We have developed a modified form of suppression subtractive hybridization (SSH) that allows multiple specimens of distinct phenotypic groups to be compared for consistent differences in gene expression. We applied this system to identify genes that were expressed in normal rat ovarian surface epithelial (ROSE) cells but whose expression was lost/downregulated in four independently transformed rat ovarian cancer cell lines. Northern blot analysis using 14 of 28 nonredundant cDNA fragments from this difference library showed that the mRNA transcripts were present in normal ROSE cells but lost o
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple myeloma (MM) evolves from monoclonal gammopathy of undetermined significance (MGUS) and smoldering multiple myeloma (SMM) with extensive metabolic reprogramming and immune remodeling. We investigated whether coordinated activation of the tumor necrosis factor receptor superfamily (TNFRSF) aligns with metabolic state and prognosis across this continuum. We integrated bone-marrow single-cell RNA sequencing from healthy donors, MGUS, SMM, and MM with bulk RNA sequencing from the Multiple Myeloma Research Foundation (MMRF) CoMMpass cohort. At single-cell resolution, per-cell metabolic act
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Early detection and treatment stratification of breast cancer remain major clinical challenges, particularly in the Middle East and North Africa (MENA) region, where population-specific circulating biomarkers are poorly defined. Circulating microRNAs (miRNAs) represent promising minimally invasive biomarkers; however, comprehensive multicenter studies in diverse MENA populations with large-scale external validation are lacking.
METHODS: Plasma circulating miRNA profiling using small RNA sequencing was performed in a multi-national MENA cohort comprising 152 breast cancer patients
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colon cancer (CC) stands as one of the most prevalent malignant neoplasms worldwide. Despite extensive investigations on the function of T cells in antitumor immunity and dynamics of tumor microenvironment (TME), their precise molecular contributions to the CC progression remain incompletely characterized. Differential gene expression analysis was implemented leveraging TCGA-COAD transcriptomic data, followed by the identification of T cell signature genes using single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) dataset. Through intersectional analysis and subsequent prognosis-related gene screening using
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The risk of developing some types of head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) is seven times higher in males, and such disparities may not be associated only with tobacco and alcohol consumption or HPV infection. Therefore, the endocrine microenvironment is considered another risk factor, as epidemiologic studies have unequivocally shown the protective effect of estrogen in women. This research was focused on progesterone receptors (PRs), the least-studied sex hormone receptors in HNSCC. Our study included fresh tissue samples from 95 primary tumors, 25 metastatic lymph nodes and 40 healt
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rho GTPases orchestrate actin dynamics and tumor cell motility, but their prognostic relevance in esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) remains unclear. We aimed to identify Rho GTPase-related differentially expressed genes (DEGs), build a prognostic model, evaluate important gene expression against clinicopathological features, and examine CTTN function in vitro.
METHODS: Transcriptomic data from GSE53625 and TCGA-ESCC were used. Rho GTPase-linked DEGs from tumor-normal comparisons entered univariate Cox, LASSO, and multivariable Cox analyses to construct a risk-score model;
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Colorectal cancer remains a significant health challenge. Filgotinib is a selective JAK1 inhibitor approved for the treatment of inflammatory diseases. However, its anti-tumor effects and underlying mechanisms in colorectal cancer (CRC) remain unexplored.
METHODS AND RESULTS: In this study, cell viability and proliferation were assessed by CCK‑8, crystal violet, and EdU assays. Mitochondrial membrane potential was evaluated using JC‑1 staining. Transcriptome sequencing (RNA‑seq) was performed on RKO cells treated with Filgotinib, followed by GO and KEGG pathway enrichment analyses
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glioblastoma (GBM) remains the most common and lethal adult malignant primary brain cancer with few treatment options. A significant issue hindering GBM therapeutic development is intratumor heterogeneity and plasticity. GBM tumors contain neoplastic cells within a fluid spectrum of diverse transcriptional states. Identifying effective therapeutics requires a platform that predicts the differential sensitivity and resistance of these states to various treatments. Here, we develop scFOCAL (Single-Cell Framework for -Omics Connectivity and Analysis via L1000), to quantify the cellular drug sensi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An understanding of the neural control of lower oesophageal sphincter (LOS) relaxation is clinically relevant because transient LOS relaxations (TLOSRs) are a mechanism of acid reflux into the oesophagus. Preganglionic motor neurones innervating the LOS are localized in the dorsal motor nucleus of the vagus (DMV). Based on a single study in cats, it is now widely accepted that these neurones are functionally organized into two separate populations, such that stimulation of the caudal and rostral DMV evokes LOS relaxation and contraction, respectively. Our goal was to map the functional LOS res
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tertiary lymphoid structures (TLS) demonstrate prognostic significance and associations with immunotherapy response in gastrointestinal malignancies, though their regulatory mechanisms remain incompletely defined. The current understanding of TLS at single-cell resolution is limited. Here, we integrated single-cell and spatial transcriptomics with TLS-specific signatures to map spatial distributions and chemokine signaling within colorectal (CRC) and gastric cancer (GC) microenvironments. We identified significant enrichment of characteristic T cell and macrophage subsets in the TLS regions. S
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glioblastoma multiforme (GBM) is characterized by rapid progression, therapeutic resistance, and a profoundly immunosuppressive tumor microenvironment. Emerging evidence suggests that endoplasmic reticulum (ER)-associated macromolecules play critical roles in tumor adaptation. In this study, we performed a multi-omics investigation of orosomucoid-like protein 2 (ORMDL2), a conserved ER membrane protein involved in sphingolipid biosynthesis and ER stress regulation, and uncovered its regulatory functions in GBM progression. Transcriptomic analyses across The Cancer Genome Atlas (TCGA), and Chin
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During breast tumor progression, the transition from ductal carcinoma in situ (DCIS) to invasive breast cancer is a critical step with large implications for prognosis. However, the mechanisms of invasion are still largely unknown. At the DCIS stage, there is an over-representation of HER2-positive lesions compared with invasive breast cancer. In this study, we investigated the associations between gene expression profiles in cancer cells and the immune microenvironment of HER2-positive DCIS and invasive breast tumors with concurrent DCIS using spatial transcriptomics. We found distinctly more
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Neuroblastoma (NB) is frequently associated with high-risk pediatric cases that demonstrate limited response to cisplatin, contributing to a poor prognosis. Recent studies have explored the role of tumor cell senescence in increasing sensitivity to this chemotherapy agent. This study aims to identify genes related to cell senescence in children diagnosed with NB, evaluate their influence on cisplatin sensitivity, and investigate potential strategies to enhance the efficacy of chemotherapy.
METHODS: Gene expression profiles and clinical data were obtained for 498 NB patients from th
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Growth hormone (GH) signaling has been implicated in tumor progression and therapy resistance across multiple cancer types, yet its role in bladder cancer remains largely unexplored. In this study, we investigated the impact of GH and its receptor (GHR) on therapy resistance and disease progression in urothelial carcinoma (UC) through integrated transcriptomic and in vitro analyses. Transcriptomic profiling of The Cancer Genome Atlas bladder cancer cohort revealed that high tumoral GHR expression was associated with differential upregulation of genes involved in drug efflux, epithelial-to-mese
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) is a leading cause of cancer-related mortality, with a pressing need for effective biomarkers and therapeutic targets. Despite the clinical use of alpha-fetoprotein (AFP) as a diagnostic biomarker, its limitations in sensitivity and specificity necessitate the identification of novel markers. In this study, we investigated the role of Protein Kinase, DNA-Activated, Catalytic Subunit (PRKDC) in HCC prognosis and its potential as a therapeutic target. Utilizing spatial transcriptomics and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), we dissected the cellular composition
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bladder urothelial carcinoma (BLCA) is one of the most prevalent tumors globally, with its incidence rising notably in developed countries, significantly affecting human health. CSE1L encodes a protein that is involved in various cellular processes and plays a critical role in cancer initiation and progression. However, its role in BLCA remains underexplored.
METHODS: CSE1L expression in BLCA was analyzed using TCGA data and validated by qRT-PCR and Western blot in clinical samples. Survival analysis and Cox regression models were used to evaluate its prognostic value. Functional
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Twenty to thirty percent of non-small cell lung cancers (NSCLC) are caused by lung squamous cell carcinoma (LUSC), especially in smokers and there has been limited study previously evaluating the situation in terms of the genome and gene expression profile, which demonstrates the relationship among DEL-1, leucocyte recruitment, and pro-inflammatory cytokines in LUSC.
MATERIAL AND METHODS: In the current study, the m-RNA expression patterns and mutation profiles of our target genes, such as, pro-inflammatory cytokines, chemoattractant molecules, and DEL-1 genes, in 511 LUSC patients. To f
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Procollagen-Lysine,2-Oxoglutarate 5-Dioxygenase 3 (PLOD3) is related to a variety of human diseases. However, its function in Colorectal cancer (CRC) remains uncertain. PLOD3 expression was analyzed using The Cancer Genome Atlas (TCGA) pan-cancer data. DAVID was used for enrichment analysis of PLOD3-related genes. The correlation between PLOD3 expression and immune cell infiltration was evaluated. Four expression profile datasets (GSE17536, GSE39582, GSE74602, and GSE113513) from Gene Expression Omnibus, and two proteomic datasets were used as validation cohorts for assessing the diagnostic an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Solid tumors are complex systems characterized by dynamic interactions between neoplastic cells, non-tumoral cells, and extracellular components. Among all the stromal cells that populate tumor microenvironment, fibroblasts are the most abundant elements and are critically involved in disease progression. Cancer-associated fibroblasts (CAFs) have pleiotropic functions in tumor growth and extracellular matrix remodeling implicated in local invasion and distant metastasis. CAFs additionally participate in the inflammatory response of the tumor site by releasing a variety of chemokines and cytoki
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: One of the key features of the Bethesda System for Reporting Thyroid Cytopathology is the risk of malignancy (ROM), which guides management for each diagnostic category. However, calculation of the ROM can be challenging for indeterminate diagnoses because only a portion of cases will be resected for cytologic-histologic correlation (CHC) analyses. In the present study, we used the probability of cancer information from ThyroSeq, version 3, reports to calculate the molecular-derived (MD) ROM for indeterminate categories.
MATERIALS AND METHODS: Cytology cases with indeterminate B
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования