T cell receptor (TCR) is a heterodimer consisting of TCRα and TCRβ chains that are generated by somatic recombination of multiple gene segments. Nascent TCR repertoire undergoes thymic selections where non-functional and potentially autoreactive receptors are removed. During the last years, the development of high-throughput sequencing technology has allowed a large scale assessment of TCR repertoire and multiple analysis tools are now also available. In our recent manuscript, Human thymic T cell repertoire is imprinted with strong convergence to shared sequences[1], we show highly overlapping
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parathyroid hormone-related protein (PTHrP) has been implicated in regulating tooth eruption and/or development. Formation of cementum, a mineralized tissue covering the tooth root surface, is a critical biological event for tooth root development. To test the hypothesis that PTHrP targets cementoblasts (CMs) and acts to regulate cementogenesis, CM cell lines were established and their responsiveness to PTHrP stimulation was determined, in vitro. First, subclones were derived from two immortalized murine cell populations that contained CMs; SV-CM/periodontal ligament (PDL) cells were obtained
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Small bowel neuroendocrine tumors (SBNET) frequently present with metastatic disease, and the efficacy of available systemic therapies, especially immune checkpoint blockade, is limited. Toward developing novel immunomodulatory strategies, we interrogated the tumor immune microenvironment of SBNETs using bulk transcriptional and digital spatial profiling (DSP).
METHODS: Patients with SBNET who underwent resection from 2003 to 2016 were retrospectively evaluated. Overall survival (OS) was assessed using the Kaplan-Meier method. The Cox proportional hazards model was used for multivari
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sepsis, a life-threatening condition triggered by a dysregulated immune response to infection, remains one of the leading causes of mortality worldwide. Thrombocytopenia, a common sepsis complication, is linked to poor outcomes and reflects disease severity and specific immunological changes affecting patient outcomes. This study aimed to investigate transcriptomic differences between septic patients with and without thrombocytopenia and to explore immune features related to clinical outcomes using whole-transcriptome RNA sequencing (RNA-Seq). We conducted a prospective study on 52 patients wh
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Previous investigations pointed out a role for antigen stimulation in Sezary syndrome (SS). High-throughput sequencing of the T cell receptor (TR) offers several applications beyond diagnostic purposes, including the study of T cell pathogenesis.
METHODS: We performed high-throughput RNA sequencing of the TR alpha (TRA) and beta (TRB) genes focusing on the complementarity-determining region 3 (CDR3) in 11 SS and one erythrodermic mycosis fungoides (MF) patients. Five psoriasis patients were employed as controls. Peripheral blood CD4+ cells were isolated and RNA sequenced (HiSeq250
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lipopolysaccharide (LPS) is one of the main constituents of the cell wall in Gram-negative bacteria. Staphylococcal enterotoxin B (SEB) is produced by the Gram-positive opportunistic pathogen, Staphylococcus aureus. Emerging evidence suggests that intraperitoneal injection of LPS combined with low-dose aerosolized SEB exposure can cause severe lung injury and even death, while SEB or LPS alone cause neither mortality nor severe pulmonary symptoms in mice. However, pulmonary effects from exposure to aerosolized SEB potentiated by LPS have not been evaluated. This study investigates the global t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type 1 diabetes is a chronic autoimmune disease, characterized by the immune-mediated destruction of insulin-producing β cells of pancreatic islets. Essential components of the innate immune antiviral response, including type I IFN and IFN receptor (IFNAR)-mediated signaling pathways, likely contribute to human type 1 diabetes susceptibility. We previously showed that LEW.1WR1 Ifnar1 -/- rats have a significant reduction in diabetes frequency following Kilham rat virus (KRV) infection. To delineate the impact of IFNAR loss on immune cell populations in KRV-induced diabetes, we performed flow c
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Toll-like receptor 4 (TLR4) activation within the bone marrow (BM) microenvironment regulates proinflammatory cytokines and chemokines, which influence immune activity and bone remodeling. However, the immune cell factors mediating TLR4-dependent cross-talk in the bone/BM microenvironment remain insufficiently defined.
METHODS: We provide a transcriptomic analysis of significant cellular and immune changes in total BM cells of wild-type mice following lipopolysaccharide (LPS)-induced TLR4 activation in vivo compared with TLR4 knockout (KO) mice. To obtain direct evidence that inte
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recurrent Pregnancy Loss (RPL) affects 2-4% of couples, and with increasing numbers of pregnancy losses the risk of miscarrying a euploid pregnancy is increased, suggesting RPL is a pathology distinct from sporadic miscarriage that is due largely to lethal embryonic aneuploidy. There are a number of conditions associated with RPL including unspecified "immune" pathologies; one of the strongest candidates for dysregulation remains T regulatory cells as depletion in the very early stages of pregnancy in mice leads to pregnancy loss. Human endometrial Treg and conventional CD4T cells were isolate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute measles virus (MV) infection results in a decrease in plasma human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) RNA levels in co-infected children. An in vitro peripheral blood mononuclear cell (PBMC) culture system was used to assess the mechanisms by which MV blocks HIV-1 replication. MV inhibited proliferation of CD4(+) T lymphocytes, the target cell for HIV-1 replication. In the presence of MV, cells did not progress to G(1b) and S phases, steps critical for the completion of HIV-1 reverse transcription and productive replication. This block in cell-cycle progression was characterized by an
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To investigate the role and mechanism of SLC12A8 in the progression of Luminal B breast cancer.
METHODS: Data from TCGA, GTEx, and HPA databases were used to analyze SLC12A8 expression and its prognostic value in breast cancer. qPCR was performed to validate SLC12A8 expression in various breast cancer cell lines. The correlation between SLC12A8 and immune cell infiltration was analyzed using ImmuCellAI and TIMER databases. Gene set enrichment analysis (GSEA) was employed to predict signaling pathways associated with SLC12A8. In vitro, siRNA-mediated knockdown of SLC12A8 or treatme
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic lymphocytic leukaemia (CLL) is a haematological malignancy primarily affecting older adults, characterised by the proliferation of functionally impaired B lymphocytes with abnormal expression of CD5, a typical T cell marker. The current study investigates the expression of cytotoxicity-related receptors (CD16, CD56, CD57, CD69) and a checkpoint (LAG-3) on γδ T cells in CLL patients. Sixty-nine treatment-naive CLL patients and fourteen healthy controls were recruited. Flow cytometry analysis revealed that the CLL patients had higher expressions of CD56 and LAG-3 and lower CD16 on their
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mycosis fungoides (MF) is a rare malignancy that is characterized by the presence of circulating tumour cells (CTCs) in a subgroup of patients. Reliably distinguishing MF from inflammatory skin conditions is challenging.
OBJECTIVES: To evaluate the potential benefits of next-generation sequencing (NGS)-based T-cell receptor rearrangement repertoire analysis in detecting clonal rearrangements in MF and inflammatory skin conditions.
METHODS: Skin biopsies and blood samples from 33 patients with MF and 10 patients with inflammatory skin conditions were analysed using TRB and TRG NGS
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CD19-CAR T cell therapy has evolved into the standard of care for relapsed/refractory B cell acute lymphoblastic leukemia (ALL); however, limited persistence of the CAR T cells enables tumor relapse for many patients. To gain a deeper understanding of the molecular characteristics associated with CAR T cell differentiation, we performed longitudinal genome-wide DNA methylation profiling of CD8+ CD19-CAR T cells post-infusion in ALL patients. We report that CAR T cells undergo a rapid and broad erasure of repressive DNA methylation reprograms at effector-associated genes. The CAR T cell post-in
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autoimmune diseases develop when autoantigens activate previously quiescent self-reactive lymphocytes. Gene-gene interaction between certain HLA class I risk alleles and variants of the endoplasmic reticulum aminopeptidase ERAP1 controls the risk for common immune-mediated diseases, including psoriasis, ankylosing spondylitis, and Behçet disease. The functional mechanisms underlying this statistical association are unknown. In psoriasis, HLA-C*06:02 mediates an autoimmune response against melanocytes by autoantigen presentation. Using various genetically modified cell lines together with an au
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Malignant melanoma is an aggressive tumor sensitive for immunotherapy such as checkpoint blockade antibodies. Still, most patients with late stage disease do not respond, and the side effects can be severe. Stimulation of the CD40 pathway to initiate anti-tumor immunity is a promising alternative. Herein, we demonstrate immune profiling data from melanoma patients treated with an adenovirus-based CD40 ligand gene therapy (AdCD40L).
METHODS: Peripheral blood mononuclear cells and plasma were collected from malignant melanoma patients (n = 15) enrolled in a phase I/IIa stud
Клиническое исследование I фазыКлиническое исследование II фазыСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The influence of phenotype and detection of clonality on prognosis in early mycosis fungoides has never been addressed in large studies.
OBJECTIVES: To correlate immunophenotype and detection of clonality with clinical outcome.
METHODS: We analysed 73 biopsy specimens from 68 patients with early mycosis fungoides (stage Ia or Ib) and at least 10 years of follow up (or dead of disease).
RESULTS: Four phenotypic groups could be identified: group A (alpha/beta+ CD4+ CD8- TIA1-), 51 patients; median survival time 160 months; group B (alpha/beta+ CD4- CD8+ TIA1+), 10 patients; median
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exclusive involvement of skin appendages in cutaneous T-cell lymphoma (CTCL) is rare, poses significant problems in diagnosis, and may provide insight into mechanisms of T-cell epitheliotropism. We report 2 cases of combined adnexal (folliculotropic/syringotropic) CTCL in which lesions developed only in chronically sun-damaged skin. Although the epidermal layer in both cases was devoid histologically of significant epidermotropism, immunohistochemistry and polymerase chain reaction analyses of deeper samples that included involved adnexae confirmed aberrant antigen expression (dominant CD4 pop
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Castleman's disease (CD) is a rare atypical lymphoproliferative disorder that is morphologically and clinically heterogenous and is associated with a risk of developing malignant lymphoma. We report the clonality status of CD tissues in 34 patients, including 14 patients infected by the human immunodeficiency virus (HIV). Four patients presented a localized form and 30 presented a multicentric form. Two cases were associated with B-cell lymphoma, 3 cases with Hodgkin's disease, and 9 cases (8 HIV+) with Kaposi's sarcoma. Histologically, 8 cases were of the hyaline-vascular type and 26 were of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Receptor-interacting protein kinase 3 (RIP3)-mediated necroptosis has attracted interest as a potential target for cancer therapy as it boosts tumor immunogenicity. Here, we synthesized a pH-sensitive polymer (CA) by conjugating aminopropyl imidazole (API) to chondroitin sulfate (CHS) for RIP3 gene delivery. CA can target cancer cells due to the specific binding ability of CHS to CD44 which is overexpressed in cancer cells. In addition, the introduction of API conferred pH sensitivity, facilitating efficient endosomal escape and enhancing gene delivery efficiency. Increased levels of high mobi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования