BACKGROUND: Post-genome-wide association study (GWAS) interpretation of osteoarthritis (OA) increasingly requires integration with single-cell biology because many risk loci likely act through sterile inflammatory remodeling, regulatory and inflammatory chondrocyte states, and tissue-stress biology rather than through large disease-stage expression shifts. We therefore asked whether a published Transformer-based post-GWAS prioritization strategy could refine a multi-gene chr12 susceptibility locus into a tractable TCTN2-centered effector-gene hypothesis.
METHODS: Using combined hip and knee o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Accurately identifying functionally distinct tumor cell subpopulations remains a critical challenge in cancer research. While single-cell epigenomics assays provide powerful insights into tumor heterogeneity beyond gene expression, computational limitations have hindered their application. METHODS: We introduce Multimodal-based Analysis of scATAC-Seq data (MAAS), a method that integrates chromatin accessibility, copy number variations (CNVs), and single-nucleotide variants (SNVs) to identify functional tumor cell subpopulations. MAAS employs a self-expressive multimodal matrix fact
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The insulin-like growth factor 1 (IGF1) gene is a member of the group of somatotropin axis genes that play a significant role in cell proliferation and growth of muscles. Here, we searched for polymorphisms in buffalo IGF1 and found two novel single nucleotide polymorphisms (SNPs), G64A and G280A, in the noncoding sequences of exon 1 and exon 4, respectively. Statistical analysis of different genotypes showed that the individuals with GG genotypes had significantly (P<0.05) higher body weight (BW) and average daily gain (ADG) than those with other genotypes at ages of 3-6 months in G64A SNP an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptosporidium species are a major cause of diarrhea and associated with growth failure. There is currently only limited knowledge of the parasite's genomic variability. We report a genomic analysis of Cryptosporidium parvum isolated from Bangladeshi infants and reanalysis of sequences from the United Kingdom. Human isolates from both locations shared 154 variants not present in the cattle-derived reference genome, suggesting host-specific adaptation of the parasite. Remarkably 34.6% of single-nucleotide polymorphisms unique to human isolates were nonsynonymous and 8.2% of these were in secre
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The article reviews literature on the role of matrix metalloproteinases (MMP) in the development of eye pathologies, specifically primary open-angle glaucoma (POAG). Regulation of the extracellular matrix is carried out by proteolytic enzymes - metalloproteinases in particular - as well as specific inhibitors of their activity (tissue metalloproteinases inhibitors). The review also reveals its involvement in the pathogenesis of various types of glaucoma, decrease in stability of the intraocular liquid outflow, proves the role of MMR in the ganglionic apoptosis, remodeling of the optic disk and
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиОригинал на русском
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report on a patient with 2 Mendelian diseases-symptomatic multiple familial cerebral cavernous malformations (FCCMs) and Wilson disease. Genetic analysis revealed single nucleotide polymorphisms in genes CCM2 and CCM3, associated with cavernous malformations, and homozygote mutation in the ATP7B gene, responsible for Wilson disease. FCCMs were symptomatic in 3 generations. The patient also had multiple lipomatosis, which is suggested to be a familial syndrome. In recent years there has been an increasing amount of publications linking FCCMs with other pathology, predominantly with extracran
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Maternal lymphocytes have been cited as a potential cause of infantile biliary atresia (BA). When hepatoportoenterostomy is performed, locoregional lymphadenopathy is frequently encountered.
METHODS: We screened enlarged nodes from 6 consecutive nonsyndromatic BA patients (age: 68 days ± 18.9 days) for maternal elements using DNA fingerprinting with short tandem repeat analysis and quantitative real-time polymerase chain reaction for allelic (single nucleotide) sequence polymorphisms.
RESULTS: Although being partly positive in infants' peripheral blood, no maternal microchimerism
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Norwegian Lundehund breed of dog has undergone a severe loss of genetic diversity as a result of inbreeding and epizootics of canine distemper. As a consequence, the breed is extremely homogeneous and accurate sex identification is not always possible by standard screening of X-chromosomal loci. To improve our genetic understanding of the breed we genotyped 17 individuals using a genome-wide array of 170 000 single nucleotide polymorphisms (SNPs). Standard analyses based on expected homozygosity of X-chromosomal loci failed in assigning individuals to the correct sex, as determined initial
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prasugrel is a widely used antiplatelet agent in the setting of percutaneous coronary intervention. In case of resistance to this third-generation thienopyridine, choices of alternative drugs remain limited. Here, we describe a case of a 49-year-old man with stent thrombosis occurring 5 days after drug-eluting stent implantation despite a well-conducted antiplatelet therapy with aspirin and prasugrel. Evaluation of platelet functions by different tests revealed prasugrel resistance. Genotyping for various CYP single-nucleotide polymorphisms showed that the patient carried mutant alleles encodi
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two hundred and fifty one Italian patients with sporadic frontotemporal lobar degeneration (FTLD) and 259 age-matched controls were tested for association with the tagging single nucleotide polymorphisms (SNPs) rs741810 and rs1052352 in the fused in sarcoma/translated in liposarcoma gene (FUS/TLS). Only patients negative for GRN mutations were included. Considering each SNP alone, no differences in either allelic or genotypic frequencies between patients and controls were found (P > 0.05), even stratifying according to gender or the presence of concomitant motor neuron disease. Haplotype analy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inherited myoclonus dystonia (MD) is an autosomal dominant disorder in which we previously mapped a novel locus to chromosome18p11 (OMIM number: 607488). Since no further informative STS markers were found within the flanking shared regions, we utilized single nucleotide polymorphisms (SNP) for fine-mapping. All known or predicted genes within this region were directly sequenced. We identified three recombinant SNPs in the distal region but none from the proximal region. Our previous linked region has now been reduced to 3.18 Mb but direct sequencing of all seven known and four predicted genes
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular determinants of antimalarial drug resistance are useful and informative tools that complement phenotypic assays for drug resistance. They also guide the design of strategies to circumvent such resistance once it has reached levels of clinical significance. Established resistance to arylaminoalcohols such as mefloquine and lumefantrine in SE Asia is mediated primarily by gene amplification of the P. falciparum drug transporter, pfmdr1. Single nucleotide polymorphisms in pfmdr1, whether assessed in field isolates or transfection experiments, are associated with changes in IC(50) values
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The opportunity for increased precision in pharmaceutical therapy will represent one of the important legacies of the Human Genome Project. Medical researchers have long suspected that genetic differences account for some of the variability in patient response to drugs, but now they hope that the identification of single nucleotide polymorphisms will allow physicians to customize pharmaceutical interventions. Pharmacogenomics will lead to fundamental changes in how drugs are discovered, tested, manufactured, labeled, and marketed. Federal regulators, the courts, and other policy makers will fa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hereditary neuralgic amyotrophy (HNA) is a rare autosomal dominant disorder. It is characterised by recurrent episodes of focal neuropathy involving the brachial plexus. Genetic linkage analysis has mapped HNA to chromosome 17q25 within a 3.5-cM interval flanked by the short tandem repeat markers D17S785 and D17S802. Here, we report the mutation analysis of four candidate genes. Mutation analysis was performed on the complete coding regions of these genes. Several exonic and intronic single nucleotide polymorphisms were detected. However, no disease-causing mutations were found, indicating tha
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Introduction: This review explores insights provided by next-generation sequencing (NGS) of pituitary tumors and the clinical implications.Areas covered: Although syndromic forms account for just 5% of pituitary tumours, past Sanger sequencing studies pragmatically focused on them. These studies identified mutations in MEN1, CDKN1B, PRKAR1A, GNAS and SDHx causing Multiple Endocrine Neoplasia-1 (MEN1), MEN4, Carney Complex-1, McCune Albright Syndrome and 3P association syndromes, respectively. Furthermore, linkage analysis of single-nucleotide polymorphisms identified AIP mutations in 20% with
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anthrax is a continuous threat in China, especially in rural regions. In July 2015, an anthrax outbreak occurred in Xifeng County, Liaoning Province. A total of 10 cutaneous anthrax cases were reported, with 210 people under medical observation. In this study, the general characteristics of human anthrax outbreak occurred in Liaoning Province were described, and all cases were caused by butchering and contacting sick animal. Meanwhile, the phylogenetic relationship between outbreak-related isolates/samples of the year 2015 and previous Bacillus anthracis strains was analyzed by means of canoni
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Though being prevalent worldwide, Mansonella parasites are among the most neglected filarial nematodes. The true prevalence and genetic diversity of this genus have yet to be fully understood. Mansonella sp. "DEUX" is a recently described filarial nematode infecting humans and other primates in Gabon and Cameroon, although its status as distinct species has been controversial. We investigated four different polymorphic regions to further explore the genetic differences between Mansonella species and to support their status as distinct species.
METHODS: We screened whole blood samp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Cryptorchidism is the most common congenital abnormality of the genitalia. However, its exact etiology remains to be defined. Homeobox (HOX) containing genes have a key role in the morphogenesis of segmental structures along the primary body axis, including the urogenital mesenchyma. In male mice with a targeted deletion of the HOXA10 gene cryptorchidism manifests in the absence of other major defects. Because to our knowledge this gene has never been examined for alterations in humans, we evaluated whether mutations of HOXA10 are associated with cryptorchidism in humans.
MATERIALS A
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor necrosis factor-α (TNF-α), a pro-inflammatory factor is involved in the pathophysiology of schizophrenia. The roles of antipsychotics, cholesterol, and TNFA single nucleotide polymorphisms (SNPs) on elevation of TNF-α in schizophrenia have been inadequately evaluated. Therefore, the present study aimed to compare serum TNF-α level between Malaysian patients with schizophrenia and healthy controls, as well as to investigate the effects of antipsychotics, cholesterol, and TNFA SNPs (rs361525, rs1800629, and rs1800630) on serum TNF-α level in schizophrenia. This study involved 150 medicated
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Apolipoprotein A-IV (apoA-IV) is an abundant lipid-binding protein in blood plasma. We previously reported that apoA-IV, as an endogenous inhibitor, competitively binds platelet αIIbβ3 integrin from its N-terminal residues, reducing the potential risk of thrombosis. This study aims to investigate how the apoA-IVQ360H and apoA-IVT347S mutations affect the structure and function of apoA-IV. These mutations are linked to increased risk of cardiovascular diseases because of multiple single-nucleotide polymorphisms in the C-terminal region of apoA-IV. We postulate that the structural hindrance caus
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.