The Schistosoma mansoni genome sequencing consortium has recently released the latest versions of the genome assembly as well as an automated preliminary gene structure annotation. The combined datasets constitute a vast resource for researchers to exploit in a variety of post-genomic studies with an emphasis of transcriptomic and proteomic tools. Here we present an innovative method used for combining diverse sources of evidence including ab initio gene predictions, protein and transcript sequence homologies, and cross-genome sequence homologies between S. mansoni and Schistosoma japonicum to
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wiskott-Aldrich syndrome (WAS) is an X-linked disease characterized by thrombocytopenia, eczema and immunodeficiency of varying severity. The WASP gene, mutations of which are responsible for the phenotype, maps to Xp11.23. We describe here a patient with a large deletion in the Xp11.23 region. The deletion, which totals 15.8 kb, begins downstream of DXS1696 and encompasses 13 kb upstream of WASP and includes the distal and proximal promoters and exons 1-6. Analysis of the 5'-boundary region identified sequences missing in the Human Genome database and, as a result, the normal DNA sequence was
Клинический случайСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To determine the DNA sequence of polymerase chain reaction (PCR) products obtained from surgical specimens of patients with severe vulvar vestibulitis, in order to identify and type the human papillomavirus (HPV)-DNA associated with vulvar vestibulitis.
STUDY DESIGN: Fifty three women, referred for dyspareunia and diagnosed as having severe vestibulitis, underwent perineoplasty operation consisting of surgical removal of the sensitive vestibule. PCR analysis using L1 HPV primer was performed, and DNA sequencing of the samples that were found to contain HPV-DNA was undertaken, using
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A cDNA clone encoding a muscarinic acetylcholine receptor (mAChR) has been isolated from the nematode Caenorhabditis elegans. The nematode mAChR, consisted of 585 amino acids, displays a high degree of amino acid sequence homology to other invertebrate and vertebrate mAChRs. Excluding a highly variable middle portion of the third intracellular loop, the C. elegans mAChR shares about 51% amino acid sequence identity with a Drosophila mAChR and 42-44% identity with human m1-m5 mAChR subtypes. Comparison of the cDNA sequence with the corresponding genomic sequence reveals that the C. elegans mACh…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The N-terminal sequence of the competitive and slow tight-binding factor Xa inhibitor (fXaI; Ki = 0.83 +/- 0.10 nM) isolated from the salivary glands of Ornithodoros savignyi ticks (Acari: Argasidae) was employed to design a degenerate gene-specific primer (GSP) for 3'-rapid amplification of cDNA ends (3'-RACE). The primer consisted of a sequence encoding for amino acid residues 5-11. A full-length gene was next constructed from the 3'-RACE product in a two-step PCR procedure and successfully expressed by the BAC-TO-BAC baculovirus expression system. The deduced amino acid sequence of the gene
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A platelet glycoprotein IIb-IIIa (GP IIb-IIIa) antagonist, salmosin, was purified to homogeneity from Korean snake (Agkistrodon halys brevicaudus) venom by means of chromatographic fractionations. We have isolated the cDNA encoding salmosin by using the cDNA library of the snake venom gland and analyzed its complete nucleotide sequence. The molecular identity was confirmed by comparison of the deduced amino acid sequence with the directly determined primary structure of salmosin. This protein is a single-chain polypeptide composed of 73 amino acids including 12 cysteines as well as the sequenc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleotide sequence polymorphisms in the von Willebrand factor (vWF) gene are useful for genetic studies in von Willebrand disease (vWD). This database describes 33 known vWF polymorphisms distributed throughout the vWF gene. DNA sequence information is available for 21 of these sites. The most informative system is a tetranucleotide repeat polymorphism in vWF intron 40. Sixteen of these polymorphisms are within vWF exons, and approximately half of them also alter the encoded amino acid sequence. Many occur close to mutations that cause vWD. The high prevalence of vWF polymorphisms must be con
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zhonghua shi yan he lin chuang bing du xue za zhi = Zhonghua shiyan he linchuang bingduxue zazhi = Chinese journal of experimental and clinical virology2001chi
OBJECTIVE: To study the relationship between presence of HPV DNA related sequence and cellular-immune responses in patients with condyloma acuminata (CA).
METHODS: HPV DNA related sequences in biopsy material of 30 CA patients were determined by using Southern blot hybridization, and typed according to the restricted fragment length polymorphism (RFLP) analysis. At the same time, the T-cell subpopulations in peripheral blood of 30 patient with CA were also measured by using anti-CD3, CD4, CD8 monoclonal antibody labeled SERC direct rosette assay.
RESULTS: HPV DNA positive results were reveal
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A gene of unknown function, Gohir.A02G131900.1, identified in Gossypium hirsutum was studied using computational sequence and structure bioinformatic tools. The encoded protein GhGH5BG-A0A1U8NW40 (UniProt A0A1U8NW40) is predicted to be secreted and localized to the cell wall. Homology and conserved residues indicate it belongs to a plant-specific subgroup of the glycoside hydrolase family 5 and likely has exo-1,3-β-glucosidase activity. This subgroup is unique in containing a fascin-like domain which may have evolved a unique glucan binding site of interest for further research.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parasites of deep-water fishes are less known in comparison to the parasites of fishes living in the demersal and epipelagic ocean zones. In the present research note we report the occurrence of larval trypanorhynch cestodes in a rare deep-water fish, the deep-water brotula, Cataetyx laticeps. Based on the 28S rDNA (region D1-D3) sequence homology and the phylogenetic analysis, the larval cestodes are putatively assigned to the genus Grillotia. It is suggested that the definitive host of this trypanorhynch is a batoid.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 5-year-old male Siberian husky bred outdoor in Tokyo had a swollen paw with interdigital granulomatous lesions in the left hindlimb. The dog had no apparent pulmonary or gastrointestinal involvement. Histopathological analysis of the skin lesions demonstrated yeast-like organisms predominantly within macrophages. Sequence analysis of fungal ribosome RNA gene isolated from a paraffin sample revealed a 100% homology with the teleomorph of Histoplasma capsulatum. The present case may support the concept of primary cutaneous canine histoplasmosis as an endemic phenotype recognized in Japan.
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in a conserved non-coding region in intron 5 of the Lmbr1 locus, which is 1 Mb away from the sonic hedgehog (Shh) coding sequence, are responsible for mouse and human preaxial polydactyly with mirror-image digit duplications. In the mouse mutants, ectopic Shh expression is observed in the anterior mesenchyme of limb buds. Furthermore, a transgenic reporter gene flanked with this conserved non-coding region shows normal polarized expression in mouse limb buds. This conserved sequence has therefore been proposed to act as a long-range, cis-acting regulator of limb-specific Shh expressi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The gene knockout technique is important in xenotransplantation research. Herein we have described the molecular cloning of two genes that are candidates to overcome the poor rate of homologous recombination.
METHODS: Candidate cDNA fragments were amplified by polymerase chain reaction (PCR) with the corresponding primer sets deduced from a multiple alignment analysis of other mammalian genes from a cDNA library prepared from pig spleen tissue. To obtain the full-length cDNA, a 5'- and 3'-RACE PCR experiments was performed.
RESULTS: We successfully isolated the cDNA sequences of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genome of the Lymantria dispar multinucleocapsid nucleopolyhedrovirus (LdMNPV) was sequenced and analyzed. It is composed of 161,046 bases with a G + C content of 57.5% and contains 163 putative open reading frames (ORFs) of >/=150 nucleotides. Homologs were found to 95 of the 155 genes predicted for the Autographa californica MNPV (AcMNPV) genome. More than 9% of the LdMNPV genome was occupied by 16 repeated genes related to AcMNPV ORF2. Readily identifiable homologs of several genes that have been reported to play important roles in the AcMNPV life cycle are not present; these include ie
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The nucleotide sequence of the inversion region responsible for flagellar phase variation in Salmonella was determined. The inversion region is 995 base pairs (bp) in length and is bounded by a 14-bp inverted repeat sequence. A homologous recombination event between the 14-bp inverted repeat sequences would result in the inversion of the DNA segment between them. Sequence homologies with other systems suggest that the 14-bp inverted repeat sequences may have some general significance as sites for specific recombinational events. The gene which specifies H2 flagellin synthesis begins 16 bp outs
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcal M protein, a dimeric alpha helical coiled-coil molecule, is an antigenically variable virulence factor on the surface of the b … tly apolar residues. Based on the differences in the heptad pattern of apolar residues and internal sequence homology, the central coiled-coil rod domain of M protein could be further divided into three subdomains I, II, and III. The streptococcal sequelae rheumatic fever (RF) and acute glomerulonephritis (AGN) have been known to be associated with distinct serotyp …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite the diversity of Escherichia coli pathotypes, there are many virulence genes common to isolates from food animals and humans, suggesting that opportunity exists for genetic exchange between human and animal isolates to create the next emerging, foodborne pathogen. Hemolytic activity in E. coli has been attributed to hemolysin genes found in either uropathogenic or enterohemorrhagic E. coli. These E. coli hemolysins are classified as RTX toxins due to a repetitive toxin domain and similar gene organization, sequence homology, and mechanism of action and presence in animal and human E. c…
СтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acid phosphatase (AcP, EC 3.1.3.2) is represented by a number of enzymes that can be differentiated according to structural and immunologica … mRNA species have been reported. This notion of a single TRAP gene is supported by the substantial sequence homology found among the various TRAPs from human tissues and from animal sources (e.g. bovine spleen and bone; rat spleen, bone and epidermis; pig uterus). The latter enzyme preparations of animal origin have been described for many years as the purple acid …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primers based on sequences flanking the vaccinia virus (VV) strain IHD hemagglutinin protein (HA) open reading frame (ORF) enabled amplification of HA DNA segments from the genome of raccoon poxvirus (RCN) and VV strain WR. The amplified segments produced unequal cross-hybridization signal intensities against each other, indicating sequence differences between the HA of RCN (in HindIII-G) and that of VV-WR (in HindIII-A). About 1.5 kb of sequences in the HA region were then determined from clones pRCN/HindIII-G and pVV/BamHI-32, a subclone of VV-WR HindIII-A. Pairwise analyses of the RCN and V
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Japanese frog Glandirana rugosa, endemic to Japan, exhibits both XY and ZW sex determination systems in different populations, representing a rare example of sex chromosome turnover within a single species. To explore the genetic basis of this phenomenon, we analyzed the X, Y, Z, and W chromosomes using microdissection followed by next-generation sequencing. All chromosomes originated from chromosome 7, and the sex chromosomal sequences were homologous. Comparative analyses revealed a high degree of sequence similarity between the Y and Z chromosomes. This suggests that the Y and Z chromos
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования