Campylobacter is a major foodborne bacterial pathogen that has become increasingly resistant to clinically important antimicrobials. Of particular concern is the emergence of erm(B)-mediated macrolide resistance, which has been increasingly documented across Campylobacter isolates from diverse ecological reservoirs. In this study, we investigated the genomic characteristics and epidemiology of erm(B)-carrying clinical Campylobacter isolates from Shanghai, alongside a globally representative dataset of all publicly available strains. Among clinical isolates obtained from a diarrhoeal outpatient
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The chemokine receptor variant CCR5delta32 is linked to HIV-1 resistance and other conditions. Its evolutionary history and allele frequency (10%-16%) in European populations have been extensively debated. We provide a detailed perspective of the evolutionary history of the deletion through time and space. We discovered that the CCR5delta32 allele arose on a pre-existing haplotype consisting of 84 variants. Using this information, we developed a haplotype-aware probabilistic model to screen 934 low-coverage ancient genomes and traced the origin of the CCR5delta32 deletion to at least 6,700 yea
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pertussis, caused by Bordetella pertussis, remains a significant public health concern despite widespread vaccination. Recent increases in macrolide-resistant strains present additional challenges for treatment and control. Yiwu, China-a highly mobile and international city-offers a unique setting to study the genomic evolution and antimicrobial resistance of B. pertussis. In this study, 63 clinical isolates from Yiwu underwent whole-genome sequencing. Over 90% of isolates showed high resistance to macrolides. Genome sizes ranged from 3.53 to 4.15 Mb, with high GC content (67.69-67.80%) and va
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We investigated the plant growth-promoting potential of two endophytic strains of Serratia marcescens, namely SmCNPMS2112 and SmUFMG85, which were isolated from the roots of the same maize (Zea mays) plant. The strains were evaluated in vitro for their ability to produce siderophores and indoleacetic acid, form biofilm, solubilize iron phosphate (Fe-P) and Araxá rock phosphate (RP), mineralize phytate, and for their ability to adhere and colonize host roots. Additionally, their plant growth-promoting potential was tested in vivo under greenhouse conditions using millet grown in soil under two
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute cellular rejection (ACR) is the main risk factor for chronic lung allograft dysfunction (CLAD), but diagnosis requires invasive transbronchial biopsy (TBB). We previously demonstrated the feasibility of bronchoalveolar lavage cell pellet (BAL-cp) gene expression for ACR diagnosis. We sought to develop and validate a genomic classifier for ACR in a multicenter cohort.
METHODS: We performed RNA-seq on 806 BAL-cp from 181 lung transplant recipients enrolled in CTOT-20. Differential expression was based on fold difference >2.0 and False Discovery adjusted p-value <0.05. Samples
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic kidney disease (CKD) affects approximately 9% of the global population, leading to increased risks of end-stage kidney disease (ESKD), cardiovascular disease (CVD), and mortality. Patients with CKD are a huge burden on health care resources globally. CKD is a complex condition influenced by a combination of genetic, environmental, and traditional risk factors. Family studies have suggested heritability rates for CKD ranging from 30% to 75%, and large genomic biobank studies have proven essential in identifying genes with substantial effects on CKD risk and in capturing cumulative genet
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION AND HYPOTHESIS: The objective was to determine the genetic variants associated with urinary incontinence subtypes using genome-wide association studies (GWAS).
METHODS: We conducted a case-control study of women older than 18 with available genetic data and at least one International Classification of Diseases 10 urinary (stress, urge or mixed) incontinence diagnosis between May 2008 and May 2023. Controls had available genetic data with no urinary incontinence diagnosis. Demographic, health, and genomic data were obtained from our institution's electronic medical records and Bio
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: Genome-wide association studies (GWAS) have significantly advanced osteoporosis research by identifying genetic loci associated with bone mineral density (BMD) and fracture risk. However, disparities persist due to the underrepresentation of non-European populations, limiting the applicability of polygenic risk scores (PRS). This review examines recent advancements in osteoporosis genetics, highlights existing disparities, and explores strategies for more inclusive research.
RECENT FINDINGS: European-focused GWAS have identified key loci for osteoporosis, including WNT sign
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) is a complex neurodegenerative disorder characterized by the death of motor neurons in the spinal cord and brain regions, leading to a reduced survival rate in patients. Nearly 20 gene mutations are associated with ALS, with SOD1, FUS, TARDBP, and C9orf72 mutations being more common. Ninety percent of ALS cases are related to sporadic ALS, while the remaining 10 % are associated with familial ALS. CRISPR/Cas9, a genome engineering technology known as clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated system 9, has the potential for g
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Talaromyces marneffei is a pathogenic fungus that causes talaromycosis. Although many antifungal drugs have been used for the treatment of talaromycosis, the effects of genomic mutations in different T. marneffei strains on the susceptibility to these antifungal drugs have not been fully studied. To reveal the association between genomic single nucleotide polymorphisms (SNPs) and susceptibility to T. marneffei, we sequenced the genomes of 15 clinical isolates of T. marneffei and analyzed the association between their SNPs and susceptibilities to 5-fluorouracil, anidulafungin, posaconazole, vor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During urban redevelopment in the historic district of a Brazilian metropolis, archaeologists uncovered a previously undocumented 17th-centu … pidemic-related mortality event. This study contributes to the growing field of historical pathogen genomics and offers a rare genomic perspective on life, mobility, and health during a period of colonial upheaval in South America.
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lean body mass is a crucial physiological component of body composition. Although lean body mass has a high heritability, studies evaluating the genetic determinants of lean mass (LM) have to date been limited largely to genome-wide association studies (GWAS) and common variants. Using whole genome sequencing (WGS)-based studies, we aimed to discover novel genetic variants associated with LM in population-based cohorts with multiple ancestries.
RESULTS: We describe the largest WGS-based meta-analysis of lean body mass to date, encompassing 10,729 WGS samples from six TOPMed cohort
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The relationship between circulating proteome and the risk of ankylosing spondylitis (AS) remains unclear, which presents significant potential for therapeutic interventions. Therefore, we performed a proteome-wide Mendelian randomization (MR) study, followed by colocalization analysis, to identify potential biomarkers and therapeutic targets for AS.
METHODS: Genetic association data for 4907 plasma proteins were obtained from a large-scale protein quantitative trait locus (pQTL) study involving 35,559 individuals. Summary-level data for AS were derived from the FinnGen study, whi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: IgG4-related disease is a rare autoimmune disorder characterised by tissue infiltration of IgG4-positive plasma cells, storiform fibrosis, elevated serum IgG4 concentrations, and increased risk of tumour complications. Previous genetic studies have implicated FCGR2B and HLA loci in susceptibility to IgG4-related disease; however, most relied on microarray-based genotyping and imputation, which have limited resolution in highly polymorphic and structurally complex regions. This study aimed to investigate genetic susceptibility to IgG4-related disease using comprehensive genomic vari
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Clinopodium chinense is an important medicinal plant in the family Lamiaceae. The desiccated roots of C. chinense possess variou … nts have been identified between the genomes of C. chinense and Thymus quinquecostatus. Comparative genomics analyses further indicated that tandem duplication may be one of the potential factors affecting the amplification of genes related to the synthesis pathway of and triterpenoid (including key metabolic nodes CYP and UGT genes). Subsequently, we iden …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
T-cell lymphomas are clinically and biologically heterogeneous malignancies that comprise ~ 10% of non-Hodgkin lymphomas. Outcomes with first-line chemotherapy remain poor. Over the past decade, integrative genomic and epigenomic studies have defined recurrent abnormalities converging on proximal T-cell antigen receptor/costimulatory signaling to the NF-κB/NFAT, JAK/STAT, PI3K/AKT/mTOR, and NOTCH pathways, alongside pervasive alterations in chromatin modifiers and the DNA methylation machinery. In this review, we frame the biology of peripheral T-cell lymphoma as two interdependent layers, inc
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infection by gastrointestinal nematodes (GINs) in sheep is a significant health issue that affects animal welfare and leads to economic losses in the production sector. Genetic selection for parasite resistance has shown promise in improving animal health and productivity. This study aimed to determine if incorporating genomic data into genetic prediction models currently used in Uruguay could improve the accuracy of breeding value estimations for GIN resistance in the Australian Merino breed. This study compared the accuracy of breeding value predictions using the BLUP (Best Linear Unbiased P
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Malaria has caused over 15.7 million deaths in the 21st century and was responsible for ~600 thousand deaths globally in 2023 alone. Although many effective antimalarial drugs have been developed and widely adopted to reduce the occurrence and severity of the disease, recurrent resistance to the frontline treatment has been of major concern. Multiple drug resistance alleles at intermediate and high allele frequency have been identified in specific Asian and African populations of P. falciparum, the deadliest malaria parasite. With the improvement in throughput of sequencing technologies and gl
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования