UNLABELLED: The VirB protein, encoded by the large virulence plasmid of Shigella spp., is a key transcriptional regulator of virulence genes. Without a functional virB gene, Shigella cells are avirulent. On the virulence plasmid, VirB functions to offset transcriptional silencing mediated by the nucleoid structuring protein, H-NS, which binds and sequesters AT-rich DNA, making it inaccessible for gene expression. Thus, gaining a mechanistic understanding of how VirB counters H-NS-mediated silencing is of considerable interest. VirB is unusual in that it does not resemble classic transcription
ПрепринтСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-Wide Association Studies (GWAS) in microbial organisms have the potential to vastly improve the way we understand, manage, and treat infectious diseases. Yet, microbial GWAS methods established thus far remain insufficiently able to capitalise on the growing wealth of bacterial and viral genetic sequence data. Facing clonal population structure and homologous recombination, existing GWAS methods struggle to achieve both the precision necessary to reject spurious findings and the power required to detect associations in microbes. In this paper, we introduce a novel phylogenetic approach
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Marine sponge-associated actinomycetes are potent sources of bioactive natural products of pharmaceutical significance. They also contributed to the discovery of several clinically relevant antimicrobials.
OBJECTIVE: To apply the non-targeted metabolomics approach in chemical profiling of the sponge-derived bacterium Rhodococcus sp. UA13, formerly recovered from the Red Sea sponge Callyspongia aff. Implexa, along with testing for the anti-infective potential of its different fractions.
METHODOLOGY: Metabolomic analysis of the crude extract was carried out using liquid chromatog
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this report, we examined the (1) activity of ceftazidime-avibactam against clinical isolates Klebsiella pneumoniae, including those harboring blaKPC, (2) potential mechanisms leading to reduced susceptibility, and (3) activity of ceftazidime-avibactam when combined with other agents. Of 802 carbapenem-resistant isolates of K. pneumoniae gathered from New York City from 1999 to 2014, all were susceptible to ceftazidime-avibactam. Minimum inhibitory concentrations (MICs) were higher in isolates with K. pneumoniae, with the carbapenemase (KPC)-3 (compared to KPC-2), and those with a frameshift
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brucella abortus is a pathogen infecting cattle, able to survive, traffic, and proliferate inside host cells. It belongs to the Alphaproteobacteria, a phylogenetic group comprising bacteria with free living, symbiotic, and pathogenic lifestyles. An essential regulator of cell cycle progression named CtrA was described in the model bacterium Caulobacter crescentus. This regulator is conserved in many alphaproteobacteria, but the evolution of its regulon remains elusive. Here we identified promoters that are CtrA targets using ChIP-seq and we found that CtrA binds to promoters of genes involved
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Shigella flexneri is a facultative intracellular pathogen that relies on a type III secretion system and its associated effector proteins to cause bacillary dysentery in humans. The genes that encode this virulence system are located on a 230-kbp plasmid and are transcribed in response to thermal, osmotic, and pH signals that are characteristic of the human lower gut. The virulence genes are organized within a regulatory cascade, and the nucleoid-associated protein H-NS represses each of the key promoters. Transcription derepression depends first on the VirF AraC-like transcription factor, a p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Macrophage infectivity potentiators (Mips) are a group of virulence factors encoded by pathogenic bacteria such as Legionella, Chlamydia, and Neisseria species. Mips are part of the FK506-binding protein (FKBP) family, whose members typically exhibit peptidylprolyl cis-trans isomerase (PPIase) activity which is inhibitable by the immunosuppressants FK506 and rapamycin. Here we describe the identification and characterization of BPSS1823, a Mip-like protein in the intracellular pathogen Burkholderia pseudomallei. Recombinant BPSS1823 protein has rapamycin-inhibitable PPIase activity, indicating
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Haemophilus parasuis is the etiological agent of Glässer's disease characterized by fibrinous polyserositis, polyarthritis, and meningitis in young pigs. But it is difficult to develop universal serological diagnostic tools and effective vaccines against this disease because of the serovar diversity of the isolates. In this study, enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction, were performed to investigate the gene profile of 111 isolates of H. parasuis from China. And a specific common gene of H. parasuis was cloned and identified as the outer-membrane protein (OMP
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria meningitidis employs redundant heme acquisition mechanisms, including TonB receptor-dependent and receptor-independent uptakes. The TonB-dependent zinc receptor ZnuD shares significant sequence similarity to HumA, a heme receptor of Moraxella catarrhalis, and contains conserved motifs found in many heme utilization proteins. We present data showing that, when expressed in Escherichia coli, ZnuD allowed heme capture on the cell surface and supported the heme-dependent growth of an E. coli hemA strain. Heme agarose captured ZnuD in enriched outer membrane fractions, and this binding wa
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Staphylococcus aureus exotoxins (SEs) have been implicated in the pathogenesis of nasal polyps (NPs) in patients with chronic rhinosinusitis (CRS). The aim of this study was to identify the correlation between SEs and T cells in NPs.
METHODS: After a nasal smear culture, the nasal lavage fluid and NP tissue were obtained from 30 CRS with NP (CRSwNP) patients. The control samples were taken from 10 normal individuals. The presence of S. aureus exotoxin A (SEA) and toxic shock syndrome toxin 1 (TSST-1) was verified through a polymerase chain reaction (PCR) analysis and immunohistoch
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Small RNAs GlmY and GlmZ compose a cascade that feedback-regulates synthesis of enzyme GlmS in Enterobacteriaceae. Here, we analyzed the transcriptional regulation of glmY/glmZ from Yersinia pseudotuberculosis, Salmonella typhimurium and Escherichia coli, as representatives for other enterobacterial species, which exhibit similar promoter architectures. The GlmY and GlmZ sRNAs of Y. pseudotuberculosis are transcribed from σ(54)-promoters that require activation by the response regulator GlrR through binding to three conserved sites located upstream of the promoters. This also applies to glmY/g
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spirochetes belonging to the Borrelia burgdorferi sensu lato (s. l.) complex have evolved remarkable ability to survive in diverse ecological niches during transmission cycles between ticks and vertebrate hosts by variable gene expression. To understand the events during spirochete transmission from feeding ticks to hosts, mRNA levels of selected B. afzelii genes (bbk32, dbpA, ospA, ospC and vlsE) were measured by quantitative real-time SYBR Green PCR. B. afzelii infected Ixodes ricinus nymphs fed on laboratory BALB/c mice for 0, 24, 48, and 72 hours. The mRNA levels of the constantly expresse
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Behcet's disease (BD) is a recalcitrant, multisystemic inflammatory disease that can lead to irreversible blindness. Microbial agents have been considered to contribute to the pathogenesis of this disease, but the underlying mechanisms remain unclear. In this study, we investigated the association of gut microbiome composition with BD as well as its possible roles in the development of this disease.
METHODS: Fecal and saliva samples were collected from 32 active BD patients and 74 healthy controls. DNA extracted from fecal samples was subjected to metagenomic analysis, whereas DNA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Melioidosis caused by Burkholderia pseudomallei is a globally important disease of increasing concern according to high case-fatality rate and epidemic spreading. The ability of B. pseudomallei to attach and invade host cells and subsequently survive intracellularly has stimulated many questions concerning the comprehension of bacterial pathogenesis progression. Transcription levels of intracellular B. pseudomallei genes in human lung epithelial cells were therefore analyzed using bioinformatic tools, RT-PCR and real time RT-PCR. Here, it is reported that the identification of bpsl1502, encodi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to evaluate prevalence, characteristics, genotypic diversity and antibacterial susceptibility of Escherichia coli encoding Shiga toxin 2f in domestic pigeons in different provinces of Iran. A total of 117 faecal samples were collected from pigeons and were subjected to molecular detection of stx2f. In total, 20, 25·8, 21·4 and 9% of pigeons from Tehran, Ferdows, Garmsar and Babol cities carried stx2f+ isolates, respectively. Of the 460 E. coli isolates examined, 43 were stx2f+ and most also carried eae (95·3%) and astA (97·7%) genes. Some of the stx2f+ isolates harboured cnf (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chimeric protein toxins that act selectively on cells expressing a designated receptor may serve as investigational probes and/or antitumor agents. Here, we report use of the enzyme sortase A (SrtA) to create four chimeric toxins designed to selectively kill cells bearing the tumor marker HER2. We first expressed and purified: (i) a receptor recognition-deficient form of diphtheria toxin that lacks its receptor-binding domain and (ii) a mutated, receptor-binding-deficient form of anthrax-protective antigen. Both proteins carried at the C terminus the sortase recognition sequence LPETGG and a H
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anthrax is a toxin-mediated disease, the lethal effects of which are initiated by the binding of protective antigen (PA) with one of three reported cell surface toxin receptors (ANTXR). Receptor binding has been shown to influence host susceptibility to the toxins. Despite this crucial role for ANTXR in the outcome of disease, and the reported immunomodulatory consequence of the anthrax toxins during infection, little is known about ANTXR expression on human leucocytes. We characterized the expression levels of ANTXR1 (TEM8) on human leucocytes using flow cytometry. In order to assess the effe
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptospira, the causative agent of leptospirosis, interacts with several host molecules, including extracellular matrix components, coagulation cascade proteins, and human complement regulators. Here we demonstrate that acquisition of factor H (FH) on the Leptospira surface is crucial for bacterial survival in the serum and that these spirochetes, besides interacting with FH, FH related-1, and C4b binding protein (C4BP), also acquire FH like-1 from human serum. We also demonstrate that binding to these complement regulators is mediated by leptospiral immunoglobulin-like (Lig) proteins, previou
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial efflux pumps have traditionally been studied as low-level drug resistance determinants. Recent insights have suggested that efflux systems are often involved with fundamental cellular physiological processes, suggesting that drug extrusion may be a secondary function. In Mycobacterium tuberculosis, little is known about the physiological or drug resistance roles of efflux pumps. Using Mycobacterium bovis BCG as a model system, we showed that deletion of the Rv1410c gene encoding the P55 efflux pump made the strain more susceptible to a range of toxic compounds, including rifampin (ri
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Defining the metabolic capabilities and regulatory mechanisms controlling gene expression is a valuable step in understanding the pathogenic properties of infectious agents such as Borrelia burgdorferi. The present studies demonstrated that B. burgdorferi encodes functional Pfs and LuxS enzymes for the breakdown of toxic products of methylation reactions. Consistent with those observations, B. burgdorferi was shown to synthesize the end product 4,5-dihydroxy-2,3-pentanedione (DPD) during laboratory cultivation. DPD undergoes spontaneous rearrangements to produce a class of pheromones collectiv
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.