INTRODUCTION: Idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) is a progressive fibrosing interstitial lung disease (ILD) characterized by immune cell in … , and MDK, consistent with modulation of immune microenvironment features.
CONCLUSION: Integrative multiomics and machine learning analyses, together with in vitro and in vivo validation, suggest that uridine attenuates pulmonary fibrosis, potentially through modulation of MMP7-associated immune-microenvironment remodeling.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Air pollution-induced cardiovascular disease is a leading contributor to the increasing global disease burden. Disruption of vascular endothelial function is a central driver of disease onset; however, the systemic mechanisms linking pollution exposure to endothelial dysfunction remain poorly defined. Here, we investigated early molecular responses to short-term exposure via integrated proteomic, metabolomic, and transcriptomic analyses. In a panel study of eight college students traveling from Qingdao to Shijiazhuang, China, where PM2.5, PM10, SO2, NO2, and CO levels were substantially higher
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Accurate diagnosis and assessment of hip involvement are important for the clinical management of ankylosing spondylitis (AS). … nocyte percentage was an influential feature across the three EDL classification tasks. Exploratory multiomics and immunohistochemical analyses showed higher LYN expression in AS than in the corresponding non-AS fracture-control groups and suggested that LYN expression was concentrated predominantly in monocytes. A high IE score was associated with earlier s …
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pharmaceutical agents, such as antiepileptic medications, can cross fetal barriers and affect the developing brain. Prenatal exposure to the antiepileptic drug valproate (VPA) is associated with an increased risk of neurodevelopmental disorders, including congenital malformations and autism spectrum disorder. In animal models and neural organoids, VPA has been shown to alter signaling pathways, such as Wnt pathway, providing insights into VPA-induced neurodevelopmental defects. Here, we exposed dorsal forebrain organoids to VPA for 30 days and examined effects at the tissue, cellular, and mole
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ferroptosis represents a promising antitumor strategy, yet its efficacy in colon cancer is compromised by excessive antioxidant glutathione (GSH) and insufficient reactive oxygen species (ROS). To address this limitation, we rationally designed integrated nanoplatforms (FeBMnDC NPs) by covalently conjugating albumin-MnO2 complexes with ferritin to codeliver the ROS-responsive dihydroartemisinin (DHA) dimer and photosensitizer Chlorin e6 (Ce6). This design synergistically disrupts redox homeostasis to induce ferroptosis and immune activation. Upon tumor accumulation and laser irradiation, the F
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ovarian cancer is characterized by high mortality, extensive genomic instability driven by copy number alterations, and a highly … unological relevance in ovarian cancer remain poorly defined.
METHODS: We performed an integrative multiomics analysis of BDKRB1 using TCGA-OV and multiple independent GEO cohorts. The analytical framework incorporated bulk transcriptomics, copy number variation profiling, single-cell RNA sequencing, immune cell deconvolution, pathway enrichment analysis (G …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Necrotizing enterocolitis (NEC) is a severe neonatal gastrointestinal disease with incompletely understood pathogenesis and a la … ith pharmacological inhibition of Snail-mediated epithelial-mesenchymal transition (EMT).
RESULTS: Multiomics analyses indicated layer-associated epithelial injury, inflammatory activation, and EMT-like fibroblast/myofibroblast remodelling during NEC. Single-cell sequencing of six intestinal samples showed reduced epithelial-cell abundance with increased fi …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prostate cancer (PCa) remains a major global health concern, ranking among the most prevalent cancer in men worldwide. Despite the availability of various therapeutic options, the clinical efficacy of current anti-PCa agents is often compromised by drug resistance and adverse effects. DNA minor groove binders offer a potential therapeutic alternative, owing to their selective mechanism of action and favorable safety profiles. In the present study, we utilized a multiomics strategy to investigate the molecular impact of novel compound MGB4. LNCaP cells were treated with doxorubicin, MGB4, or a …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Current treatments for Alzheimer's disease (AD) help reduce symptoms for a limited time but do not treat the underlying pathology. To identify potential therapeutic targets for AD, an integrative network analysis was previously carried out using 364 human postmortem control, mild cognitive impairment, and AD brains. This analysis identified proline endopeptidase-like protein (PREPL), an understudied protein, as a downregulated protein in late-onset AD patients. In this study we investigate the role of PREPL. Analyses of data from human postmortem samples and PREPL knockdown (KD) cells suggest
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Here we present DynaVelo, a generative neural ordinary differential equation model that learns the joint dynamics of gene expression and transcription factor (TF) motif activity from single-cell multiome data. DynaVelo learns a functional form of the vector field, such that the model can be perturbed in silico and not only used to draw trajectories. We show that DynaVelo recovers the bifurcating in vivo dynamics of wild-type murine germinal center (GC) B cells and reveals how these dynamics change under heterozygous loss of epigenetic regulators Arid1a and Ctcf. In silico perturbation yields d
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic ductal adenocarcinoma (PAAD) is characterized by extreme malignancy and profound resistance to therapy, largely driven by a fibrotic and immunosuppressive tumour microenvironment (TME). The deubiquitinase OTU domain-containing protein 7B (OTUD7B) has been implicated in inflammatory and oncogenic signalling, but its role in PAAD and its TME remains unclear. This study integrated single-cell RNA-seq datasets from the GEO and bulk RNA-seq data from the TCGA to delineate the cellular ecosystem of PAAD, and employed cell-cell communication analysis, high-dimensional weighted gene coexpre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Single-cell multi-omics (scMulti-omics) technologies have revolutionized our understanding of cellular functions and interactions by enabling the simultaneous measurement of diverse cellular modalities. Integrating these heterogeneous data types presents significant challenges due to differences in scale, resolution, and biological variability across the omics layers. Traditional computational methods often fail to reconcile these differences, leading to a loss of critical biological variability and subtle intermolecular interactions.
METHODS: To address these challenges, we have
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Breast malignant phyllodes tumours are rare fibroepithelial neoplasms arising from periductal stromal cells, characterized by rapid progression and a high recurrence rate. The poor prognosis largely stems from the lack of effective therapeutic strategies, underscoring the insufficient understanding of their molecular mechanisms and therapeutic targets. Moreover, most previous studies have mainly focused on the tumour core, while the molecular features of the surrounding peritumoural tissue remain insufficiently explored.
METHODS: To address this problem, we collected 66 phyllodes
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Breast invasive carcinoma (BRCA) remains a leading cause of female cancer mortality, necessitating novel biomarkers and therapeutic targets. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 (HNRNPA3) emerges as a potential regulator in tumor progression and immune modulation, yet its comprehensive role in BRCA remains uncharacterized.
METHODS: We conducted an integrated multiomics analysis of HNRNPA3 in BRCA using data from TCGA, GEO datasets, single-cell RNA sequencing, and spatial transcriptomics. Bioinformatics approaches included differential expression analysis, survival analysis, …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Melanoma is aggressive with limited treatment options. Paclitaxel (PTX) is effective but limited by poor solubility, systemic toxicity, and insufficient intratumoral retention. Here, we report an in situ needle-free platform that amplifies local PTX exposure via multiretention nanoscale mixed polymeric micelles composed of Soluplus and a dipotassium glycyrrhizinate-PEG-folic acid conjugate (DG-pp-FA). Needle-free intratumoral jet injection at the tumor site reduces needle-related barriers and discomfort. The micelles integrate thermoenabled local deposition and physical retention, pH-responsiv
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to identify ubiquitination-related diagnostic biomarkers in diabetic nephropathy (DN), explore their molecular mechanisms and candidate therapeutic agents, and further validate their expression and functions through experiments conducted in vivo and in vitro. The GSE30122 dataset from the GEO database was used to screen for differentially expressed genes (DEGs). Ubiquitination-related genes (URGs) were derived from the GSEA database. Weighted gene coexpression network analysis (WGCNA) was applied for the identification of ubiquitination-associated gene modules. Least absolute
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cutaneous T-cell lymphoma (CTCL) remains a challenging disease due to its significant heterogeneity, therapy resistance, and relentless progression. Multiomics technologies offer the potential to provide uniquely precise views of disease progression and response to therapy. Here, we present a comprehensive multiomics view of CTCL clonal evolution, incorporating exome, whole-genome, epigenome, bulk, single-cell T-cell receptor, and single-cell RNA sequencing of 99 clinically annotated serial skin, peripheral blood, and lymph node samples from 34 patients with CTCL. We leveraged this extensive d…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Papillary thyroid carcinoma (PTC) is the most common type of primary endocrine malignancy. The tumor immune microenvironment (TIME) and genetic alterations play crucial roles in the progression of PTC. With the advance in research, there has been a heightened focus on re-evaluating molecular targeted therapies and identifying novel targets through molecular biology-based approaches. This study aimed to identify robust prognostic biomarkers and to construct a reliable risk model for patients with PTC by integrating multiomics data.
METHODS: RNA-sequencing (RNA-seq) data from six Ge…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Down syndrome (DS) is the most common genetic cause of intellectual disability, yet the cellular and molecular mechanisms driving this developmental disorder remain unclear. In this study, we profiled human mid-gestation neocortex with snMultiomics across 26 donors. We observed a reduction in neural progenitors and corticothalamic neurons and an increase of intratelencephalic neurons, accompanied by accelerated neuronal specification. We uncovered widespread changes in gene expression, chromatin accessibility, and cell interaction networks affecting neurogenesis, specification, and maturation;…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polycystic ovary syndrome (PCOS) is a common endocrine disorder with developmental origins. While the etiology is unclear, current postulates include epigenetic programming. Cell-type-specific epigenetic changes by which prenatal androgen excess programs the neuroendocrine axis have not been defined. Using single-nucleus (sn) multiome sequencing (single-nucleus ribonucleic acid sequencing [snRNAseq] + single-nucleus assay for transposase-accessible chromatin using sequencing [snATACseq]) of the mouse preoptic area, we profiled transcriptional and chromatin accessibility landscapes across 31 ce
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования