Protein evolution requires sequence changes to alter molecular properties without disrupting the dynamic organization necessary for function. How residue-level networks of correlated motions accommodate such mutations remains poorly understood. Here, we investigate the evolution of correlated conformational dynamics in nonstructural protein 1 (NS1) variants of influenza A viruses that emerged between 1918 and 2004. From molecular dynamics (MD) simulations we built residue networks in which edge weights reflect generalized correlations of conformational motion. The network of correlated dynamic
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The monoclonal antibody 5T4 defines a human oncotrophoblast antigen expressed by a variety of carcinomas but with a restricted pattern of expression in normal adult tissues. The 5T4 antigen has been isolated from term placenta as a 72-kDa glycoprotein consisting of a 42-kDa core protein with extensive N-linked glycosylation. A cDNA has been isolated from a human placental library using pools of oligonucleotides based on amino acid sequence obtained from purified 5T4 molecules. The predicted open reading frame encodes a protein of 420 amino acids with a molecular mass of 46 kDa and 8 potential
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gene catIII, encoding a type III enterobacterial chloramphenicol acetyltransferase, was cloned from the transmissible plasmid R387 into pBR322 and bacteriophage M13 mp8. Nucleotide sequence analysis of 1160 bp of DNA identified an open reading frame encoding a protein of 213 amino acid residues and a calculated molecular mass of 24965 Da. The predicted N-terminal sequence is identical with that determined by Edman degradation of chloramphenicol acetyltransferase purified from Escherichia coli harbouring R387. Sequences equivalent to the consensus motifs for initiation and rho-factor-indepe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trichinellosis is a globally-distributed zoonotic parasitic disease caused by nematode worms of the genus Trichinella. One of the most common species of Trichinella known to affect human health is T. britovi; however, it is relatively poorly investigated. A thorough knowledge of the proteins expressed by Trichinella is important when developing immunological detection methods and vaccines and studying its interactions with the host. The present study uses the Pichia pastoris expression system to produce a soluble TbCLP antigen which induces strong antibody responses in the host during natural
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Based on the amino-acid sequence of the macaque epididymal secretory protein, ESP 13.2 (Q9BEE3/AJ236909), it has now been classified as beta-defensin DEFB126. DEFB126 is one of the five beta-defensins with genes that are clustered along chromosome 20pl3, and all five proteins have an extended carboxy terminus that continues beyond the 6-cysteine beta-defensin core region. This 60-amino acid carboxyl tail extension of the DEFB126 molecule is extraordinarily rich in threonine and serine (40%), many of which appear to be likely candidates for having O-glycosylation. DEFB126 has been shown to coat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We isolated a novel human ATP-binding cassette (ABC) transporter cDNA, determined its nucleotide sequence, and designated it human ABC7 (hABC7). The nucleotide sequence was highly homologous to the ATM1 gene in yeast, which encodes an ABC transporter (yAtm1p) located in the mitochondrial inner membrane. The deduced human product, a putative half-type transporter, consists of 752 amino acids that are 48.9% identical to those of yAtm1p. A computer-assisted protein structural and localization analysis revealed that the mitochondrial targeting signal of yAtm1p is conserved in the N-terminal region
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The question addressed in this report focuses on the autoantigenicity of self antigens, principally cytochrome c and lysozyme. Of interest is whether the immune system produces autoantibodies to its host proteins reacting randomly with all potential antigen sites or is autoreactively selective for certain determinants. Based on experimental evidence from autoantibodies against cytochromes c, Jemmerson and Margoliash [Jemmerson, R. & Margoliash, E. (1979) Nature (London) 282, 468-471] have described a striking correlation between autoreactive sequence regions and evolutionary instability. While
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rhodnius prolixus is a Hemiptera that feeds exclusively on vertebrate blood in all life stages. Its salivary glands produce potent pharmacological substances that counteract host hemostasis, including anti-clotting, anti-platelet, and vasodilatory substances. To obtain a further insight into the salivary biochemical and pharmacological complexity of this insect, a cDNA library was randomly sequenced, and salivary gland homogenates were fractionated by HPLC to obtain aminoterminal sequences of abundantly expressed proteins. Results indicate a remarkable expansion of the lipocalin family in Rhod
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The SARS-CoV-2 ORF8 protein is a unique accessory viral protein among human coronaviruses, characterized by recurrent deletions and mutations with functional consequences. In this short report, we demonstrate that several dominant SARS-CoV-2 strains, despite encoding ORF8, fail to secrete the protein, revealing a recurring pattern of ORF8 functional impairment that cannot be detected by sequence analysis alone. In agreement with other studies, several high-frequency mutations were identified using the Nextstrain/augur pipeline, including G8Stop, Q27Stop, D119-/F120- double deletions, and nucle
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have identified a Dictyostelium discoideum cDNA sequence with homology to centrins. The derived protein, Dictyostelium discoideum centrinn-related protein (DdCrp), is the most divergent member of the centrin family. Most strikingly it lacks the first two EF-hand consensus motifs, whereas a number of other centrin-specific sequence features are conserved. Southern and Northern blot analysis and the data presently available from the Dictyostelium genome and cDNA projects suggest that DdCrp is the only centrin isoform present in Dictyostelium. Immunofluorescence analysis with anti-DdCrp antibo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The kinetoplastid membrane protein 11 (KMP-11) has been recently described in Leishmania (Leishmania) donovani as a major component of the promastigote membrane. Two oligonucleotide primers were synthesized to PCR-amplify the entire encoding region of New World Leishmania species. The Leishmania (Viannia) panamensis amplification product was clone, sequenced and the putative amino acid sequence determined. A remarkably high degree of sequence homology was observed with the corresponding molecule of L. (L) donovani and L. (L) infantum (97% and 96%, respectively). Southern blot analysis showed t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A cDNA library was constructed from the venom glands of the Brazilian "armed" spider, Phoneutria nigriventer, and a clone coding for Tx1, a lethal toxin, was identified and sequenced. The sequence data derived from this cDNA clone combined with the previously determined amino acid sequence predict that Tx1 is initially synthesized as a preprotoxin. Four segments (comprising the signal sequence, a short, 15-amino acid, glutamate-rich sequence, the functional toxin, and 2 glycine residues) can be distinguished. The structure of the preprotoxin and the proposed processing steps required to form t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In our previous transcriptomic studies using DNA microarray analysis, a probe designed from an unknown expressed sequence tag (EST) showed significant differential gene expression in the pharyngeal epithelia. The objectives of this study are to annotate the gene sequence and compare the gene transcription levels among different bovine tissues based on our published microarray data. The gene transcribing the EST contains a 90-amino-acid protein sequence. The results of bioinformatic analyses using comparative genetics, multiple sequence alignments, phylogenetic analysis and promoter sequence an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteins typically fold into unique three-dimensional structures largely driven by interactions between hydrophobic amino acids. This understanding has helped improve our knowledge of protein folding. However, recent research has shown an exception to this idea, demonstrating that specific threonine-rich peptides have a strong tendency to form β-hairpin structures, even in the highly hydrophilic amino acid sequences. This finding suggests that the hydrophilic amino acid sequence space still leaves room for exploring foldable amino acid sequences. In this study, we conducted a systematic explor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A hypovirulent isolate, W370, of the white root rot fungus Rosellinia necatrix has previously been shown to harbour 12 dsRNA segments. In this study, complete nucleotide sequences of segments 2 and 5 of W370 dsRNAs were determined. The nucleotide sequence of genome segment 2 was 3773 bases long with a single long open reading frame (ORF) encoding 1226 amino acid residues with a predicted molecular mass of approximately 138.5 kDa. The nucleotide sequence of segment 5 was 2089 bases long with a single long ORF, whose deduced polypeptide contained 646 amino acid residues with a predicted molecula
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) first appeared in Southern China in November 2002, and then quickly spread to 33 countries on five continents along international air travel routes. Although the SARS epidemic has been contained, there is a clear need for a safe and effective vaccine should an outbreak of a SARS-CoV infection reappear in human population. In this study, we tested four DNA-vaccine constructs: (1) pLL70, containing cDNA for the SARS-CoV spike (S) gene; (2) pcDNA-SS, containing codon-optimized S gene for SARS-CoV S protein (residues 12-1255) fused with a le
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Paracoccidioides brasiliensis is a well-characterized pathogen of humans. To identify proteins involved in the fungus-host interaction, P. brasiliensis yeast proteins were separated by liquid isoelectric focusing, and fractions were subjected to sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis and Western blot analysis. Immunoreactive bands were detected with pooled sera of patients with P. brasiliensis infection. A protein species with a molecular mass of 45 kDa was subsequently purified to homogeneity by preparative gel electrophoresis. The amino acid sequence of four endoproteinase
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Monoclonal antibodies (Mab) to the prion protein (PrP) have been critical to the neuropathological characterisation of PrP-related diseases in human and animals. Although PrP is highly evolutionary conserved, there is some sequence divergence among species. We have analysed the F89/160.1.5 Mab raised against the bovine prion protein for immunoreactivity with the human prion protein. The antibody recognised the IHFG epitope of the prion protein. An analysis of the Swiss Prot database confirmed conservation of the epitope in humans. Further immunohistochemical (IHC) analysis showed a highly sens
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: African swine fever virus (ASF) is a large DNA virus that is the only member of the Asfarviridae family. The spread of the ASF virus in the territory of the Russian Federation, Eastern Europe and China indicates the ineffectiveness of existing methods of combating the disease and reinforces the urgent need to create effective vaccines. One of the most significant antigens required for the formation of immune protection against ASF is a serotype-specific CD2v protein.
THE PURPOSE OF THE STUDY: This study presents the results of immuno-informatics on the identification of B- and T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The process of creating a model of the structure formed by a pair of interacting molecules is commonly referred to as docking. Protein docking is one of the most studied topics in computational and structural biology with applications to drug design and beyond. In this chapter, we describe ClusPro, a web server for protein-protein and protein-peptide docking. As an input, the server requires two Protein Data Bank (PDB) files (protein-protein mode) or a PDB file for the protein and a sequence for the ligand (protein-peptide mode). Its output consists of ten models of the resulting structure for
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования