Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization In-Source Decay (MALDI-ISD) Mass Spectro-metry is a very powerful tool for providing terminal sequence information of biomolecules with minimal sample preparations. Fragmentation is induced at the position where hydrogen radical transfers from the matrix to analyte in the MALDI-ISD process by proposed mechanism. Uniform fragmentation in MALDI-ISD generates relative simple ion spectra of readable sequence ladders with labile modifications retained, which is advantageous over other fragmentation methods such as collision-induced dissociation (CID) for
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
T-cell receptor (TCR)-based therapeutics recognize specific peptides presented by human leukocyte antigens (HLAs) on antigen-presenting cells. The docking orientation of TCRs to peptide-HLA (pHLA) complexes is critical for T-cell activation as it underpins signaling and downstream immune responses. Traditionally, TCR binding geometries with pHLAs have been resolved through X-ray crystallography. Here, we demonstrate that conventional peptide-level hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry (HDX-MS) workflows can identify productive TCR engagement with their cognate pHLAs. By quantifying dif…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stilbenes represent a class of compounds with a common 1, 2-diphenylethylene backbone that have shown extraordinary potential in the biomedical field. As the most well-known example, resveratrol proved to have anti-aging effects and significant potential in the fight against cardiovascular diseases and some types of cancer. Mass spectrometry is an analytical method of critical importance in all studies related to stilbenes that are important in the biomedical field. From the discovery of new natural compounds and mapping the grape metabolome up to advanced investigations of stilbenes' potentia…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis B virus (HBV) remains a major global public health challenge, and its early screening is essential for controlling transmission and improving treatment outcomes. We analyzed serum samples from 422 participants via Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) to establish a screening model for hepatitis B surface antigen (HBsAg)-positive status. Following multi-bin preprocessing and single-sample spectral aggregation, we assessed three machine learning algorithms-random forest, deep neural network, and light gradient boosting machine (Lig…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-throughput lipidomics is increasingly important for large-scale studies and clinical applications. While shotgun lipidomics enables rapid analysis, it suffers from limitations such as carryover, ion suppression, and limited structural specificity. Acoustic droplet ejection mass spectrometry (ADE-MS) presents a novel approach, enabling touchless nanoliter-scale sample introduction at high speed, precision, and accuracy. Initially designed for single-droplet injection, ADE-MS was adapted for direct infusion with stable signals. In this study, we developed and benchmarked a scalable workflow…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Boric acid ingestion in children and adults has been shown to increase urinary riboflavin excretion (1), while high intakes of riboflavin re … an interaction with boron, direct evidence has been lacking. In this study, electrospray ionization mass spectrometry (ESI-MS) was used to investigate complex formation between riboflavin and boric acid. In negative-ion mode at pH 10.3, riboflavin produced a dominant ion at m/z 375.3, and the addition of boric acid resulted in a new signal at m/z 401.3, correspondi …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ascosphaera apis is a fungal pathogen of honeybee larvae and the primary cause of chalkbrood disease, which weakens bee colonies, impairing their ability to function effectively and making them more susceptible to other pathogens and environmental stressors. This study aimed to develop and validate an in-house matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) spectral library for A. apis. A new MALDI-TOF MS library was constructed using reference Ascosphaera species and validated through whole-genome-based confirmation of 31 clinical isolates of A. api…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Native mass spectrometry (nMS) is a powerful label-free method for detecting biomolecular complexes, resolving stoichiometry, and quantifying affinity (Kd). However, signal overlap in heterogeneous systems often limits its accuracy. Charge detection (CD)-nMS, which independently measures the mass-to-charge ratio and charge of individual ions, overcomes this challenge, enabling quantitative analysis of polydisperse and high molecular weight complexes with unresolved charge states. Here, we systematically validate CD-nMS for precise Kd determination using soluble protein-ligand complexes of know…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A significant fraction of atmospheric mercury enters the aquatic and terrestrial environments via the deposition of gaseous oxidized mercury … rized by Raman spectroscopy. Vapor above these solids was analyzed by ion drift-chemical ionization mass spectrometry (ID-CIMS), using the SF6 -, HNO3·NO3 -, and I- reagent ions. When X and Y are both halogens, XHgY readily volatilizes and can be detected by ID-CIMS, based on unique ion products XHgY·F-, XHgY·NO3 -, and XHgY·I-. On the contrary, mixed mercuric salt …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Malaria remains a major public health challenge, causing high mortality and morbidity, particularly in developing countries. Microparticles (MPs), also known as plasma membrane-derived extracellular vesicles (PMEVs), are sub-cellular structures formed by budding off the plasma membrane. Although present in healthy individuals, their numbers increase during pathological conditions such as malaria. While several studies have examined proteins in cell-specific MPs, limited information exists on the protein composition of circulating MPs in malaria and their link to disease symptoms. T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung cancer (LC) is a leading cause of cancer mortality worldwide, frequently complicated by malignant pleural effusion (MPE). This study aimed to investigate volatile organic compounds (VOCs) in pleural effusion to identify metabolic biomarkers for LC. A total of 107 LC-related MPE and 112 benign pleural effusion (BPE) patients were enrolled and divided into discovery (MPE: n = 75; BPE: n = 78) and validation (MPE: n = 32; BPE: n = 34) cohorts. Paired tumor and adjacent nontumor tissues from 14 LC patients formed an independent cohort. Differential VOCs were identified using criteria of q < 0
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Structural proteomics methods allow for the proteome-wide interrogation of protein structural differences between two different conditions. Limited proteolysis mass spectrometry (LiP-MS), as originally implemented by the Picotti lab, utilizes a promiscuous protease to cleave at solvent-exposed regions of a protein to encode structural information, which is then read out with mass spectrometry proteomics. Here, we present a protocol that details experimental steps and data analysis for a LiP-MS workflow. First, tissue is homogenized under native conditions and then subjected to limited proteoly…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Apolipoprotein A-IV amyloidosis (AApoA-Ⅳ) is a rare subtype of cardiac amyloidosis (CA) and is often overlooked because of its clinical similarity to transthyretin (ATTR) CA.
CASE SUMMARY: An 82-year-old man presented with heart failure with preserved ejection fraction. His clinical features, including grade 1 uptake on 99mTc-pyrophosphate scintigraphy, closely mimicked ATTR CA. Histologic examination revealed intracellular Congo red-positive amyloid deposits and characteristic electron microscopic findings. Mass spectrometry-based proteomic analysis confirmed the diagnosis of AAp…
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study profiles the personalized immunopeptidomes of 13 Thai patients with renal cell carcinoma (RCC), addressing a critical knowledge gap in Southeast Asian populations characterized by distinct HLA allele distributions. We combined whole-exome sequencing (WES)-based personalized proteome construction with liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS), using both database-driven searches and de novo peptide sequencing. HLA typing identified several class I allotypes that are underrepresented in publicly available immunopeptidome resources, including seven alleles not previousl…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This review highlights the growing impact of StageTips (Stop and Go Extraction Tips), a pipette tip-based LC column in MS-based proteomics. By packing standard pipette tips with reversed-phase, ion-exchange, or metal oxide materials, StageTips enable efficient peptide desalting, fractionation, selective enrichment, and in-tip reactions with minimal sample loss. Recent improvements, including new resin designs and integrated workflows, have further expanded the applications to phosphoproteomics, protein terminomics, and single-cell proteomics. With their simplicity, high reproducibility, and lo
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Comprehensive steroid profiling by liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) can be achieved using small biospecimen samples. LC-MS/MS assays offer superior accuracy to immunoassays, but they also introduce layers of complexity and opportunities for errors. Validation and harmonization studies are essential to ensure reliable results, as these assays are being increasingly incorporated in clinical laboratories. We developed an LC-MS/MS assay that simultaneously quantifies 18 Δ4 steroids, including mineralocorticoids, glucocorticoids, and androgens (both classic and…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Most commercial passenger jet aircraft use compressed engine air after cooling as a source for ventilation and cabin pressurization onboard. … ing. An approach is presented for documenting exposure to engine oil fumes by using high-resolution mass spectrometry (MS) to monitor and quantify post-translational modifications of subjects' butyrylcholinesterase (BChE) that are consistent with exposure to the engine oil TAPs. We hypothesized that plasma from exposed individuals would show modifications or adduct …
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The adoption of mass spectrometry for high-throughput screening in drug discovery has become increasingly prevalent and has enabled label-free screening against diverse targets. Cellular assays for phenotypic screening, however, are primarily conducted by microscopy as there remain many challenges associated with conducting phenotypic screens via ultra-high throughput mass spectrometry. Following a simple on-plate extraction, infrared matrix-assisted laser desorption electrospray ionization (IR-MALDESI) was employed to directly sample the cell lysate at a speed of one sample per second with hi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate and comprehensive peptide spectrum annotation is a crucial step to interpreting mass spectrometry-based proteomics data. While peak assignment in peptide fragmentation spectra is central to a broad range of proteomics applications, current tools tend to be specialized to a specific task. Here, we present a more comprehensive interactive graphical tool (Annotator), along with the underlying codebase written in Rust (rustyms). Annotator enables unified spectrum annotation for bottom-up, middle-down, top-down, cross-linked, and glycopeptide fragmentation mass spectra from all fragmentati…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Designer benzodiazepines are a commonly misused class of novel psychoactive substances (NPS) that present challenges for forensic toxicology laboratories and public health. Due to the difficulty in detection by routine toxicology methods, it is important to enhance the analytical methods for the identification and quantitation of designer benzodiazepines. The aim of this study was to identify and quantify designer benzodiazepines using gas chromatography coupled with mass spectrometry (GC-MS) in postmortem blood specimens. A method originally validated to identify and quantitate alprazolam was…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования