Background: The cellular heterogeneity and spatial organization patterns of the tumor microenvironment (TME) play a crucial role in colorectal cancer (CRC) progression, but their spatial distribution and cellular communication mechanisms require further elucidation. This study aims to systematically dissect the cellular heterogeneity and spatial organization characteristics of the CRC microenvironment by integrating single-cell and spatial transcriptomic data. Methods: Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics data of primary CRC were integrated to characterize the TME. Intercellu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mitochondria-associated endoplasmic reticulum membranes (MAM) play a critical regulatory role in cancer, yet their function in bladder cancer (BCa) remains unclear.
METHODS: This study conducted a comprehensive analysis of extensive RNA sequencing and single-cell transcriptomic data. A MAM risk feature model was constructed and evaluated using LASSO-Cox regression, Kaplan-Meier survival curves, and receiver operating characteristic (ROC) analysis. Cell communication networks were decoded using CellChat, and tumor-infiltrating immune cells were quantified through CIBERSORT. Machine
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ovarian cancer is the second most frequently occurring cancer and the most fatal gynecological malignancy of all gynecological cancers worldwide. MicroRNAs (miR) have been reported to be downregulated or upregulated in a variety of human malignancies, and involved in the formation and progression of the majority of human cancers, including epithelial ovarian cancer (EOC). miR‑320 has been identified as a tumor suppressor in multiple human cancers. However, the expression levels, biological role and underlying mechanisms of miR‑320 in EOC remain to be elucidated. In the present study, reverse t
СтатьяОтозванная публикацияПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: MiRNAs are small, noncoding RNA molecules that serve as important regulators of cancer-related processes. Abnormal expression of miR-577 has been found in several tumors. However, the expression pattern and biological function of miR-577 in progression of papillary thyroid cancer (PTC) remain unknown. This study is aimed to determine its expression pattern and explore the function underlying the mechanism of miR-577 in PTC.
PATIENTS AND METHODS: Using quantitative RT-PCR, we detected miR-577 expression in PTC cell lines and primary tumor tissues. MTT assay and colony formation were
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Comprehensive analysis of gene expression using RNA extracted from frozen lymphoma specimens is becoming increasingly important for understanding disease pathogenesis, disease subclassification, and prognostication. As paraffin tissues are widely available whereas frozen specimens are not, development of gene expression analysis based on RNA extracted from paraffin-embedded tissues would facilitate application of the accumulated knowledge to a sample type that is typical of clinical practice. In the present study, we have developed and optimized methods of RNA extraction from paraffin-embedded
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To gain insights into the molecular basis for metastasis, we compared the global gene expression profile of metastatic colorectal cancer with that of primary cancers, benign colorectal tumors, and normal colorectal epithelium. Among the genes identified, the PRL-3 protein tyrosine phosphatase gene was of particular interest. It was expressed at high levels in each of 18 cancer metastases studied but at lower levels in nonmetastatic tumors and normal colorectal epithelium. In 3 of 12 metastases examined, multiple copies of the PRL-3 gene were found within a small amplicon located at chromosome
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Follicular lymphoma (FL), an indolent neoplasm caused by a t(14;18) chromosomal translocation that juxtaposes the BCL2 gene and immunoglobulin locus, has a variable clinical course and frequently undergoes transformation to an aggressive lymphoma. Although BCL2 mutations have been previously described, their relationship to FL progression remains unclear. In this study, we evaluated the frequency and nature of BCL2 mutations in 2 independent cohorts of grade 1 and 2 FLs, along with the correlation between BCL2 mutations, transformation risk, and survival. The prevalence of BCL2 coding sequence
Клиническое исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CHD7 is a chromatin remodeler protein that controls gene expression via the formation of multi-protein complexes with specific transcription factors. During development, CHD7 controls several differentiation programs, mainly by acting on neural progenitors and neural crest (NC) cells. Thus, its roles range from the central nervous system to the peripheral nervous system and the organs colonized by NC cells, including the heart. Accordingly, mutated CHD7 is linked to CHARGE syndrome, which is characterized by several neuronal dysfunctions and by malformations of NC-derived/populated organs. Alt
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung cancer is one of the main causes of cancer mortality globally. Most patients received radiotherapy during the course of disease. However, radioresistance generally occurs in the majority of these patients, leading to poor curative effect, and the underlying mechanism remains unclear. In the present study, miR-18a-5p expression was downregulated in irradiated lung cancer cells. Overexpression of miR-18a-5p increased the radiosensitivity of lung cancer cells and inhibited the growth of A549 xenografts after radiation exposure. Dual luciferase report system and miR-18a-5p overexpression iden
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Major gynecological malignancy like cervical cancer faces global challenges in conventional treatments, leading researchers to explore newer anticancer therapeutics with reduced toxicity and off-target effects. Traditional ethnomedicinal plants with source of novel adjuvant chemotherapeutics are attracting considerable interest. β-catenin pathway dysregulation is cardinal in cancer propagation, with well-noted regulation in migration/EMT-potential and cancer cell stemness. Present study focuses towards identifying molecular mechanisms of anti-migratory efficacy of Croton caudatus leaf-extract
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcription factor FOXP2 participates in language acquisition and increasing evidence suggests that dysregulation of FOXP2 is associated with human tumorigenesis and progression. Reducing FOXP2 levels has increased breast cancer stem cell viability, but its inhibitory mechanisms to cancer stem cells are still not fully understood. In this study, we found that the expression levels of FOXP2 were downregulated in clinical breast cancers and negatively correlated with the cancer stem cell marker ALDH1. We demonstrated that the expression of FOXP2 was significantly decreased in the mammosphere f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Glioblastoma (GBM) is a highly aggressive brain tumor, with glioblastoma stem cells (GSCs) occupying the pinnacle of a complex tumor microenvironment (TME), conferring therapeutic resistance. The TME plays a role in tumor development by creating a niche rich in reactive oxygen species (ROS) through oxidative stress (OS). Here, we identified NAD(P)H: quinone oxidoreductase 1 (NQO1) as an essential regulatory factor in antioxidant stress response, which is key to maintaining GSCs and the immunosuppressive TME.
METHODS: Proteomics analysis and epigenetic profiling using H3K27ac ChIP-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumorigenesis is typically accompanied by cellular dedifferentiation and the acquisition of stem cell-like attributes. However, few studies have comprehensively evaluated the putative relationships between these characteristics and various cancers. Here, we integrated gene expression and DNA methylation quantitative trait loci (cis-eQTL and cis-mQTL) data from the blood to perform multi-omics Mendelian randomization analysis. Our analyses revealed 967 stem cell-associated genes (P < 0.05) and 11,262 methylation sites (P < 0.01) significantly related to 12 cancers. SMAD7 (cg14321542) in colon c
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metastasis and therapy resistance are main clinical challenges of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) still limiting patient`s prognosis. Both are dependent on tumor cell plasticity, which allows rapid adaptation of tumor cells to changing microenvironmental conditions. Epithelial-Mesenchymal-Transition (EMT), a process by which carcinoma cells acquire invasive abilities, is associated with a gain of cancer stem cell (CSC) properties. Different CSC phenotypes were described in PDAC, whereby high levels of the CSC marker Nestin was identified in CSC clones of mesenchymal Panc1 cells, while
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The local expression of coagulation-related genes defines the tumor coagulome. The tumor coagulome plays a pivotal role in cancer-associated thrombosis (CAT) and hemostatic complications, such as venous thromboembolism (VTE), which are frequent in patients with advanced/metastatic cancer. Genomic analyses of human tumors, such as skin cutaneous melanoma (SKCM), have unveiled the complexity of the metastatic trajectories. However, no study to date has focused on the metastatic coagulome along these trajectories. Using bulk-tumor and single-cell analyses of primary SKCM, metastastic samples and
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer stem cells (CSCs) are pervasively present in human cancers and have a fundamental role in treatment failure and disease recurrence. Identifying critical elements that sustain the CSC phenotype may lead to novel strategies for cancer treatment. Here, we provide evidence of an essential link between the σ1 receptor (σ1R), a ligand-regulated chaperone protein residing preferentially at the endoplasmic reticulum-mitochondria contact sites, and CSCs in castration-resistant prostate cancers (CRPCs). Integrating functional assays in multiple preclinical models with transcriptomic and proteomic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bladder cancer (BCa) presents a significant clinical challenge, with a pressing need for biomarkers to predict prognosis and guide immunotherapy. Aly/REF export factor (ALYREF) is a key regulator in various cancers, but its role in bladder cancer (BCa) remains unclear. This study aimed to investigate the clinical significance of ALYREF and its association with immunotherapy response and metastatic potential in BCa. We integrated pan-cancer bioinformatic analyses with clinical validation using RT-qPCR, immunohistochemistry, and Western blot on patient samples. We assessed ALYREF's correlation w
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prostate cancer risk is influenced by various factors, including exposure to heavy metals like cadmium (Cd). The study reveals that the autophagy-regulating gene PLAC8 (placenta-specific 8) is significantly involved in Cd-induced prostate carcinogenesis, and NF-κB acts as the upstream transcriptional activator of PLAC8, which then selectively up-regulates BCL-xL, providing a survival advantage to Cd-transformed cells. NF-κB activation stabilizes PLAC8 in the cytosol, disrupting autophagy by allowing PLAC8 to colocalize with LC3B instead of LAMP1. Silencing NF-κB down-regulates PLAC8 and its su
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emerging evidence indicates that androgen receptor (AR) signaling plays a critical role in the pathogenesis of male-dominant urothelial cancer. Meanwhile, latrophilins (LPHNs), a group of the G-protein-coupled receptor to which a spider venom latrotoxin is known to bind, remain largely uncharacterized in neoplastic diseases. The present study aimed to determine the functional role of LPHN3 (encoded by the ADGRL3 gene), in association with AR signaling, in urothelial tumorigenesis. In human normal urothelial SVHUC cells, AR overexpression and androgen treatment considerably increased the expres
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycosis fungoides (MF) is the most common primary cutaneous T-cell lymphoma. While initially restricted to the skin, malignant cells can appear in blood, bone marrow and secondary lymphoid organs in later disease stages. However, only little is known about phenotypic and functional properties of malignant T cells in relationship to tissue environments over the course of disease progression. We thus profiled the tumor micromilieu in skin, blood and lymph node in a patient with advanced MF using single-cell RNA sequencing combined with V-D-J T-cell receptor sequencing. In skin, we identified clo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.