Severe combined immunodeficiency disease (SCID), characterized by profound immune system dysfunction, can lead to life-threatening infections and death. Animal models play a pivotal role in elucidating biological processes and advancing therapeutic strategies. Recent advances in gene-editing technologies, including zinc-finger nucleases (ZFNs), transcription activator-like effector nucleases (TALENs), CRISPR/Cas9, and base editing, have significantly enhanced the generation of SCID models. These models have not only deepened our understanding of disease pathophysiology but have also driven pro
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tobacco use continues to pose a significant public health challenge, not only due to its immediate toxic effects but also because of its long-lasting epigenetic consequences. The present review explores the complex and evolving field of epigenetics to examine how maternal, paternal and even grandparental smoking can alter the heritable regulation of gene expression, with consequences that span multiple generations. The focus is placed on DNA methylation as a central mechanism mediating these effects, particularly in the placenta and germ cells. Evidence from human cohort studies and animal mod
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation, a key component of epigenetic regulation, is essential for preserving normal cellular functions, supporting plant growth, and facilitating development and responses to stress. Whole genome bisulfite sequencing (WGBS) is the definitive method for studying DNA methylation and is extensively used in functional genomics research across both animal and plant species. While various analysis tools have been created for WGBS, a thorough evaluation of their performance in analyzing plant data remains lacking. This study provides a comprehensive assessment of six widely used alignment m…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Tandem repeats (TRs) are major sources of genetic variation and important genetic markers. Their expansions are not only involved in gene expression regulation but also associated with many nervous system diseases and cancers. However, there is a lack of an efficient tandem repeat identification tool for seamless integration with larger bioinformatics programs developed with the popular Python language.
RESULTS: We introduce pytrf, a Python package for identification of both exact and approximate TRs from genomic sequences. It allows seamless embedding into other programs develope
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Viral genome analysis is crucial for understanding virus evolution and mutation. Investigations into viral evolutionary dynamics and mutation patterns have garnered significant research attention since the outbreak of COVID-19. The basic structure of many virus genomes is highly conserved [1]. RNA viruses have high mutation rates, and single-nucleotide variations may induce substantial phenotypic alterations in terms of viral function and pathogenicity. Thus, special assembly methods are required for viral genome analysis.
RESULT: PVGA starts with a reference genome and the sequen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In a standard analysis, pleiotropic variants are identified by running separate genome-wide association studies (GWAS) and combining results across traits. But such statistical approach based on marginal summary statistics may lead to spurious results. We propose a new statistical approach, Debiased-regularized Factor Analysis Regression Model (DrFARM), through a joint regression model for simultaneous analysis of high-dimensional genetic variants and multilevel dependencies. This joint modeling strategy controls overall error to permit universal false discovery rate (FDR) control. DrFARM uses
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Here, we present a protocol for extracting intergenic regions from annotated genomes using TIGRE (Tool for Intergenic Region Extraction). This protocol describes steps for installing and running TIGRE locally. Via TIGRE, the user can prepare the input data ("clean" command), retrieve the intergenic sequences ("extract" command), obtain the respective intergenic nucleotide sequences ("getfasta" command), and merge different GFF3 files ("combine" command). TIGRE capabilities are demonstrated on the retrieval of intergenic sequences from 1,207 land plant mitochondrial genomes.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Narrative review synthesizes the most current literature on the SARS-CoV-2 XEC variant, focusing on its genomic evolution, immune evasion characteristics, epidemiological dynamics, and public health implications. To achieve this, we conducted a structured search of the literature of peer-reviewed articles, preprints, and official surveillance data from 2023 to early 2025, prioritizing virological, clinical, and immunological reports related to XEC and its parent lineages. Defined by the distinctive spike protein mutations, T22N and Q493E, XEC exhibits modest reductions in neutralization in vit
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite 40 years of conservation of the critically endangered Chinese alligator (Alligator sinensis), the genomic underpinnings of its status remained uncharted. Genome sequencing data of 244 individuals uncovered relatively low overall genomic diversity/heterozygosity and long runs of homozygosity, with captive populations exhibiting higher heterozygosity and smaller inbreeding coefficients compared to wild individuals. The decreased level of inbreeding in the captive population demonstrates the contribution of the large captive breeding population. The estimated recent effective population s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Divergence in marine environments is complex, often occurring despite the absence of physical barriers. This study investigates the genomic structure and demographic history of the economically important pink shrimp Farfantepenaeus brasiliensis across its Western Atlantic distribution using genomic data (ddRAD) and mitochondrial sequences. We tested the hypothesis that oceanographic features in the region act as barriers, generating genetically divergent groups despite high connectivity potential. Samples from four regions (Florida-USA, Northeastern-Brazil, Eastern-Brazil, and Southeastern-Bra
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Despite advancements in artificial insemination, sheep fertility rates remain suboptimal. Recent studies in other species highlight the critical role of reproductive microbiota in influencing fertility outcomes. This research explores the relationship between ovine vaginal microbiota, associated functional pathways, and fertility using advanced nanopore long-reading metagenomic sequencing on 297 ewes from three Spanish breeds across four herds. The study aimed to describe a core vaginal microbiota, analyse the complex interactions with herd, breed, age, and parity factors, and iden
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Prostate cancer remains a prevalent global health challenge, with limited treatment options for advanced stages. There is a criti … inding, suggesting a more limited capacity for direct protein engagement.
CONCLUSIONS: Integrating genomics, bioinformatics, and molecular docking provides an effective strategy for identifying and prioritizing drug repurposing candidates in prostate cancer. Estradiol-benzoate, estradiol-cypionate, and selumetinib emerge as promising candidates, meriting …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ageing comprises a cascade of processes that are inherent in all living creatures. There are fourteen general hallmarks of cellular ageing, the majority of which occur at a molecular level. A significant disturbance in the regulation of genome activity is commonly observed during cellular ageing. Overall confusion and disruption in the proper functioning of the genome are also well-known prerogatives of cancerous cells, and it is believed that this genomic instability provides a direct link between aging and cancer. The spatial organization of nuclear DNA in chromatin is the foundation of the
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Direct oral anticoagulants (DOACs) are used to prevent and treat thromboembolic events in adults. We aimed to investigate whether pharmacogenomic variation contributes to the risk of bleeding during DOAC treatment.
METHODS: Cases were recruited from reports of bleeding sent to the Swedish Medical Products Agency (n = 129, 60% men, 93% Swedish, 89% on factor Xa inhibitors) and compared with population controls (n = 4891) and a subset matched for exposure to DOACs (n = 353). We performed a genome-wide association study, with analyses of candidate single nucleotide polymorphisms (SNPs)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Syngas fermentation is a powerful platform for converting waste streams into sustainable carboxylic acid precursors for value-added biochemicals. Steel mills produce significant syngas, yet industrial microbial syngas valorization remains unrealized. The most promising syngas-converting biocatalysts consist of Clostridia species, such as Clostridium kluyveri, Clostridium autoethanogenum, and Clostridium ljungdahlii. Clostridium luticellarii, a recently discovered species, shares close phylogenetic ties with these organisms. Preliminary metabolic studies suggest its potential for syngas acetoge
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Predictive safety risk biomarkers for drug-induced liver injury (DILI) are critically needed to enhance patient risk stratification and minimize adverse outcomes. This study aims to identify genomic markers associated with increased mortality in toxic liver disease, using the KEM® (Knowledge Extraction and Management) explainable Artificial Intelligence platform. From 225 participants diagnosed with toxic liver disease within the UK Biobank cohort, data were consolidated, including survival outcomes, clinical phenotypes, comorbidities, and 36 394 genomic single nucleotide polymorphisms (SNPs)
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The biology of locally radiorecurrent prostate cancer (LRR-PCa) is poorly understood.
METHODS AND MATERIALS: We sought to explore … Genome Atlas (genomic; n = 496) and Gleason grade-at-recurrence-matched patients from the Decipher Genomics Resource for Intelligent Discovery (transcriptomic; n = 22,320).
RESULTS: Twenty-five patients (69%) had pathologic upgrading at recurrence (17% vs 64% with Gleason grade 4-5 disease; P < .001). The LRR-PCa cohort demonstrated significantly greater …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mrakia is a cold-adapted yeast genus commonly found in polar environments, including the Antarctic and Arctic regions. Several Mrakia genome sequences have been reported to date; however, comprehensive genomic analyses remain limited. Further, there are no reports of complete mitochondrial genome sequences for the genus Mrakia. Therefore, we isolated two cold-adapted yeast strains, Mrakia gelida PAMC 26583 and Mrakia robertii PAMC 26600, from Arctic lichens. Phylogenetic analysis placed both strains within the order Cystofilobasidiales. High-quality whole-genome assemblies were generated using
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterobacter cloacae complex is a group of common opportunistic pathogens on intensive care units. On intensive care units sepsis is treated with high doses of antibiotics. This treatment does not only eliminate pathogenic bacteria but parts of the microbiome community as well. This leads to an imbalance of the gut microbiome. However, some bacteria can survive such treatment due to certain survival and resistance mechanisms. Not only antibiotic resistance mechanisms but also forming strong communities via biofilm formation promotes cell survival. Here, we investigated the properties of the is
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Metastatic breast cancer (MBC) is the most significant clinical challenge in patient care; hence, we need new personalized therapeutic targets and innovative inhibitors. Genomic, proteomic, and structural analysis can be a pivotal tool for faster and more cost-efficient lead discovery.
METHODS: The study employed gene expression profiling (Microarray, PCR, Bulk RNA-Seq) and computer-aided drug design, including structural modeling, virtual screening, docking, pharmacophore modeling, ADMET analysis, and NMA dynamics. A large compound library was screened to identify stable, high-af
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования