Atrazine (ATR) is a globally prevalent herbicide linked to increased risks of cognitive impairment and neurodegeneration, but its molecular mechanism remains unclear. This study integrates bioinformatics, machine learning, and experimental validation to elucidate ATR induced Alzheimer's disease (AD)-like pathology. We combined predicted ATR targets with AD brain transcriptomics, identifying 32 shared genes enriched in neurodegeneration and synaptic signaling pathways. We constructed a diagnostic model using 14 machine learning algorithms; the ensemble model achieved an improved AUC of 0.891 in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite their huge technological interest, practical application of MXene nanomaterials is somehow hampered by their potential toxicity. In this regard, the present work showcases the design and implementation of a full in-silico methodology for the toxicological analysis of nanoparticles (NPs) of two MXenes within a human cell environment, employing cost-effective computational approaches to achieve a preliminary hazard estimation in the absence of experimental data. This study combines computational methodologies of very different nature, from Density Functional Theory (DFT) calculations for
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiovascular thromboses bring heavy global health burdens, while traditional screening of food-derived antithrombotic peptides is inefficient. This work built an integrated pipeline integrating de novo peptide generation, hybrid LSTM-GCN deep learning, and molecular simulations, screening 15,000 sequences to obtain lead peptide FPGGIP. It had a binding affinity of -6.4 kcal/mol and a stable thrombin complex (RMSD = 1.42 Å), acting as a competitive thrombin inhibitor (IC50 = 14.3 μM). FPGGIP exerted ex vivo anticoagulation, suppressed vascular smooth muscle proliferation, relieved oxidative s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alternative splicing is a key mechanism that expands transcriptomic and proteomic diversity; however, its contribution to the functional complexity of many genes remains poorly understood. RAB8B, a member of the Rab family of small GTPases, plays an important role in intracellular vesicle trafficking and membrane dynamics, yet little is known about its alternatively spliced variants.
METHODS AND RESULTS: In this study, we combined in silico analyses with experimental validation to identify and characterize novel transcript variants of the human RAB8B gene. Bioinformatic analysis i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Agrochemical seed coatings are widely used to control soil-borne pathogens. However, their unintended ecological effects on rhizosphere interactions and plant health remain unclear. Here, we combined a field transplantation trial, multi-omics analyses, and molecular docking to investigate the effects of fungicide-based seed coatings on the rhizosphere microecology of Fritillaria cirrhosa.The field trial showed that coating treatment unexpectedly increased bulb rot incidence by 2.8-fold compared with untreated controls (P < 0.001). Multi-omics analyses further indicated that coating application
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein language models, as well as models that incorporate structural information or homologous sequences, estimate the sequence likelihood p(sequence), which reflects the protein fitness landscape and is commonly used in mutation effect prediction and protein design. It is widely believed in deep learning field that larger models perform better across tasks. However, for fitness prediction, language model performance declines beyond a certain size, raising concerns about their scalability. Here we showed that model size, training dataset and stochastic elements can bias the predicted p(seque
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The development and progression of bladder cancer are closely linked to its complex tumor microenvironment. Hedyotis diffusa and Scutellaria barbata (HD-SB) are commonly used as a prominent herbal pair for treating bladder cancer. However, the pharmacological targets and molecular mechanisms by which HD-SB impacts bladder cancer require further elucidation. Additionally, it remains uncertain whether this herbal pair affects the prognosis and treatment efficacy of bladder cancer. METHODS: We employed network pharmacology to predict the targets of HD-SB and bladder cancer, identifyin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The re-emergence of orthopoxviruses, most notably mpox virus (MPXV), poses a growing global public health threat. Well-characterised murine anti-orthopoxvirus antibodies are clinically limited by anti-mouse antibody responses, while traditional sequence-based humanisation often impairs antigen-binding activity.
METHODS: We developed an experimentally validated structure-guided computational humanisation framework prioritising 3D architectural congruence over sequence identity, integrating Foldseek-based structural alignment and interface-residue constraints. We applied this framew
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Detecting signals of polygenic adaptation remains a significant challenge in population genomics, as traditional methods often struggle to identify the associated subtle, multi-locus allele-frequency shifts. Here, we introduced and tested several novel approaches combining machine learning techniques with traditional statistical tests to detect polygenic adaptation patterns in time-series of allele frequency changes from whole genome data. We implemented a Naive Bayesian Classifier (NBC) and One-Class Support Vector Machines (OCSVM), and compared their performance against the class
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aims to elucidate the potential roles of commonly used plasticizers, including Diethyl Phthalate (DEP), Dimethyl Phthalate (DMP), and Dioctyl Phthalate (DOP), in the pathogenesis of Acute Myeloid Leukemia (AML). The focus is to highlight the complex interactions between these environmental chemicals and key molecular pathways involved in tumorigenesis. We employed network toxicology and molecular docking techniques to analyze the interactions between plasticizers and key proteins associated with AML. Utilizing databases such as The Cancer Genome Atlas (TCGA), we divided selected key
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polycystic ovary syndrome (PCOS) is a prevalent endocrine and metabolic disorder characterised by heterogeneous clinical and molecular phenotypes. Flaxseed, widely used in traditional Chinese medicine and as a nutritional supplement, has shown promising therapeutic potential for PCOS. In this study, we integrated transcriptomic data with machine learning-based analytical approaches and network pharmacology to investigate the molecular mechanisms underlying PCOS and to identify the potential targets and pathways modulated by flaxseed. Differentially expressed genes (DEGs) and PCOS-related targe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Citrus fruits, known for their vibrant flavours and health benefits, are susceptible to fungal attacks, particularly from toxigenic Penicillium fungi, which pose a significant pre- and post-harvest hazard. However, aromatic oils and their nanoparticles may effectively address this issue. Marjoram and fennel oils, alongside their nanoparticles, were extracted, and their aromatic constituents and antimicrobial activities were evaluated. A simulated medium with fungal spores was used to assess anti-toxigenic activity, and a simulated infection experiment was conducted with orange and lemon fruits
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD) is a global health challenge characterized by complex pathogenesis and limited therapeutic options. Emerging evidence highlights PANoptosis-a coordinated interplay of pyroptosis, apoptosis, and necroptosis-as a critical driver of metabolic and immune dysregulation in NAFLD. Here, we integrated multiple datasets and interpretable machine learning to unravel the role of PANoptosis in NAFLD diagnosis, subtyping, and immune microenvironment remodeling. By intersecting differentially expressed genes and PANoptosis-related genes, we identified 9 hub genes (e
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The worldwide increase in antifungal resistance, particularly in Candida sp., requires the exploration of novel therapeutic agents. Natural compounds have been a rich source of antimicrobial molecules, where peptides constitute the class of the most bioactive components. Therefore, this study looks into the target-specific binding efficacy of insect-derived antifungal peptides (n = 37) as possible alternatives to traditional antifungal treatments. Using computational methods, namely the HPEPDOCK and HDOCK platforms, molecular docking was performed to evaluate the interactions between selected
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Poultry industry worldwide: Newcastle Disease (ND) is highly contagious poultry viral disease posed a major threat to the poultry industry due to millions of deaths worldwide. Newcastle Disease Virus (NDV) cause recurrent epidemics due to its rapid genomic evolution. In this study, we developed an in silico vaccine against all NDV strains using matrix protein. A reverse vaccinology approach was employed to develop the vaccine. B- and T- cell epitopes that were antigenic, virulent, non-allergenic and MHC alleles binders were selected and linked via linkers. To enhance the immunogenicity EAAAK a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Depression in patients with prostate cancer (PC) has become a significant public health issue. Given the high treatment failure rate and short life expectancy of patients with castration-resistant prostate cancer (CRPC), their risk of developing major depressive disorder (MDD) is significantly increased. However, the exact mechanisms of comorbidity between CRPC and MDD are not yet clear, and there is a lack of standardized intervention strategies to address this clinical issue. This study used bioinformatics methods combined with Mendelian randomization (MR) analysis to explore the molecular m
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing prevalence of type 2 diabetes has driven an increasing demand for safe and effective α-glucosidase inhibitors (AGIs). Given prior findings of α-glucosidase inhibitory activity in Paenibacillus spp., this study aims to evaluate the biosynthetic capacity and inhibitory potential of Paenibacillus sp. JNUCC 31. Genomic annotation of the strain JNUCC 31 revealed multiple biosynthetic gene clusters associated with secondary metabolite biosynthesis. Fatty acid profiling initially identified anteiso-C15:0 (57.32%) as the dominant fatty acid via GC-MS. Subsequently, the ethyl acetate ext
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study evaluated the antioxidant properties, phytochemical content, and protein interactions of Tamarix smyrnensis flower extracts prepared with different solvents (methanol, ethanol, ethyl acetate). The antioxidant activities were assessed using the DPPH, metal chelation, and CUPRAC assays. Ethanol extracts exhibited the strongest radical scavenging activity (IC50 = 25.15 µg/mL), while methanol extracts showed superior metal chelation (49.84 mg/mL) and reducing power (IC50 = 35.95 µg/mL). HPLC analysis identified key bioactive compounds, with p-coumaric acid, catechin, and gallic acid bei
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Efficient C1 utilization relies on glycolaldehyde (GALD) as a key intermediate, typically formed via condensation of two formaldehyde (FALD) molecules catalyzed by glycolaldehyde synthase (GALS). While catalytic activity improvements have been achieved, limited attention to thermal stability has constrained industrial application. Building on the high catalytic efficiency (153.3 M-1·s-1) variant GALS M3 (T87A/A416T/W463I), we applied computer-aided design strategy to further enhance enzyme stability. After two rounds of systematic protein engineering, variant GALS M5 (GALS M3-A381P/K290P) was
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the increasing prevalence of environmental pollutants, there is growing concern about the potential effects of these substances in major diseases such as liver cancer. Previous studies have suggested that various chemicals, such as benzo[a]pyrene(BaP), produced by burning carbon containing fuels, may negatively affect liver health, but the exact mechanisms remain unclear. This study aimed to explore the potential molecular mechanisms of BaP in the progression of liver cancer. Through an exhaustive study of databases such as ChEMBL, SwissTargetPrediction, STITCH and TCGA, we identified 169
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования