The identification of genes primarily responsible for complex genetic disorders is a daunting task. Despite the assignment of many susceptibility loci, there has only been limited success in identifying disease genes based solely on positional information from genome-wide screens. The incorporation of several complementary strategies in a single integrated approach should facilitate and further enhance the efficacy of this search for genes. To permit the integration of linkage, association and expression data, together with functional annotations, we have developed a Java-based software tool:
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurofibromatosis 1 (NF1), an autosomal dominant disease, exhibits extreme clinical variability. This variability greatly increases the burden for affected families and impairs our ability to understand the pathogenesis of NF1. Recognition of heterogeneity within a disease may provide important pathogenic insights, therefore we tested clinical data from three large sets of NF1 patients for evidence that certain common features are more likely to occur in some NF1 patients than in others. Clinical information on 4,402 patients with NF1 was obtained from three independent databases. We examined
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The blepharophimosis syndrome (BPES) is a rare genetic disorder characterized by blepharophimosis, ptosis, epicanthus inversus, and telecanthus. In type I, BPES is associated with female infertility, while in type II, the eyelid defect occurs by itself. The BPES syndrome has been mapped to 3q23. Previously, we constructed a YAC-, PAC-, and cosmid-based physical map surrounding the 3q23 translocation breakpoint of a t(3;4)(q23;p15.2) BPES patient, containing a 110-kb PAC (169-C 10) and a 43-kb cosmid (11-L 10) spanning the breakpoint. In this report, we present the identification of BPESC1 (BPE
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Congenital heart disease (CHD) is the most common type of birth defect with family- and population-based studies supporting a strong genetic cause for CHD. The goal of this study was to determine whether a whole exome sequencing (WES) approach could identify pathogenic-segregating variants in multiplex CHD families.
METHODS AND RESULTS: WES was performed on 9 kindreds with familial CHD, 4 with atrial septal defects, 2 with patent ductus arteriosus, 2 with tetralogy of Fallot, and 1 with pulmonary valve dysplasia. Rare variants (<1% minor allele frequency) that segregated with dise
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reprogramming of glycolytic metabolism plays a critical role in the pathogenesis of myocardial ischemia-reperfusion injury (MIRI). Although transient glycolysis activation may alleviate energy deficits, excessive glycolytic flux can worsen myocardial damage. This study aimed to identify specific biomarkers and therapeutic targets by investigating glycolysis-related genes in MIRI. We analyzed differentially expressed genes (DEGs) from GEO datasets GSE61592 and GSE160516 and constructed co-expression modules using weighted gene co-expression network analysis (WGCNA). By intersecting DEGs, WGCNA
СтатьяВалидационное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Metabolic dysfunction-associated steatohepatitis (MASH) is becoming increasingly prevalent. Regulated cell death (RCD) has emerged as a significant disease phenotype and may act as a marker for liver fibrosis. The present study aimed to investigate the regulation of RCD-related genes in MASH to elucidate the role of RCD in the progression of MASH.
METHODS: The gene expression profiles from the GSE130970 and GSE49541 datasets were retrieved from the Gene Expression Omnibus (GEO) database for analysis. A total of 101 combinations of 10 machine learning algorithms were employed to sc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Malignant mesothelioma (MM) is a relatively rare and highly lethal tumor with few treatment options. Thus, it is important to identify prognostic markers that can help clinicians diagnose mesothelioma earlier and assess disease activity more accurately. Alternative splicing (AS) events have been recognized as critical signatures for tumor diagnosis and treatment in multiple cancers, including MM.
METHODS: We systematically examined the AS events and clinical information of 83 MM samples from TCGA database. Univariate Cox regression analysis was used to identify AS events associate
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peripheral blood transcriptome is a highly promising area for biomarker development. However, transcript abundances (TA) in these cell mixture samples are confounded by proportions of the component leukocyte subpopulations. This poses a challenge to clinical applications, as the cell of origin of any change in TA is not known without prior cell separation procedure. We developed a framework to develop a cell-type informative TA biomarkers which enable determination of TA of a single cell-type (B lymphocytes) directly in cell mixture samples of peripheral blood (e.g., peripheral blood mononucle
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) is the sixth most prevalent malignancy worldwide, with high incidence and poor survival rates. Increased expression of microRNA-205-5p (miR-205-5p) may influence the outcomes of HNSCC, but the identities of miR-205-5p target genes and the potential signaling pathways related to HNSCC remain unclear. RT-qPCR was used to detect the expression levels of miR-205-5p in the plasma of patients with HNSCC. We also performed a meta-analysis using data from relevant literature, and the Gene Expression Omnibus (GEO) and the Cancer Genome Atlas (TCGA) database
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Differentially methylated genes (DMGs) play a crucial role in the etiology and pathogenesis of esophageal squamous cell carcinoma (ESCC). This study aimed to ascertain aberrant DMGs and pathways by comprehensive bioinformatics analysis. We downloaded the gene expression microarray of GSE51287 from the Gene Expression Omnibus (GEO). Aberrant DMGs were obtained using the GEO2R tool. Gene ontology (GO) analysis and Kyoto Encyclopedia of Gene and Genome pathway enrichment analyses were performed on selected genes by using the Database for Annotation Visualization and Integrated Discovery. A protei
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
American journal of medical genetics. Part B, Neuropsychiatric genetics : the official publication of the International Society of Psychiatric Genetics2019eng
Anxiety disorders (ANX), namely generalized anxiety, panic disorder, and phobias, are common, etiologically complex syndromes that show increasing prevalence and comorbidity throughout adolescence and beyond. Few genome-wide association studies (GWAS) examining ANX risk have been published and almost exclusively in individuals of European ancestry. In this study, we phenotyped participants from the Army Study To Assess Risk and Resilience in Servicemembers (STARRS) to approximate DSM-based ANX diagnoses. We factor-analyzed those to create a single dimensional anxiety score for each subject. GW
СтатьяМетаанализПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The South African national treatment programme includes nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NRTIs) in both first and second line highly active antiretroviral therapy regimens. Mutations in the RNase H domain have been associated with resistance to NRTIs but primarily in HIV-1 subtype B studies. Here, we investigated the prevalence and association of RNase H mutations with NRTI resistance in sequences from HIV-1 subtype C infected individuals. RNase H sequences from 112 NRTI treated but virologically failing individuals and 28 antiretroviral therapy (ART)-naive individuals were generat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-throughput whole genome sequencing has unlocked a multitude of possibilities enabling members of the Neisseria genus to be examined with unprecedented detail, including the human pathogens Neisseria meningitidis and Neisseria gonorrhoeae. To maximise the potential benefit of this for public health, it is becoming increasingly important to ensure that this plethora of data are adequately stored, disseminated and made readily accessible. Investigations facilitating cross-species comparisons as well as the analysis of global datasets will allow differences among and within species and across
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The implementation of nucleic acid-based tests for blood donor screening has improved the safety of the blood supply; however, the increasing number of emerging pathogen tests is burdensome. Development of multiplex testing platforms that allow simultaneous screening for different pathogens is a potential solution.
STUDY DESIGN AND METHODS: The TessArray resequencing microarray is a platform that allows multiplex detection and identification of 97 different blood-borne pathogens in one single test. The objective was to evaluate the lowest concentration detected in blood or plasma,
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cilia are microtubule based organelles that project from cells. Cilia are found on almost every cell type of the human body and numerous diseases, collectively termed ciliopathies, are associated with defects in cilia, including respiratory infections, male infertility, situs inversus, polycystic kidney disease, retinal degeneration, and Bardet-Biedl Syndrome. Here we show that Illumina-based whole-genome transcriptome analysis in the biflagellate green alga Chlamydomonas reinhardtii identifies 1850 genes up-regulated during ciliogenesis, 4392 genes down-regulated, and 4548 genes with no chang
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: In order to screen out important genes from large gene data of gene microarray after nerve injury, we combine gene ontology (GO) method and computer pattern recognition technology to find key genes responding to nerve injury, and then verify one of these screened-out genes.
METHODS: Data mining and gene ontology analysis of gene chip data GSE26350 was carried out through MATLAB software. Cd44 was selected from screened-out key gene molecular spectrum by comparing genes' different GO terms and positions on score map of principal component. Function interferences were employed to inf
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptospirosis is considered to be a re-emerging disease that has impacts on public health both globally and in and Thailand. The leptospires outbreak in Thailand during 1999 was largely due to the etiologic agent Leptospira borgpetersenii serogroup Sejroe. This had a related immunity profile in cows from Thailand, which serovars Tarassovi and Sejroe were prevalent. Development of a vaccine protecting against leptospiral infection in livestock has been considered. One family of proteins being targeted as candidates for vaccine development are leucine-rich repeats (LRRs), which have diverse func
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Flaviviruses include the mosquito-borne dengue, Japanese encephalitis, yellow fever and West Nile and the tick-borne encephalitis viruses. They are responsible for considerable world-wide morbidity and mortality. Viral entry is mediated by a conserved fusion peptide containing 16 amino acids located in domain II of the envelope protein E. Highly orchestrated conformational changes initiated by exposure to acidic pH accompany the fusion process and are important factors limiting amino acid changes in the fusion peptide that still permit fusion with host cell membranes in both arthro
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The molecular characterisation of species and genotypes of Cryptosporidium and Giardia is essential for accurately identifying organisms and assessing zoonotic transmission. Results of recent molecular epidemiological studies strongly suggest that zoonotic transmission plays an important role in cryptosporidiosis epidemiology. In such cases the most prevalent zoonotic species is Cryptosporidium parvum. Genotyping and subtyping data suggest that zoonotic transmission is not as prevalent in the epidemiology of giardiasis. Molecular characterisation of Cryptosporidium and Giardia is a relatively
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer epidemiology, biomarkers & prevention : a publication of the American Association for Cancer Research, cosponsored by the American Society of Preventive Oncology2005eng
Genetic anticipation in familial non-Hodgkin's lymphoma, Hodgkin's lymphoma, and chronic lymphocytic leukemia (CLL) has been consistently reported in the literature. However, most of these findings were based on data from families ascertained for genetic studies. Fecundity bias, right censoring bias, and secular trends can lead to erroneous conclusions regarding the presence of anticipation. Our report investigates anticipation in four lymphoproliferative cancers, non-Hodgkin's lymphoma, Hodgkin's lymphoma, CLL, and multiple myeloma, drawn from Swedish and Danish population-based registries. W
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования