Marburg virus disease (MVD), a deadly zoonotic illness in humans, is caused by the Marburg virus (MARV), a single-stranded RNA virus belonging to the Orthomarburgvirus genus of the Filoviridae family. There are currently no approved vaccines or efficient antiviral therapies for MARV, despite high morbidity and fatality rates of the virus, particularly in Africa. Recognizing its epidemic potential and its inclusion on the WHO list of blueprint priority pathogens, an immunoinformatics approach was used to design novel multi-epitope saRNA vaccine candidates (MB-saVaxI and MB-saVaxII) targeting th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hosta ventricosa, also known as blue plantain lily, is an important traditional herbal medicinal and ornamental plant in China. Prior to this study, no virus has been reported to infect H. ventricosa plants. Based on RNA-seq, transmission electron microscopy, and RT-PCR analyses, we have demonstrated that the H. ventricosa plant showing leaf chlorosis, mottle, mosaic, and crinkling symptoms was co-infected with hosta virus X (HVX) and a novel luteovirus, which we tentatively named hosta ventricosa luteovirus (HVLV). The genome of HVLV is a 5723 nt long, positive-sense, and single-stranded RNA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infectious laryngotracheitis virus (ILTV) causes severe respiratory disease in chickens and results in huge economic losses in the poultry industry worldwide. To correlate the genomic difference with the replication and pathogenicity, phenotypes of three ILTVs isolated from chickens in China from 2016 to 2018 were sequenced by high-throughput sequencing. Based on the entire genome, the isolates GD2018 and SH2017 shared 99.9% nucleotide homology, while the isolate SH2016 shared 99.7% nucleotide homology with GD2018 and SH2017, respectively. Each virus genome contained 82 ORFs encoding 77 kinds
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coronaviruses (CoVs), including severe acute respiratory syndrome CoV and Middle East respiratory syndrome CoV, are enveloped RNA viruses that carry a large positive-sense single-stranded RNA genome and cause a variety of diseases in humans and domestic animals. Very little is known about the host pathways that regulate the stability of CoV mRNAs, which carry some unusual features. Nonsense-mediated decay (NMD) is a eukaryotic RNA surveillance pathway that detects mRNAs harboring aberrant features and targets them for degradation. Although CoV mRNAs are of cytoplasmic origin, the presence of s
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Complete or almost complete hepatitis B virus (HBV) genomes were sequenced for 13 genotype A and 42 genotype D strains from the former USSR. The strains were classifiable within subgenotypes A2, D1, D2 and D3. Comparison of the deduced gene products for the four ORFs of 89 genotype D strains revealed 27 subgenotype-specific residues, and a region spanning residues 58-128 in the spacer region of the P gene could be used to distinguish between D1 and D4. This enabled the allocation to subgenotype of strains with partially sequenced genomes. D2 was dominating, while D3 was found in low frequency
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel porcine gammaherpesvirus was detected in the blood of domestic pigs by PCR. With degenerate-primer PCR and subsequent long-distance PCR approaches a 60-kbp genome stretch was amplified. Sequence analysis revealed the presence of the gammaherpesvirus ORFs 03 to 46 as well as a putative chemokine receptor and a v-bcl-2 gene. The 60-kbp sequence was compared with the corresponding sequence of the porcine lymphotropic herpesvirus 1 (PLHV-1) published recently and the sequence of PLHV-2, which was amplified from porcine tonsil. Considerable sequence differences (amino acid identities: 49-89
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Обязанность к внутриклеточному хламидии разошлась в патогенном и экологическом хламидии 0,7-1,4 миллиарда лет назад. В то время как патогенные хламидии адаптировались к широкому кругу позвоночных, экологические хламидии обитают в одноклеточном амебе, свободном акантамоэбе. Однако вопрос о том, каким образом и почему произошло это расхождение, остается неясным. В то же время были обнаружены гигантские вирусы, состоящие из вирусов протозоа и вирусов, связанных с вирусом протозоа, при этом предполагается, что первая группа в большей степени повлияла на окружающую среду хламидиаи во время их эволю
СтатьяПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human parainfluenza virus type 3 (HPIV3) is a major pediatric respiratory pathogen lacking available vaccines or antiviral drugs. We generated live-attenuated HPIV3 vaccine candidates by codon-pair deoptimization (CPD). HPIV3 open reading frames (ORFs) encoding the nucleoprotein (N), phosphoprotein (P), matrix (M), fusion (F), hemagglutinin-neuraminidase (HN), and polymerase (L) were modified singly or in combination to generate 12 viruses designated Min-N, Min-P, Min-M, Min-FHN, Min-L, Min-NP, Min-NPM, Min-NPL, Min-PM, Min-PFHN, Min-MFHN, and Min-PMFHN. CPD of N or L severely reduced growth i
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytomegaloviruses (CMVs) are highly adapted to their host species resulting in strict species specificity. Hence, in vivo examination of all aspects of CMV biology employs animal models using host-specific CMVs. Infection of rhesus macaques (RM) with rhesus CMV (RhCMV) has been established as a representative model for infection of humans with HCMV due to the close evolutionary relationships of both host and virus. However, the only available RhCMV clone that permits genetic modifications is based on the 68-1 strain which has been passaged in fibroblasts for decades resulting in multiple genom
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Using computer algorithms and commercial DNA synthesis, one or more ORFs of a microbial pathogen such as a virus can be recoded and deoptimized by several strategies that may involve the introduction of up to thousands of nucleotide (nt) changes without affecting amino acid (aa) coding. The synonymous recoding strategies that have been applied to RNA viruses include: deoptimization of codon or codon-pair usage, which may reduce protein expression among other effects; increased content of immunomodulatory CpG and UpA RNA, which increase immune responses and thereby restrict viral replication; a
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The extraordinarily high prevalence of HTLV-1 subtype C (HTLV-1C) in some isolated indigenous communities in Oceania and the severity of the health conditions associated with the virus impress the great need for basic and translational research to prevent and treat HTLV-1 infection. The genome of the virus's most common subtype, HTLV-1A, encodes structural, enzymatic, and regulatory proteins that contribute to viral persistence and pathogenesis. Among these is the p30 protein encoded by the doubly spliced Tax-orf II mRNA, a nuclear/nucleolar protein with both transcriptional and post-transcrip
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Vaccinia virus (VACV)-DUKE was isolated from a lesion on a 54 year old female who presented to a doctor at the Duke University Medical Center. She was diagnosed with progressive vaccinia and treated with vaccinia immune globulin. The availability of the VACV-DUKE genome sequence permits a first time genomic comparison of a VACV isolate associated with a smallpox vaccine complication with the sequence of culture-derived clonal isolates of the Dryvax vaccine.
RESULTS: This study showed that VACV-DUKE is most similar to VACV-ACAM2000 and CLONE3, two VACV clones isolated from the Dryv
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
First reported in 1987, the porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) has significantly disrupted the major regions affected by PRRSV in the pig breeding industry. Recently, outbreaks of disease caused by recombinant PRRSV strains in China have raised serious concerns. Effective immunization and infection control in pig populations is critical, as the virus frequently undergoes mutation and recombination. This study characterized a novel recombinant PRRSV strain, BX/CH/22, isolated from Northeast China. Genetic analysis revealed that BX/CH/22 is a recombinant of JXA1, NADC 30
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Genomic surveillance of positive SARS-CoV-2 samples is important to monitor the genetic changes occurring in virus, this was enhanced after the WHO designation of XBB.1.16 as a variant under monitoring in March 2023. From 5th February till May 6, 2023 all positive SARS-CoV-2 samples were monitored for genetic changes.
METHODS: A total of 1757 samples having Ct value <25 (for E and ORF gene) from different districts of Rajasthan were processed for Next Generation Sequencing (NGS). The FASTA files obtained on sequencing were used for lineage determination using Nextclade and phylogenet
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A family member of inhibitor of apoptosis protein (IAP) termed baculoviral IAP repeat-containing 7 (BIRC7) from channel catfish (Ictalurus punctatus) was identified, the full length cDNA sequence of channel catfish BIRC7 (CcBIRC7) was 1686 bp, containing a 5'UTR of 93 bp, a 3'UTR of 399 bp with a poly (A) tail and an ORF of 1194 bp encoding a putative protein of 398 amino acids. The putative CcBIRC7 protein contains two BIR super-family conservative domains and a C-terminal RING finger motif. Phylogenetic analysis showed that catfish CcBIRC7 was moderately conserved with other BIRC7. Quantitat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) is a typical immunosuppressive virus devastating the global swine industry. DEAD-box helicases (DDXs) are a family of ATP-dependent RNA helicases that are predominantly implicated in modulating cellular RNA metabolism. Meanwhile, a growing number of studies have suggested that some DDXs are associated with innate immunity and virus infection, so they are considered potential antiviral targets. Herein, we screened 40 DDXs and found that ectopic expression of DDX10 exhibited a significant anti-PRRSV effect, while DDX10 knockdown promote
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human roseoloviruses human herpesvirus 6A (HHV-6A), HHV-6B, and HHV-7 comprise the Roseolovirus genus of the human Betaherpesvirinae subfamily. Infections with these viruses have been implicated in many diseases; however, it has been challenging to establish infections with roseoloviruses as direct drivers of pathology, because they are nearly ubiquitous and display species-specific tropism. Furthermore, controlled study of infection has been hampered by the lack of experimental models, and until now, a mouse roseolovirus has not been identified. Herein we describe a virus that causes seve
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Replication-competent poxvirus vectors with an attenuation phenotype and with a high immunogenic capacity of the foreign expressed antigen are being pursued as novel vaccine vectors against different pathogens. In this investigation, we have examined the replication and immunogenic characteristics of two vaccinia virus (VACV) mutants, M65 and M101. These mutants were generated after 65 and 101 serial passages of persistently infected Friend erythroleukemia (FEL) cells. In cultured cells of different origins, the mutants are replication competent and have growth kinetics similar to or slightly
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Seronegative hepatitis--non-A, non-B, non-C, non-D, non-E hepatitis--is poorly characterized but strongly associated with serious complications. We collected 92 sera specimens from patients with non-A-E hepatitis in Chongqing, China between 1999 and 2007. Ten sera pools were screened by Solexa deep sequencing. We discovered a 3,780-bp contig present in all 10 pools that yielded BLASTx E scores of 7e-05-0.008 against parvoviruses. The complete sequence of the in silico-assembled 3,780-bp contig was confirmed by gene amplification of overlapping regions over almost the entire genome, and the vir
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Varicella-zoster virus (VZV) is the only human herpes virus for which a vaccine has been licensed. A clinical VZV isolate, designated the parent Oka (pOka) strain was passed in human and non-human fibroblasts to produce vaccine Oka (vOka). The pOka and vOka viruses exhibit similar infectivity in cultured cells but healthy susceptible individuals given vaccines derived from vOka rarely develop the cutaneous vesicular lesions characteristic of varicella. Inoculation of skin xenografts in the SCIDhu mouse model of VZV pathogenesis demonstrated that vOka had a reduced capacity to replicate in diff
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.