The apicomplexan Cryptosporidium parvum is one of the most prevalent protozoan parasites of humans. We report the physical mapping of the genome of the Iowa isolate, sequencing and analysis of chromosome 6, and approximately 0.9 Mbp of sequence sampled from the remainder of the genome. To construct a robust physical map, we devised a novel and general strategy, enabling accurate placement of clones regardless of clone artefacts. Analysis reveals a compact genome, unusually rich in membrane proteins. As in Plasmodium falciparum, the mean size of the predicted proteins is larger than that in oth
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heat shock protein 60 (hsp60) were isolated from several fungal, protozoal and many bacterial pathogens and successfully used for protective vaccination in some infection models. This work focuses on the isolation of recombinant hsp60 from the dermatophyte, Trichophyton mentagrophytes as a potentially protective antigen in trichophytosis. With the help of a previously tested set of degenerated primers, it was used reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) for isolation of partial cDNA of the hsp60 T. mentagrophytes (labelled hsp60-TM814), which was cloned into cloning vector. Th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Orientia tsutsugamushi is the causative agent of scrub typhus. One of the protein antigens of this species, the conserved 47-kDa protein (HtrA), has been shown to induce an antibody response in patients and can provide protective immunity against live challenge by Orientia in mice. Pepscan experiments identified many peptide epitope clusters in different parts of this protein. The majority of the most reactive epitopes are located at the C terminus of the protein (from amino acid 333 to amino acid 430). Protein sequence analysis revealed that the 47-kDa protein contains a trypsin domain and ha
СтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Culexflavivirus (CxFV) is an insect specific virus that has been isolated from Culexpipiens, Culexquinquefasciatus, Culextritaeniorhynchus and other Culex mosquitoes. It is a novel flavivirus isolated in Asia, North America, Central America and Africa. Phylogenetic analysis indicates that, based on the envelope gene (E gene) sequence, the worldwide CxFV strains can be divided into two genotypes.
RESULT: A virus (SDDM06-11) was isolated from Culexpipiens collected in Shandong Province, China in 2006. The strain caused cytopathic effect (CPE) in Aedesalbopictus (C6/36) cells by 3 da
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During 2009, 616 bats representing at least 22 species were collected from 10 locations throughout Kenya. A new lyssavirus, named Shimoni bat virus (SHIBV), was isolated from the brain of a dead Commerson's leaf-nosed bat (Hipposideros commersoni), found in a cave in the coastal region of Kenya. Genetic distances and phylogenetic reconstructions, implemented for each gene and for the concatenated alignment of all five structural genes (N, P, M, G and L), demonstrated that SHIBV cannot be identified with any of the existing species, but rather should be considered an independent species within
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The aim was to identify the codon usage bias between the newly identified duck plague virus (DPV) UL35 gene (GenBank accession No. EF643558) and the UL35-like genes of 27 other reference herpesviruses.
METHODS: A comparative analysis of the codon usage bias of the 28 herpesviruses was performed by using the CodonW 1.4 program and CUSP (create a codon usage table) program of EMBOSS (The European Molecular Biology Open Software Suite).
RESULTS: The results showed obvious differences of the synonymous codon usage bias in the 28 herpesviruses indicated by the Codon Adaptation Index, e
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The transformer architecture in deep learning has revolutionized protein sequence analysis. Recent advancements in protein language models have paved the way for significant progress across various domains, including protein function and structure prediction, multiple sequence alignments and mutation effect prediction. A protein language model is commonly trained on individual proteins, ignoring the interdependencies between sequences within a genome. However, biological understanding reveals that protein-protein interactions span entire genomic regions, underscoring the limitations of focusin
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The group A Streptococcus (GAS) sof gene encodes the serum opacity factor protein, which is capable of opacifying mammalian sera and binding at least two host proteins, fibronectin and fibrinogen. The sof gene exists in approximately 50% of clinical isolates, and there is a classical association of so-called nephritogenic strains with the opacity factor-positive phenotype. In both a type emm49 strain and a type emm12 strain, the sequences upstream of the 5' end of sof and downstream of the putative terminator were determined to be nearly identical to a region in the M type 1 genome approximate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
alpha-L-Iduronidase (IDUA; EC 3.2.1.76) is a lysosomal hydrolase in the metabolic pathway responsible for the degradation of the glycosaminoglycans heparan sulfate and dermatan sulfate. A deficiency of IDUA in humans leads to the accumulation of these glycosaminoglycans and results in the lysosomal storage disorder mucopolysaccharidosis type I. We have isolated and sequenced cDNA clones containing part of the human IDUA coding region and used PCR from reverse-transcribed RNA to obtain the full IDUA sequence. Analysis of the predicted 653-amino acid precursor protein shows that IDUA has a 26-am
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chikungunya fever (CHIKF) is an acute febrile illness caused by a mosquito-borne alphavirus, chikungunya virus (CHIKV). This disease re-emerged in Kenya in 2004, and spread to the countries in and around the Indian Ocean. The re-emerging epidemics rapidly spread to regions like India and Southeast Asia, and it was subsequently identified in Europe in 2007, probably as a result of importation of chikungunya cases. On the one hand, chikungunya is one of the neglected diseases and has only attracted strong attention during large outbreaks. In 2008-2009, there was a major outbreak of chikungunya f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We screened a phage library of Rickettsia typhi with a polyclonal antiserum to clone genes which encode immunogenic proteins of R. typhi. Among several clones obtained, one clone codes for a 466-amino-acid protein similar to the heat-shock protein, HtrA. The deduced rickettsial HtrA contains a putative signal peptide sequence at the N-terminus, a serine protease-like domain, and two PDZ domains. The recombinant protein of rickettsial HtrA reacted with sera from patients with murine typhus and tsutsugamushi disease. We suggest that this gene and its recombinant protein would be valuable for the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cases of canine rabies continue to occur in North and Northeast Brazil, and the number of notifications of rabies cases in wild canids has increased as a result of the expansion of urban areas at the expense of areas with native vegetation. In light of this, we performed molecular characterization of rabies virus isolates from dogs and Cerdocyon thous from various states in North and Northeast Brazil. In all, 102 samples from dogs (n = 56) and Cerdocyon thous (n = 46) collected between 2006 and 2012 were used. The nucleotide sequences obtained for the N gene of rabies virus were analyzed, and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Polymorphic bases in several exons of the BCR gene have been found in several studies of the BCR-ABL fusion gene . Most of the polymorphisms do not have any implications for the primary structure of the BCR-ABL protein. Nucleotide changes are often located in the area close to the fusion region, and therefore may influence primer annealing. Our previous work failed to amplify 15 of 200 samples from BCR-ABL positive chronic myelogenous leukemia (CML) patients using multiplex PCR, the standard method to detect BCR-ABL transcripts used in our institution. The failure was considered du
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Snake Venom Metalloproteinases (SVMPs) are the most abundant components present in Viperidae venom. They are important in the induction of systemic alterations and local tissue damage after envenomation. In the present study, a metalloproteinase named BpMPI was isolated from Bothropoides pauloensis snake venom and its biochemical and enzymatic characteristics were determined. BpMPI was purified in two chromatography steps on ion exchange CM-Sepharose Fast flow and Sephacryl S-300. This protease was homogeneous on SDS-PAGE and showed a single chain polypeptide of 20kDa under non reducing condit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have isolated a full-length cDNA clone of 2.2 kb from a lambda ZapII NBL-1 (bovine renal epithelial cell) cDNA library using a portion of the rat renal sodium-dependent phosphate transporter cDNA as a probe. Expression of this cDNA clone in the COS cell line has shown it to specifically encode a sodium-dependent phosphate transporter from bovine renal epithelial cells. Sequence analysis of the clone showed a single open reading frame of 693 amino acids which has 70% similarity to the phosphate transporter of rat and human kidney [Magagnin, S., Werner, A., Markovich, D., Sorribas, V., Stange
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In North America, tick-borne relapsing fever is caused by the species Borrelia hermsii, B. parkeri, and B. turicatae, which are transmitted to humans through the bite of the respective infected tick vectors. Here we describe the identification and functional characterization of a surface lipoprotein of B. parkeri, designated BpcA, that binds the human complement regulators factor H and factor H-related protein 1 and, simultaneously, the host protease plasminogen. In contrast, the homologous B. turicatae protein failed to bind human factor H and factor H-related protein 1 but retained its plasm
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Regulators of G protein signaling (RGS) proteins modulate the physiologic actions of many neurotransmitters, hormones, and other signaling molecules. Human RGS proteins comprise a family of 20 canonical proteins that bind directly to G protein-coupled receptors/G protein complexes to limit the lifetime of their signaling events, which regulate all aspects of cell and organ physiology. Genetic variations account for diverse human traits and individual predispositions to disease. RGS proteins contribute to many complex polygenic human traits and pathologies such as hypertension, atherosclerosis,
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gene encoding a protein that reacted with antibodies specific for Legionella pneumophila macrophage infectivity potentiator (LpMip) was cloned from Coxiella burnetii, the obligate intracellular rickettsia that causes Q fever in humans. Nucleotide sequencing analysis revealed an ORF encoding a gene product of 230 amino acids with a molecular mass of 25.5 kDa and a predicted pI of 10.7. The predicted amino acid sequence from the ORF shows similarity with Mip/Mip-like proteins of Legionella (46%) and Chlamydia (30%). Moreover, like LpMip, the amino acid sequence of the C terminus of this prot
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spider venoms are composed of hundreds of proteins and peptides. Several of these venom toxins are cysteine-rich peptides in the mass range of 3-9 kDa. Small peptides (<3 kDa) can be fully characterized by mass spectrometry analysis, while proteins are generally identified by the bottom-up approach in which proteins are first digested with trypsin to generate shorter peptides for MS/MS characterization. In general, it is sufficient for protein identification to sequence two or more peptides, but for venom peptidomics it is desirable to completely elucidate peptide sequences and the number of d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spider venoms are composed of hundreds of proteins and peptides. Several of these venom toxins are cysteine-rich peptides in the mass range of 3-9 kDa. Small peptides (<3 kDa) can be fully characterized by mass spectrometry analysis, while proteins are generally identified by the bottom-up approach in which proteins are first digested with trypsin to generate shorter peptides for MS/MS characterization. In general, it is sufficient for protein identification to sequence two or more peptides, but for venom peptidomics it is desirable to completely elucidate peptide sequences and the number of d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования