To ensure genome stability, mammalian cells employ several DNA repair pathways. Nonhomologous DNA end joining (NHEJ) is the DNA repair process that fixes double-strand breaks throughout the cell cycle. NHEJ is involved in the development of B and T lymphocytes through its function in V(D)J recombination and class switch recombination (CSR). NHEJ consists of several core and accessory factors, including Ku70, Ku80, XRCC4, DNA ligase 4, DNA-PKcs, Artemis, and XLF. Paralog of XRCC4 and XLF (PAXX) is the recently described accessory NHEJ factor that structurally resembles XRCC4 and XLF and interac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Severe combined immunodeficiency (SCID) mice are defective in their ability to rearrange their variable (V), diversity (D) and joining (J) genetic elements to generate functional immunoglobulin (Ig) and T-cell receptor (TCR) molecules; as a result, they lack mature B and T cells. These mice are highly sensitive to ionizing radiation, suggesting that the product of the scid gene plays a critical role in both V(D)J recombination and DNA double-strand break repair. Recent studies suggest that the SCID defect lies in the gene encoding the catalytic subunit of DNA-dependent protein kinase (DNA-PK;
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Timely diagnosis of tuberculosis (TB) remains a critical challenge, highlighting the need for better screening tools. Traditional antibody-based detection methods for TB are often costly and cumbersome. To address this, we developed a streamlined centrifugal SELEX approach using a 69-nucleotide DNA library and the recombinant TB biomarker Ag85B, towards fabrication of an aptasensing platform offering a simpler and faster alternative.
RESULTS: Two high affinity DNA aptamers were screened through 12 rounds of SELEX and verified with in silico docking, circular dichroism spectroscopy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of >300 serovars of Leptospira confounded the use of generalized bacterin, the whole cell lysate, as vaccines to control leptospirosis. Because of substantial genetic and geographic heterogeneity among circulating serovars, one vaccine strain per serovar cannot be efficacious against all the serovars. We have performed heterologous DNA prime-protein boost vaccination challenge studies in hamsters using in vivo expressed, leptospiral recombinase A (RecA) and flagellar hook associated protein (FliD). We prepared the monovalent recombinant protein, plasmid DNA, and DNA prime protein
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polymyositis is regarded as an autoimmune inflammatory muscle disease. A major subgroup of patients have autoantibodies to cellular histidyl-transfer RNA synthetase (HRS). We have analyzed the role of the autoantigen HRS in the induction of murine myositis in a comparative study of inoculation of BALB/c mice with recombinant HRS protein versus naked DNA coding for HRS. Adult BALB/c mice produced antibodies to human HRS following inoculation with HRS protein and adjuvant, but myositis was not observed. Alternatively, expression plasmid DNA constructs encoding full-length and truncated human HRS
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
According to the cDNA sequence of anti-neuroexcitation peptide of scorpion Buthus martensii Karsch, the putative mature anti-neuroexcitation peptide (ANEP) encoding DNA fragment was obtained by a PCR method, then was cloned into expression plasmid pET28a, fused with His tag at its 3' end. When expressed in E. coli BL21 (DE3), the expression of recombinant ANEP was 15% of total cellular proteins, while most recombinant ANEP products existed in the form of insoluble inclusion bodies. Coexpression of molecular chaperones or protein disulfide isomerase could not improve its solubility. The recombi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Structural Maintenance of Chromosomes (SMCs) are part of a large family of ring complexes that participates in a number of DNA transactions. Among SMCs, SMC1A gene is unique. It encodes a subunit of the cohesin-core complex that tethers sister chromatids together to ensure correct chromosome segregation in both mitosis and meiosis. As a member of the cohesin ring, SMC1A takes part in gene transcription regulation and genome organization; and it participates in the DNA Damage Repair (DDR) pathway, being phosphorylated by Ataxia Telangiectasia Mutated (ATM) and Ataxia Telangiectasia and Rad3 Rel
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fanconi anaemia (FA) is a hereditary disease featuring hypersensitivity to DNA cross-linker-induced chromosomal instability in association with developmental abnormalities, bone marrow failure and a strong predisposition to cancer. A total of 17 FA disease genes have been reported, all of which act in a recessive mode of inheritance. Here we report on a de novo g.41022153G>A; p.Ala293Thr (NM_002875) missense mutation in one allele of the homologous recombination DNA repair gene RAD51 in an FA-like patient. This heterozygous mutation causes a novel FA subtype, 'FA-R', which appears to be the fi
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Budding yeast Slx4 interacts with the structure-specific endonuclease Slx1 to ensure completion of ribosomal DNA replication. Slx4 also interacts with the Rad1-Rad10 endonuclease to control cleavage of 3' flaps during repair of double-strand breaks (DSBs). Here we describe the identification of human SLX4, a scaffold for DNA repair nucleases XPF-ERCC1, MUS81-EME1, and SLX1. SLX4 immunoprecipitates show SLX1-dependent nuclease activity toward Holliday junctions and MUS81-dependent activity toward other branched DNA structures. Furthermore, SLX4 enhances the nuclease activity of SLX1, MUS81, and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA topoisomerase II is involved in DNA topologic changes through the formation of a cleavable complex. This is stabilized by the antitumor drug VP16, which results in DNA breakage, aberrant recombination, and cell death. In this work, we compare the chromosomal damage induced by VP16 with that induced by bleomycin (BLM) in lymphoblasts from patients affected by the chromosome breakage syndromes ataxia telangiectasia (AT), xeroderma pigmentosum (XP), and Bloom syndrome (BS), and by the progeroid syndromes Werner (WS) and Cockayne (CS). Patients affected by AT, XP, BS, and WS have a greatly enh
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new chimeric oncogene, trk-2h, has been generated by recombination of two segments of MDA-MB231 human breast carcinoma cell line DNA after transfection in NIH/3T3 cells. The rearranged DNA segments form a fused transcriptional unit. Sequences at the 3' end are homologous to the tyrosine kinase receptor moiety found in the trk oncogene which resembles a truncated growth factor receptor lacking part of its extracellular domain (Martin-Zanca et al., 1986). The 5' sequence of the trk-2h oncogene is contributed by a gene which is expressed in all human cells tested, and is not related to any know
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To overcome low efficiency and/or genomic instability induced by DNA cleavage in current genome-editing approaches, a novel pop-in/pop-out-based editing system was developed for Pichia pastoris. An ingenious arrangement of components leads to a more efficient screening by permitting the only type of DNA recombination under defined pressure conditions, in terms of the overall efficiency of gene editing, the system virtually depends on the integration efficiency mediated by single-crossover recombination. It does not rely on exogenous recombinases or programmable nucleases such as Cas9, thereby
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Imidocarb dipropionate (IMD) is a chemotherapeutic agent prescribed for the treatment and control of babesiosis; it is known to be a nucleic acid synthesis inhibitor. Although it is an effective babesicide, there are reports of persistent IMD residues retained at high levels in edible tissues of cattle, swine and sheep, raising concerns about potential effects on humans. Since the carcinogenic potential of a chemical compound can be assessed through its effect on the homologous recombination, we investigated whether IMD is recombinogenic in Aspergillus nidulans diploid cells and whether it is
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Faulty DNA repair and epigenetic regulation contribute to neurodegeneration in Alzheimer's disease. Long-read sequencing enables analysis of "dark regions" that are difficult to study via traditional sequencing methodologies.
METHODS: Using nanopore whole-genome DNA sequencing of post mortem brain from early- and late- stage Alzheimer's disease cases and controls, we analyzed retrotransposition, non-allelic homologous recombination (NAHR), structural variation, and DNA methylation within repetitive regions.
RESULTS: Retrotransposon insertions and NAHR were enriched in centromer
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: DNA repair pathways have been leveraged for genetic engineering strategies, including self-eliminating transgenes in insects. In effort towards establishing a self-eliminating transgenic system that leaves desired cargoes like antibodies or anti-viral molecules in Aedes aegypti, steps were taken to generate a plasmid with direct repeats and other necessary transgenic components. Here, we present an account of series of recombination events in E. coli that were encountered during the building of a multi-component plasmid for achieving a cargo-leaving self-eliminating transgenic syste
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In vertebrate antigen receptor gene rearrangement, V(D)J recombination events can occur by deletion or by inversion. For deletional events, the signal joint is deleted from the genome. Nearly half of the immunoglobulin light chain genes undergo V(D)J recombination in an inversional manner, and both signal and coding joint formation must occur to retain chromosomal integrity. But given the undetermined amount of pre-B and pre-T cell death that occurs during V(D)J recombination, the efficiency with which both joints are completed is not known, nor is the relative efficiency (balance) of signal v
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dysfunction of tumor suppressor genes BRCA1 and BRCA2 is involved in the pathogenesis of malignant tumors, especially breast and ovarian carcinoma. BRCA1/2 genes may be inactivated by germinal and somatic mutations or epigenetic changes. Germinal mutations are responsible for the hereditary breast and ovarian carcinoma syndrome. Defects of BRCA1/2 genes lead to the failure of homologous recombination, the basic mechanism for DNA double strand break repair. The resultant genomic instability is associated with a high risk of malignant transformation of the cell, but it also results in a higher s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A full-length rat androgen receptor cDNA was used to produce a recombinant baculovirus (AcrAR) by homologous recombination. Spodoptera frugiperda (Sf9) cells infected with this virus expressed a 110-kDa polypeptide that amounted up to about one-third of total cell protein. Studies with AR antibodies confirmed that this protein was indeed rAR. Only a minor portion of the recombinant AR was soluble in buffers without ionic detergents, but its complete solubilization was achieved in 6 M guanidine HCl (GdnHCl). Electron microscopy of cell pellets revealed that AR was localized to electron-dense cy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Large serine integrases catalyze unidirectional insertion of large DNA payloads and, in the presence of a cognate recombination directionality factor (RDF), catalyze unidirectional excision. Understanding how directionality is enforced has been hampered by a lack of structural information. Here, we report 8 structures of SPβ integrase-DNA complexes along the integrative (-RDF) and excisive (+RDF) reaction pathways at resolutions extending to 3.15 Å. These include tetrameric intermediates before and after strand exchange and product-bound dimers for both pathways. We find that recombination-ind
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous study has shown that the usual DNA marker for Norrie disease, the L1.28 probe which identifies the DXS7 locus, can recombine with the disease locus. In this study, we used a human ornithine aminotransferase (OAT) cDNA which detects OAT-related DNA sequences mapped to the same region on the X chromosome as that of the L1.28 probe to investigate the family with Norrie disease who exhibited the recombinational event. When genomic DNA from this family was digested with the PvuII restriction endonuclease, we found a restriction fragment length polymorphism (RFLP) of 4.2 kb in size. This fr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования