Adult T-cell leukemia/lymphoma (ATLL) is a T-cell malignancy associated with HTLV-1. The HTLV-1 provirus genome has the pX region that encodes tax and HTLV-1 basic leucine zipper factor (HBZ). Previous studies have reported that the tax gene is expressed in few ATLL cases, but the HBZ gene in all ATLL cases. In this study, we used HBZ gene in situ hybridization (HBZ-ISH) for detection of the HBZ gene in formalin-fixed paraffin-embedded tissues. This method showed that all cases (n = 19) were positive for the ATLL cell line (MT-1, MT-2, and MT-4) and ATLL mouse model (HBZ-Tg mice and NOD/SCID/β…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Histopathological study of bone marrow biopsy (BMB) in chronic myelomonocytic leukemia (CMML) is often difficult and might benefit from an immunohistochemical approach. We immunostained 15 cases of CMML, focusing at two new antibodies staining for CD14 and CD16 on paraffin-embedded tissues. CD68 (KP1), CD68 (PG-M1), and CD163 were not differentially expressed between CMML and chronic myelogenous leukemia (CML). In CMML BMB, we found a significant increase in the number of CD14+ monocytes. This increase was made of dispersed cells in the interstitium, often exhibiting bilobated nuclei, and bein…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) is the most common primary liver cancer and its diagnosis on routine stains is usually straightforward, except in some cases where there may be difficulty in distinguishing HCCs from metastatic carcinomas (MC) and cholangiocarcinomas (CC). Hepatocyte Paraffin 1 antibody (Hep Par 1) is a new monoclonal antibody which reacts with normal and neoplastic hepatocytes, and this study aims to determine its specificity and sensitivity in distinguishing hepatocellular carcinoma (HCC) from cholangiocarcinoma (CC) and metastatic carcinomas (MC). Hep Par 1 antibody was applie…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Paraffin-section immunohistochemistry with heat-induced epitope retrieval using a newly characterized monoclonal antibody (clone 56C6) against the CD10 antigen was performed on 56 hematopoietic tumors previously studied for CD10 expression by flow cytometry. The cases included 33 precursor B-lymphoblastic leukemias, 10 acute myeloid leukemias, five precursor T-lymphoblastic leukemias, five follicular lymphomas, and three Burkitt cell leukemias. Forty of the 56 cases were CD10 positive by flow cytometry studies, including all five follicular lymphomas (100%); 30 of 33 (91%) cases of precursor B…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In 1975, we presented the results of a study on a family with a constellation of features that included a chronic spinocerebellar syndrome, neuropathologically proven Leigh syndrome, and sudden death in infancy or childhood affecting several members over three generations. Inheritance was thought to be autosomal dominant. Twenty years later, we reinterpreted the inheritance pattern as maternal. Mitochondrial DNA (mtDNA) extracted from paraffin-embedded brain samples from the proband revealed the A8344G myoclonic epilepsy and ragged-red fiber (MERRF) mutation as the molecular basis for this mul…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Terminal deoxynucleotidyl transferase (TdT) is a DNA polymerase located in the cell nucleus which catalyses the polymerization of deoxynucleotides at the 3'hydroxyl ends of oligo- or polydeoxynucleotide initiators without a template. TdT is known as a useful marker for the diagnosis of acute lymphoblastic leukaemia/lymphoma, but its detection usually requires fresh tissue specimens or cell suspensions, using either an enzyme analysis or immuno-fluorescence or -peroxidase staining. Until the recent development of the use of microwave-treated paraffin sections for immunoperoxidase staining, dete…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A survey is given of methods involving decalcification and paraffin embedding of iliac crest biopsy for osteological and haematological diagnostic procedures. In order to avoid shrinkage, loss of antigens, and fading of ferritin iron and enzymes, a fixative has been designed that is composed of an aqueous solution of calcium acetate (10(-1) M), glutaraldehyde (0.5%), and formaldehyde (1%; CGF). CGF-fixated specimens are decalcified in an aqueous solution of 10% di-sodium ethylene-diaminotetraacetate (EDTA) neutralized by tris[hydroxy]methylaminomethane and embedded in paraffin. Tissue prepared…
Аннотация на английскомСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MELAS (mitochondrial myopathy, encephalopathy, lactic acidosis, and stroke-like episodes) is a clinically devastating disease of children and young adults. The cause of the stroke-like episodes is not known. We have sequenced the mitochondrial DNA (mtDNA) in archival paraffin-embedded material from two cases. In only one of these did the mitochondrial tRNA(Leu(UUR) gene contain the nucleotide 3243 A-to-G mutation that is most commonly responsible for MELAS. In this case, we determined the relative proportion of mutant:wild-type mtDNA in sections of the central nervous system and other tissues …
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Thin-cut formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tumor sections on glass slides represent a large, underused biorepository for precision oncology, but their long-term room temperature storage raises concerns about nucleic acid integrity and analytical validity. We evaluated whether 20- to 30-year-old archival breast cancer FFPE slides could support contemporary DNA and RNA molecular profiling, including tumor subtyping using orthogonal DNA, and RNA-based approaches.
METHODS: Two archival cohorts were studied: (1) SWOG S8897 low-risk breast tumors stored as 6-µm unstained FFPE section…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer remains the most common cancer affecting women globally, with a disproportionate impact on low- and middle-income countries (LMICs), where survival is poor despite lower incidence. Conducting molecular studies in these settings is often hampered by limited resources and technical challenges, particularly when using traditional DNA sources. This is also true for pharmacogenetic studies among Africans. For this, we propose novel CYP2D6 PCR protocols optimized for formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue blocks, a readily available and accessible resource in LMICs. Although fo…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Adult Schistosoma mansoni parasites inhabit the hepatic portal system of the vertebrate host, their deposited eggs causing granulomatous pathology in both the intestines and liver. In the intestines, egg secretions drive inflammatory processes involved in extravasation to the gut lumen.
METHODS: Here, we investigate parasite-host interactions in a mouse model during the acute phase of a patent infection at 5 and 7 weeks, using parallel histological and proteomic analysis of paraffin-embedded ileal tissues.
RESULTS: Histology at week 7 showed infected animals had more inflammation…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The accumulation of α-synuclein (α-Syn) pathology in peripheral tissues of Parkinson's disease (PD) has attracted growing scientific interest in recent years. Here, we present a protocol for the immunodetection of α-Syn pathology in murine liver tissue from models of PD using fluorescence microscopy. We describe steps for liver isolation, fixation, embedding, and immunodetection using an array of antibodies targeting α-Syn. This approach offers valuable applications for studying PD in transgenic mouse models and could be adapted for human liver tissue. For complete details on the use and execu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Imaging-based spatial transcriptomics (ST) is evolving rapidly as a pivotal technology in studying the biology of tumors and their associated microenvironments. However, the strengths of the commercially available ST platforms in studying spatial biology have not been systematically evaluated using rigorously controlled experiments. In this study, we used serial 5-μm sections of formalin-fixed, paraffin-embedded surgically resected lung adenocarcinoma and pleural mesothelioma tumor samples in tissue microarrays to compare the performance of the single cell ST platforms CosMx, MERFISH, and Xeni…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteomic technologies have advanced our understanding of disease mechanisms, patient stratification and targeted therapies. However, applying cardiac proteomics in translational research requires overcoming the barrier of tissue accessibility. Formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) heart tissue, widely preserved in pathology collections, remains a largely untapped resource. Here we demonstrate that proteomic profiles are well preserved in FFPE human heart specimens and compatible with high-resolution, quantitative analysis. Quantifying approximately 4,000 proteins per sample, we show this a…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prion disease is an infectious and fatal neurodegenerative disease. Western blotting (WB)-based identification of proteinase K (PK)-resistant prion protein (PrPres) is considered a definitive diagnosis of prion diseases. In this study, we aimed to detect PrPres using formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) specimens from cases of sporadic Creutzfeldt-Jakob disease (sCJD), Gerstmann-Sträussler-Scheinker disease (GSS), glycosylphosphatidylinositol-anchorless prion disease (GPIALP), and V180I CJD. FFPE samples were prepared after formic acid treatment to inactivate infectivity. After deparaffiniz…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We evaluated the Xpert MTB/Rif Ultra assay performance for Mycobacterium tuberculosis (MTB) detection in formalin-fixed paraffin-embedded tissue (FFPET) compared to mycobacterial culture or laboratory-developed MTB PCR test (LDT). FFPET samples with histological features suggestive of tuberculosis from 2018 to 2023 were selected. Five hundred microlitres of tissue lysis buffer was added to FFPET scrolls and incubated at 75 °C for 5 min. After adding 50 µl of proteinase K and overnight incubation at 56 °C, sample aliquots were processed as per the manufacturer's instructions. MTB culture or LDT…
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Formalin-fixed, paraffin-embedded tissues represent a majority of all biopsy specimens commonly analyzed by histologic or immunohistochemical staining with adhesive coverslips attached. Mass spectrometry (MS) has recently been used to precisely quantify proteins in samples consisting of multiple unstained formalin-fixed, paraffin-embedded sections. Here, we report an MS method to analyze proteins from a single coverslipped 4-μm section previously stained with hematoxylin and eosin, Masson trichrome, or 3,3'-diaminobenzidine-based immunohistochemical staining. We analyzed serial unstained and s…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Integrity of nucleic acids derived from archived formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) cancer specimens affects diagnosis, prognosis, and therapy. Several factors affect the quality and quantity of extracted nucleic acids and one of such factors is storage period.
AIM: We investigated the impact of storage duration on the quality and quantity of nucleic acids extracted from archived FFPE lymphoma biopsies in Nigeria.
MATERIALS AND METHODS: A total of 53 FFPE biopsies diagnosed as lymphoma stored over several years (2008-2019) were analyzed. They were 22 chronic lymphocytic leuk…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования