Producing functional proteins involves multiple steps during mRNA translation on the ribosomes. However, co-translational regulatory mechanisms remain poorly characterized in intact mammalian systems. As a proof-of-concept, we developed a multi-omics approach to investigate endothelial-specific, co-translational regulation by modifying the translating ribosome affinity purification (TRAP) in vivo. We simultaneously co-immunoprecipitated (IP) polysome-associated mRNAs and proteins from the hearts of hemagglutinin-tagged ribosomal protein L22 mice (RiboTag) crossed with inducible endothelial-spe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hereditary leiomyomatosis and renal cell carcinoma (HLRCC) is an autosomal dominant condition characterized by the development of cutaneous and uterine leiomyomas and risk for development of an aggressive form of papillary renal cell cancer. HLRCC is caused by germline inactivating pathogenic variants in the fumarate hydratase (FH) gene, which encodes the enzyme that catalyzes the interconversion of fumarate and L-malate. We utilized enzyme and protein mobility assays to evaluate the FH enzyme in a cohort of patients who showed clinical manifestations of HLRCC but were negative for known patho
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study aims to qualitatively and quantitatively review the association between Epstein-Barr virus (EBV) and oral squamous cell carcinoma (OSCC).
METHODS: PubMed, Scopus, and Web of Science databases were searched using the keywords "EBV or Epstein Barr virus and Oral cancer or Oral squamous cell carcinoma" for published case-control studies in the English language upto August 2019.
RESULTS: The search yielded 985 articles out of which 966 articles were excluded by screening their titles and abstracts as they were irrelevant or duplicates. Based on the full-text assessment of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This chapter summarises research investigating the expression of huntingtin sense and anti-sense transcripts, the effect of the mutation on huntingtin processing as well as the more global effect of the mutation on the coding and non-coding transcriptomes. The huntingtin gene is ubiquitously expressed, although expression levels vary between tissues and cell types. A SNP that affects NF-ĸB binding in the huntingtin promoter modulates the expression level of huntingtin transcripts and is associated with the age of disease onset. Incomplete splicing between exon 1 and exon 2 has been shown to re
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toll-like receptors (TLRs) are important innate immune receptors that recognize multiple pathogen-associated molecular patterns (PAMPs) and activate the immune responses to resist the invasion of pathogens. Many TLRs need assistance from trafficking chaperones to transport to the specific cell compartments and then are processed before they are activated. In this study, we identified an important trafficking chaperone, Unc-93 homolog B1 (unc93b1), from the Epinephelus coioides (orange-spotted grouper). The deduced protein sequence of Eco.unc93b1 was 632 amino acids, containing 12 transmembrane
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Despite the favourable survival rates of childhood acute lymphoblastic leukaemia (ALL), a significant number of patients present resistance to antileukaemic agents and dismal prognosis. In this study, we analysed miR-125b expression in childhood ALL and evaluated its clinical utility for patients treated with Berlin-Frankfurt-Münster (BFM) protocol.
METHODS: The study included 272 bone marrow specimens obtained on diagnosis and on BFM day 33 from 125 patients and 64 healthy children. Following extraction, RNA was polyadenylated and reverse transcribed. miR-125b levels were quantif
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Huntington's disease (HD) is an adult-onset neurodegenerative disorder caused by a mutated CAG repeat in the huntingtin gene that is translated into an expanded polyglutamine tract. The clinical manifestation of HD is a progressive physical, cognitive, and psychiatric deterioration that is eventually fatal. The mutant huntingtin protein is processed into several smaller fragments, which have been implicated as critical factors in HD pathogenesis. The search for proteases responsible for their production has led to the identification of several cleavage sites on the huntingtin protein. However,
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАКомментарийПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kaposi sarcoma-associated herpesvirus (KSHV) ORF57, also known as Mta (mRNA transcript accumulation), enhances viral intron-less transcript accumulation and promotes splicing of intron-containing viral RNA transcripts. In this study, we identified KSHV PAN, a long non-coding polyadenylated nuclear RNA as a main target of ORF57 by a genome-wide CLIP (cross-linking and immunoprecipitation) approach. KSHV genome lacking ORF57 expresses only a minimal amount of PAN. In cotransfection experiments, ORF57 alone increased PAN expression by 20-30-fold when compared to vector control. This accumulation
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The thyroid stimulating hormone (TSH) is a glycoprotein synthesized and secreted from thyrotrophs of the anterior pituitary gland. It acts b … ffer in the length of their 3' untranslated regions were found. They reflect the use of alternative polyadenylation cleavage sites. Seasonal changes in sbsTSHR mRNA levels in female and male sea bass during the first ovarian and testicular recrudescence suggest that in females the TSHR could participate in active vitellogenesis and in the regulation of gamete mat …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND INFORMATION: In Xenopus, during oocyte maturation and the segmentation period, cell cycle progression is independent of new transcription, but requires de novo translation. This suggests that the completion of oocyte maturation and then the rapid cell division period is controlled exclusively at a post-transcriptional level by specific gene products. To isolate these maternal genes, a differential screening of a Xenopus egg cDNA library was performed. Several cDNAs were isolated which correspond to mRNA polyadenylated in eggs and deadenylated in embryos, and these constitute the fou
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The open reading frame BPLF1 of Epstein-Barr virus (EBV) shows homology to the Herpes simplex virus 1 (HSV1) protein VP16. This protein is a structural tegument component playing a pivotal role for HSV replication as trans-activator of viral immediate-early genes. An EBV gene with a comparable function has not been described so far. However, computer analysis indicated that BPLF1 may be a tegument protein homologous to VP16. This is the first report on the characterisation of the BPLF1 gene, its transcription, and expression of its gene product in vitro and in vivo. Using RT-PCR and Northern b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The replication and transcription activator (RTA) of Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (KSHV), or human herpesvirus 8, a homologue of Epstein-Barr virus BRLF1 or Rta, is a strong transactivator and inducer of lytic replication. RTA acting alone can induce lytic replication of KSHV in infected cell lines that originated from primary effusion lymphomas, leading to virus production. During the lytic replication process, RTA activates many kinds of genes, including polyadenylated nuclear RNA, K8, K9 (vIRF), ORF57, and so on. We focused here on the mechanism of how RTA upregulates the K9 (vIR
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
X-linked dyskeratosis congenita (DC) is a bone marrow failure syndrome caused by mutations in the DKC1 gene located at Xq28. By 20 years of … ene. Normal levels of mRNA are produced from the deleted gene, with the transcripts using a cryptic polyadenylation site in the antisense strand of the adjacent MPP1 gene, normally located 1 kb downstream of DKC1 in a tail to tail orientation. The predicted truncated protein lacks a lysine-rich peptide that is less conserved than the rest of the dyskerin molecule …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is a disparity in the fact that epidermal growth factor (EGF) can stimulate proliferation of a wide variety of cells in vitro, yet sites of synthesis for this polypeptide in vivo are generally associated with nonproliferative or differentiated cell populations. Unlike other known mitogenic members of the EGF family of ligands, EGF derives from a large (M(r) approximately 130,000) protein that contains multiple EGF-like domains; some of these domains contain putative Ca(2+)-binding sites. In the present study, the mouse vaginal epithelium was used as a prototype tissue to investigate expr
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic variants in untranslated regions (UTRs) can alter post-transcriptional regulation, yet functional interpretation remains difficult b … and stronger top-k enrichment. A TP53 rs78378222 case study connected model sensitivity to a known polyadenylation-signal context, whereas RNAfold-derived differences were window-dependent and were treated as exploratory. These results support UTR-FNex as a multimodal prioritization framework while defining important limits in cross-gene and cross-source general …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer immunotherapy has improved outcomes across many tumor types, but primary and acquired resistance, tumor heterogeneity and a shortage of safe targets remain unresolved. Part of this gap arises because tumor cells evade immune recognition not only through genomic mutation but also through post-transcriptional mRNA processing, a network comprising 5' capping, splicing, alternative polyadenylation (APA), RNA editing, epitranscriptomic modification, nonsense-mediated decay (NMD), RNA stability and translational control. These processes govern antigen presentation, transcript degradation, che…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Temporal lobe epilepsy (TLE) is a common neurological disorder frequently resistant to pharmacological treatment, yet its molecular mechanisms remain incompletely understood. Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1 (CPEB1) is a post-transcriptional regulator implicated in neuronal stress responses; however, its role in epilepsy and redox-inflammatory signaling remains unclear.
METHODS: An integrative multi-omics strategy combining single-cell transcriptomics, bulk RNA sequencing, and bioinformatics analyses was employed, followed by validation in human epileptic hipp…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bladder cancer (BC) remains a prevalent malignancy worldwide, with rising incidence rates each year. Despite progress in therapeutic strategies, many patients suffer recurrence or progression, emphasizing the urgent need for novel prognostic biomarkers and therapeutic targets. This research evaluated the prognostic relevance and functional role of Cleavage and Polyadenylation Specificity Factor 3 (CPSF3) in BC.
METHODS: We analyzed CPSF3 expression using The Cancer Genome Atlas data and immunohistochemistry on a cohort of 203 BC patients. A nomogram incorporating CPSF3 expression …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIV-1 latency remains a major barrier to viral eradication, and the mechanisms underlying the maintenance of proviral transcriptional silenc … ent of key cis-regulatory elements, including the TAR stem-loop, the splice donor site SD1, and the polyadenylation signal. Collectively, our findings uncover a noncanonical role of Ago1 in HIV-1 transcriptional repression, further expanding its functional repertoire beyond RNA interference and providing new insights into the mechanisms maintaining HIV-1 latency, …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: RNA sequencing of whole blood has been increasingly employed to find transcriptomic signatures of disease states. These studies … t the gene level and 0.736 at the transcript isoform level. We identified 2 genes with differential polyadenylation, 9 genes with differential expression and 4 genes with differential transcript usage between bacterial and viral infection. Gene ontology gene set enrichment analysis of poly(A) tail length revealed enrichment of long tails in mRNA of genes involved …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования