Despite their potential applications in host-guest chemistry, there are only five reported structures of poly-[n]-catenanes self-assembled by elusive M12L8 icosahedral nanocages. This small number of structures of M12L8 poly-[n]-catenanes is because self-assembly of large metal-organic cages (MOCs) with large windows allowing catenation by means of mechanical bonds is very challenging. Structural reports of M12L8 poly-[n]-catenanes are needed to increase our knowledge about the self-assembly and genesis of such materials. Poly-[n]-catenane (1·p-CT) self-assembly of interlocked M12L8 icosahedra
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Our previous studies showed that neutrophil infiltration and activation plays an important role in the pathogenesis of abdominal aortic aneurysms (AAA). However, there is a lack of noninvasive, inflammatory cell-specific molecular imaging methods to provide early diagnosis of AAA formation. Formyl peptide receptor 1 (FPR1) is rapidly upregulated on neutrophils during inflammation. Therefore, it is hypothesized that the use of cinnamoyl-F-(D)L-F-(D)L-F-K (cFLFLF), a PEGylated peptide ligand that binds FPR1 on activated neutrophils, would permit accurate and noninvasive diagnosis of
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colloidal quantum dots are semiconductor nanocrystals (NCs) which have stimulated a great deal of research and have attracted technical interest in recent years due to their chemical stability and the tunability of photophysical properties. While internal structure of large quantum dots is similar to bulk, their surface structure and passivating role of capping ligands (surfactants) are not fully understood to date. We apply ab initio wavefunction methods, density functional theory, and semiempirical approaches to study the passivation effects of substituted phosphine and amine ligands on the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The bioactive phyto-components of M. charantia L. demonstrate significant therapeutic potential against the acetylcholinesterase (AChE) enzyme, which is associated with neurodegenerative diseases such as Alzheimer's. In this study, computational tools were used to screen the essential bioactive compounds of M. charantia L. against AChE. Docking results revealed that among the 19 phytocompounds analysed, Ajmalacine, Alkaloid AQC2, Alkaloid SP-K, Steroid U, and Quinine exhibited high binding affinities towards AChE. Ligand-protein binding interactions indicated that these selected compounds show
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Banana bunchy top virus (BBTV) is one of the most destructive viral pathogens of banana, causing substantial yield and production losses worldwide. This study employed an integrated in silico-in vitro approach to identify and experimentally evaluate a potential antiviral compound against BBTV. The three-dimensional structure of the BBTV coat protein (CP) was predicted using I-TASSER, followed by structural refinement and validation. A library of 64 reported antiviral compounds was screened against the CP using AutoDock Vina, and the selected ligand was further characterized using density funct
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular dynamics (MD)-based methods to predict the enantioselectivity or product specificity of enzymes typically use a near attack conformation (NAC) approach. The computational efficiency of this ground-state approach, taking minutes to hours, allows to in silico screen thousands of enzyme variants. During the computational design and screening of new variants of limonene epoxide hydrolase for improved stereoselectivity, it was noticed that, while this approach gave satisfactory prediction accuracy for most substrates, the enantioselectivity predictions were far less accurate for variants
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) can persist in human blood and may perturb hematological homeostasis by interacting with coagulation factor XII (FXII), the initiator of the contact system. This study combined in vitro, ex vivo, and in vivo experiments with computational modeling to evaluate the effects of legacy PFAS (PFOS and PFOA) and their alternatives (6:2 Cl-PFESA, HFPO-DA, HFPO-TA, and HFPO-TeA) on FXII and downstream contact activation. In vitro and ex vivo screening showed that 6:2 Cl-PFESA had a greater capacity to activate FXII than PFOS, whereas HFPO-TA induced more prono
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fluorene (FL) possesses a characteristic π-electron conjugation, resulting in its diverse utilization as a molecular scaffold in fields such as organic electronics, biochemistry, combustion science, and the synthesis of electroluminescent materials. Whereas the vibrational structures of the ground singlet (S0) and the lowest-lying triplet (T1) electronic states in 9H-FL have previously been investigated using techniques such as matrix-isolation Fourier-transform infrared spectroscopy, electron attachment to FL isomers remains largely unexplored. In this work, geometries and vibrational frequen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autosomal dominant polycystic kidney disease (ADPKD) is a progressive genetic disorder characterized by renal cyst formation and eventual kidney failure, with limited effective therapeutic options. In this study, we employed an integrated computational framework combining microarray-based gene expression profiling, network pharmacology, and structure-based drug discovery to identify potential therapeutic targets and phytochemical inhibitors. Differential expression analysis of the GSE7869 dataset (18 ADPKD vs. 3 controls) identified 233 significant genes, including 42 upregulated and 191 downr
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Cholangiocarcinoma (CCA) is an aggressive malignancy characterized by a poor prognosis, where timely diagnosis and accurate staging are critical yet challenging. Conventional imaging techniques often fail to effectively differentiate primary lesions from micrometastases or to distinguish benign from malignant findings. Fibroblast activation protein (FAP), highly expressed in cancer-associated fibroblasts, presents a promising molecular target for improving diagnostic precision.
MATERIALS AND METHODS: This review synthesizes current clinical evidence regarding the application of
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plants pass transgenerational inheritance through genetic and epigenetic information; however, the soil's role as the host environment in this memory transfer remains largely unexplored. Research within this field has largely been domain-specific, with only 117 publications in 24 years integrating fields of soil persistent metabolites (soil chemistry), stress-induced microbial consortia (soil microbiology), and plant molecular science (plant epigenetics). In this perspective article, we synthesize evidence and propose a testable hypothesis, the Hologenomic Stress Legacy (HSL) hypothesis. It st
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Numerous studies have reported the biological activities of tilapia skin oligopeptides, which exhibit diverse physiological effects. However, research on the relationship between peptide structural characteristics and their activities remains relatively scarce. In this study, we combined computational simulations with biological experiments to investigate the anti-metastatic mechanism of the tilapia skin oligopeptide LSGYG. Computational analyses supported recurrent Zn-neighboring and pocket-associated recognition modes of LSGYG in the catalytic region of matrix metalloproteinase-2 (MMP-2) and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: T-cell large granular lymphocyte leukemia (T-LGLL) is a rare, indolent lymphoproliferative disorder of cytotoxic T cells in the peripheral blood, bone marrow, and spleen. This analysis was conducted to characterize genomic alterations and highlight potential therapeutic targets, with the goal of refining the molecular landscape of T-LGLL by emphasizing population-specific biomarkers.
MATERIALS AND METHODS: This study utilized the American Association for Cancer Research (AACR) Project Genomics Evidence Neoplasia Information Exchange (GENIE) database to identify common gene mut
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Circulating tumor DNA (ctDNA) detection offers minimally invasive monitoring of cancer from blood samples. While tumor-informed approaches are sensitive, their clinical application is limited by cost, tissue availability, and turnaround time. In contrast, tumor-naïve assays offer faster turnaround times and broader applicability, but often sacrifice sensitivity.
METHODS: Here, we developed DEEPctMUT, a computational pipeline for tumor-naïve ctDNA detection that integrates unique molecular identifiers (UMIs) with three complementary error-polishing strategies: (1) machine learning-
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/OBJECTIVES: DNA methylation is a key epigenetic process that regulates gene expression and is often disrupted in colorectal cancer (CRC). Aberrant methylation of promoter CpG islands can silence tumor suppressor genes and drive tumorigenesis. A subset of CRCs exhibits the CpG Island Methylator Phenotype (CIMP), characterized by widespread hypermethylation and distinct clinical outcomes. Identifying genes whose expression is epigenetically regulated by methylation is important for prioritizing candidate biomarkers and therapeutic targets in CRC.
METHODS: We developed and compared a
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammation-driven diseases are characterized by localized oxidative stress, acidosis, and hyperthermia-microenvironmental features that often compromise the effectiveness of conventional anti-inflammatory therapies due to poor site selectivity and uncontrolled systemic exposure. In this context, the present study provides an exclusively in silico investigation of an inflammation-responsive drug delivery concept based on β-cyclodextrin (β-CD) encapsulation of a redox-active vanadium complex, VO-INAP-tryptophan. Leveraging the supramolecular host-guest properties of β-CD, the computational mod
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Complementarity Determining Regions (CDRs) in antibodies, and in particular the CDR-H3 loop, often display conformational plasticity that is essential for their function. Due to this flexibility, the structural investigation of antibody-antigen binding cannot exclusively rely on experimental techniques that only provide snapshots of unbound and bound states, such as X-ray crystallography. Moreover, X-ray structures can be biased due to experimental conditions and crystal packing. In this context, computational techniques, and especially conformational sampling methods, are an essential complem
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The SARS-CoV-2 receptor-binding domain (RBD) undergoes frequent mutations, weakening current therapeutics. Despite its importance in viral entry, most inhibitors lack resilience to antigenic drift, emphasizing the need for broad-spectrum agents that maintain binding across variants while preserving host specificity.
RESEARCH DESIGN AND METHODS: The authors employed computational mutagenesis to design h-ACE2-derived peptidomimetics incorporating nonstandard amino acids (NSAAs), targeting conserved RBD residues in SARS-CoV-2, Omicron, and JN.1. Approximately 10,000 NSAAs were screen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: RNA molecules adopt dynamic ensembles of secondary structures, where the local structural context of each nucleotide-such as whether it resides in a stem or a specific type of loop-strongly shapes molecular interactions and regulatory function. Structural-context probabilities therefore provide a more functionally informative view of RNA folding than the minimum free energy structures or base-pairing probabilities. However, existing tools either require O(N3) time or employ span-restricted approximations that omit long-range base-pairs, limiting their applicability to large and bio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For the first time, we implement the deep-neural-network-based variational Monte Carlo approach for the multiquark bound states, whose complexity surpasses that of electron or nucleon systems due to strong SU(3) color interactions. We design a novel and high-efficiency architecture, DeepQuark, to address the unique challenges in multiquark systems such as stronger correlations, extra discrete quantum numbers, and intractable confinement interaction. Our method demonstrates competitive performance with state-of-the-art approaches, including diffusion Monte Carlo and Gaussian expansion method, i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.