Quantifying the spatial distribution of microRNAs (miRNAs) within plant tissue is critical for deciphering cell-specific gene-regulatory pathways. While numerous miRNAs are involved in plant response pathways, traditional spatial miRNA detection techniques are limited to simultaneously profiling two miRNAs with a limited dynamic range. We introduce an advanced spatial profiling approach using multispectral imaging in which miRNAs are uniquely identified with spectrally distinct, minimally overlapping fluorophores. Spectral multiplexing is performed using functionalized DNA probes fixed within
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudouridine (Ψ) is a prevalent RNA modification whose site-resolved quantification is critical for understanding epitranscriptomic regulation. We present pseU-SCOPE, a ligation-assisted rolling circle amplification (RCA) assay that converts a bisulfite-derived Ψ signature into a padlock-probe ligation gate, enabling single-nucleotide resolution without qPCR. The workflow supports fluorescence and gel-based, naked-eye readouts following RCA and operates with low RNA input. We validate pseU-SCOPE on established Ψ sites across human rRNAs and mitochondrial tRNAs, generate calibration curves for
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA degradation by nucleases is central to genome maintenance, immune defense, and the clearance of extracellular DNA, yet its execution at the single-molecule level remains poorly defined. Here, we use high-speed atomic force microscopy (HS-AFM) to directly visualize the real-time dynamics of DNA digestion by DNase I at nanometer resolution. DNase I repeatedly revisits structurally strained DNA regions before cleavage initiation, revealing a topology-sensitive mode of interaction that is inaccessible to ensemble biochemical approaches. Time-resolved imaging further uncovers a multistep degrad
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Australian Plague Locust (APL), Chortoicetes terminifera, the most important pest locust in Australia, can cause significant damage to crops and grasslands when present in high numbers. We have developed a new LAMP (loop-mediated isothermal amplification) assay specifically targeting APL for rapid diagnostics to support locust management. We tested five DNA extraction methods for potential near-field use and designed an APL gBlock as a synthetic positive control. The performance of new LAMP assay was assessed against a panel of eleven closely related Australian grasshopper species (family
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Magnesium ions (Mg2+) play a crucial role in stabilizing various RNA tertiary motifs, such as pseudoknots, G-quadruplexes, kissing loops, and A-minor motifs, to name a few. Despite their importance, the precise location and role of Mg2+ ions in RNA folding are challenging to characterize both experimentally and computationally. In this study, we employ an all-atom structure-based model integrated with the dynamic counterion condensation (DCC) model to investigate the folding and unfolding transitions of apo SAM-II riboswitch RNA at physiological concentrations of Mg2+. Using the Energy Landsca
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BaseScope is an ultra-sensitive in situ hybridization technique specifically designed for detection of rare, short RNA molecules, particularly enabling co-detection of exon junctions in splice variants. Its use is cost intensive due to required protocol optimization for each tissue, especially when target expression is very low. Here, we present a protocol to validate functionality of custom-designed BaseScope probes by utilizing cell-free synthesized protein lysates and in vitro-transcribed purified mRNA as positive controls. We detail steps for slide preparation, probe hybridization, signal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aptamers bind to their targets with exceptional affinity and specificity. However, their intracellular application is hampered by the lack of knowledge about the effect of the cellular milieu on the RNA structure/stability. In this study, cellular crowding was mimicked using polyethylene glycol (PEG), and the crucial role of Mg2+ ions in stabilizing the structure of an RNA aptamer was investigated. Increasing the concentration of Mg2+ or PEG increased the thermal stability of the aptamer. The crowding effect lowered the requirement of the Mg2+ ion to form the binding-competent conformer of the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
GenBank entries of pathogenetic viral sequences are typically annotated with host species and epidemiological metadata. However, linking these entries to their corresponding published studies remains labor-intensive. We developed GenBank2PubMed, a computation pipeline that integrates GenBank sequence data with metadata from published studies. The pipeline aggregates GenBank entries into submission sets based on shared authorship, title similarity, submission dates, and the sequential nature of their accession numbers. Using automated methods, including GPT-4, we linked these submission sets to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell-free DNA (cfDNA) has emerged as a pivotal biomarker with significant implications across medical fields, including non-invasive prenatal testing and oncology. As cfDNA reflects the physiological and pathological states of the body, a detailed understanding of the biology of cfDNA, including the origins, production, circulation, and clearance, is crucial for advancing its diagnostic applications. This review offers a detailed account of the current understanding of the biology of cfDNA, integrating findings to explore mechanistic insights underlying the production and clearance of cfDNA. W
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic Lupus Erythematosus (SLE) is a chronic inflammatory autoimmune disease characterized by multi-organ damage, a complex interplay of immune dysregulation, and antibodies against nuclear macromolecules like DNA. Among these, anti-dsDNA antibodies are not only crucial diagnostic markers but also active participants in disease pathogenesis, forming immune complexes that deposit in various tissues and trigger inflammation. Emerging research has highlighted the critical role of Deoxyribonuclease 1-Like 3 (DNASE1L3), a secreted endonuclease, in maintaining homeostasis of cell-free DNA (cfDNA)
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNA (miRNA) is involved in the progression of Alzheimer's disease (AD) and emerges as a promising AD biomarker and therapeutic target. Therefore, there is an urgent need to develop convenient and precise miRNA detection methods for AD diagnosis. Herein, a dual-signal amplification strategy based on rolling circle amplification and APE1-assisted amplification for miRNA analysis for early diagnosis of AD was proposed. The strategy consisted of dumbbell-shaped probe (DP) as amplification template and a reporter probe (RP) with an AP site modification. In the presence of the target miRNA, the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycoplasma pneumoniae can cause respiratory infections and pneumonia, posing a serious threat to the health of children and adolescents. Early diagnosis of Mycoplasma pneumoniae infection is crucial for clinical treatment. Currently, diagnostic methods for Mycoplasma pneumoniae infection include pathogen detection, molecular biology techniques, and bacterial culture, all of which have certain limitations. Here, we developed a rapid, simple, and accurate detection method for Mycoplasma pneumoniae that does not rely on large equipment or complex operations. This technology combines the CRISPR-Ca
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The diagnostic tool for identifying cystic echinococcosis (CE) patients at an early stage is currently lacking. However, circulatory cell-free DNA (cfDNA) has shown potential as a biomarker for parasitic infections and could be used for diagnosing CE.
RESEARCH DESIGN AND METHODS: The plasma and urine samples were collected from 39 patients with confirmed CE through imaging and histopathological techniques. All plasma samples were tested for anti-echinococcal antibodies using a commercial ELISA test. Total plasma and urine cfDNA were extracted and an in-house PCR assay was develope
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mosquito-borne flaviviruses including dengue, Zika, yellow fever, and regional encephalitis produce a large amount of short subgenomic flaviviral RNAs during infection. A segment of these RNAs named as xrRNA1 features a multi-pseudoknot (PK)-associated structure, which resists the host cell enzyme (XRN1) from degrading the viral RNA. We investigate how this long-range RNA PK folds in the presence of counterions, specifically in a mix of monovalent (K+) and divalent (Mg2+) salts at physiological concentrations. In this study, we use extensive explicit solvent molecular dynamics (MD) simulations
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: S. pyogenes, is a primary pathogen that leads to pharyngitis and can also trigger severe conditions like necrotizing fasciitis and streptococcal toxic shock syndrome (STSS), often resulting in high mortality rates. Therefore, prompt identification and appropriate treatment of S. pyogenes infections are crucial in preventing the worsening of symptoms and alleviating the disease's impact.
RESULTS: In this study, a newly developed technique called multiple cross displacement amplification (MCDA) was employed to detect S. pyogenes,specifically targeting the speB gene, at a temperature
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Leptospirosis is an important zoonotic infection worldwide. Diagnosis of leptospirosis is challenging given its nonspecific clinical symptoms that overlap with other acute febrile illnesses and limitations with conventional diagnostic testing. Alternative advanced diagnostics, such as microbial cell-free DNA (mcfDNA), are increasingly being used to aid in the diagnosis of infections and can be applied to pathogens with public health importance such as Leptospira , a nationally notifiable disease.
METHODS: The Karius Test uses plasma mcfDNA sequencing to detect and quantify DNA-bas
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Malignant lymphomas represent a highly heterogeneous group of tumors with varied clinical behavior - from indolent to very aggressive forms with survival in the order of months. From the very beginning, these diseases are considered systemic, often occurring in several anatomical locations simultaneously. However, diagnosis and exact classification are usually inferred from a bio-psy of a single pathological lymph node or infiltrate, even though clinical experience shows that the bio-logical behavior of lymphoma is not necessarily identical across anatomical locations. In an effort
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
At present, the conventional method for detecting COVID-19 infection is reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) performed on nasopharyngeal and pharyngeal swabs. In addition, other detection techniques such as isothermal nucleic acid amplification, enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) have also been proposed and are being used. However, these techniques are limited to central hospitals and pathologies. Point-of-care solutions may play an important role in rapid and timely detection by an individual at their doorstep. In addition, the disease adversely affects the function
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Timely diagnosis remains an unmet need in non-neutropenic patients at risk for aspergillosis, including those with COVID-19-associated pulmonary aspergillosis (CAPA), which in its early stages is characterized by tissue-invasive growth of the lungs with limited angioinvasion. Currently available mycological tests show limited sensitivity when testing blood specimens. Metagenomic next-generation sequencing (mNGS) to detect microbial cell-free DNA (mcfDNA) in plasma might overcome some of the limitations of conventional diagnostics. A two-center cohort study involving 114 COVID-19 intensive care
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SARS-CoV-2 genetic sequence results collected from native COVID-19 cases who waited or saw relatives off at Xi'an Xianyang International Airport were highly consistent with the imported cases. In order to explore the routes of transmission and influencing factors that may cause the transmission of SARS-CoV-2 at the airport, a field simulation experiment of aerosol diffusion was adopted based on epidemiological survey data and a detailed field investigation of airport structure and ventilation. The results showed that the inbound passengers waited for approximately 3 h in the rest area on the f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования