Considering that the circulating proteome represents a primary source of candidate biomarkers and therapeutic targets, we conducted a large-scale Mendelian randomization (MR) study to identify plasma proteins potentially involved in the pathogenesis and treatment of common urological cancers (UCs), including bladder cancer (BC), prostate cancer (PC), renal cell carcinoma (RCC), and testicular cancer (TC). Cis-protein quantitative trait loci (cis-pQTLs) were derived from two large-scale genome-wide association studies (GWASs) of plasma proteomes. GWAS for UCs were obtained from FinnGen and pan-…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: As a key index of reproductive performance in pigs, gestation length (GL) exerts a direct influence on litter size and the survi … ions on Sus scrofa chromosomes (SSC) 2, 7, 9, and 14. BFM refined the confidence intervals of these quantitative trait loci (QTLs), narrowing them to 10,460,892-10,737,692 bp and 31,384,086-31,384,333 bp on SSC7:, to 127,322,114-128,205,369 bp on SSC9:, and to 24,640,681-25,479,574 bp on SSC12:. TWAS revealed significant GL-related gene expression changes in relevant tis …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chronic kidney disease (CKD) significantly increases the risk of coronary artery disease (CAD), but the causal plasma proteins linking these conditions are poorly understood. This study aimed to identify genetically validated plasma biomarkers and therapeutic targets for this cardiorenal link.
METHODS: We integrated multi-omics data using a Mendelian randomization (MR) framework. The analysis incorporated protein quantitative trait loci (pQTL) data and gene expression datasets for CAD and CKD. A mediation MR approach identified plasma proteins that genetically mediate the causal p…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The height of the first fruiting branch node (HFFBN) is a core indicator for mechanical harvesting of cotton, and the development of molecular markers for this trait is important for accelerating the breeding process. In this study, using bulked segregant analysis coupled with whole-genome sequencing (BSA-seq), one quantitative trait locus (QTL) associated with the HFFBN was mapped; a molecular marker, qFBH7, associated with the HFFBN of cotton was developed; and its application value was systematically evaluated. A total of 20 lines with extreme phenotypes were selected from the recombinant i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immune-mediated diseases (IMD) encompass a wide range of autoimmune and inflammatory disorders with aetiology related to immune system dysfunction, signifying a disease area with great potential for drug repurposing. In this study, we employed the genetically informed Mendelian Randomization (MR) method with two distinct exposure types: immune blood cell abundance and protein quantitative trait loci (pQTL) to validate and repurpose 834 drug targets which have been investigated for IMD treatment. Utilizing two-sample MR, we first established causal relationships between major peripheral immune …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Infection susceptibility and systemic infection severity arise from distinct tissue barriers and host-response compartments, but plasma-protein genetic studies often treat infection as a broad phenotype. We aimed to define a site-resolved host plasma-protein architecture of infection susceptibility across urinary, lower-respiratory, systemic, and skin/soft-tissue infection outcomes. Methods: We performed proteome-wide two-sample cis-protein quantitative trait locus (cis-pQTL) Mendelian randomization (MR) using UK Biobank Pharma Proteomics Project (UKB-PPP) instruments an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Alzheimer's disease (AD) exhibits marked genetic heterogeneity between early-onset (EOAD) and late-onset (LOAD) forms. EOAD is typically associated with highly penetrant variants, whereas LOAD follows a polygenic architecture dominated by non-coding variation. However, the tissue-specific regulatory consequences of these variants remain insufficiently characterized. This study aimed to compare the regulatory genomic architectures underlying EOAD and LOAD using a multi-tissue integrative approach. Methods: GWAS-associated variants for EOAD and LOAD were retrieved from the
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The purpose was to investigate the shared key genes between chronic periodontitis (CP) and aging.
MATERIALS AND METHODS: First, we collected single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data of peripheral blood samples from patients with CP, aging, and healthy control (HC) and confirmed the cross-group coexpressed and downregulated cell subsets as the core research objects. Subsequently, we explored the dynamic evolutionary rules and functional interaction patterns of these cell subsets by integrating pseudotime trajectory analysis and intercellular communication modeling. Then, we scree
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mitochondrial dysfunction is a key hallmark of aging, and blood-based biomarkers related to mitochondrial genes provide an effec … odels.
METHODS: Summary statistics on ANM, gene expression, DNA methylation, and protein abundance quantitative trait loci (eQTL, mQTL, pQTL) were obtained from public databases. Genetic variations associated with mitochondrial dysfunction were selected as instrumental variables, and SMR analysis was performed to investigate causal relationships with ANM. MR methods wer …
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type 2 diabetes (T2D) is a complex metabolic disorder strongly influenced by genetics. Most genetic studies, including expression quantitative trait loci (eQTL) analyses, use bulk pancreatic tissue, masking cell-specific mechanisms. Here, by integrating single-cell RNA sequencing, chromatin accessibility, and genome-wide association studies (GWAS) data, we systematically identified 328 pancreatic cell-type-specific cis-eQTLs associated with T2D. We pinpointed nine key genes (including STIL in beta and delta cells; ZSWIM5 in alpha, delta, and ductal cells; IL1RN, ANP32E, IPP, MLLT11, and SLC23A…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Constipation currently affects approximately 15% of the global population, and contemporary lifestyles are increasing its incidence every year. A significant number of individuals with constipation also experience ileus, a common surgical emergency known for its sudden onset and rapid progression. However, the intricate dynamics of the relationship between constipation and ileus are not well understood. This study aimed to elucidate the causal relationship and underlying mechanisms of constipation and ileus, thereby advancing our understanding of their interconnections. A bidirectional 2-sampl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The development of effective disease-modifying therapies for Alzheimer's disease (AD) remains a critical unmet need. While Mende … 2, p-tau), neuroimaging endophenotypes, cognitive traits, and risk factors. Blood/CSF/brain protein quantitative trait loci (pQTLs) from large-scale proteomics studies were analyzed to identify druggable targets. A rigorous validation cascade was subsequently performed: Bayesian colocalization was performed to assess whether the same variants are associated with the prot …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This Summary-data-based Mendelian randomization (SMR) study investigates the genetic basis of Graves' disease (GD) using a multi-omics approach to elucidate biological mechanisms and identify therapeutic candidates.
METHODS: SMR and Bayesian colocalization analyzed GD associations with methylation (mQTL), expression (eQTL), and protein quantitative trait loci (pQTL) using FinnGen as the discovery cohort. Top SNPs underwent methylation-gene expression and gene expression-protein interaction analyses. Key findings were validated against an independent GWAS dataset. Functional enrich…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We assembled the genome of Mengdou1137 with high quality and revealed the specific disease resistance genes and a large number of genomic variations related to agronomic traits. As a cornerstone in the global agricultural landscape, soybean stands as a pivotal oilseed crop, underpinning both nutritional and industrial applications. The burgeoning development of novel soybean varieties significantly propels the crop's industrialization, offering enhanced traits that cater to diverse agricultural and commercial needs. In this study, we present the de novo assembly of the genome a high-yield Chin
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Somatic mutations in long-lived conifers are rarely characterized yet offer a unique window into the spontaneous genetic forces that shape variation in plants. In Pinus taeda, dwarf phenotypes originate from abnormal branches, colloquially known as "witches' brooms", where progeny derived from the affected branch segregate for dwarfism in an apparent Mendelian 1:1 ratio. In this study, we genotyped six unrelated wind-pollinated families segregating for dwarfism using single-nucleotide polymorphism markers that had been previously positioned on a linkage map. Trait-loci association analyses ide
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The transcription factor Tbx20 is integral to heart development and plays a significant role in various cardiac diseases. Despite its established importance, the regulatory mechanisms and functional significance of Tbx20 remain incompletely understood. To elucidate these mechanisms, we initially conducted eQTL mapping to identify genetic loci associated with Tbx20 expression in heart tissue from BXD mice. Co-expression and enrichment analyses revealed pathways linked to Tbx20, including dilated cardiomyopathy, hypertrophic cardiomyopathy, and FoxO signaling. Additionally, protein-protein inter
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Currently, there remains a significant gap in effective pharmacologic interventions for neonatal respiratory distress syndrome (NRDS). To address this critical unmet medical need, we aimed to systematically identify novel therapeutic targets and preventive strategies through comprehensive integration and analysis of multiple publicly accessible datasets. In this study, we employed an integrative approach combining druggable genome data, cis-expression quantitative trait loci (cis-eQTL) from human blood and lung tissues, and genome-wide association study summary statistics for neonatal respirat…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prostatitis is a common condition in andrology and urology that significantly impacts the quality of life of affected individuals. Current treatments often fail to provide lasting benefits. To identify novel therapeutic targets, we conducted a drug-targeted Mendelian randomization (MR) study. Using cis-expression quantitative trait loci (cis-eQTL) data from the eQTLGen Consortium combined with Genome-Wide Association Studies (GWAS) data on prostatitis from FinnGen, we performed a two-sample MR analysis. This analysis identified nine potential causal genes: ANXA1, CRY2, DSTYK, FKBP1A, LAMA5, NE…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Frailty and sarcopenia are age-related conditions linked to mitochondrial dysfunction, but their causal mechanisms remain poorly defined. This study aimed to identify mitochondrial-related genes causally associated with frailty and sarcopenia using comprehensive multi-omics approaches. We performed summary-data-based Mendelian randomization using genome-wide association study summary statistics for the frailty index and sarcopenia-related traits. Quantitative trait loci data for DNA methylation, gene expression, and plasma protein abundance were analyzed across 1136 mitochondrial-related genes…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intervertebral disc degeneration (IVDD) is a common cause of neck, back, and low back pain, it is also a major global public health problem. Lactate is a metabolic product of intervertebral disc cells and is closely related to disc degeneration. Lactylation (Lac), driven by lactic acid, is associated with intervertebral disc degeneration, and targeting-related genes may provide new therapeutic directions for intervertebral disc degeneration. In this study, data from genome-wide association studies were combined with drugs associated with Lac accumulation and expression quantitative trait loci …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.