Enterococci are common commensals of the human gut and important opportunistic pathogens, with Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis being the most clinically prevalent species. A significant epidemiological shift has emerged with an increasing clinical burden of E. faecium. To compare genomic evolution of E. faecium and E. faecalis, we performed whole-genome sequencing on 93 E. faecium and 32 E. faecalis isolates causing bloodstream infections at a single hospital (2022-2024). Analysis of patient demographics revealed that E. faecium infections originated from fewer sources than E. f
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Norovirus is the primary cause of viral gastroenteritis (GE). To investigate norovirus epidemiology, there is a need for whole-genome sequencing and reference sets consisting of complete genomes. To investigate the potential of shotgun metagenomic sequencing on the Illumina platform for whole-genome sequencing, 71 reverse transcriptase quantitative PCR (RT-qPCR) norovirus positive-feces (threshold cycle [CT], <30) samples from norovirus surveillance within The Netherlands were subjected to metagenomic sequencing. Data were analyzed through an in-house next-generation sequencing (NGS) analysis
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Our understanding of how bacterial pathogens colonize and persist during human infection has been hampered by the limited characterization of bacterial physiology during infection and a research bias toward in vitro, fast-growing bacteria. Recent research has begun to address these gaps in knowledge by directly quantifying bacterial mRNA levels during human infection, with the goal of assessing microbial community function at the infection site. However, mRNA levels are not always predictive of protein levels, which are the primary functional units of a cell. Here, we used carefully controlled
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lower respiratory tract infections (LRTIs) exacerbate chronic airway diseases, yet phenotype-specific microbial signatures are poorly defined. We applied broncho-alveolar lavage fluid (BALF) genomic sequencing to identify biomarkers for asthma and chronic obstructive pulmonary disease (COPD).
METHODS: Between December 2023 and February 2025, 1-146 adults with suspected LRTI enrolled from the First Hospital of Jilin University underwent BALF next-generation sequencing. Patients were stratified by lung function, with the impaired pulmonary function group further divided into asthma,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reverse zoonoses, which arise from interactions between humans and animals, are facilitated by the similarity of angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) cell receptors across different hosts and the high mutation rate of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), enabling transmission across species. This study aimed to explore the transmission of SARS-CoV-2 between humans and companion animals by conducting molecular investigations on nasopharyngeal and oropharyngeal swabs from 100 domestic Cats (Felis catus) in Egypt which had contact with SARS-CoV-2 positive owners from De
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ductal carcinoma in situ (DCIS) of the breast is a non-obligate precursor of Invasive Ductal Carcinoma (IDC) and thus the identification of features that may predict DCIS progression would be of potential clinical value. Experimental mouse models can be used to address this challenge by studying DCIS-to-IDC biology. Here we utilize single cell RNA sequencing (scRNAseq) on the C3Tag genetically engineered mouse model that forms DCIS-like precursor lesions and for which many lesions progress into end-stage basal-like molecular subtype IDC. We also perform bulk RNAseq analysis on 10 human synchro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human odontogenic aberrations such as abnormal tooth number and delayed tooth eruption can occur as a symptom of rare syndromes or, more commonly, as nonsyndromic phenotypes. These phenotypes can require extensive and expensive dental treatment, posing a significant burden. While many dental phenotypes are heritable, most nonsyndromic cases have not been linked to causal genes. We demonstrate the novel finding that common sequence variants associated with human odontogenic phenotypes are enriched in developmental craniofacial enhancers conserved between human and mouse. However, the bulk natur
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Duchenne muscular dystrophy (DMD) is a severe, progressive neuromuscular disorder caused by reading frame disrupting mutations in the DMD gene leading to absence of functional dystrophin. Antisense oligonucleotide (AON)-mediated exon skipping is a therapeutic approach aimed at restoring the reading frame at the pre-mRNA level, allowing the production of internally truncated partly functional dystrophin proteins. AONs work in a sequence specific manner, which warrants generating humanized mouse models for preclinical tests. To address this, we previously generated the hDMDdel52/mdx mouse model
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Legionella pneumophila is the causative agent of a severe type of pneumonia (lung infection) called Legionnaires' disease. It is emerging as an antibiotic-resistant strain day by day. Hence, identifying novel drug targets and vaccine candidates is essential to fight against this pathogen. Here, attempts were taken through a subtractive genomics approach on the complete proteome of L. pneumophila to address the challenges of multidrug resistance. A total of 2,930 proteins from L. pneumophila proteome were investigated through diverse subtractive proteomics approaches, e.g., identification of hu
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antibiotic resistance is an increasing threat to human health. In the case of Aspergillus fumigatus, which is both an environmental saprobe and an opportunistic human fungal pathogen, resistance is suggested to arise from fungicide use in agriculture, as the azoles used for plant protection share the same molecular target as the frontline antifungals used clinically. However, limiting azole fungicide use on crop fields to preserve their activity for clinical use could threaten the global food supply via a reduction in yield. In this study, we clarify the link between azole fungicide use on cro
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Infections with H7 highly pathogenic avian influenza (HPAI) viruses remain a major public health concern. Adaptation of low-pathogenic H7N7 to highly pathogenic H7N7 in Europe in 2015 raised further alarm for a potential pandemic. An in-depth understanding of antibody responses to HPAI H7 virus following infection in humans could provide important insight into virus gene expression as well as define key protective and serodiagnostic targets. Here we used whole-genome gene fragment phage display libraries (GFPDLs) expressing peptides of 15 to 350 amino acids across the complete geno
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human germ cells are the foundation of human reproduction and development, ensuring heredity and contributing to genetic diversity. Accordingly, their anomalies lead to critical diseases, including infertility. Recent advances in genomics and stem cell-based in vitro gametogenesis research have expanded our knowledge of how human germ cells are specified and differentiate during embryonic and fetal development, elucidating evolutionarily distinctive as well as conserved properties of human germ cell development. Here, based on the evidence from both in vivo and in vitro studies, we provide an
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Archaeological remains covered with concretions, including human bones, are commonly found in certain areas and time periods of interest for understanding the past, but have yet to be investigated for potential ancient DNA (aDNA) and protein content. We extracted aDNA and proteins in tandem from human dental remains and their surrounding concretions and compared them to non-concreted human dental remains from the same site. Concretions appeared homogeneous in color and texture, consisting of a hard dark gray sediment adhered to the bone surfaces, presumably as a result of cyclical waterlogging
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human induced pluripotent stem cells (hiPSCs) are emerging as a tool for understanding human brain development at cellular, molecular, and genomic levels. Here we show that hiPSCs grown in suspension in the presence of rostral neuralizing factors can generate 3D structures containing polarized radial glia, intermediate progenitors, and a spectrum of layer-specific cortical neurons reminiscent of their organization in vivo. The hiPSC-derived multilayered structures express a gene expression profile typical of the embryonic telencephalon but not that of other CNS regions. Their transcriptome is
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two subspecies of Trypanosoma brucei s.l. co-exist within the animal populations of Eastern Africa; T. b. brucei a parasite which only infects livestock and wildlife and T. b. rhodesiense a zoonotic parasite which infects domestic livestock, wildlife, and which in humans, results in the disease known as Human African Trypanosomiasis (HAT) or sleeping sickness. In order to assess the risk posed to humans from HAT it is necessary to identify animals harbouring potentially human infective parasites. The multiplex PCR method described here permits differentiation of human and non-human infective p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The Klebsiella pneumoniae (KP) species complex (KpSC) comprises KP as the predominant species, and six other taxa including two subspecies each of Klebsiella variicola (KV) and Klebsiella quasipneumoniae (KQ), all capable of causing clinical infections and often challenging to differentiate. Among these, KP is by far the most clinically significant, with the emergence of multidrug-resistant and hypervirulent strains leading to severe infections and limited treatment options, underscoring the need to understand the genomic features of KP.
METHODS: This study compared globally dis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial relatedness measured using select chromosomal loci forms the basis of public health genomic surveillance. While approximating vertical evolution through this approach has proven exceptionally valuable for understanding pathogen dynamics, it excludes a fundamental dimension of bacterial evolution-horizontal gene transfer. Incorporating the accessory genome is the logical remediation and has recently shown promise in expanding epidemiological resolution for enteric pathogens. Employing k-mer-based Jaccard index analysis, and a novel genome length distance metric, we computed pangenome
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The inaugural issue of Circulation: Cardiovascular Genetics arrives at a remarkable time in the history of genetic research and cardiovascular medicine. Despite tremendous progress in knowledge gained, cardiovascular disease(CVD) remains the leading cause of death in the United States,1 and it has overcome infectious diseases as the leading cause of death worldwide.2 In addition, rates of CVD remain higher in black and Hispanic populations in the United States.1 The recent Strategic Plan of the National Heart, Lung,and Blood Institute (NHLBI) emphasizes research areas to fill the significant k
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Enteroviruses (EVs) and adenoviruses (ADVs) have been considered common causes of myocarditis and dilated cardiomyopathy. In the present study, we report on the association of parvovirus B19 (PVB19) genomes in the clinical setting of acute myocarditis.
METHODS AND RESULTS: This study included 24 consecutive patients admitted to our hospital within 24 hours after onset of chest pain. Acute myocardial infarction had been excluded in all patients by coronary angiography. Endomyocardial biopsies were analyzed by nested polymerase chain reaction/reverse transcriptase-polymerase chain r
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-human primate (NHP)-derived adenoviruses have formed a valuable alternative for the use of human adenoviruses in vaccine development and gene therapy strategies by virtue of the low seroprevalence of neutralizing immunity in the human population. The more recent use of several human adenoviruses as oncolytic agents has exhibited excellent safety profiles and firm evidence of clinical efficacy. This proffers the question whether NHP-derived adenoviruses could also be employed for viral oncolysis in human patients. While vaccine vectors are conventionally made as replication-defective vector
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.