) and butyrylcholinesterase (BChE). This study investigated the trunk bark of Terminalia triptera Stapf. as a potential source of bioactive secondary metabolites for AD management. Bioassay-guided isolation led to the identification of two flavan-3-ol derivatives, epicatechin-(4β→8)-ent-catechin (1) and (-)-catechin (2), reported here for the first time from this species. In vitro assays demonstrated that the dimeric compound 1 exhibited st
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endocannabinoid system plays a pivotal role in controlling neuroinflammation, and modulating this system may not only aid in managing symptoms of neurodegenerative diseases such as Alzheimer's disease, Parkinson's disease, Multiple sclerosis, Epilepsy, Central and Peripheral neuropathic pain, but also, have the potential to target these diseases at an early-stage. In the present study, six different pharmacophore hypotheses were generated from Cannabidiol (CBD)-Cannabinoid Receptor subtype-2 (CB2) and then Zinc database was screened for identification of hit molecules. Identified 215 hit molec
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Styrene is a ubiquitous volatile organic compound linked to hematologic and vascular alterations; however, the molecular mechanisms connecting exposure to atherosclerosis remain poorly characterized.
METHODS: We integrated peripheral blood mononuclear cell transcriptomic profiles (GSE23746) with toxicogenomic data from the Comparative Toxicogenomics Database, applying support vector machine recursive feature elimination and least absolute shrinkage and selection operator machine learning algorithms to identify core targets at the styrene-atherosclerosis intersection. Immune infilt
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Histopathologic evaluation remains central to cancer diagnosis and treatment planning, yet the molecular programs underlying distinct tissue morphologies are not routinely accessible in clinical workflows. Spatial transcriptomic/proteomic platforms provide region-specific molecular measurements but are limited by cost, throughput, and scalability. Most computational pathology models rely on either bulk tissue-based gene expression or a focused gene/protein expression-panel prediction, thereby obscuring subregion-specific morphologic-molecular relationships and limiting spatial interpretation o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Quantitative Structure-Property Relationship (QSPR) modeling is a successful computational technique that is capable of predicting physicochemical properties on the basis of the molecular structure. Twenty-five commonly used antidepressant drugs were used in the present study and a complete QSPR analysis was carried out by using neighborhood degree-based topological indices obtained from chemical graph theory. Molecular graphs, with the hydrogen atoms suppressed, were calculated nine topological descriptors; the correlations between these descriptors and eight measured physicochemical prop
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecularly imprinted polymers (MIPs) are widely used as robust synthetic receptors for electrochemical chemosensing, but a limited understanding of the relationships among molecular recognition, polymer architecture, and analytical performance constrains the rational design of high-performance MIP-based sensors. This review critically examines computation-guided strategies for designing MIP receptors, imprinted layers, and electrode-integrated sensing interfaces. In particular, we emphasize quantum-chemical calculations, molecular docking, molecular dynamics simulations, chemometrics, and dat
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dipeptidyl peptidase-4 (DPP-4) is an established therapeutic target in the treatment of type 2 diabetes mellitus (T2DM), primarily due to its role in regulating incretin activity and glucose homeostasis. Although clinically approved DPP-4 inhibitors are widely used, their moderate efficacy has driven the search for novel compounds with improved properties. In this context, natural products have attracted considerable attention as a source of structurally diverse and biologically active molecules. At the same time, molecular docking has emerged as a key computational tool for the identification
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Display-related organic light-emitting/modulating materials (DOLMs) are increasingly detected in the environment, raising growing health concerns. However, toxicological data remain available for only a limited number of DOLMs, and their toxicity and underlying mechanisms remain insufficiently characterized, impeding accurate hazard assessment. This study presents the first systematic computational toxicity assessment of 1838 DOLMs by integrating network toxicology and molecular docking approaches. Based on the toxicity assessment of all 1838 DOLMs, six priority endpoints were identified: card
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drug resistance arising during cancer development and progression remains a major challenge in the treatment of epidermal growth factor receptor (EGFR)-driven tumors, particularly those harboring the clinically relevant T790M/L858R double mutation. In this study, we developed an integrated computational workflow combining explainable machine learning, virtual screening, molecular dynamics simulations, and binding free-energy calculations to identify novel inhibitors of this drug-resistant EGFR variant. An XGBoost regression model was trained using scaffold-aware cross-validation, Bayesian hype
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antioxidant peptides from marine proteins are promising bioactive compounds, yet efficient discovery and multilevel validation remain challenging. Here, we established a proteome-scale workflow integrating virtual enzymatic hydrolysis, dual-model antioxidant prediction, consensus ranking, toxicity screening, sequence-diversity-informed selection, experimental validation, and molecular simulation to identify antioxidant short peptides from Apostichopus japonicus. Five newly identified antioxidant short peptides (DHE, HDHE, DDHN, EHED, and QHDE) were synthesized for experimental validation. All
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Molecular imaging of adrenal tumors has become established in clinical routine, because they often cannot be characterized using morphological imaging alone. It can provide an important contribution to the localization and characterization of these lesions.
OBJECTIVES: The use of various radiopharmaceuticals forms the basis of molecular imaging via positron emission tomography (PET)/computed tomography (CT) and single photon emission computed tomography (SPECT)/CT.
MATERIALS AND METHODS: We conducted a literature search on established and novel PET- and SPECT-tracers used in adre
Аннотация на английскомСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Alzheimer's disease (AD) is a debilitating neurodegenerative condition marked by progressive cognitive decline and memory impairment, affecting millions worldwide. Despite extensive research, no definitive cure exists, underscoring the need for innovative approaches to drug discovery and development.
METHODS: This review focuses on the application of molecular docking techniques in the context of AD drug discovery. The methodology involves the use of computational modeling tools to predict and analyze the interactions between small drug-like molecules and key protein targets imp
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pyelonephritis-associated pili (Pap) expression in uropathogenic Escherichia coli is regulated by a complex phase variation mechanism involving the competition between leucine-responsive regulatory protein (Lrp) and DNA adenine methylase (Dam). Population dynamics of pap gene expression has been studied extensively and the detailed molecular mechanism has been largely elucidated, providing sufficient information for mathematical modeling. Although the Gillespie algorithm is suited for modeling of stochastic systems such as the pap operon, it becomes computationally expensive when detailed mole
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The complex and multifactorial nature of different neurodegenerative disorders hampers the capacity to identify effective treatments. Therefore, instead of relying solely on monotherapies or combination therapies, which typically come with dosing complications and limited synergy, multitarget-directed ligand strategies have emerged as one of the most dynamic and promising approaches to improve outcomes for such diseases. This study sought to identify dual modulators that specifically target cannabinoid receptor type 2 (CB2R) and muscarinic acetylcholine receptor subtype 1 (M1R), two receptors
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования