BACKGROUND: Although human papillomavirus (HPV) testing and Thin-Prep Cytology Test (TCT) are currently adopted as the first-line screening methods for cervical cancer, both of them have limitations. This study aimed to develop and validate new methylation-based biomarkers from formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue and TCT samples in a Chinese population to improve early detection of cervical cancer (CC).
METHODS: We performed a differential methylation analysis of cervical FFPE tissues and TCT samples through targeted methylation sequencing. Quantitative methylation-specific PCR (qM…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hypertension is a leading contributor to cardiovascular disease in people with HIV (PWH), yet its underlying molecular mechanism … < 0.05], enriched in vascular, metabolic, and immune pathways. Top DMPs near ATP8B2 gene [3.8% DNA methylation (DNAm) per SD change in SBP], MIR378E gene (- 9.5% DNAm per SD change in SBP), SNORA114 gene (5.2% DNAm per SD change in DBP), and ANXA11 gene (- 7.9% DNAm per SD change in DBP). A total of 204 DMPs were associated with hypertension, including a top …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To evaluate NK6 homeobox 1 (NKX6.1) promoter methylation in cervical lesions and its association with human papillomavirus (HPV)16/18 infection, histological sub-type, and patient outcomes using clinical and bioinformatic data.
METHODS: A total of 207 cervical tissue samples, including cervicitis (n = 22), cervical intraepithelial neoplasia grade 3 (n = 20), adenocarcinoma in situ (n = 6), adenocarcinoma (n = 59), and squamous cell carcinoma (n = 100), were analyzed by methylation-specific polymerase chain reaction and bisulfite sequencing. HPV genotyping was performed with the INN…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation of the glutathione S-transferase pi 1 (GSTP1) promoter is a widely studied epigenetic biomarker for prostate cancer; however, its direct detection in genomic DNA remains analytically challenging without complex chemical or amplification-based workflows. Here, we report a nucleic acid-based radial flow assay (NABRFA) that enables visual and pattern-based detection of gene-specific DNA methylation using gold nanoparticle (AuNP)-conjugated oligonucleotide probes. Thiol-modified single-stranded DNA probes targeting the GSTP1 CpG island (5'ThG) were conjugated to AuNPs to form stabl…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background. Studies of comorbid (syntropic) and inversely comorbid (rarely occurring together, i.e., dystropic) diseases have focused on the search for molecular causes of this phenomenon. Materials. We investigated DNA methylation levels in regulatory regions of 23 apoptosis-associated genes as candidate loci associated with the "cancer-neurodegeneration" dystropy in patients with Huntington's disease (HD) and patients with non-small cell lung cancer (LC). Results. Statistically significant differences in methylation levels between the HD and LC groups were found for 41 CpG sites in 16 genes.…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recent studies have demonstrated that patients with stage IB-IIIA non-small cell lung cancer (NSCLC) harboring EGFR mutations (E … ation were included. FFPE tumor and lymph node specimens were collected and subjected to the 8-gene methylation panel using modified MOB-qMSP approach. We employed stepwise regression to select variables and logistic regression to establish the predictive model. Cross-validation and decision curve analysis were performed.
RESULTS: A total of 242 patients wit …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polycystic ovary syndrome (PCOS) is a multifactorial endocrine disorder characterized by hyperandrogenism, ovulatory dysfunction, and metabolic disturbances, with insulin resistance (IR) playing a critical role in its pathogenesis. Emerging evidence suggests that epigenetic mechanisms, such as DNA methylation, may influence insulin signaling and metabolic pathways in PCOS by altering gene expression without changing the DNA sequence. This systematic review aims to evaluate the impact of DNA methylation on IR and metabolic dysfunction among PCOS patients by analyzing key genes involved in these…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomic imprinting is the parent-of-origin dependent monoallelic expression of genes often associated with regions of germline-derived DNA methylation that are maintained as differentially methylated regions (gDMRs) in somatic tissues. This form of epigenetic regulation is highly conserved in mammals and is thought to have co-evolved with placentation. Tissue-specific gDMRs have been identified in human placenta, suggesting that species-specific imprinting dependent on unorthodox epigenetic establishment or maintenance may be more widespread than previously anticipated. Non-canonical imprintin…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicobacter pylori (H. pylori) infection mediates activation of oncogenes and inhibition of tumor suppressor genes through aberrant DNA methylation, which is the predominant risk factor for gastric tumorigenesis. Here, by integrating transcriptome and epigenetic multi-omics analyses of gastric tissues and mouse models, we identified that inhibitor of differentiation 4 (ID4) was downregulated in H. pylori-infected gastric tissues and associated with prognosis of gastric cancer (GC). H. pylori infection remarkably increased the methylation level of the ID4 promoter region in the GC patients and…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hotspot mutations in H3-3A gene are key drivers in giant cell tumor of bone (GCTB). Rare primary bone sarcomas also harbor this mutation, bu … c complexity, was also significantly lower in BSH3-3A compared with HGOS, yet higher than GCTB. DNA methylation analysis revealed that most BSH3-3A and MGCTB cases form a distinct cluster, positioned near but separate from GCTB, and clearly separated from HGOS. Differential methylation analysis revealed that BSH3-3A exhibited the highest degree of similarity …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteosarcoma (OS), the most prevalent primary bone malignancy in adolescents, is characterized by aggressive progression and early metastasis. However, the epigenetic drivers of its metastatic heterogeneity remain poorly understood. Herein, we integrated bulk DNA methylation profiling and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) to elucidate the epigenetic mechanisms driving OS metastatic heterogeneity. Consensus clustering identified two methylation subtypes (K = 2) with distinct survival outcomes, where hypermethylated (MSO-high) tumors exhibited poor prognosis. Weighted gene co-expression net…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deoxynivalenol (DON) is a globally distributed mycotoxin that contaminates agricultural foods. Previous studies have reported high concentrations of DON in staple foods as well as its associated toxic effects; however, there are limited studies on DNA methylation. Therefore, we investigated the effect of DON on global DNA methylation as well as the possible mechanism of DNA methylation changes by miR-29b and DNA methylation regulators in human hepatocellular carcinoma (HepG2) cells. HepG2 cells were exposed to 5, 10, and 26.17 μM of DON for 72 h. Global DNA methylation was determined using ELI…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Malnutrition in amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is associated with disease severity, and epigenetic regulation may be involved. The aim of this study was to assess the methylation levels of specific DNA sequences from the nuclear and mitochondrial genomes in a population with ALS to elucidate their relationship with nutritional status and the evolution of the disease. Methods: Patients with ALS were evaluated between 2013 and 2021 (n = 66). They were categorized according to their nutritional status, using the Global Leadership Initiative on Malnutrition (GLIM) criteria, and di…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Epigenetic modifications, particularly deoxyribonucleic acid (DNA) methylation, regulate the expression of immune-mediated factors. This study aimed to investigate the methylation landscape of the interleukin-10 (IL10) gene in Graves' disease (GD).
METHODS: This study quantitatively profiled DNA methylation levels within the IL-10 gene using peripheral blood samples from GD patients and healthy controls. Machine learning models were constructed based on CpG methylation features to classify disease status. Furthermore, correlation between specific CpG sites methylation and clinical …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In bacteria, DNA gyrase plays a key role in cellular processes by affecting supercoiling. However, how gyrase localizes on the chromosome to … the target of three pneumococcal restriction systems: DpnI, DpnII, and DpnIII. We demonstrated that methylation at GATC by the DpnII (GAmeTC) or DpnIII (GATCme) systems decreased gyrase cleavage and supercoiling activity. We hypothesized that strains with methylated GATC would be more resistant to subinhibitory concentrations of fluoroquinolones. We indeed de …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The etiology of attention-deficit/hyperactivity disorder (ADHD) remains poorly understood, despite it being one of the most common neurodevelopmental disorders worldwide. Past research suggests methylmercury exposure and DNA methylation (DNAm) levels are each associated with ADHD in children, yet whether they interact to affect ADHD is unknown. Leveraging data from a longitudinal cohort of children in Mexico, this novel epigenetic-environment interaction study identified significant interactions between childhood mercury exposure (measured at 6-12 years of age) and adolescent blood leukocyte D…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dysregulation of DNA methylation has been implicated in Alzheimer's disease (AD), making the manipulation of DNA methylation processes a promising therapeutic strategy. DNA methyltransferase 3a (DNMT3a), one of the two de novo DNMTs, is involved in learning and memory. However, it remains elusive whether and how alterations in DNMT3a expression contributes to AD pathogenesis. In this study, we investigated the consequences of DNA methylation dysregulations in the hippocampus of 5xFAD mouse model of AD and explored the use of L-methionine (MET) supplement to restore DNA methylation dysregulatio…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation at gene promoters is generally considered to be associated with transcriptional repression in vertebrates. However, lack of a clear picture of where promoter methylation is most important for transcriptional regulation has hindered our understanding of this relationship and resulted in the use of a wide variety of arbitrary promoter definitions. We demonstrate here that the use of different promoter definitions can lead to contradictory results between studies of promoter methylation. In response, we have developed Methodical, a computational method that combines RNA-seq and wh…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation is a crucial epigenetic modification associated with diseases. Current DNA methylation regulators like azacitidine often lack selectivity, causing side effects, necessitating the development of targeted agents. Our previous research showed sinomenine selectively regulates DNA methylation in the mPGES-1 promoter but not the COX-2 gene. This study reveals that sinomenine achieves selectivity through sequence-specific intercalation-a novel mechanism distinct from conventional DNMT inhibitors. Using ultrahigh-resolution fluorescence microscopy, we confirmed the distribution of sino…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ADAMTS (A Disintegrin and Metalloproteinase with Thrombospondin motifs) family is a group of secretory proteases involved in the maintenance of central nervous system (CNS) homeostasis and neuronal disease. ADAMTS18 is a member of this family and has been linked to the integrity of the human brain's white matter. However, the cellular and molecular basis of ADAMTS18 in brain metabolism and homeostasis remains unclear. In this study, a total of 47,719 genes were identified in 8 independent wild type (WT) and Adamts18 knockout (KO) mouse brain samples using brain transcriptomic analysis. The abu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования