The dbPTM (http://dbPTM.mbc.nctu.edu.tw/) has been maintained for over 10 years with the aim to provide functional and structural analyses for post-translational modifications (PTMs). In this update, dbPTM not only integrates more experimentally validated PTMs from available databases and through manual curation of literature but also provides PTM-disease associations based on non-synonymous single nucleotide polymorphisms (nsSNPs). The high-throughput deep sequencing technology has led to a surge in the data generated through analysis of association between SNPs and diseases, both in terms of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The combination of excess mycotoxin exposure and selenium deficiency has been widely considered as a cause of Kashin-Beck disease (KBD). The present study aimed to investigate the expression profiles of selenium-related genes in human chondrocytes after exposure to T-2 toxin and deoxynivalenol (DON) and to preliminarily identify the potential biological functions of the identified genes. Gene expression profiling was performed on human chondrocytes treated with 0.01 μg/ml T-2 toxin and 1.0 μg/ml DON by using Affymetrix Human Gene Arrays. The 1660 selenium-related genes were derived from the Co
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: We investigated interferon-stimulated gene 15 (ISG15), a poorly understood ubiquitin-like modifier, and its enzymatic pathway in dermatomyositis (DM), an autoimmune disease primarily involving muscle and skin.
METHODS: We generated microarray data measuring transcript abundance for approximately 18,000 genes in each of 113 human muscle biopsy specimens, and studied biopsy specimens and cultured skeletal muscle using immunohistochemistry, immunoblotting proteomics, real-time quantitative polymerase chain reaction, and laser-capture microdissection.
RESULTS: Transcripts encoding ISG
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Constitutional mutations of the WT1 gene, encoding a zinc-finger transcription factor involved in renal and gonadal development, are found in most patients with Denys-Drash syndrome (DDS), or diffuse mesangial sclerosis (DMS) associated with pseudohermaphroditism and/or Wilms tumor (WT). Most mutations in DDS patients lie in exon 8 or exon 9, encoding zinc finger 2 or zinc finger 3, respectively, with a hot spot (R394W) in exon 9. We analyzed a series of 24 patients, 10 with isolated DMS (IDMS), 10 with DDS, and 4 with urogenital abnormalities and/or WT. We report WT1 heterozygous mutations in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The prediction of enzyme kinetic parameters, particularly $\mathit{k}_{\text{cat}}$ and $\mathit{K}_{\text{m}}$, is rapidly evolving from physics-based modeling toward data-driven artificial intelligence (AI) approaches, driven by expanding biochemical databases and advances in machine learning (ML) and deep learning (DL). We focus on AI-based enzyme kinetic parameter prediction, with an emphasis on $\mathit{k}_{\text{cat}}$ and $\mathit{K}_{\text{m}}$, while also considering related parameters, such as $\mathit{K}_{\text{i}}$ and $\mathit{k}_{\text{cat}}/\mathit{K}_{\text{m}}$. The key findin
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sterol carrier protein 2 (SCP2) plays a critical role in intracellular lipid transport and metabolism across human tissues. The objective of this study was to perform a comprehensive pan-cancer analysis of SCP2, evaluating its expression, prognostic significance, and functional mechanisms.
METHODS: We analyzed SCP2 expression using data from TCGA and GTEx databases. Prognostic significance was evaluated via Kaplan-Meier and Cox regression analyses, alongside nomogram construction. Functional mechanisms were investigated through GO, KEGG, and GSEA enrichment analyses. Genetic alter
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Colorectal cancer (CRC) is a highly vascularised tumour often characterised by elevated oxidative phosphorylation (OXPHOS) activity, positioning OXPHOS as a potential metabolic vulnerability for targeted therapy. SLIRP is an RNA-binding protein involved in the post-transcriptional regulation of mitochondrial gene expression. However, its specific function and underlying mechanism in CRC remain poorly understood.
METHODS: Clinical specimens and public databases were utilised to analyse both the subcellular localisation and expression of SLIRP in CRC. The functional role of SLIRP in
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: High-sensitivity C-reactive protein (hs-CRP) has emerged as a significant biomarker for assessing inflammatory activity in atherosclerosis, which may predict sudden death, especially in individuals with advanced atherosclerotic disease or those at high risk for acute events.
METHODS: This systematic review aimed to evaluate the significance of changes in hs-CRP levels over time in the population with atherosclerosis; the frequency of cardiovascular events, including mortality, stroke, and myocardial infarction; and changes in the progression of atherosclerosis. We conducted a comp
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tomato (Solanum lycopersicum), despite being the most important vegetable crop world-wide, remains vulnerable to over 200 diseases caused by different pests. Although tomato molecular response to individual stresses is well studied, the gene regulatory network (GRN) representing the crosstalk and trade-offs of multi-stress responses remains almost unexplored. We developed GENIAL (Gene rEgulatory Network and topologIcal datA anaLysis) to refine and analyze complex GRNs and TomTom, a knowledge graph that gathers 11 publicly available databases in a unique FAIR (Findable, Accessible, Interoperabl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic adenocarcinoma (PAAD) is a highly aggressive malignancy characterized by rapid progression. In this study, we identify the small MAF protein, MAFF, as a critical driver of PAAD tumorigenesis and a negative regulator of the necroptotic pathway. MAFF silencing significantly suppressed malignant phenotypes in PAAD cells in vitro and attenuated overall tumor growth in vivo, while ectopic expression promoted tumor progression. Mechanistically, RNA-sequencing and Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) identified necroptosis as a key pathway suppressed by MAFF. We established that MAFF acts a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: La ribonucleoprotein domain family member 7 (LARP7) is an RNA-binding protein that belongs to the LARP family, acting as a tumor suppressor in multiple cancers. However, the role of LARP7 in lung cancer cell bio-behaviors and the underlying mechanisms are not well clarified. This study aims to investigate the role of LARP7 in regulating lung cancer phenotypes and its association with non-small cell lung cancer (NSCLC).
METHODS: In this study, we first utilized public databases to assess the expression of LARP7 in lung cancer, then explored the effects of LARP7 on tumor growth, as
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome (ME/CFS) is a chronic, multisystem disease characterized by post-exertional malaise and persistent fatigue. The cause of ME/CFS is not well understood, and there are no established biomarkers or FDA-approved pharmacotherapies. The clinical heterogeneity of ME/CFS presents challenges to diagnosis and treatment and necessitates collaborative efforts to generate robust findings. This study leveraged gene and protein expression data from the mapMECFS data repository and the DecodeME Genome-Wide Association Study (GWAS) to assess consistent gene si
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Papillary thyroid carcinoma (PTC) is the most prevalent malignant tumor of the endocrine system, yet the specific role of Forkhead box protein K2 (FOXK2) in its progression remains incompletely elucidated. Analyses based on public databases and 31 pairs of matched clinical specimens revealed that both FOXK2 and SH2D3A were significantly upregulated in PTC tissues and cell lines, with their expression levels showing a strong positive correlation. Functional experiments indicated that knockdown of FOXK2 or SH2D3A markedly inhibited PTC cell proliferation, invasion, and migration while reducing t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Whole-exome sequencing identified a novel de novo heterozygous LEF1 variant (c.880 C > T; p.Pro294Ser) in a male pediatric patient who presented with intractable chronic yellow-green watery diarrhea with onset at 18 months of age. The condition persisted for 4 years and was complicated by protein-energy malnutrition and growth failure refractory to standard therapy. Gastrointestinal endoscopy showed mucosal edema accompanied by mild chronic inflammation, and this variant was not present in public population genomic databases. Functional validation was performed in Lef1 (c.876 C > G; p.Pro292Se
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Whole genome shotgun sequencing and assembly is routine. However, identifying protein-coding genes in newly assembled genomes remains complex, time-consuming, and labour-intensive. Therefore, most eukaryotic genome assemblies in public databases lack gene annotations reducing their value for evolutionary and functional genomics. Here, we present fDOG-Assembly (fDA), a novel tool for targeted, feature architecture-aware ortholog searches directly in unannotated genome assemblies. Benchmarking shows that fDA performs similarly to BUSCO and Compleasm in ortholog identification while offering the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Medicinal chemistry research : an international journal for rapid communications on design and mechanisms of action of biologically active agents2026eng
The genus Laggera (Asteraceae) comprises medicinal plants traditionally used for treating inflammatory, infectious, and respiratory disorders. However, a comprehensive review of its phytochemistry and pharmacological potential is still limited. A systematic literature search was conducted across major scientific databases, including PubMed, Scopus, Web of Science, and Google Scholar, covering publications through April, 2026. Keywords such as "Laggera", "phytochemistry", "essential oil", "pharmacology", and "synthesis" were used. Relevant studies were selected based on their focus on chemical
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Biomarker-guided stratification is essential for optimizing adjuvant systemic therapy in early-stage breast cancer, requiring a balance between therapeutic benefit and avoidance of overtreatment.
AREAS COVERED: This review summarizes established and emerging prognostic and predictive biomarkers guiding adjuvant therapy selection. Evidence was synthesized from structured searches of PubMed, EMBASE, clinical trial databases and author expertise, focusing on morphological and molecular biomarkers, including multigene assays, protein and immune-based markers, mutation profiling, liq
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Radioresistance is one of the primary causes of prostate cancer treatment failure and post-radiotherapy progression. However, there is currently a lack of effective targets to increase radiotherapy sensitivity and inhibit malignant progression. We identified AKR1C3 as a potential key target associated with radioresistance and malignant progression through integrated bioinformatic analysis of RNA sequencing (RNA-seq) data from prostate cancer clinical samples in The Cancer Genome Atlas (TCGA) and Gene Expression Omnibus (GEO) databases. The promotion of radioresistance by AKR1C3 in both AR-posi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ginsenosides are triterpenoid saponins and the main active compounds in Panax ginseng. They are key bioactives contributing to ginseng's antioxidant, immunomodulatory, and anti-aging effects, supporting their role in functional foods and targeted therapies. Current anti-aging research often focuses on individual organs, neglecting the interconnected nature of aging across multiple organs. We aims to systematically review and meta-analyze the effects and mechanisms of ginsenosides on multi-organ aging. We conducted a systematic search of five databases for studies published until 31 December 20
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования