Hepatocyte Nuclear Factor 1 beta (HNF1β) is a transcription factor which plays an important role during early organogenesis, especially of the pancreato-biliary and urogenital tract. Furthermore, HNF1β is an established marker in the differential diagnosis of ovarian cancer and shows a distinct nuclear expression in the clear cell carcinoma subtype. Recently, it has been described in yolk sac tumor, which represents a common component in many non-seminomatous germ cell tumors. Due to its broad histologic diversity, the diagnosis may be challenging and additional tools are very helpful in the w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: According to mRNA microarray, proteomics and other studies, biological abnormalities of eutopic endometrium (EM) are involved in … es/proteins.
CONCLUSION: TRIzol treatment of secretory phase EM allows combined proteomic and mRNA microarray analysis of the same sample, but comparison between proteomic and microarray data was not evident, probably due to post-translational modifications.
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Systemic juvenile idiopathic arthritis (sJIA) is a rheumatic disease in childhood characterised by systemic symptoms and a relatively poor prognosis. Peripheral leukocytes are thought to play a pathological role in sJIA although the exact cause of the disease is still obscure. In this study, we aimed to clarify cellular functional abnormalities in sJIA.
METHODS: We analysed the gene expression profile in peripheral leukocytes from 51 patients with sJIA, 6 patients with polyarticular type JIA (polyJIA) and 8 healthy children utilising DNA microarrays. Gene ontology analysis and net
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuroblastoma (NB) exhibits profound clinical and molecular heterogeneity, highlighting the need for reproducible biomarkers for disease stratification. This study aimed to identify robust stage-associated gene signatures through integrative machine learning (ML) and cross-platform validation. Four independent NB microarray datasets were integrated to perform a multi-cohort meta-analysis. Differentially expressed genes (DEGs) were identified using Linear Models for Microarray Data (limma), followed by feature selection through three orthogonal ML models - Random Forest (RF), eXtreme Gradient B
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ongoing need for chromosome microarray analysis (CMA) characterization prompted the description of all 16,138 copy number variants (CNVs) found in 3832 patients studied from 2009 to 2024, 92% of them with developmental disabilities and/or autism. Detailed reporting shows the overlap of variants qualified as benign (15,083 CNVs, sizes 0.1 Kb-3 Mb) or of uncertain significance (216 CNVs, sizes 11 Kb-20 Mb) with pathogenic CNVs (836, 11 Kb-31 Mb), which are emphasized in most studies. Further distinguishing pathogenic CNVs were 88 recurring microdeletion/duplications and 86 in single patients, wi…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromosomal microarray analysis (CMA) was performed for 40 patients with B-ALL undergoing treatment according to the ALL-2016 protocol to investigate the copy number alterations (CNAs) and copy neutral loss of heterozygosity (cnLOH) associated with minimal residual disease (MRD)-positive remission. Aberrations involving over 20,000 genes were identified, and a random forest approach was applied to isolate a subset of genes whose CNAs and cnLOH are significantly associated with poor therapeutic response. We have assembled the triple matched healthy population data and used that data as a refere…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Preeclampsia (PE) is a serious pregnancy-related complication caused by high blood pressure in pregnant women. The severe form has more devastating effects. According to the growing evidence, the placenta is a crucial component in the pathogenesis of PE, and eliminating it will alleviate symptoms.
METHODS: GEO's severe preeclampsia placenta microarray datasets; GSE147776, GSE66273, GSE102897, and GSE10588, were chosen to identify differentially expressed genes (DEGs) in different biological pathways. The analysis of hub genes and related non-coding RNAs was done as well.
RESULT
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: (i) To provide baseline knowledge of gene expression in macroscopically normal articular cartilage, (ii) to test the hypothesis that age, body-mass-index (BMI), and sex are associated with cartilage RNA transcriptome, and (iii) to predict individuals at potential risk for developing "pre-osteoarthritis" (OA) based on screening of genetic risk-alleles associated with OA and gene transcripts differentially expressed between normal and OA cartilage.
DESIGN: Healthy-appearing cartilage was obtained from the medial femoral notch of 12 knees with a meniscus tear undergoing arthroscopic
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glycosylation is co- and posttranslational modifications affecting proteins. The glycopattern changes are associated with changes in biological function and are involved in many diseases including cancer. We present the lectin-based protein microarray method enabling determination of differences in protein glycosylation. The method involves isolation of targeted protein from samples by immunoprecipitation, spotting of protein from multiple samples into arrays on a microarray slide, incubation with set of biotinylated lectins, the reaction with fluorescent conjugate of streptavidin, and detecti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autosomal polycystic kidney disease (ADPKD) is a frequent monogenic renal disease, characterised by fluid-filled cysts that are thought to result from multiple deregulated pathways such as cell proliferation and apoptosis. MicroRNAs (miRNAs) are small non-coding RNAs that regulate the expression of many genes associated with such biological processes and human pathologies. To explore the possible regulatory role of miRNAs in PKD, the PKD/Mhm (cy/+) rat, served as a model to study human ADPKD. A parallel microarray-based approach was conducted to profile the expression changes of mRNAs and miRN
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SCOPE: This study addresses the effects of branched-chain amino acids (BCAA) on global gene expression in liver and skeletal muscle and the molecular mechanisms underlying the improvement in liver cirrhosis using DNA microarray analysis combined with RNase protection assay.
METHODS AND RESULTS: Male Wistar rats administered carbon tetrachloride (CCl(4) ) repeatedly for 19 weeks as a decompensated cirrhosis model were thereafter given BCAA-enriched diet (AL) or normal diet (LC) for 5 weeks. The control-diet rats without CCl(4) administration were used as a normal control group. Gene expression…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To study the common molecular mechanisms of various viruses infections that might result in congential cardiovascular diseases in perinatal period, changes in mRNA expression levels of ECV304 cells infected by rubella virus (RUBV), human cytomegalovirus (HCMV), and herpes simplex virus type 2 (HSV-2) were analyzed using a microarray system representing 18,716 human genes. 99 genes were found to exhibit differential expression (80 up-regulated and 19 down-regulated). Biological process analysis showed that 33 signaling pathways including 22 genes were relevant significantly to RV, HCMV and HSV-
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: PET imaging is useful for evaluating locally advanced primary breast cancer. Expression of specific molecular markers in these c … primary breast cancer, ER-negative tumors display higher (18)F-FDG uptake than ER-positive tumors. Microarray analysis confirms these data and identifies genes associated with increased glucose use as measured by PET. These genes significantly overlap those of a previously validated ER-status molecular phenotype. These preliminary data support a growing body of evid …
Клиническое исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To evaluate the protein expression of fibroblast growth factor receptor-3 (FGFR3), hamartin, 14-3-3sigma, Aurora-A, and E-cadherin using immunohistochemistry (IHC) in a series of human bladder carcinomas and to evaluate their value in distinguishing T1a from T1b tumours and in predicting their behaviour, as T1 urothelial bladder tumours present great diagnostic and therapeutic challenges to pathologists and clinicians.
PATIENTS, MATERIALS AND METHODS: Tissue microarrays were constructed from 94 patients (Ta 20, T1a 31, T1b 14, and T2 29 patients) using tissue obtained at first dise
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atypical neuroleptics are associated with clinical significant weight gain, whereas stimulants are used as anorexiant drugs. The aim of this study was to examine gene expression changes in the mouse frontal cortex following chronic oral treatment with antipsychotics and a stimulant by microarray assessments. Twenty 10-12-week-old male C57BL6 mice received daily for 31 days either the typical neuroleptic haloperidol (1 mg/kg), the atypical neuroleptic clozapine (10 mg/kg) or the stimulant phenylpropanolamine (3 mg/kg). We identified a set of genes that was differently expressed between the neur
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To identify disease-specific gene expression profiles in patients with rheumatoid arthritis (RA), using complementary DNA (cDNA) microarray analyses on lymphoblastoid B cell lines (LCLs) derived from RA-discordant monozygotic (MZ) twins.
METHODS: The cDNA was prepared from LCLs derived from the peripheral blood of 11 pairs of RA-discordant MZ twins. The RA twin cDNA was labeled with cy5 fluorescent dye, and the cDNA of the healthy co-twin was labeled with cy3. To determine relative expression profiles, cDNA from each twin pair was combined and hybridized on 20,000-element microarra
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАTwin StudyПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To establish the possible roles of oxidative stress, inflammatory processes and other unknown mechanisms in neurodegeneration, we investigated brain gene alterations in N-methyl-4-phenyl-1,2,3,6-tetrahydropyridine (MPTP) mice model of Parkinson's disease using Atlas mouse cDNA expression array membrane. The expression of 51 different genes involved in oxidative stress, inflammation, glutamate and neurotrophic factors pathways as well as in still undefined processes, such as cell cycle regulators and signal transduction molecules, was differentially affected by the treatment. The present study
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The inherited causes behind fetuses with a single umbilical artery (SUA) are still poorly understood, largely because published … rried out in all affected cases, with samples analyzed via conventional karyotyping and chromosomal microarray analysis (CMA) to detect any chromosomal abnormalities.
RESULTS: In the present study, four cases of chromosome aneuploid and two cases of chromosomal structural abnormalities were identified through karyotype analysis, with the chromosomal aberration detec …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Malignant pleural mesothelioma (MPM) is a highly aggressive cancer with short survival time. Unbalanced competing endogenous RNAs (ceRNAs) have been shown to participate in the tumor pathogenesis and served as biomarkers for the clinical prognosis. However, the comprehensive analyses of the ceRNA network in the prognosis of MPM are still rarely reported. In this study, we obtained the transcriptome data of the MPM and the normal samples from TCGA, EGA, and GEO databases and identified the differentially expressed (DE) mRNAs, lncRNAs, and miRNAs. The functions of the prognostic genes and the ov
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Erectile dysfunction (ED) is a debilitating medical condition in which current treatments are minimally effective in diabetic patients due to neuropathy of the cavernous nerve, a peripheral nerve that innervates the penis. Loss of innervation causes apoptosis of penile smooth muscle, remodeling of corpora cavernosa (penile erectile tissue) morphology, and ED.
AIM: In this study, microarray and pathway analysis were used to obtain a global understanding of how signaling mechanisms are altered in diabetic patients and animal models as ED develops, in order to identify novel targets
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования