Aims: In this methylome-wide association study of cholestatic liver diseases (primary sclerosing cholangitis and primary biliary cholangitis), the authors aimed to elucidate changes in methylome and pathway enrichment to identify candidate genes. Patients & methods: Reduced representation bisulfite sequencing was performed on liver tissue from 58 patients with primary sclerosing cholangitis (n = 13), primary biliary cholangitis (n = 20), alcoholic liver disease (n = 21) and live liver donors (n = 4). Pathway enrichment and network analysis were used to explore key genes/pathways. Results: Both
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The causes for male sexual orientation are complicated, which have not yet been clarified. Recent years have witnessed fruitful progress in the field of biology, while the impact of environment has received little attention. Adverse childhood experiences (ACEs), identified as a special environment in the early stage of development, can affect the individual phenotype by DNA methylation. Given the relationships among male sexual orientation, ACEs, and DNA methylation, as well as based on the existing theory, this article proposes the model "ACEs-DNA methylation-male sexual orientation"from the …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Offspring generated by in vitro fertilization (IVF) are believed to be healthy but display a possible predisposition to chronic diseases, like hypertension and glucose intolerance. Since epigenetic changes are believed to underlie such phenotype, this study aimed at describing global DNA methylation changes in the liver of adult mice generated by natural mating (FB group) or by IVF. Embryos were generated by IVF or natural mating. At 30 weeks of age, mice were sacrificed. The liver was removed, and global DNA methylation was assessed using whole-genome bisulfite sequencing (WGBS). Genomic Regi…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Obsessive-compulsive disorder (OCD) is characterized by intrusive thoughts and repetitive actions, that presents the involvement of the cortico-striatal areas. The contribution of environmental risk factors to OCD development suggests that epigenetic mechanisms may contribute to its pathophysiology. DNA methylation changes and gene expression were evaluated in post-mortem brain tissues of the cortical (anterior cingulate gyrus and orbitofrontal cortex) and ventral striatum (nucleus accumbens, caudate nucleus and putamen) areas from eight OCD patients and eight matched controls.
RE…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lead, a known neurotoxicant, has previously received attention in Parkinson's disease (PD) research, but epidemiologic studies have been limited in sample size and findings are equivocal. We generated two methylation-based biomarkers for cumulative tibia and patella bone-measured lead exposure in 1528 PD patients and 1169 controls. PD status was associated with increased levels of the DNAm biomarker for tibia-lead levels. We estimated a meta-OR for PD of 1.89 per unit DNAm tibia-lead increase (95% CI 1.59, 2.24; p = 8.1E-13). The current study supports the notion that chronic and long-term lea
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lung cancer is the leading cause of cancer-related mortality. The alteration of DNA methylation plays a major role in the development of lung cancer. Methylation biomarkers become a possible method for lung cancer diagnosis.
RESULTS: We identified eleven lung cancer-specific methylation markers (CDO1, GSHR, HOXA11, HOXB4-1, HOXB4-2, HOXB4-3, HOXB4-4, LHX9, MIR196A1, PTGER4-1, and PTGER4-2), which could differentiate benign and malignant pulmonary nodules. The methylation levels of these markers are significantly higher in malignant tissues. In bronchoalveolar lavage fluid (BALF) s…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exposure to early life stress (ELS) during childhood or prenatally increases the risk of future psychiatric disorders. The effect of stress … or 1.5 h/day, whilst separated from their mother, from postnatal day (P) 4-6. 3'mRNA sequencing and DNA methylation immunoprecipitation (meDIP) sequencing were performed on hypothalamic tissue at P6. Behaviour was assessed with the elevated plus, open field mazes and in-cage monitoring at 3-4 months of age. MMS was only associated with subtle changes in gene expr …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In mammals, females generally live longer than males. Nevertheless, the mechanisms underpinning sex-dependent longevity are currently unclear. Epigenetic clocks are powerful biological biomarkers capable of precisely estimating chronological age and identifying novel factors influencing the aging rate using only DNA methylation data. In this study, we developed the first epigenetic clock for domesticated sheep (Ovis aries), which can predict chronological age with a median absolute error of 5.1 months. We have discovered that castrated male sheep have a decelerated aging rate compared to intac…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In patients with hormone receptor-positive breast cancer, differentiating between patients with a low and a high risk of recurrence is an ongoing challenge. In current practice, prognostic clinical parameters are used for risk prediction. DNA methylation markers have been proven to be of additional prognostic value in several cancer types. Numerous prognostic DNA methylation markers for breast cancer have been published in the literature. However, to date, none of these markers are used in clinical practice.
METHODS: We conducted a systematic review of PubMed and EMBASE to assess …
Поддержка исследования: вне правительства СШАСистематический обзорСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Although distinct DNA methylation patterns have been reported, its localization and roles remain to be defined in heart failure. We investigated the cellular and subcellular localization of DNA methylation and its pathophysiological significance in human failing hearts.
METHODS AND RESULTS: Using left ventricular (LV) endomyocardial biopsy specimens from 75 patients with dilated cardiomyopathy (DCM; age: 58 ± 14 years old, %female: 32%) and 20 patients without heart failure (controls; age: 56 ± 17 years old, %female: 45%), we performed immunohistochemistry and immunoelectron microscopy …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aim: To investigate whether genes implicated in dementia pathogenesis are differently methylated in peripheral blood. Materials & methods: Participants included 160 cognitively healthy individuals aged 70+ years: 73 who were subsequently diagnosed with dementia and 87 controls matched on age, gender, education, smoking and baseline cognition. A total of 49 participants also provided blood samples at diagnosis. Blood DNA methylation of APOE, APP, BDNF, PIN1, SNCA and TOMM40 was examined. Results: A total of 56 of 299 probes were differentially methylated in dementia compared with controls and 3…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prior candidate gene studies have shown tumor suppressor DNA methylation in breast milk related with history of breast biopsy, an established risk factor for breast cancer. To further establish the utility of breast milk as a tissue-specific biospecimen for investigations of breast carcinogenesis, we measured genome-wide DNA methylation in breast milk from women with and without a diagnosis of breast cancer in two independent cohorts. DNA methylation was assessed using Illumina HumanMethylation450k in 87 breast milk samples. Through an epigenome-wide association study we explored CpG sites ass…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many neural sex differences are differences in the number of neurons of a particular phenotype. For example, male rodents have more calbindin-expressing neurons in the medial preoptic area (mPOA) and bed nucleus of the stria terminalis (BNST), and females have more neurons expressing estrogen receptor alpha (ERα) and kisspeptin in the ventromedial nucleus of the hypothalamus (VMH) and the anteroventral periventricular nucleus (AVPV), respectively. These sex differences depend on neonatal exposure to testosterone, but the underlying molecular mechanisms are unknown. DNA methylation is important…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present study aimed to identify potentially important biomarkers associated with polycystic ovary syndrome (PCOS) by integrating DNA methylation with transcriptome profiling. The transcription (E‑MTAB‑3768) and methylation (E‑MTAB‑3777) datasets were retrieved from ArrayExpress. Paired transcription and methylation profiling data of 10 cases of PCOS and 10 healthy controls were available for screening differentially expressed genes (DEGs) and differentially methylated genes (DMGs). Genes with a negative correlation between expression levels and methylation levels were retained by correlati…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
People with ataxia-telangiectasia (A-T) display phenotypic variability with regard to progression of immunodeficiency, sino-pulmonary disease, and neurologic decline. To determine the association between differential gene expression, epigenetic state, and phenotypic variation among people with A-T, we performed transcriptional and genome-wide DNA methylation profiling in patients with mild and classic A-T progression as well as healthy controls. RNA and genomic DNA were isolated from peripheral blood mononuclear cells for transcriptional and DNA methylation profiling with RNA-sequencing and mo…
Клиническое исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation analysis may improve risk stratification in cervical screening. We used a pan-epigenomic approach to identify new methylation markers along the continuum of cervical intraepithelial neoplasia (CIN) to cervical cancer. Physician-collected samples (54 normal, 50 CIN1, 40 CIN2 and 42 CIN3) were randomly selected from women at a single-center colposcopy clinic. Extracted DNA was subjected to Illumina Infinium EPIC array analysis, and methylation was assessed blinded to histopathological and clinical data. CpG sites whose state of methylation correlated with lesion grade were assess…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple sclerosis (MS) is an autoimmune and demyelinating disease of the central nervous system characterised by incoordination, sensory lo … odifies gene expression without altering the DNA sequence. The most studied epigenetic mechanism is DNA methylation. This epigenetic mark participates in distinct MS pathophysiological processes, including blood-brain barrier breakdown, inflammatory response, demyelination, remyelination failure and neurodegeneration. In this study, we also accurately summarised …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Abnormal blood pressure during pregnancy is associated with impaired fetal growth, predisposing the offspring to cardiometabolic abnormalities over the life-course. Placental DNA methylation may be the regulatory pathway through which maternal blood pressure influences fetal and adult health outcomes. Epigenome-wide association study of 301 participants with placenta sample examined associations between DNA methylation and millimetre of mercury increases in systolic and diastolic blood pressure in each trimester. Findings were further examined using gene expression, gene pathway, and functiona…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In mammals, the acquisition of the germline from the soma provides the germline with an essential challenge: the need to erase and reset genomic methylation1. In the male germline, RNA-directed DNA methylation silences young, active transposable elements2-4. The PIWI protein MIWI2 (PIWIL4) and its associated PIWI-interacting RNAs (piRNAs) instruct DNA methylation of transposable elements3,5. piRNAs are proposed to tether MIWI2 to nascent transposable element transcripts; however, the mechanism by which MIWI2 directs the de novo methylation of transposable elements is poorly understood, althoug…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: DNA methylation has been proposed as an epigenetic mechanism by which the childhood neighborhood environment may have implications for the genome that compromise adult health.
OBJECTIVE: To ascertain whether childhood neighborhood socioeconomic disadvantage is associated with differences in DNA methylation by age 18 years.
DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS: This longitudinal cohort study analyzed data from the Environmental Risk (E-Risk) Longitudinal Twin Study, a nationally representative birth cohort of children born between 1994 and 1995 in England and Wales and followed up fr…
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАTwin StudyПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования