Aspergillus species are major opportunistic pathogens responsible for invasive aspergillosis, with antifungal resistance posing increasing challenges to their treatment worldwide. We investigated the antifungal susceptibility and genomic features of Aspergillus isolates from sterile clinical specimens collected at a tertiary hospital in Thailand between January and December 2023. In total, 24 isolates were identified via culture and tested for amphotericin B and voriconazole susceptibility using CLSI M38 broth microdilution, and whole-genome sequencing was performed on selected isolates to cha
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS & METHODS: DNA methylation and genomic instability are critical drivers of cancer initiation and malignant progression. However, the roles of methylation aberrations and genomic instability in malignant progression have not been thoroughly investigated in intrahepatic cholangiocarcinoma (ICC). To address this, we identified differentially methylated regions (DMRs) and somatic copy number alterations (SCNAs) from 341 ICC samples across various stages.
RESULTS: Our findings revealed that stages IAIB, II, IIIA, and IIIB exhibited comparable methylation changes, whereas stage IV ICC showed a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study presents the first comprehensive genome analysis of Enterocloster aldenensis in Thailand, an organism typically found in the gut but occasionally acting as an opportunistic pathogen. A scrotal tissue sample from a patient with suspected Fournier's gangrene was initially collected for Bacteroides surveillance in Southern Thailand, E. aldenensis PSUA25 was identified to Bacteroides thetaiotaomicron by Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) and later reclassified as E. aldenensis following whole-genome sequencing. Species confirmatio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Eosinophilia, characterised by elevated eosinophil levels, is associated with various allergic and inflammatory conditions. This study aimed to elucidate the genetic determinants of eosinophil levels by examining polygenic risk scores (PRS) and identifying significant single nucleotide polymorphisms (SNPs).
METHODS: We conducted a comprehensive genome-wide association study (GWAS) on eosinophil levels using a large cohort, comprising 221 851 controls (eosinophil levels ≤ 5%) and 11 200 cases (eosinophil levels > 5%) in Taiwan. The analysis included covariates such as age, sex and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: Large-scale genome-wide association studies (GWAS) should ideally inform the development of pharmacological treatments, but whether GWAS-identified mechanisms of disease liability correspond to the pathophysiological processes targeted by current pharmacological treatments is unclear.
OBJECTIVE: To investigate whether functional information from a range of open bioinformatics datasets can elucidate the relationship between GWAS-identified genetic variation and the genes targeted by current treatments for psychiatric disorders.
DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS: Associations betwe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Black wool can effectively prevent sheep from DNA damage as well as fungal infection, and can improve reproductive performance. In order to explore the candidate genes related to black wool formation in Qira sheep.
METHODS: We selected 123 adult healthy ewes with different coat colors in Qira sheep groups (black (B), brown (Y) and grey (G)) and extracted DNA from their venous blood to obtain Illumina Ovine SNP 50K chip data. Subsequently, our PCA, NJ-tree, and Admixture population structure analyses of the 3 wool color Qira sheep populations showed that the 3 middle wool color popu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Melanin pigments block genotoxic agents by positioning on the sun-exposed side of the nucleus in human skin keratinocytes. How this positioning is regulated and its role in genome photoprotection remain unknown. Here, by developing a model of human keratinocytes internalizing extracellular melanin into pigment organelles, we show that keratin 5 and keratin 14 intermediate filaments and microtubules control the three-dimensional perinuclear position of pigments, shielding DNA from photodamage. Imaging and microrheology in a human-disease-related model identify structural keratin cages surroundi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent years gene therapy has emerged as a powerful technology for treatment of a large variety of inherited disorders. With the FDA approval of in vivo gene therapy of hemophilia A and B using AAV-mediated transgene delivery to hepatocytes, the path towards a new treatment era seemed paved. Also, CRISPR-Cas based approaches have reached the clinic, as in the ex vivo treatment of hematopoietic stem cells for sickle cell disease and thalassemia patients. The question arises whether these innovative strategies will also be suitable for patients with von Willebrand Disease (VWD). Whilst in and
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mucopolysaccharidosis (MPS) type VII is a storage disorder of autosomal recessive origin that is caused by a deficiency in a lysosomal enzyme that results in the accumulation of glycosaminoglycans and causes secondary metabolic pathway problems. It has systemic symptoms that mainly include progressive skeletal dysplasia, cardiovascular manifestations, hepatosplenomegaly, coarse facies, and many other manifestations, and cognitive decline is observed in most cases. A significant proportion of patients may present with foetal hydrops. Allelic variations in specific ethnic groups expl
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Meniere disease (MD) is a cochleo-vestibular syndrome defined by episodes of vertigo associated with tinnitus and sensorineural hearing loss. While MD immune response has been linked to autoinflammation and type 2 cytokines, other molecular mechanisms such as DNA methylation have an emerging yet underexplored role in MD pathophysiology.To understand the role of DNA methylation in MD, we performed whole-genome bisulphite sequencing in MD patients (n = 40) and controls (n = 13) and used differentially methylated cytosines (DMCs) to define clusters, cell types, and biochemical pathways in MD. We
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Apicomplexan parasite, Babesia rossi, is an Ixodid tick-transmitted pathogen that causes the most severe form of canine babesiosis disease. Compared to other Babesia pathogens of dogs, B. rossi exhibits unique pathophysiology, virulence, and a responsiveness to drugs that differs from the small Babesia parasites.
RESULTS: Here we report the first near-complete chromosome-level assembly of Babesia rossi strain PMB - isolated from a sick dog from Pietermaritzburg, South Africa. Assembly with long-read HiFi data yielded 21.06 Mbp genome size, spanning across five gene-dense chromosom
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
African populations harbor the highest genetic diversity globally, shaped by over 300 000 years of adaptation to the continent's diverse ecology. Parasitic infections like malaria (Plasmodium falciparum) and sleeping sickness (Trypanosoma brucei) have driven genetic selection for resistance. For instance, the sickle-cell mutation (HBB:c.20A>T) offers malaria protection but causes sickle-cell disease. Similarly, APOL1 gene variants (G1/G2) protect against sleeping sickness but increase the risk of kidney disease. While these variants provide survival benefits, they also pose significant health
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Presbycusis, also known as age-related hearing loss (ARHL), is the most frequent sensory disability affecting elderly adults worldwide. ARHL is characterized by bilateral, progressive, sensorineural hearing loss that is more pronounced at a high frequency. Conventional factors associated with ARHL include diabetes, hypertension, and a family history of hearing loss. The severity of hearing impairment varies between individuals. The defined causative molecular pathogenesis for ARHL is unknown, thus the identification of underlying pathogenic mechanisms involved in ARHL is imperative
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Corynebacterium is a widespread and abundant bacterial genus on human skin. Occasionally, corynebacteria are isolated from clinical specimens associated with infection. In this study, 56 bacterial isolates were examined. These isolates were obtained from 52 patients with diverse infections such as keratitis, osteitis/osteomyelitis, mastitis, (suspected) foreign body associated infections (spine, prosthetic joint), suspected meningitis, post-operative infections, among others. These isolates were identified as corynebacteria by MALDI-TOF mass spectrometry but could not be reliably a
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hereditary breast and ovarian cancer (HBOC) syndrome is primarily associated with mutations in BRCA1 and BRCA2, but increasing evidence links it to other malignancies, including male breast, prostate, and pancreatic cancers. Advances in genetic testing have led to the use of multigene panels, revealing that additional genes contribute to HBOC risk. We tested 280 patients with suspected HBOC using a multigene panel including BRCA1, BRCA2, and other genes involved in homologous recombination (HR) and additional DNA repair mechanisms. Variants were classified as pathogenic variants (PVs), variant
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fungal skin infections represent a significant global health burden, affecting approximately one billion people annually. Despite their prevalence and major global health impact, the molecular mechanisms underlying pathogenicity remain largely uncharacterized. Here we present high quality genomic datasets for 51 fungal strains, representing highly prevalent and clinically relevant species associated with human skin infections. Comparative genomics reveal substantial variation in genome size and gene contents, indicating genome compaction occurred as the fungi transitioned from free-living to h…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Spinal meningiomas (SMs) are less frequently diagnosed than intracranial meningiomas. While recent advancements in tumor biology have identified key driver genes in SMs through targeted sequencing, few studies have yet to characterize the genomic profiles of these tumors together with their methylation signatures. In this study, we present our institutional experience of a combined genomic and epigenetic analysis of 8 thoracic SMs.
METHODS: We performed targeted genomic sequencing and DNA methylation profiling on 8 primary SMs. We further collected relevant clinical information and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Obligate host-associated bacteria with reduced genomes, such as phytoplasmas, face strong evolutionary constraints, including metabolic dependence on hosts, limited opportunities for horizontal gene transfer (HGT), and frequent population bottlenecks. Despite these limitations, phytoplasmas, which are parasitic, insect-transmitted plant pathogens, maintain a diverse arsenal of secreted effectors that manipulate both plant and insect hosts to promote infection and transmission. These effectors can suppress immunity and reprogram plant development, inducing alterations such as witch's broom and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Flaviviruses Dengue virus (DENV), West Nile virus (WNV), Zika virus (ZIKV), and Yellow Fever virus (YFV), are mosquito-borne viruses that represent a persistent challenge to global health due to the emergence and re-emergence of outbreaks of significant magnitudes. Their positive-sense RNA genome, about 11,000 nucleotides long, encodes structural and nonstructural proteins. These viruses evolve rapidly through mutations and genetic recombination, which can lead to more virulent and transmissible strains. Although whole-genome sequencing is ideal for studying their evolution and geographic
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human adenoviruses (HAdV) comprise more than 100 genotypes with species-specific differences in tropism and immune response and can cause severe infections in immunocompromised patients. This study aimed to characterise the HAdV species involved in pediatric infections to assess their clinical impact and guide future therapeutic strategies based on AdV-specific T-cell responses. Between January and October 2024, 595 pediatric HAdV diagnoses were made at the Bambino Gesù Children's Hospital (Rome), and whole-genome sequencing was performed on 60 samples. Most patients (91.7%) were hospitalised,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.