We present a combinatorial machine learning method to evaluate and optimize peptide vaccine formulations for SARS-CoV-2. Our approach optimizes the presentation likelihood of a diverse set of vaccine peptides conditioned on a target human-population HLA haplotype distribution and expected epitope drift. Our proposed SARS-CoV-2 MHC class I vaccine formulations provide 93.21% predicted population coverage with at least five vaccine peptide-HLA average hits per person (≥ 1 peptide: 99.91%) with all vaccine peptides perfectly conserved across 4,690 geographically sampled SARS-CoV-2 genomes. Our pr
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To examine associations of HLA class I and class II alleles with ankylosing spondylitis (AS) in three cohorts of patients of European, Asian and African ancestry.
METHODS: HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1, HLA-DQB1 and HLA-DPB1 alleles were genotyped in 1948 unrelated white and 67 African-American patients with AS from the Prospective Study of Outcomes in Ankylosing Spondylitis cohort, the North American Spondylitis Consortium and Australo-Anglo-American Spondyloarthritis Consortium, 990 white and 245 African-American Controls and HLA-B alleles in 442 Han Chinese patients with AS and
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pharmacogenomics is gradually becoming more and more indispensable in modern medicine. In several cases, a pharmacogenomics test may alleviate serious drug-induced adverse reactions, if it precedes drug prescription. In this article, we provide an overview of the well-established HLA-based carbamazepine- and allopurinol-induced adverse reactions, as one of the most characteristic examples of the clinical application of pharmacogenomics, highlighting its regional impact in Southeast Asian populations in preventing adverse reactions of certain drug/allele pairs. This example provides useful insi
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tracheal reconstruction is indicated in cases of malignancy, traumatic injury, and subglottic or tracheal stenosis. Recent progress in airway transplantation has provided renewed optimism for potential solutions for defects involving more than half of the tracheal length in adults or one-third of the tracheal length in children. Biologic scaffolds derived from decellularized tissues and organs have shown great promise in tracheal allotransplantation, and cyclical decellularization techniques have been hypothesized as abrogating the need for immunosuppressive therapy. In this study, we performe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIM OF THE STUDY: Rheumatic heart disease (RHD) is often preceded by rheumatic fever (RF). The disease is a multisystem inflammatory condition that develops as a sequel to untreated throat infection by group A beta-hemolytic streptococci. Several studies have suggested that genetic susceptibility to RHD may be linked to human leukocyte antigen (HLA) class II alleles. The study aim was to investigate the association between RHD and the antigens HLA-A, -B, -C, -DR and -DQ profile in RHD patients in eastern Turkey.
METHODS: A case-control study was conducted which included 85 unre
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Superantigens include viral and bacterial products, mainly of streptococci, staphylococci that stimulate T cells to proliferate nonspecifically through interaction with class II major histocompatibility complex products on antigen-presenting cells and then with variable regions on the beta chain of T cell receptor complex. Superantigens cause symptoms via release of immune cytokines. These proteins should be considered potential cause of illnesses such as rheumatic fever, arthritis. Kawasaki syndrome, atopic dermatitis, and guttate psoriasis because of their potent immune system-altering capac
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Disturbance of T cell-mediated immunity has been reported in acute visceral leishmaniasis (AVL). In a study of 16 patients with AVL, defective production of interleukin-1 (IL-1) by peripheral blood mononuclear cells was demonstrated in response to leishmania antigens, heat-killed Listeria organisms, and lipopolysaccharide when compared to posttherapy values or controls. This global defect in IL-1 production was corrected after successful therapy. Twelve of 16 patients responded with a greater than or equal to 2.5-fold increase in IL-1 production that correlated with clinical cure, P less than
Клиническое исследованиеКонтролируемое клиническое исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leprosy is of interest to immunologists because the varied clinical manifestations of the disease correlate closely with the immunological spectrum. Resistance to infection is dependent on appropriate cell-mediated immunity, but patients with the lepromatous form fail to respond to antigens of M. leprae. In vitro studies have revealed the existence of T-suppressor cells of the phenotype CD8+, CD3+, HLA-DR+, FcR+, 9.3-, which are restricted by major histocompatibility complex (MHC) class II antigens. Several new candidate vaccines against leprosy have been effective in breaking immunological un
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Immunodeficient mice engrafted with peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) are models to study new cancer immunotherapy agents. However, this approach is associated with xenograft-versus-host disease (xGVHD), which starts early after PBMC transfer and limits the duration and interpretation of experiments. Here, we explore different approaches to overcome xGVHD and better support the development of cancer immunotherapies.
METHODS: Immunodeficient NOD-scid IL2Rgnull (NSG) mice were intravenously transferred with human PBMCs and subcutaneously co-engrafted with HT29 human colon c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although we earlier demonstrated that the human leukocyte antigen (HLA) DRB1*04:05 allele was associated with susceptibility to autoimmune hepatitis (AIH) in Japan, the precise relationship of HLA haplotype and the role of amino acid alignment with disease susceptibility and progression has not been fully clarified. We reinvestigated HLA class I A, B, and C and HLA class II DRB1, DQB1, and DPB1 alleles and haplotypes in a larger new cohort of 156 Japanese patients with type 1 AIH and compared them with the published data of 210 healthy subjects. The DRB1*04:05-DQB1*04:01 haplotype was signific
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Transplant glomerulopathy (TG) is a histopathologic entity of kidney allografts related to anti-human leukocyte antigen (HLA) antibodies. The goal of this study was to determine the relationships among antibody characteristics (level and specificity), risk for TG, and graft survival.
METHODS: The presence and characteristics of anti-HLA antibody were assessed by single antigen beads assays in stored pretransplant sera from 598 kidney recipients with negative T-cell crossmatch. Transplant glomerulopathy was diagnosed by surveillance and clinical biopsies.
RESULTS: Thirty-nine perc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: An association between HLA antigens and susceptibility to multiple sclerosis (MS) has been established, especially in Caucasian populations. Such associations have not been as clearly defined in many Arab populations, where even the frequencies of specific HLA antigens remain unclear
OBJECTIVE: The study was designed to (i) investigate the frequencies of HLA Class I and II antigens in Kuwaiti Arabs with MS, and; (ii) assess possible inter-relationships between HLA Class II antigens and such clinical phenotypic variables in MS as age at onset, gender, disease subtype and scale of d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biopsied skeletal muscles from patients with inflammatory myopathy (6 cases of polymyositis (PM), 2 cases of dermatomyositis (DM), 5 cases of collagen disease with polymyositis and a case of allergic granulomatous angitis) were examined by comparing immunostained infiltrated cells at perivascular, perimysial and the endomysial sites as well as examining the histochemical findings on serial frozen sections from cases examined by our laboratory over the past three years. CD68 was used for macrophage, L26 for B lymphocytes, CD4 and CD8 for T lymphocytes. Expression of HLA-ABC was examined for Cla
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To examine the effect of pulsed intravenous methylprednisolone (IVMP) on polymositis (PM) and dermatomyositis (DM), two biopsies were taken from the same muscle before and after IVMP in one case each of PM and DM. After IVMP, numerous muscle fibers were seen undergoing regeneration. Among all subsets of infiltrating cells that decreased in number, macrophages in the perivascular area decreased markedly. Also conspicuous was decrease of CD8+ cells in the endomysium in PM and that of B-cells in the perivascular area in DM. Among infiltrating cells, frequency of those which expressed the signal t
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryosections of 28 primary and metastatic midgut carcinoid tumors from 12 patients with carcinoid syndrome were investigated immunohistochemically with antibodies that recognize human MHC class I (HLA-ABC) and class II (HLA-DR) antigens. The tumor parenchyma of all six patients treated with interferon alpha (IFN-alpha) during a mean 8.6 months (3 x 10(6) to 5 x 10(6) U three times weekly) exhibited unequivocal HLA-ABC immunoreactivity, with only minor discrepancies between primary lesions and metastases in mesenteric lymph nodes and liver. Class I staining was absent on the tumor cells of all
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antibody-mediated rejection (AMR) is a serious post-transplant complication that is associated with a worse prognosis of survival of transplanted organs. The diagnosis of AMR is based on clinical, pathological characteristics and on the detection of antibodies specific to the organ donors' mismatched human leukocyte antigens (HLA) antigens. Accumulating evidence in recent years however suggests that antibodies against antigens encoded by genes outside the HLA complex can play a role in the development of AMR. Non-HLA antigens are mostly expressed on the surface of endothelial and epithelial ce
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial superantigens (sAgs) are powerful activators of the immune response that trigger unspecific T cell responses accompanied by the release of proinflammatory cytokines. Streptococcus equi (S. equi) and Streptococcus zooepidemicus (S. zooepidemicus) produce sAgs that play an important role in their ability to cause disease. Strangles, caused by S. equi, is one of the most common infectious diseases of horses worldwide. Here, we report the identification of a new sAg of S. zooepidemicus, SpeS, and show that mutation of the putative T cell receptor (TCR)-binding motif (YAY to IAY) abrogate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Astroglia, the primary homeostatic cells of the central nervous system, play an important role in neuroinflammation. They act as facultative immunocompetent antigen-presenting cells (APCs), expressing major histocompatibility complex (MHC) class II antigens upon activation with interferon (IFN)-γ and possibly other proinflammatory cytokines that are upregulated in disease states, including multiple sclerosis (MS). We characterized the anti-inflammatory effects of fingolimod (FTY720), an established drug for MS, and its phosphorylated metabolite (FTY720-P) in IFN-γ-activated cultured rat astroc
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ocular cicatricial pemphigoid (OCP) is an autoimmune disease that affects the conjunctiva and other mucous membranes. Major histocompatibility complex (MHC) class II genes are important in autoimmunity because the antigen is presented to the T cell receptor in association with these molecules. A highly statistically significant association has been observed between patients with OCP and DQw7 (DQB1*0301) gene. DNA sequences of the second and third exons of the DQB1*0301 gene were determined in three OCP patients and compared with a control homozygous cell line for DQw7 from the Tenth Internatio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Next-generation sequencing (NGS) at the HLA-A, -B, -C, -DRB1, -DRB3/4/5, -DQA1, -DQB1, -DPA1, and -DPB1 loci was performed on 5,266 southern Chinese unrelated donors of the Hong Kong Bone Marrow Donor Registry. High-resolution HLA genotypes defined by full sequencing of class I loci and extended coverage of class II loci were attained to determine allele frequencies and estimate haplotype frequencies. This study provides allele and haplotype frequencies on 11 loci estimated for the first time in the Hong Kong Chinese population. These results describe extended haplotypes including the less fre
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования