Familial Mediterranean fever (FMF) is the most common hereditary inflammatory periodic disease, characterized by recurrent episodes of fever and abdominal pain, synovitis, and pleuritis. The aim of this study was to determine the frequency and distribution of Mediterranean fever (MEFV) gene mutations in Van province of Eastern Anatolia and to compare them with the other studies from various regions of Turkey. Therefore, we retrospectively evaluated MEFV gene mutations in 1058 pediatric patients with suspected FMF. The MEFV gene mutations were investigated using Sanger sequencing and the multip
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although modern Chlamydia muridarum has been passaged for decades, there are no reports on the consequences of serial passage with strong selection pressure on its fitness. In order to explore the potential for Pasteurian selection to induce genomic and phenotypic perturbations to C. muridarum, a starter population was passaged in cultured cells for 28 generations without standard infection assistance. The resultant population, designated CMG28, displays markedly reduced in vitro dependence on centrifugation for infection and low incidence and severity of upper genital tract pathology followin
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To design and evaluate a next-generation sequencing (NGS)-based method for T-cell receptor γ (TCRG) gene-based T-cell clonality testing on the Ion Torrent Personal Genome Machine (Life Technologies, Carlsbad, CA) platform.
METHODS: We analyzed a series of peripheral blood, bone marrow, and formalin-fixed paraffin-embedded tissue specimens with NGS vs traditional capillary electrophoresis methods.
RESULTS: Using a custom analysis algorithm that we developed, our NGS assay identified between 2,215 and 48,222 unique TCRG rearrangements in a series of 48 samples. We established crite
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The importance of proper mutational analysis of BRCA1/2 in individuals at risk for hereditary breast and ovarian cancer syndrome is widely accepted. Standard genetic screening includes targeted analysis of recurrent, population-specific mutations. The purpose of the study was to establish the frequency of germline BRCA1/2 mutations in a group of 134 unrelated patients with primary ovarian cancer. Next generation sequencing analysis revealed a presence of 20 (14.9%) mutations, where 65% (n = 13) were recurrent BRCA1 alterations included in the standard diagnostic panel in northern Poland. Howev
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent studies have confirmed the utility of massively parallel sequencing (MPS) in addressing genetically heterogeneous hereditary hearing impairment. By applying a MPS diagnostic panel targeting 129 known deafness genes, we identified a novel frameshift GATA3 mutation, c.149delT (p.Phe51LeufsX144), in a hearing-impaired family compatible with autosomal dominant inheritance. The GATA3 haploinsufficiency is thought to be associated with the hypoparathyroidism, sensorineural deafness, and renal dysplasia (HDR) syndrome. The pathogenicity of GATA3 c.149delT was supported by its absence in the 54
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Follicular lymphoma (FL) is currently incurable using conventional chemotherapy or immunotherapy regimes, compelling new strategies. Advances in high-throughput sequencing technologies that can reveal oncogenic pathways have stimulated interest in tailoring therapies toward actionable somatic mutations. However, for mutation-directed therapies to be most effective, the mutations must be uniformly present in evolved tumor cells as well as in the self-renewing tumor-cell precursors. Here, we show striking intratumoral clonal diversity within FL tumors in the representation of mutations in the ma
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vibrio cholerae has evolved to adeptly transition between the human small intestine and aquatic environments, leading to water-borne spread and transmission of the lethal diarrheal disease cholera. Using a host model that mimics the pathology of human cholera, we applied high density transposon mutagenesis combined with massively parallel sequencing (Tn-seq) to determine the fitness contribution of >90% of all non-essential genes of V. cholerae both during host infection and dissemination. Targeted mutagenesis and validation of 35 genes confirmed our results for the selective conditions with a
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In embryonic stem (ES) cells, bivalent chromatin domains containing H3K4me3 and H3K27me3 marks silence developmental genes, while keeping them poised for activation following differentiation. We have identified gene sets associated with H3K27me3 and H3K4me3 marks at transcription start sites in a high-grade ovarian serous tumour and examined their association with epigenetic silencing and malignant progression. This revealed novel silenced bivalent marked genes, not described previously for ES cells, which are significantly enriched for the PI3K (P<10(-7)) and TGF-β signalling pathways (P<10(-
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The somatic genetic basis of chronic lymphocytic leukemia, a common and clinically heterogeneous leukemia occurring in adults, remains poorly understood.
METHODS: We obtained DNA samples from leukemia cells in 91 patients with chronic lymphocytic leukemia and performed massively parallel sequencing of 88 whole exomes and whole genomes, together with sequencing of matched germline DNA, to characterize the spectrum of somatic mutations in this disease.
RESULTS: Nine genes that are mutated at significant frequencies were identified, including four with established roles in chronic l
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Liuwei Dihuang pills (LW) are widely used as the traditional tonic prescription for the treatment of diabetes and diabetic kidney disease (DKD). This study aimed to investigate the potential mechanism underlying LW-mediated prevention and treatment of DKD from the perspective of host-gut microbiome co-metabolism.
METHODS: A rat model of DKD was established using high-fat diet and streptozotocin. Levels of type IV collagen (Col IV), fibronectin (FN), laminin (Lam), transforming growth factor-β (TGF-β), SMAD family member 7 (SMAD7), and SMAD3 in the kidneys were determined by real t
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Real-time quantitative PCR is used routinely for the high-throughput diagnosis of viral pathogens, such as West Nile virus (WNV). Rapidly evolving RNA viruses present a challenge for diagnosis because they accumulate mutations that may render them undetectable. To explore the effect of sequence variations on assay performance, we generated every possible single point mutation within the target region of the widely used TaqMan assay for WNV and found that the TaqMan assay failed to detect 47% of possible single nucleotide variations in the probe-binding site and was unable to detect any targets
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Echoviruses (E) are a diverse group of viruses responsible for various pathological conditions in humans including aseptic meningitis, myocarditis, and acute flaccid paralysis. The detection and identification of echovirus genotypes in clinical samples is challenging due to its high genetic diversity. Here, we report the complete genome sequences of nine echoviruses, obtained by next-generation sequencing of 238 fecal samples from individuals with gastroenteritis in regions of Brazil. Detected viruses were classified into six genotypes: Three E1 sequences (BRA/TO-028, BRA/TO-069 and BRA/TO-236
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Metagenomic next-generation sequencing (NGS) of cerebrospinal fluid (CSF) has the potential to identify a broad range of pathogens in a single test.
METHODS: In a 1-year, multicenter, prospective study, we investigated the usefulness of metagenomic NGS of CSF for the diagnosis of infectious meningitis and encephalitis in hospitalized patients. All positive tests for pathogens on metagenomic NGS were confirmed by orthogonal laboratory testing. Physician feedback was elicited by teleconferences with a clinical microbial sequencing board and by surveys. Clinical effect was evaluated
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАКлиническое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To determine a panel of serum microRNAs (miRNAs) that could be used as novel biomarkers for diagnosis of hepatocellular carcinoma (HCC).
METHODS: We initially screened 9 out of 754 serum miRNAs by TaqMan Low Density Array in two pooled samples respectively from 35 HCC and 35 normal controls, and then validated individually by RT-qPCR in another 114 patients and 114 controls arranged in two phases. The changes of the selected miRNAs after operation and their prognostic value were examined.
RESULTS: miR-375, miR-10a, miR-122 and miR-423 were found to be significantly higher in HCC than in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The 2022 MPXV global health emergency highlighted the necessity for rapid diagnostic measures in response to mpox clade IIb outbreaks. This study investigates the mpox lineages identified in Thailand during this period and explores the transmission dynamics of dominant lineages.
METHODS: Using targeted next-generation sequencing from 162 individuals infected with mpox, we created a transmission network map by linking high-similarity sequences through molecular-temporal distance matrices.
RESULTS: Our findings reveal that the study population aligns with global trends of transmiss
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Cryptococcosis has attracted global attention due to its high mortality rate, unique geographical distribution, and tendency to cause severe and rapid disease progression. Metagenomic next-generation sequencing (mNGS) is a novel detection technology that provides diagnostic insights for identifying pathogens, particularly rare ones. The present article describes 4 individuals diagnosed with pulmonary cryptococcosis (PC) using mNGS of bronchoalveolar lavage fluid (BALF).
CASE PRESENTATION: Among these patients, 3 had cancer, 1 had sarcoidosis and diabetes, and 2 were exposed to p
СтатьяКлинический случайОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The phytopathogenic fungus Leptosphaeria biglobosa is the host of diverse mycoviruses. Comprehensive analysis of next-generation sequencing (NGS) data obtained from purified double-stranded RNA (dsRNA) revealed the presence of three single-stranded RNA (ssRNA) molecules. These RNAs, designated ssRNA1, ssRNA2, and ssRNA3, are respectively 2,646, 683, and 575 bp in length. ssRNA1 contains a single open reading frame (ORF) encoding a putative RNA-dependent RNA polymerase (RdRP) and represents the genome of a novel member of the family Botourmiaviridae, designated as "Leptosphaeria biglobosa botou
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Large pancreatic cystic lesions (PCLs) have a higher risk of malignant transformation compared with smaller PCLs, although the biological basis for this remains unclear. We aimed to study the high-risk mutation (HRM) patterns in large vs small PCLs using cyst fluid next-generation sequencing (NGS) analysis.
STUDY DESIGN: This is a large multicenter study that included patients with PCLs who underwent pancreatic cyst fluid PancreaSeq NGS testing between January 2018 and February 2020. Patients without index cyst size data were excluded from this study. HRMs were defined as alterati
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Enhanced immune response against bacterial flagellins among patients with Crohn's disease (CD) is associated with aggressive disease course. However, its association with response to biologic treatment is unknown. We aimed to assess whether treatment response among patients with CD is associated with antibody reaction to bacterial flagellins and related microbial alterations.
METHODS: Thirty-nine patients with active CD (Harvey-Bradshaw Index > 4 or fecal calprotectin > 150 μg/g) commencing biologic treatment were included. Serum and stool samples were collected at baseline and
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Dynamic changes in ctDNA variant allele frequency reflect real-time therapeutic efficacy. Timely treatment modification guided by ctDNA variant allele frequency may enable precision selection of optimized regimens to counteract evolving resistance in breast cancer. In this study, we developed a therapeutic approach integrating ctDNA dynamics with sequential organoid drug screening to optimize breast cancer treatment. Targeted deep sequencing on plasma samples from 71 patients with breast cancer revealed that ctDNA clearance correlates with improved disease-free survival. Additional
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования