A comprehensive understanding of life history is vital to successful species conservation and management. When different life history stages are accompanied by considerable morphological or cryptic variation, such as the egg and larval phases exhibited by most fishes, genomic tools are essential for identifying species so that early-life ecology questions can be studied. Genotyping-in-thousands by sequencing (GT-seq) has recently emerged as a targeted and efficient approach for species identification. We leveraged existing genomic and transcriptomic data to develop a GT-seq panel capable of di
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recently, cases of human infection with rat hepatitis E virus (ratHEV, Rocahepevirus ratti) have been reported worldwide. Due to the significant genetic differences between ratHEV and human HEV genotypes 1-4 (Paslahepevirus balayani), current HEV diagnostic assays are unable to detect ratHEV. The aim was to establish and validate a laboratory-developed ratHEV RT-qPCR assay for use with human plasma and stool samples on a fully automated, high-throughput platform. Published primers and probes were optimized for use on cobas 5800/6800/8800 systems using European Union In Vitro Diagnostics Regula
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To achieve rapid and simultaneous detection of Goose Parvovirus (GPV), Goose Paramyxovirus (GPMV), Novel Goose Reovirus (NGRV), and Tembusu Virus (TMUV), the specific primers and TaqMan probes were designed and synthesized based on the VP3 gene of GPV, the F gene of GPMV, the σC gene of NGRV, and the E gene of TMUV, respectively, and a quadruplex real-time fluorescent RT-PCR (RT-qPCR) assay was successfully developed through optimization of the reaction system and conditions. The developed quadruplex RT-qPCR assay enabled the specific detection of GPV, GPMV, NGRV, and TMUV without cross-reacti
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Antimicrobial resistance (AMR) is a growing threat to public health, especially in low- and middle-income countries. This study aimed to identify multidrug-resistant (MDR) pathogens in clinical samples from a tertiary hospital in Ecuador, evaluate their phenotypic antibiotic susceptibility, and compare these findings with genotypic resistance patterns. METHODS: Clinical samples were collected from an Ecuadorian reference hospital from September 2022 to September 2023. Bacterial identification and susceptibility testing were performed using the VITEK-2 system. After genomic DNA extr
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Interspecific hybridization between relative species Cobitis taenia (with a diploid genome designated as TT), Cobitis elongatoid … spectively. Methods: In this study, fluorescence in situ hybridization (FISH) with 5S rDNA and 28S rDNA probes was used to analyze and compare chromosomal distribution patterns of rDNAs in clonally reproduced triploid Cobitis hybrids of different genomic constitutions ETT, ETN, EEN and EET (referred to using acronyms denoting the haploid genomes of their par …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Thrombospondin-1 (TSP-1) is an extracellular glycoprotein that mediates the differentiation of pulmonary endothelial cells and specialized stem cells into alveolar epithelial lineage-specific cells during the repair phase after lung injury. Since bronchopulmonary dysplasia (BPD) involves the inhibition of lung development with altered lung structure and vasculature, differential expression of the THBS-1 gene may impact lung development and pulmonary endothelial cell repair and have an important role in BPD.
METHODS: This prospective single-center cohort study included ELBW infants
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The bovine leukemia virus (BLV) is an important infectious agent transmitted from cattle to humans. It is considered one of the oncogenic viruses in breast cancer, so an accurate detection of this virus is important. The study aimed to design a specific and sensitive method based on TaqMan® real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) for BLV detection. Probes and primers were designed using bioinformatics software for a 108 pairs region of the BLV tax gene. Criteria employed for determining analytical sensitivity were prepared using in-vitro RNA transcriptions. The National Center for Biotech
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Senecavirus A (SVA) is a newly pathogenic virus correlated with the acute death of piglets and vesicular lesions in pigs. The further prevalence of SVA will cause considerable economic damage to the global pig farming industry. Therefore, rapid and accurate diagnostic tools for SVA are crucial for preventing and controlling the disease.
METHODS: We designed multiple primer pairs targeting the most conserved region of the SVA 3D gene and selected those with the highest specificity. Nfo-probes were subsequently developed based on the highest specificity primer pairs. Subsequently, t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hand, foot, and mouth (HMFD) disease caused by enterovirus 71 (EV 71), is closely associated with severe clinical manifestations and can be deadly. Early detection of EV 71 can be achieved by detecting the increment in miR296 and miR16 in the serum. Using HCR to amplify signals and convert biological signals into metal nanoparticle signals detectable by ICP-MS is a detection method that can collect more accurate and reliable information, compared with traditional methods, in the detection of biological samples.
RESULTS: We described a strategy for the simultaneous detection of miR
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Circulating tumor cells (CTCs) are cells shed from primary or metastatic tumors and spread into the peripheral bloodstream. Mutation detection in CTCs can reveal vital genetic information about the tumors and can be used for "liquid biopsy" to indicate cancer treatment and targeted medication. However, current methods to measure the mutations in CTCs are based on PCR or DNA sequencing which are cumbersome and time-consuming and require sophisticated equipment. These largely limited their applications especially in areas with poor healthcare infrastructure. Here we report a simple, convenient,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intraductal oncocytic papillary neoplasms (IOPNs) of the pancreatobiliary system are tumors comprising oncocytic cells, in which three types of fusion genes involving -PRKACA/-PRKACB were recently identified. IOPNs infrequently combine with other histological subtypes of pancreatic intraductal papillary mucinous neoplasms (IPMNs) and intraductal papillary neoplasms of the bile duct (IPNBs). This study aimed to confirm the sensitivity/specificity of the fusion genes for IOPNs and to examine their significance in other oncocytic lesions. An RT-PCR, followed by DNA sequencing, was undertaken to e
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Solute carrier family 23 member 1 (SVCT1) and solute carrier family 23 member 2 (SVCT2), encoded by SLC23A1 and SLC23A2, may be associated with preeclampsia (PE). The purpose of this study was to investigate the association between polymorphisms of SLC23A1 and SLC23A2 and PE in Chinese Han population. The primers and double-labeled probes were designed according to the SNPs of rs10063949 in SLC23A1, rs6133175 and rs1279683 in SLC23A2. Genomic DNA was extracted from peripheral blood of 2,066 subjects (1,029 with PE and 1,037 without PE), and Taqman real-time PCR was used to detect the three SNP
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ABSTRACT: Vibrio cholerae can cause pandemic cholera in humans. The bacterium resides in aquatic environments worldwide. Continuous testing of V. cholerae contamination in water and aquatic products is imperative for food safety control and human health. In this study, a rapid and visualized method was developed for the first time based on loop-mediated isothermal amplification (LAMP) for detection of the important virulence-related genes ace, zot, cri, and nanH for toxins and the infectious process of V. cholerae. Three pairs of molecular probes targeting each of these genes were designed and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genome wide association study identified hedgehog interacting protein gene (HHIP) variants with chronic obstructive pulmonary disease and asthma. Loss of HHIP, a key regulator of the hedgehog signaling pathway, leads to impaired lung morphogenesis and lethality in animal models, through unimpeded sonic hedgehog expression blocking mesenchymal-expressed fibroblast growth factor 10 (FGF10). Since bronchopulmonary dysplasia (BPD) is also associated with altered lung development and worsens with stimuli including mechanical ventilation, reactive oxygen species, and inflammation, HHIP a
СтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Approximately 1-2% of chronic myeloid leukemia (CML) patients harbor atypical BCR-ABL1 transcripts that cannot be monitored by real-time quantitative PCR (RT-qPCR) using standard methodologies. Within the European Treatment and Outcome Study (EUTOS) for CML we established and validated robust RT-qPCR methods for these patients.
METHODS: BCR-ABL1 transcripts were amplified and sequenced to characterize the underlying fusion. Residual disease monitoring was carried out by RT-qPCR with specific primers and probes using serial dilutions of appropriate BCR-ABL1 and GUSB plasmid DNA calibr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We developed a novel real-time PCR assay that simultaneously evaluates 11 major nucleos(t)ide antiviral (NA) drug resistance mutations (mt) in chronic hepatitis B patients (CHB), including L180M, M204I/V, and V207M (lamivudine [LMV] resistance), N/H238A/T (adefovir [ADF] resistance), which are circulating in Vietnam; and T184G/L, S202I, and M250V (entecavir [ETV] resistance) and A194T (tenofovir resistance), which have been recently reported in several studies across the globe. We detected drug-resistant mt in hepatitis B virus (HBV) samples using our predesigned panel of allele-specific locke
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To determine the association between endoplasmic reticulum aminopeptidase (ERAP)1 and ERAP2 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) and human leukocyte antigens (HLA)-B27+ or HLA-B15+ patients with spondyloarthritis (SpA).
METHODS: 104 patients with SpA according to Assessment of Spondyloarthritis International Society criteria were included in the study. HLA typing was performed by PCR. The polymorphisms were determined by real-time PCR on genomic DNA using customised probes for SNPs rs27044, rs17482078, rs10050860 and rs30187 in ERAP1, and rs2910686, rs2248374 and rs2549782 in ERA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Glucose-6-phosphate dehydrogenase deficiency (G6PDd), haemoglobin C (HbC) and S (HbS) are inherited blood disorders (IBD) common in populations in malaria endemic areas. All are associated to some degree with protection against clinical malaria whilst additionally G6PDd is associated with haemolysis following treatment with 8-aminoquinolines. Measuring the prevalence of these inherited blood disorders in affected populations can improve understanding of disease epidemiology. Current methodologies in epidemiological studies commonly rely on individual target amplification and visual
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ВАЖНЕЙШИЕ И ЗАДАЧИ: Папильомавирус человека (ВПЧ) является причиной рака шейки матки, одной из основных причин смертности от рака у индийских женщин. Нынешнее исследование было проведено для того, чтобы дополнить имеющиеся данные о распределении ВПЧ по типам в индейцах, с тем чтобы попытаться документально зафиксировать типы ВПВ для будущей программы вакцинации, если таковые имеются. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ: В 223 случаях заболевания раком шейки матки и 2408 случаях заболевания здоровыми женщинами без рака и внутриэпифелевой неоплазией шейки матки (контроль). Велосипедная цепная реакция полимеразы,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Listeria monocytogenes is an important foodborne pathogen, causative agent of listeriosis. The epidemiology and persistence of this bacterium in meat processing plants may be related to its serotype, so it is of utmost importance to carry out a correct differentiation of L. monocytogenes serotypes. The objective of this study was to develop a unique quadruplex real-time quantitative PCR (qPCR) method able to differentiate the four most predominant and worrying L. monocytogenes serotypes (1/2a, 1/2b, 1/2c and 4b) in isolates from meat processing plants and ready-to-eat (RTE) dry-cured meat prod
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.