The current era we experience is full with pandemic infectious agents that no longer threatens the major local source but the whole globe. Almost the most emerging infectious agents are severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS CoV-2), followed by monkeypox virus (MPXV). Since no approved antiviral drugs nor licensed active vaccines are yet available, we aimed to utilize immunoinformatics approach to design chimeric vaccine against the two mentioned viruses. This is the first study to deal with design divalent vaccine against SARS-CoV-2 and MPXV. ORF8, E and M proteins from Omicron…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence or reemergence of monkeypox (Mpox) and Ebola virus (EBOV) agents causing zoonotic diseases remains a huge threat to human health. Our study aimed at designing a multi-epitope vaccine (MEV) candidate to target both the Mpox and EBOV agents using immunoinformatics tools. Viral protein sequences were retrieved, and potential nonallergenic, nontoxic, and antigenic epitopes were obtained. Next, cytotoxic and helper T-cell (CTL and HTL, respectively) and B-cell (BCL) epitopes were predicted, and those potential epitopes were fused utilizing proper linkers. The in silico cloning and exp…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coronaviruses (CoVs) are positive-stranded RNA viruses with short clubs on their edges. CoVs are pathogenic viruses that infect several animals and plant organisms, as well as humans (lethal respiratory dysfunctions). A noval strain of CoV has been reported and named as SARS-CoV-2. Numerous COVID-19 cases were being reported all over the World. COVID-19 and has a high mortality rate. In the present study, immunoinformatics techniques were utilized to predict the antigenic epitopes against 3C like protein. B-cell epitopes and Cytotoxic T-lymphocyte (CTL) were designed computationally against SA…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Development of a suitable vaccine against visceral leishmaniasis (VL), a fatal parasitic disease, is considered to be vital for maintaining … ptide), this led to the identification of antigenic epitopes of the above-stated proteins utilizing immunoinformatics. Out of thirty-six, three peptides-P-10 (enolase), P-14, and P-15 (TPI) elicited common significant lymphoproliferative as well as Th1-biased cytokine responses both in golden hamsters and human subjects. Further, immunization with these peptides pl …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Visceral leishmaniasis is a dreadful infectious disease and caused by the intracellular protozoan parasites, Leishmania donovani and Leishmania infantum. Despite extensive efforts for developing effective prophylactic vaccine, still no vaccine is available against leishmaniasis. However, advancement in immunoinformatics methods generated new dimension in peptide based vaccine development. The present study was aimed to identify T-cell epitopes from the vaccine candidate antigens like Lipophosphogylcan-3(LPG-3) and Nucleoside hydrolase (NH) from the L. donovani using in silico methods. Availabl…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic cancer (PC) is a major global health burden, characterized by high mortality rates. Immunotherapy-based strategies have shown promise in combating malignant diseases such as PC. Among these, cancer vaccines are gaining considerable interest as one of the most effective immunotherapeutic approaches. Therefore, in this study, we aimed to develop an effective peptide-based vaccine against PC via immunoinformatic techniques. To construct the vaccine, antigenic proteins associated with PC, including ITGA2, LMAC2, BMPR2, ZFP91, and S100A16, were selected. The predicted epitopes were assem
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) continues to threaten the global swine industry, and currently available vaccines often provide incomplete protection against emerging virulent strains. In this study, we developed a phage T4-based multi-epitope nanoparticle vaccine targeting PEDV. B and T cell epitopes derived from the PEDV spike (S) protein were identified through immunoinformatic analyses and assembled into a tandem epitope construct (Pep) using flexible linkers. In silico analyses predicted favorable antigenic properties of Pep and a stable interaction with Toll-like receptor 3 (TLR3)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptospirosis is a public health concern with lethality around 15% of the total cases. The current vaccines against Leptospira infection based on bacterins have several limitations, which require urgent development of new ones. In this context, groundbreaking approaches such as peptide-vaccines could be used to come around with promising results. Our goal was to identify conserved and immunogenic epitopes from the lipoprotein LruC that could interact with Major Histocompatibility Complex (MHC) I and II. LruC is a conserved lipoprotein expressed during leptospirosis that is considered among vac
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: Taenia solium is a neglected tropical disease; larvae of this parasite infect central nervous system i.e. Neurocysticercosis, and adults mature and survive into intestine i.e. Taeniasis. Globally more than 50 million people are at the risk of infection. This is one of the main etiological agents for onset of new early epilepsy in developing countries. However, there is no vaccine available to protect human from its infection. Hence, there is an urgent need for a good vaccine.Methods: We applied immune-informatics approach to design a multi-epitope chimeric vaccine consisting of both
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epitope prediction is a key challenge in immunology and therapeutic antibody design. Existing computational methods rely on residue-level graph representations that fail to capture fine-grained atomic-level geometric information essential for antibody-antigen recognition. Considering that protein structure files (e.g. Protein Data Bank (PDB) files) inherently contain 3D atomic coordinates, we model proteins as atomic-level point clouds to directly preserve high-resolution spatial features . Building on this representation, we propose Point cloud-based Epitope Prediction Network(PEPNet), a two-
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The efficacy of immune checkpoint blockade (ICB) is heterogeneous across patients. Tumour immune phenotype classification (immune-inflamed, -excluded, and -desert) represents a foundational but inadequate framework for predicting ICB efficacy. Here we aimed to develop an integrated immunogenomic classification to improve ICB response prediction and identify subtype-specific therapeutic vulnerabilities.
METHODS: We analysed 13 public ICB cohorts and an in-house cohort. Using RNA-seq data, we developed ImmPred, a seven-gene classifier trained on IHC-defined immune phenotypes, and in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rheumatoid arthritis (RA) is a systemic autoimmune disease primarily affecting the joints, resulting in inflammation, swelling, and pain, ultimately impacting patients' quality of life and causing premature death. TNF-α, regulated by the NF-κB transcription factor, is a key cytokine implicated in tissue destruction and disease progression. Both TNF-α and the NF-κB receptor ligand (RANKL) are considered significant targets in the treatment of RA. Due to the limitations of current therapeutic strategies in providing safe and effective long-term healing, there is a clear need for novel therapeuti
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Shape space is a decades-old conceptual model of antibody-antigen interactions that underlies antigenic maps used to trace viral evolution. Here, we apply this concept to T cell receptors (TCRs) and the peptide-MHC complexes (pMHCs) that they recognize. We start by reviewing the history of shape space and its deep connections to concepts in statistical physics (energy landscapes) and computer science (complexity theory). Leveraging these connections, we propose a model in which TCR-pMHC binding relies on multiple, possibly conflicting, structural constraints-implying that pMHCs recognized by t
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hydatid cyst disease is caused by the parasite Echinococcus and poses significant health concerns worldwide. Due to the lack of early symptoms and limited diagnostic tools, researchers aim to design a more specific and sensitive antigen. The study focuses on developing a recombinant multi-epitope antigen using two parasite proteins (EgTeg and EgFABP1) and the IH4 nanobody.
METHODS: Protein sequences were analyzed and validated using bioinformatics tools, and B-cell epitopes were identified. The resulting antigen, confirmed by UniProt, is 266 amino acids long.
RESULTS: The multi-e
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tuberculosis (TB), caused by Mycobacterium tuberculosis (Mtb), remains a critical public health concern due to the limited efficacy of the Bacillus Calmette-Guerin (BCG) vaccine, the only WHO-approved vaccine so far. Based on the reverse vaccinology approach, this study involves in silico prediction of a fusion constructed from four highly immunogenic antigens from the latent, early, and active stages of the disease. The fusion named TetraFuVac11 consists of the complete sequences of the antigens CFP-7 and EspC and the truncated sequences of the antigens HspX and Hrp1. Major Histocompatibility
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Glioblastoma (GBM) is the most common malignant intracranial tumor in adults, with a median survival of only 16 to 20 months. Neoantigen therapy has shown advantages in the treatment of GBM, as it improves the immunosuppressive microenvironment within the tumor. However, the identification of truly immunogenic neoantigens remains a major challenge. Current computational prediction tools primarily focus on antigen presentation, whereas algorithms that incorporate T-cell immunogenicity features remain limited. Furthermore, standard validation methods, such as enzyme-linked immunospot
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: There is a pressing need for vaccine development platforms that are rapid, effective, and adaptable to emerging pathogens such as SARS-CoV-2. Circular RNA (circRNA) offers advantages in stability and non-immunogenicity over traditional mRNA approaches. We aimed to investigate the effect of increasing the amplification of a non-dominant surface epitope in the circRNA structure on the induction of an immune response to that epitope in a mouse model.
METHODS: Two circRNA constructs containing one and ten copies of an epitope were designed using immunoinformatic methods, and their imp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To address the unmet need for a prophylactic therapy against BK polyomavirus (BKPV) in transplant recipients, this study employed a mechanism-based computational approach to design a multi-epitope chimeric nanoparticle (CNP) vaccine, predicting its biopharmaceutical and immunological profile.
METHODS: A comprehensive computational biopharmaceutics pipeline was implemented. Conserved and immunodominant B-cell, helper T-lymphocyte (HTL), and cytotoxic T-lymphocyte (CTL) epitopes from all major BKPV proteins were identified using immunoinformatic tools. Epitopes were rigorously validate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Varicellovirus bovinealpha1 (BoAHV-1) and 5 (BoAHV-5) are important pathogens associated with respiratory, reproductive, and neurological disorders in cattle, remaining globally relevant since their first reports in the 1950s and 1960s. Envelope glycoproteins B, C, and D play critical roles in viral attachment and fusion, making them key targets for immune responses and promising candidates for vaccine development. This study aimed to design a multi-epitope protein using immunoinformatic approaches, incorporating highly conserved, antigenic B- and T- cell epitopes with strong predicted MHC-bin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Somatic hypermutation (SHM) status of IGHV gene, despite being a mature diagnostic biomarker in chronic lymphocytic leukemia (CLL), poses serious methodological problems for molecular laboratories. They may choose between inefficient Sanger sequencing protocols and expensive, recently developed next-generation sequencing-based methods. The performance of both types of methods seemed incomparable, and concerted validation of different protocols between laboratories was inconsiderable. Here, a new tagmentation-based approach to sequencing of IGHV locus is presented, which is agnostic to the ampl
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования