The resistance of growth factor receptor tyrosine kinase inhibitors (EGFR-TKIs) in non-small cell lung cancer (NSCLC), especially against the EGFR L858R/T790M/C797S mutations, remains an ongoing challenge. In this study, we screened a total of 2.05 million compounds from the ChEMBL database through virtual screening, identifying five promising candidates with high binding affinities and favourable ADMET properties. These candidates were further evaluated through molecular dynamics (MD) simulations, revealing more restricted conformational changes and enhanced stability compared to Osimertinib.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HBV genotype C, particularly subgenotype C2, is associated with an elevated risk of HCC and aggressive disease activity. We previously identified a nonsynonymous sV184A variant in the HBsAg region, predominantly in HBV subgenotype C2. This study investigates the mechanistic role of the sV184A variant in promoting liver disease progression. Analysis of 109 chronically HBV-infected patients revealed that the sV184A variant correlates with significantly elevated HBV DNA. Both patient data and public database indicated that sV184A is associated with high frequency of BCP mutations, however, the hi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cervical cancer progression, particularly in the context of HPV infection, is driven by complex transcriptional alterations within the tumor microenvironment. Understanding the molecular mechanisms underlying HPV-induced immune evasion is crucial for developing effective therapeutic strategies. Transcriptomic analyses were performed using three independent datasets (GSE127265, GSE166466, and GSE218460) to identify differentially expressed genes (DEGs) between HPV-positive and HPV-negative cervical cancer samples. Protein-protein interaction networks were constructed using Cytoscape and STRING,
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Annexin A5 (ANXA5) is a small calcium-dependent protein that binds specifically to negatively charged phosphatidylserine as a marker of apoptosis. Previous studies have shown that ANXA5 expression is elevated in hypertensive patients and is closely related to left ventricular systolic function in hypertensive patients, but its specific mechanism of action has not been clarified. GEO database analysis showed that ANXA5 expression was significantly upregulated in hypertensive myocardial hypertrophy. The expression of ANXA5 protein and mRNA was overexpressed, and knockdown of ANXA5 can effectivel
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SARS-CoV-2 amino acid variants that contribute to an increased transmissibility or to host immune system escape are likely to increase in frequency due to positive selection and may be identified using different methods, such as codeML, FEL, FUBAR, and MEME. Nevertheless, when using different methods, the results do not always agree. The sampling scheme used in different studies may partially explain the differences that are found, but there is also the possibility that some of the identified positively selected amino acid sites are false positives. This is especially important in the context
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leukocyte antigen related protein (LAR), a member of the PTP family, has become a potential target for exploring therapeutic interventions for various complex diseases, including neurodegenerative diseases. The reuse of FDA-approved drugs offers a promising approach for rapidly identifying potential LAR inhibitors. In this study, we conducted a structure-based virtual screening of FDA-approved drugs from ZINC database and selected candidate compounds based on their binding affinity and interactions with LAR. Our research revealed that the candidate compound ZINC6716957 exhibited excellent bind
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Women with polycystic ovary syndrome (PCOS) have increased odds of concurrent depression, indicating that the relationship between PCOS and depression is more likely to be comorbid. However, the underlying mechanism remains unclear. Here, we aimed to use bioinformatic analysis to screen for the genetic elements shared between PCOS and depression.
METHODS: Differentially expressed genes (DEGs) were screened out through GEO2R using the PCOS and depression datasets in NCBI. Protein-protein interaction (PPI) network analysis and enrichment analysis were performed to identify the poten
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Minimal Change Disease (MCD), which is associated with podocyte injury, is the leading cause of nephrotic syndrome in children. A considerable number of patients experience relapses and require prolonged use of prednisone and immunosuppressants. Multi-drug resistance and frequent relapses can lead to disease progression to focal and segmental glomerulosclerosis (FSGS). To identify potential targets for therapy of podocyte injury, we examined microarray data of mRNAs in glomerular samples from both MCD patients and healthy donors, obtained from the GEO database. Differentially expressed genes (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mpox virus (MPXV), a member of the Poxviridae family, which recently appeared outside of the African continent has emerged as a global threat to public health. Given the scarcity of antiviral treatments for mpox disease, there is a pressing need to identify and develop new therapeutics. We investigated 5715 phytochemicals from 266 species available in IMMPAT database as potential inhibitors for six MPXV targets namely thymidylate kinase (A48R), DNA ligase (A50R), rifampicin resistance protein (D13L), palmytilated EEV membrane protein (F13L), viral core cysteine proteinase (I7L), and DNA po
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is a highly heterogeneous disease. Despite recent tremen-dous progress in managing CLL, the disease remains incurable with clinical therapies, and relapse is inevitable. To overcome this, new diagnostic and prognostic markers need to be investigated. We thus screened through the public database for genes with diagnostic, prognostic, and therapeutic implications in CLL. We further performed RT-qPCR and Western blot analysis to measure the candidate gene and protein expression levels, respectively, in peripheral blood mononuclear cells. Our results indicated th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
p63 plays a crucial role in epithelia-originating tumours; however, its role in intrahepatic cholangiocarcinoma (iCCA) has not been completely explored. Our study revealed the oncogenic properties of p63 in iCCA and identified the major expressed isoform as ΔNp63α. We collected iCCA clinical data from The Cancer Genome Atlas database and analyzed p63 expression in iCCA tissue samples. We further established genetically modified iCCA cell lines in which p63 was overexpressed or knocked down to study the protein function/function of p63 in iCCA. We found that cells overexpressing p63, but not p6
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antibiotic resistance is a critical problem that results in a high morbidity and mortality rate. The process of discovering new chemotherapy and antibiotics is challenging, expensive, and time-consuming, with only a few getting approved for clinical use. Therefore, screening already-approved drugs to combat pathogens such as bacteria that cause serious infections in humans and animals is highly encouraged. In this work, we aim to identify approved antibiotics that can inhibit the mecA antibiotic resistance gene found in methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) strains. The MecA prote
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To investigate possible cross-talk genes, associated pathways, and transcription factors between chronic periodontitis (CP) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD).
METHODS: The gene expression profiles of CP (GSE10334 and GSE16134) and COPD (GSE76925) were downloaded from the GEO database. Differential expression and functional clustering analyses were performed. The protein‑protein interaction (PPI) network was constructed. The core cross-talk genes were filtered using four topological analysis algorithms and modular segmentation. Then, functional clustering analysis wa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arsenic trioxide (ATO) is a great discovery in the treatment of acute promyelocytic leukemia (APL), which has been used in an increasing number of malignant diseases. Systematic integrative analysis will help to precisely understand the mechanism of ATO and find new combined drugs. Therefore, we developed a one-stop comprehensive database of ATO named ATOdb by manually compiling a wealth of experimentally supported ATO-related data from 3479 articles, and integrated analysis tools. The current version of ATOdb contains 8373 associations among 2300 ATO targets, 80 conditions and 262 combined dr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Cocaine is a highly addictive drug that is abused due to its excitatory effect on the central nervous system. It is critical to reveal the mechanisms of cocaine addiction and identify key genes that play an important role in addiction.
METHODS: In this study, we proposed a centrality algorithm integration strategy to identify key genes in a protein-protein interaction (PPI) network constructed by deferential genes from cocaine addiction-related datasets. In order to investigate potential therapeutic drugs for cocaine addiction, a network of targeted relationships between nervous
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Outbreaks of hand, foot and mouth disease (HFMD) have occurred frequently in the Asian-Pacific region over the last two decades, caused mainly by the serotypes in Enterovirus A species. High-quality monoclonal antibodies (mAbs) are needed to improve the accuracy and efficiency of the diagnosis of enteroviruses associated HFMD. In this study, a mAb 1A11 was generated using full particles of CV-A5 as an immunogen. In indirect immunofluorescence and Western blotting assays, 1A11 bound to the viral proteins of CV-A2, CV-A4, CV-A5, CV-A6, CV-A10, CV-A16, and EV-A71 of the Enterovirus A and targeted
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endometrial cancer (EC) is the most frequent gynaecologic cancer in postmenopausal women. We used 2D-DIGE and mass spectrometry to identify candidate biomarkers in endometrial cancer, analysing the serum protein contents of 10 patients versus 10 control subjects. Using gel-based proteomics, we identified 24 candidate biomarkers, considering only spots with a fold change in volume percentage ≥ 1.5 or intensity change ≤ 0.6, which were significantly different between cases and controls (p < 0.05). We used Western blotting analysis both in the serum and tissue of 43 patients for data validation.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective To screen out the key genes leading to diabetic cardiomyopathy by analyzing the mRNA array associated with diabetic cardiomyopathy in the GEO database. Methods The online tool GEO2R of GEO was used to mine the differentially expressed genes (DEG) in the datasets GSE4745 and GSE5606.R was used to draw the volcano map of the DEG,and the Venn diagram was established online to identify the common DEG shared by the two datasets.The clusterProfile package in R was used for gene ontology annotation and Kyoto encyclopedia of genes and genomes pathway enrichment of the DEG.GSEA was used for g
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The histone acetylation-deacetylation at lysine regulates the functions of many cellular proteins. An increased expression of HDAC6 can cause an increased amount of deacetylated histones, which leads to an inhibition of gene expression and has been associated with cancer cell proliferation. The present study screened the ZINC database to find novel HDAC6 inhibitors using virtual high-throughput screening techniques. The docking score, free energy, and binding pattern of the complexes were used to select a best ligand for further study. Molecular dynamic simulations, binding interactions, and t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The aim of the study is to explore the molecular mechanism of activating blood circulation and dispersing stasis herbs in the treatment of pre-eclampsia with Chuanxiong Rhizoma-Radix Salvia miltiorrhiza.
METHODS: The chemical composition and targets of Chuanxiong Rhizoma-Radix Salvia miltiorrhiza were retrieved from the TCMSP database, and a PPI network was constructed for common genes. Subsequently, a graph of the "active component-target-action pathway" was plotted by Cytoscape 3.7.2 and a KEGG pathway enrichment was performed using the R language cluster profiler package. Molecu
СтатьяОтозванная публикацияПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования