BACKGROUND: The Sepsis Prevention in Neonates in Zambia study is a prospective cohort study that evaluated an infection prevention and control (IPC) bundle in the University Teaching Hospital neonatal intensive care unit (NICU) in Lusaka, Zambia. We present here the etiologies, antimicrobial resistance profiles, and associated mortality of bloodstream infections (BSI) in this cohort.
METHODS: Venous blood was collected from neonates with clinically suspected sepsis and cultured with an automated blood culture system. Organism identification and susceptibility testing were done using the Vitek
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The horizontal gene transfer events are the major contributors to the current spread of CTX-M-encoding genes, the most common extended-spectrum β-lactamase (ESBL), and many clinically crucial antimicrobial resistance (AMR) genes. This study presents evidence of the critical role of IS26 transposable element for the mobility of bla CTX-M gene among Escherichia coli isolates from children and domestic animals in the community. We suggest that the nucleotide sequences of IS26-bla CTX-M could be used to study bla CTX-M transmission between humans, domestic animals, and the environment, because und
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Antimicrobial resistance (AMR) is a major public health concern. The spread of AMR-encoding genes between enterobacteria, especially in Klebsiella pneumoniae strains, lead to failure in the treatment of most individuals. The aim of this study was to characterize multi-drug resistant (MDR) clinical K. pneumoniae isolates that produce extended-spectrum β-lactamases (ESBLs) from Algeria.
METHODOLOGY: The isolates were identified using biochemical tests, and the identification was confirmed by mass spectrometry using VITEK® MS (BioMerieux, Marcy l'Etoile, France). Antibiotic suscept
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The dissemination of NDM-1 carbapenemases (New Delhi Metallo-β-lactamase) is a global public health problem, mainly in developing countries. The aim of this study was to characterize the spread of NDM-producing bacteria in the Southern Brazilian states analyzing epidemiological, molecular, and antimicrobial susceptibility aspects.
METHODS: A total of 10,684 carbapenem-resistant isolates of Enterobacterales, Pseudomonas spp. and Acinetobacter spp. obtained from several hospitals in eight cities in Southern Brazil were screened, and 486 NDM-producing bacteria were selected.
RESULTS
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbapenem-resistant K pneumoniae (CRKP) clinical isolates have spread widely now-a-days throughout the world. This study was designed to investigate the carbapenem resistance among Klebsiella pneumoniae and to see anitimicrobial susceptibility of these CRKP isolates to other antimicrobials in a tertiary care hospital in Bangladesh. K pneumoniae was detected by standard methods and various biochemical tests like Triple Sugar Iron (TSI) agar media, Simmons citrate agar media and Motility-Indole-Urea (MIU) agar media. Imipenem resistance was used as the indicator for carbapenem resistance. Agar
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background Extended-spectrum β-lactamases (ESBLs)-producing Klebsiella pneumoniae is reported worldwide increasingly. However, studies on ESBLs are still scarce in Ethiopia. Therefore, the current study aimed to determine the magnitude and resistance patterns of ESBL-producing K. pneumoniae as well as the frequency of ESBL-encoding genes.Methods A cross-sectional study was conducted from September 2018 to February 2019 at Tikur Anbessa Specialized Hospital, Addis Ababa, Ethiopia among a total of 132 non-duplicate K. pneumoniae isolates. Phenotypic detection of ESBL production was done using Co
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aim: This study aimed to establish the in vitro efficacy and susceptibility profiles of new β-lactam antibiotics against clinically isolated carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae (CPKP) strains. Materials and Methods: A total of 117 nonduplicated CPKP isolates were tested against cefiderocol, cefepime-zidebactam, ceftazidime-avibactam, tigecycline, and other 20 antibiotics by broth microdilution. The carbapenemase genes were identified using PCR and sequencing, while multilocus sequence typing established the bacterial strains. Results: Three significant sequence types (STs), including
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We characterized five carbapenemase-producing Enterobacterales (CPE) isolates from two health care institutions in Lima, Peru. The isolates were identified as Klebsiella pneumoniae (n = 3), Citrobacter portucalensis (n = 1), and Escherichia coli (n = 1). All were identified as blaOXA-48-like gene carriers using conventional PCR. Whole-genome sequencing found the presence of the blaOXA-181 gene as the only carbapenemase gene in all isolates. Genes associated with resistance to aminoglycosides, quinolones, amphenicols, fosfomycins, macrolides, tetracyclines, sulfonamides, and trimethoprim were a
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Piperacillin-tazobactam resistance (P/T-R) is increasingly reported among Escherichia coli isolates. Although in vitro experiments have suggested that blaTEM gene plays a key role in the P/T-R acquisition, no clinical in vivo study has yet confirmed the role of blaTEM or other genes. Therefore, we aimed to identify the mechanisms underlying P/T-R by following up patients with E. coli complicated intra-abdominal infections (cIAI) who experienced P/T treatment failure. Four pairs of strains, clonally related from four patients, were isolated both before and after treatment with P/T dosed at 4 g/
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: While the treatment of ESBL-producing Enterobacterales osteomyelitis relies on carbapenems, the optimal regimen for OXA48 types remains unclear. We evaluated the efficacy of ceftazidime/avibactam in different combinations in an experimental model of OXA-48-/ESBL-producing Escherichia coli osteomyelitis.
METHODS: E. coli pACYC184 is a clinical strain harbouring blaOXA-48 and blaCTX-M-15 inserts, with 'increased exposure susceptibility' to imipenem (MIC, 2 mg/L), gentamicin (MIC, 0.5 mg/L), colistin (MIC, 0.25 mg/L), ceftazidime/avibactam (MIC, 0.094 mg/L) and fosfomycin (MIC, 1 mg/
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present study revealed the emergence of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (CRKP) and the associated driving factors in an urban river system surrounding Cuttack city, Odisha. The high contamination factor and contamination degree indicate poor water quality. The CRKP isolates showed 100% resistance against piperacillin, amoxicillin-clavulanic acid, piperacillin-tazobactam, ceftriaxone, ceftazidime, meropenem, and imipenem but less resistance to colistin (12.85%). Among the CRKP isolates, carbapenemase genes blaNDM, blaOXA-48-like, and blaKPC were detected in 94.28%, 35%, and 10% o
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A successful outcome of a post-surgical wound infection management by a carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae is described in a dog. Four multidrug-resistant and carbapenem-resistant Escherichia coli strains belonging to ST410 (n = 1) and ST648 (n = 3) were isolated from faecal samples and nasal swabs of this dog at admission to a veterinary hospital in the United Kingdom, and one month after discharge. Whole-genome sequencing analysis suggests dissemination of a 46,161-bp IncX3 blaNDM-5-carrying plasmid among E. coli strains from the different lineages. In this study, the E. coli ST648 s
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The clinical impact of infections due to extended-spectrum β-lactamase (ESBL)- and/or carbapenemase-producing Enterobacterales (Ent) has reached dramatic levels worldwide. Infections due to these multidrug-resistant (MDR) pathogens-especially Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae-may originate from a prior asymptomatic intestinal colonization that could also favor transmission to other subjects. It is therefore desirable that gut carriers are rapidly identified to try preventing both the occurrence of serious endogenous infections and potential transmission. Together with the infection pr
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microbes evolve rapidly by modifying their genomes through mutations or through the horizontal acquisition of mobile genetic elements (MGEs) linked with fitness traits such as antimicrobial resistance (AMR), virulence, and metabolic functions. We conducted a multicentric study in India and collected different clinical samples for decoding the genome sequences of bacterial pathogens associated with sepsis, urinary tract infections, and respiratory infections to understand the functional potency associated with AMR and its dynamics. Genomic analysis identified several acquired AMR genes (ARGs) t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae are distributed worldwide. This study aimed to characterize a hypervirulent tigecycline-resistant and carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae strain, XJ-K2, collected from a patient's blood. We tested antimicrobial susceptibility, virulence, and whole-genome sequencing (WGS) on strain XJ-K2. WGS data were used to identify virulence and resistance genes and to perform multilocus sequence typing (MLST) and phylogenetic analysis. Three novel plasmids, including a pLVPK-like virulence plasmid (pXJ-K2-p1) and two multiple resistance plasmids (pXJ-K2-KPC
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Extended spectrum β-lactamase (ESBL)- and ampicillinase C (AmpC)-carrying Enterobacteriaceae have been widely reported among companion animals. According to previous studies, dogs with a shelter or stray background might be at risk of carrying such bacteria. The aim of this study was to explore, with whole-genome sequencing (WGS), the genomic characteristics of ESBL-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolated from imported dogs with a stray or shelter background.
METHODS: E. coli (n = 58) and K. pneumoniae (n = 2) isolates from imported dogs originating from seve
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gut colonisation by extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli is a risk factor for developing overt infection. The gut microbiome can provide colonisation resistance against enteropathogens, but it remains unclear whether it confers resistance against ESBL-producing E coli. We aimed to identify a potential role of the microbiome in controlling colonisation by this antibiotic-resistant bacterium.
METHODS: For this matched case-control study, we used faeces from 2751 individuals in a Dutch cross-sectional population study (PIENTER-3) to culture ESBL-producing b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing Escherichia (E.) coli have been widely described as the cause of treatment failures in humans around the world. The origin of human infections with these microorganisms is discussed controversially and in most cases hard to identify. Since they pose a relevant risk to human health, it becomes crucial to understand their sources and the transmission pathways. In this study, we analyzed data from different studies in Germany and grouped ESBL-producing E. coli from different sources and human cases into subtypes based on their phenotypic and genot
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biocidal compounds are frequently used as disinfectants in poultry industry and their widespread usage has risen concern due to the co-selection and persistence of antimicrobial resistance among bacteria. In this study, extended spectrum β-lactamase producing (ESBL) Escherichia coli isolates (n = 60) obtained from chicken meat were characterized by Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE) and further tested for disinfectant and heavy metal resistance phenotypically and genotypically. Plasmid replicon types of these isolates were also determined. ESBL producing E. coli isolates were found to be
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasmid-borne colistin resistance is considered one of the most complex public health concerns worldwide. Several studies reported the presence of the mcr-1.1 harboring Salmonella from the foodstuffs worldwide; still, there is a knowledge gap about the occurrence of these isolates in the Middle East. In this study, we report an mcr-1.1-mediated colistin resistance in two multidrug-resistant (MDR) S. Minnesota (denoted as Sal_2 and Sal_10), with both being also extended-spectrum β-lactamase (ESBL) producing. These isolates have been recovered from two independent samples out of 315 chilled chic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.