The rapid expansion of plasma proteomic data and protein quantitative trait loci (pQTLs) provides an opportunity to identify genes that confer disease risk through their effect on plasma protein abundance. We conducted an Alzheimer's disease (AD) proteome-wide association study (PWAS) integrating publicly available plasma cis-pQTL data (1348 European American and 1385 African American genetically determined protein models) with AD dementia GWAS summary statistics. Whereas the African American PWAS identified one candidate [apolipoprotein E (APOE)] and multiple suggestive genes, the European Am
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The role of Tumor Necrosis Factor (TNF)-Related Apoptosis-Inducing Ligand (TRAIL) has been highlighted in autoimmune and metabolic disorders. However, there is still an inadequate explanation of its causal relationship with primary immune thrombocytopenia (ITP). This study employed Mendelian Randomization (MR) to identify the potential causal associations among TRAIL, plasma metabolites, and ITP.
METHODS: This study was conducted focusing on analyzing data from a Genome-Wide Association Study (GWAS) comprising inflammatory proteins, plasma metabolites, and the FinnGen consortium…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Genetic factors contribute to physical activity (PA) and sedentary behavior (SB), two complex behavioral traits. They may be associated with musculoskeletal and inflammatory diseases. However, the relationships of domain-specific PA and SB traits with osteoporosis (OS), psoriatic arthritis (PsA), and rheumatoid arthritis (RA) remain unclear. A two-sample Mendelian randomization (MR) analysis assessed potential bidirectional associations between these behavioral traits and the three diseases.
METHODS: GWAS summary statistics were used to examine five domain-specific PA traits, three
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to investigate the genetic causality between cataract (senile and other types) and psychiatric disorders using Mendelian randomization (MR). We performed a bidirectional 2-sample MR analysis using genome-wide association studies summary data. Primary analysis employed inverse-variance weighted, MR-Egger, weighted median, and weighted mode methods. Sensitivity analyses included Cochran Q, MR-pleiotropy residual sum and outlier, MR-Egger intercept, and leave-one-out tests to assess heterogeneity and pleiotropy. Forward MR analysis revealed a suggestive causal effect of other cat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Calcific aortic valve stenosis (AS) is the most prevalent valvular heart disease in high-income countries, affecting 9.4 million persons globally. While surgical and transcatheter aortic valve replacement have transformed outcomes, they address end-stage disease rather than the underlying pathobiology. The development of pharmacological therapies to slow or halt AS progression would represent a paradigm shift in disease management. Recent advances have substantially expanded our understanding of AS pathogenesis. Large-scale genome-wide association studies have identified over 260 risk loci, wi
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cervical cancer remains a major global public health concern, with persistent infection by high-risk human papillomavirus (hrHPV) types recognized as the primary etiological factor. This review explores the multifactorial nature of the disease, focusing on the complex interplay between host genetic susceptibility and epigenetic alterations that drive cervical carcinogenesis. Evidence from genome-wide association studies (GWAS) is discussed, highlighting the contribution of specific genetic loci, predominantly within the HLA region, to susceptibility to HPV infection and disease progression. In
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple sclerosis (MS) is a complex autoimmune disease with strong genetic components, but its genetic mechanisms remain largely underexplored. We aimed to pinpoint causal genes and evaluate their utility for MS risk prediction. We integrated MS genome-wide association study summaries with brain-derived splicing quantitative trait loci (sQTLs) and expression quantitative trait loci (eQTLs) via summary-data-based Mendelian randomization (SMR) and colocalization analyses to identify potential causal genes. Weighted gene coexpression network analysis (WGCNA) of the E-MTAB-5151 dataset identified…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Observational studies suggest that alterations in circulating lipid levels may be associated with multiple sclerosis (MS) susceptibility and severity.
OBJECTIVES: Our study employs two-sample Mendelian randomisation (MR) to investigate whether these relationships are causal.
METHODS: Genetic instruments for 249 metabolites, predominantly lipids and lipoproteins, were obtained from a combined dataset of European-ancestry individuals from the UK and Estonian Biobanks. Outcome data were obtained from the International MS Genetics Consortium GWAS studies of MS susceptibility and seve
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Multiple sclerosis (MS) develops after a prolonged preclinical phase. Identifying circulating biomarkers that capture this early biology can improve risk stratification and guide intervention. We aimed to identify plasma proteins driving MS susceptibility using large-scale proteogenomic integration and to evaluate their prediagnostic predictive value and effects on severity.
METHODS: We used cis-acting protein quantitative trait loci (pQTL) for 2,545 plasma proteins (n = 80,824). Predicted protein levels were tested for association with MS risk in 14,802 cases and 26,703 controls u
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BackgroundGastric cancer (GC) remains a major cause of cancer-related mortality, and biomarkers for early detection are needed.MethodsStomach and blood expression quantitative trait loci were integrated with two GC genome-wide association studies using Mendelian randomization (MR), Bayesian colocalization, and summary-data-based MR/heterogeneity in dependent instruments (SMR/HEIDI) testing. Bulk and single-cell transcriptomic analyses characterized candidate expression and lesion-associated patterns. CDC16 protein expression was evaluated by immunohistochemistry in 53 paired GC and non-neoplas
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasma lipid composition has been linked to multiple cancers, yet its causal contribution to gastric cancer and the potential intermediary role of immune cells remain unclear. We aimed to clarify these relationships and identify specific lipid and immune cell traits that either protect against or promote gastric cancer. We performed a 2-sample, 2-step Mendelian randomization analysis using summary statistics from large genome-wide association studies of gastric cancer (1423 cases, 3,14,193 controls), plasma lipidomics (179 molecular species), and 731 immune cell phenotypes. Independent, genome
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigates the causal relationship between genetically proxied iron-supplement drugs and inflammatory bowel disease (IBD) risk. After identifying 8 commonly used iron supplementation drugs based on the guidelines, a search for each of these drugs yielded 18 key regulatory targets and the locus information of each drug-targeted gene was obtained. Hemoglobin was selected as a biomarker downstream of drug regulation and its single nucleotide polymorphism (SNP) data were extracted and screened from genome-wide association studies (GWAS). Strict screening conditions were set to obtain
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung cancer remains a leading cause of global morbidity and mortality, imposing a significant healthcare burden worldwide. To comprehensively investigate potential risk factors for lung cancer and provide a theoretical basis for its prevention and treatment, we utilized publicly available genome-wide association study data of European ancestry. We treated various traits as exposures and lung cancer as the outcome. Causal relationships were assessed using 5 Mendelian randomization (MR) methods: inverse-variance weighted, constrained maximum likelihood and model averaging, debiased inverse-varia…
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A) is an abundant post-transcriptional RNA modification that critically regulates brain function. Dysregulation of m6A signaling has been implicated in several neurological diseases, including Alzheimer's disease (AD). However, whether genetic variation associated with the risk of AD is mediated via m6A-dependent gene regulation is currently unknown. Here we investigated the association of m6A with the risk of AD using the summary-data-based Mendelian randomization (SMR) approach. By integrating m6A quantitative trait loci (m6A-QTLs) and genome-wide association study (GWA…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous studies have suggested an association between periodontitis and intracranial aneurysms (IAs). However, it remains unclear whether the association is causal. This study systematically investigated the potential genetic link between periodontitis and IAs, including the formation and rupture of IAs. This study utilized publicly available genome-wide association study summary statistics data for a 2-sample bidirectional Mendelian randomization (MR) analysis. The main statistical analysis method used was inverse variance weighting. The reliability of the results was verified through sensit…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The microRNA expression profile in the bodily fluids of individuals with acute pancreatitis (AP) undergoes considerable alterations; nevertheless, the precise mechanism requires more elucidation.
METHODS: A dataset of 2083 human blood microRNAs (miRNAs) was obtained from the miRNA expression quantitative loci data. The genome-wide association study data for AP was obtained from the FinnGen Consortium. The causal association between miRNA and susceptibility to AP was evaluated using the Mendelian randomization (MR) method. Receiver operating characteristic (ROC) curve analyses were…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell multiomics provides critical insights into how disease-associated variants identified through genome-wide association studies (GWASs) influence transcription factor eRegulons within a specific cellular context; however, the regulatory roles of genetic variants in aging and disease remain unclear. Here, we present scMORE, a method that integrates single-cell transcriptomes and chromatin accessibility with GWAS summary statistics to identify cell-type-specific eRegulons associated with diseases. scMORE effectively captures trait-relevant cellular features and demonstrates robust perf
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peripheral artery disease (PAD) is a major contributor to morbidity in older adults. We aimed to determine genetic and non-genetic determinants of PAD and ankle-brachial index (ABI) in the Long Life Family Study (LLFS). 3006 individuals had ABI assessment, including 1090 probands (mean age 89), 1554 offspring (mean age 60) and 362 spousal controls (mean age 61). Outcomes include minimum of right and left ABIs and PAD (ABI <0.9). Stepwise regression determined independent significant non-genetic correlates of ABI and PAD. Genomewide association and linkage analyses were adjusted for age, sex, s
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) represents one of the most prevalent chronic liver conditions worldwide. Previous studies have highlighted an association between circulating growth differentiation factor 15 (GDF-15) levels and NAFLD, as well as the involvement of immune cells in its pathogenesis and progression. However, the causal relationships remain unclear.
METHODS: We obtained summary-level data for circulating GDF-15 levels, NAFLD, and 731 immune cell phenotypes from large-scale genome-wide association studies (GWAS) and the FinnGen database. Mendelian randomization
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This observational study aimed to compare various genotyping and enrichment platforms to determine the most comprehensive coverage for genome-wide association studies, specifically targeting new therapeutic approaches against coronaviruses using chloroquine. Pharmacogenomic studies have become essential for understanding individual drug responses, and optimal platform selection is critical for identifying relevant genetic variants. We developed Python scripts to assess the coverage rates of these platforms, focusing on the absorption, distribution, metabolism, and excretion (ADME) genes involv
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования