BACKGROUND: Burkholderia pseudomallei, the causative agent of melioidosis, is a Gram-negative bacterium widely distributed in soil and water in endemic areas. This soil saprophyte can survive harsh environmental conditions, even in soils where herbicides (containing superoxide generators) are abundant. Sigma factor E (σE) is a key regulator of extra-cytoplasmic stress response in Gram-negative bacteria. In this study, we identified the B. pseudomallei σE regulon and characterized the indirect role that σE plays in the regulation of spermidine, contributing to the successful survival of B. pseu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Altered microbiota composition, changes in immune responses and impaired intestinal barrier functions are observed in IBD. Most of these features are controlled by proteases and their inhibitors to maintain gut homeostasis. Unrestrained or excessive proteolysis can lead to pathological gastrointestinal conditions. The aim was to validate the identified protease IBD candidates from a previously performed systematic review through a genetic association study and functional follow-up.
DESIGN: We performed a genetic association study in a large multicentre cohort of patients with Crohn
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Uterine leiomyomas (or fibroids) are the most common tumors in women of reproductive age. Early studies of two familial cancer syndromes, the multiple cutaneous and uterine leiomyomatosis (MCUL1), and the hereditary leiomyomatosis and renal cell cancer (HLRCC), implicated FH, a gene on chromosome 1q43 encoding the tricarboxylic acid cycle fumarate hydratase enzyme. The role of this metabolic housekeeping gene in tumorigenesis is still a matter of debate and pseudo-hypoxia has been suggested as a pathological mechanism. Inactivating FH mutations have rarely been observed in the nonsyndromic and
Клиническое исследованиеСтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TSC1 and TSC2 are responsible for the tumor suppressor gene syndrome tuberous sclerosis (TSC). Mammalian TSC genes have been shown to be involved in cell cycle regulation. Recently, in Drosophila, these data have been confirmed and TSC genes have further been demonstrated to affect cell size control. Here we provide supporting data for the fact that the latter function is conserved in mammals. Human TSC1 and TSC2 trigger mammalian cell size reduction and a dominant-negative TSC2 mutant induces increased size. These effects occur in all cell cycle phases, are dependent on the activity of the ph
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The high-affinity siderophore salicylate is an intermediate in the biosynthetic pathway of pyochelin, another siderophore and chelator of transition metal ions, in Pseudomonas aeruginosa. The 2.5-kb region upstream of the salicylate biosynthetic genes pchBA was sequenced and found to contain two additional, contiguous genes, pchD and pchC, having the same orientation. The deduced amino acid sequence of the 60-kDa PchD protein was similar to those of the EntE protein (2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase) of Escherichia coli and other adenylate-forming enzymes, suggesting that salicylate might be a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zika virus (ZIKV) is a serious public health concern that may lead to neurological disorders in affected individuals. The virus can be transmitted from an infected mother to her fetus, via mosquitoes, or sexually. ZIKV infections are associated with increased risk for Guillain-Barré syndrome (GBS) and congenital microcephaly in newborns infected prenatally. Dysregulations of intracellular microRNAs (miRNAs) in infected neurons have been linked to different neurological diseases. To determine the potential role of miRNAs in ZIKV infection we developed a chronically infected neuroblastoma cell l
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viperid snake venoms induce severe tissue damage, characterized by the direct toxic action of venom components, i.e., phospholipases A2 (PLA2s) and metalloproteinases (SVMPs), concomitantly with the onset of endogenous inflammatory processes, in an intricate scenario of tissue alterations. Understanding the expression of relevant genes in muscle tissue will provide valuable insights into the undergoing pathological and inflammatory processes. In this study, we have used the Nanostring technology to evaluate the patterns of gene expression in mouse skeletal muscle 1 h, 6 h, and 24 h after injec
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To evaluate the possibility to distinguish virulent from non-virulent isolates, gene expression in human umbilical vein endothelial cells (HUVEC) induced by invasive and colonizing isolates of Staphylococcus aureus was compared. Gene expression in HUVEC was analyzed by microarray analysis after 4 h of infection with Staphylococcus aureus, isolated from healthy nasal carriers (n = 5) and from blood of septic patients (n = 5), to explore possible differences between the groups of bacteria in interaction with HUVEC. All isolates were spa-typed to disclose strain relatedness. Moreover, the isolate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Under conditions of sulfur deprivation, O-acetylserine (OAS) accumulates, which leads to the induction of a common set of six genes, called OAS cluster genes. These genes are induced not only under sulfur deprivation, but also under other conditions where OAS accumulates, such as shift to darkness and stress conditions leading to reactive oxygen species (ROS) or methyl-jasmonate accumulation. Using the OAS cluster genes as a query in ATTED-II, a co-expression network is derived stably spanning several hundred conditions. This allowed us not only to describe the downstream function of the OAS c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autosomal monoallelic gene expression and asynchronous replication between alleles are established features of imprinted genes and genes regulated by allelic exclusion. Inactivation/Stability Centers (I/SCs) are recently described autosomal loci that exhibit epigenetic regulation of allelic expression and replication timing, with differences that can be comparable to those observed between the active and inactive X chromosomes . Here, we characterize >100 autosomal loci with allele-specific epigenetic regulation of replication timing and gene expression, defining them as I/SCs. I/SCs are appro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Patients with sub-acute cerebral venous sinus thrombosis experience (SA.CVST) severe symptoms compared to two other venous sinus-related diseases, including chronic cerebral venous sinus thrombosis (C.CVST) and idiopathic intracranial hypertension (IIH).
OBJECTIVE: This study aimed to determine whether the different immune reactions in different venous sinuses are related.
METHODS: Stagnant blood in the cerebral venous sinuses was extracted by passing a microcatheter and CD14-positive cells were sorted by magnetic beads and subjected to RNA-seq sequencing.
RESULTS: Compared to p
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cronobacter sakazakii, an important Gram-negative foodborne pathogen, can cause neonatal meningitis and sepsis with high rates of infection and death. Gene ESA_RS15745 encodes a sugar transporter protein, which is not only essential for osmotic pressure maintenance during bacterial growth and reproduction but also associated with their desiccation tolerance, motility, and biofilm formation. Here, a mutant strain of ESA_RS15745 (ΔESA_RS15745) and the complementation strain (cpESA_RS15745) were constructed using a suicide vector knockout and gene complementation. ΔESA_RS15745 was found to have a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gene XPD/ERCC2 encodes an ATP-dependent 5'-3' helicase of 760 amino acids. There are few transcription factors known to be involved in the regulation of XPD, and these include the hypoxia-inducible factor-1α (HIF-1α), p53, hepatitis B virus x protein (HBx) and specificity protein 1 (Sp1). To identify functional elements of xpd gene in fish we employed a comparative genomic approach. In our in silico attempt to identify cis-regulatory transcription factor binding sites (TFBSs) conserved among the xpd promoter sequences from five available fish species, we verified that in some cases the spa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Tick Subolesin and its ortholog in insects and vertebrates, Akirin, have been suggested to play a role in the immune response through regulation of nuclear factor-kappa B (NF-kB)-dependent and independent gene expression via interaction with intermediate proteins that interact with NF-kB and other regulatory proteins, bind DNA or remodel chromatin to regulate gene expression. The objective of this study was to characterize the structure and regulation of subolesin in Ixodes scapularis. I. scapularis is a vector of emerging pathogens such as Borrelia burgdorferi, Anaplasma phagocyto
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Histone acetyltransferases (HATs) regulate transcription epigenetically through histone acetylation and play crucial roles in plant development. In this study, we identified a cotton HAT gene, GhHAT11, associated with plant height and investigated its regulatory functions and underlying mechanisms. Tissue-specific expression analysis showed that GhHAT11 was predominantly expressed in stems. Virus-induced gene silencing (VIGS) of GhHAT11 significantly reduced cotton plant height and internode cell length, whereas heterologous overexpression of GhHAT11 in Arabidopsis thaliana increased plant hei
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DNA chips facilitate genomic-wide exploration of gene expression. The authors hypothesized that ischemic (IPC) and anesthetic preconditioning (APC) would differentially modulate gene expression in hearts.
METHODS: Affymetrix rat U34A gene chips were used to explore the transcriptional response to IPC and APC, sustained ischemia (110 min) without reperfusion, and time-matched perfusion in isolated rat hearts. IPC was induced by three cycles of 5 min of ischemia, and APC was induced by 1.5 minimum alveolar concentration isoflurane (110 min). For each heart, a separate chip was used
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The RNA-binding protein Musashi2 plays a critical role in normal and malignant hematopoiesis. Aberrant expression of Musashi2 is linked to the inappropriate expression of several miRNAs. In this study, we observed downregulation of miR-143 and miR-199 in CML and AML cell lines. Bioinformatic analysis revealed potential interactions between these miRNAs and Musashi2 mRNA, which were also confirmed by our experimental data. In K562 cells, which showed the strongest negative correlation between Musashi2 and the candidate miRNAs, overexpression of miRNAs led to reduced cell proliferation and invas
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Elevated levels of reactive oxygen species (ROS) have been proposed as a risk factor for the development of papillary thyroid carcinoma (PTC) in patients with Hashimoto thyroiditis (HT). However, it has yet to be proven that the total levels of ROS are sufficiently increased to contribute to carcinogenesis. We hypothesized that if the ROS levels were increased in HT, ROS-related genes would also be differently expressed in PTC with HT. To find differentially expressed genes (DEGs) we analyzed data from the Cancer Genomic Atlas, gene expression data from RNA sequencing: 33 from normal thyroid t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptococcus neoformans is the etiologic agent of cryptococcosis. Two mating types exist in this fungus, MAT alpha and MATa. The CPRa gene of C. neoformans is a MATa strain-specific gene and encodes a putative seven-transmembrane domain pheromone receptor. Unlike the other reported fungal pheromone receptors, CPRa shows functional diversity. Deletion of CPRa drastically affects mating efficiency but does not abolish mating. CPRa expression is developmentally regulated and is not affected by deletion of the transcriptional regulator STE12a. The expression of CPRa is markedly increased by shifti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gonadotropin-inducible ovarian transcription factor-1 (Giot1) belongs to a family of fast-responsive genes, and gonadotropins rapidly induce its expression in steroidogenic cells of ovaries and testes of rats. Gonadal Giot1 gene expression is regulated by cyclic adenosine monophosphate (cAMP) -dependent protein kinase A pathway, with essential role of orphan nuclear receptor NR4A1 transcription factor (nuclear receptor subfamily 4, group A, member 1). A recent study reports that Giot1 is also expressed in adrenals, however, the mechanism of its regulation in adrenal gland is yet to be identifi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования