Porcine parvovirus (PPV), a non-envelope single-stranded DNA virus, causes severe reproductive disorders in swine worldwide, characterized by fetal mortality, mummification, and reduced boar fertility. As a highly prevalent pathogen in Chinese swine herds, PPV imposes substantial economic burdens on intensive pig production systems. This review systematically synthesizes recent advances in PPV virology, focusing on genomic evolution of emerging strains (PPV1-PPV8), epidemiological dynamics of emerging strains, molecular pathogenesis, and novel diagnostic tools. Furthermore, we critically evalu
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) is highly heterogeneous and aggressive, and the absence of precision individual treatment regimen enables repeated immune escape. Exploiting regulatory T cell (Treg) marker genes as key classifiers, we used 10 clustering algorithms to integrate the multi-omics HCC patient data and combined them with 10 machine learning (ML) algorithms to delineate molecular subtypes predictive of prognosis and immune response. We identified two cancer subtypes (CSs) that are associated with prognosis, with the second subtype (CS2) showing the most favorable prognostic outcomes. S
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Belt and Road Initiative has promoted economic growth and population mobility in Kashgar region but also increased the risk of tuberculosis (TB) transmission. Therefore, we conducted clustering and phylogenetic analyses to delineate the recent transmission and population evolution of Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) in Kashgar since 21st century. The results revealed a high clustering rate of MTBC in Kashgar, reaching 44.1%, with 62.4% of cases involving cross-county transmission clusters. The clustering risk of Lineage 4 was significantly higher than that of other lineages (aOR,
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Precursor states of Multiple Myeloma (MM) and its native tumor microenvironment need in-depth molecular characterization to better stratify and treat patients at risk. Using single-cell RNA sequencing of bone marrow cells from precursor stages, MGUS and smoldering myeloma (SMM), to full-blown MM alongside healthy donors, we demonstrate early immune changes during patient progression. We find NK cell abundance is frequently increased in early stages, and associated with altered chemokine receptor expression. As early as SMM, we show loss of GrK+ memory cytotoxic T-cells, and show their critical
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Probabilistic bet hedging, a strategy to maximize fitness in unpredictable environments by matching phenotypic variability to environmental variability, is theorized to account for the evolution of various fate-specification decisions, including viral latency. However, the molecular mechanisms underlying bet hedging remain unclear. Here, we report that large variability in protein abundance within individual herpesvirus virion particles enables probabilistic bet hedging between viral replication and latency. Superresolution imaging of individual virions of the human herpesvirus cytomegalovirus
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Monoclonal gammopathy of undetermined significance (MGUS) is an asymptomatic disorder with serum monoclonal immunoglobulin less than 30 g/l. It preferentially affects elderly patients; MGUS prevalence is about 1% in the general population and about 10% in patients aged over 80 years. MGUS diagnosis is based on elimination of other causes of serum monoclonal immunoglobulin, particularly multiple myeloma. Within the 20 years following diagnosis of MGUS, about 25% of patients will evolve towards myeloma or other malignant lymphoproliferative disorder. No factor has been identified to date which c
Аннотация на английскомСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toll-like receptors (TLRs) are central to innate immunity and the most studied class of pattern recognition receptors (PRRs). Upon recognition of pathogen-associated molecular patterns (PAMPs) from bacteria, viruses, fungi, and parasites, strong immune responses that bridge innate and adaptive immunity are initiated. Their ability to sense various ligands has made TLR agonists promising candidates for adjuvant development. Unlike traditional adjuvants, TLR ligands directly activate immune pathways, leading to strong, specific, and lasting protection. In aquaculture, there is a critical need fo
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hybrid sterility is a critical postzygotic barrier that limits gene flow during speciation, yet the genetic architecture underlying evolution of such barriers in the early stages of speciation remains poorly characterized. In house mice, F1 male sterility observed in crosses between Mus musculus musculus and M. m. domesticus has been attributed to incompatibilities between heterozygous autosomal Prdm9, which controls primarily the position of recombination hotspots, and copy number variation in X-linked Mir465 miRNA genes. This molecular mechanism, identified in laboratory crosses, provided th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Respiratory syncytial virus (RSV) resurged in many regions after the relaxation of stringent non-pharmaceutical interventions (NPIs) implemented during the COVID-19 pandemic. Here, we characterized the epidemiological patterns and molecular evolution of RSV among pediatric inpatients with acute respiratory tract infections (ARTIs) on tropical Hainan Island, China. We retrospectively analyzed 32,329 children (≤18 years) hospitalized at Hainan Women and Children's Medical Center from January 2021 to December 2024. RSV positivity was determined using targeted next-generation sequencing. In total,
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SARS-CoV-2 has undergone repeated and rapid evolution to circumvent host immunity. However, outside of prolonged infections in immunocompromised hosts, within-host positive selection has rarely been detected. Here we combine daily longitudinal sampling of individuals with replicate sequencing to increase the accuracy of and lower the threshold for variant calling. We sequenced 577 specimens from 105 individuals in a household cohort during the BA.1/BA.2 variant period. Individuals exhibited extremely low viral diversity, and we estimated a low within-host evolutionary rate. Within-host dynamic
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Monoclonal antibodies (mAbs) targeting the SARS-CoV-2 receptor-binding domain are used to treat and prevent COVID-19. However, the rapid evolution of SARS-CoV-2 drives continuous escape from therapeutic mAbs. Therefore, the ability to identify broadly neutralizing antibodies (bnAbs) to future variants is needed. Here we use deep mutational scanning to predict viral receptor-binding domain evolution and to select for mAbs neutralizing both existing and prospective variants. A retrospective analysis of 1,103 SARS-CoV-2 wild-type-elicited mAbs shows that this method can increase the probability o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) is derived from simian T-cell leukemia virus type 1 (STLV-1), and together they form a broader category known as primate T-cell leukemia virus type 1 (PTLV-1). PTLV-1 encodes multiple proteins from overlapping open reading frames (ORFs) in the pX region. This study aims to characterize the conservation of these proteins in different PTLV-1 subtypes and their role in pathogenesis. For the first time, we report the full-length proviral sequence of an STLV-1 strain isolated from chimpanzee and African green monkey. Phylogenetic analysis reveals high con
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: A panzootic of highly pathogenic avian influenza (HPAI) H5N1 viruses from clade 2.3.4.4b has triggered a multistate outbreak in US dairy cattle and an unknown number of human infections. HPAI viruses are handled in specialized biocontainment facilities. Ethical considerations limit certain evolution experiments aimed at assessing viral resistance to potential therapeutics. We have developed a replicating recombinant vesicular stomatitis virus (rVSV) where we replaced its glycoprotein with the hemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA) genes of a 2.3.4.4b H5N1 virus (rVSV-H5N1dc2024)
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Campylobacter is a major foodborne bacterial pathogen that has become increasingly resistant to clinically important antimicrobials. Of particular concern is the emergence of erm(B)-mediated macrolide resistance, which has been increasingly documented across Campylobacter isolates from diverse ecological reservoirs. In this study, we investigated the genomic characteristics and epidemiology of erm(B)-carrying clinical Campylobacter isolates from Shanghai, alongside a globally representative dataset of all publicly available strains. Among clinical isolates obtained from a diarrhoeal outpatient
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Amid the persistent threat of future pandemics, the continuous evolution of SARS-CoV-2 exposed critical challenges for vaccine efficacy and therapeutic interventions, highlighting the need for rapid and adaptable approaches to respond to immune escape variants.
METHODS: Here, we report the use of immortalized B cell libraries from human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) and tonsil tissues to uncover B cell clones exhibiting cross-reactive neutralization against various SARS-CoV-2 variants and perform directed evolution of immortalized B cell clones to produce antibodies
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptospirosis, a global health concern caused by Leptospira sp. is largely unknown due to its elusive phylogeographic distribution and flow. Therefore, this study aimed to understand the geographical distribution and evolutionary changes of pathogenic, non-pathogenic, and opportunistic strains of Leptospira. This study used genome-scale data, 16S rDNA gene sequences, and virulence proteins to construct precise phylogenetic trees using robust bootstrapping techniques. Phylogenomic studies indicated that pathogenic Leptospira strains constituted a distinct cluster from opportunistic and non-path
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vocal production learning ("vocal learning") is a convergently evolved trait in vertebrates. To identify brain genomic elements associated with mammalian vocal learning, we integrated genomic, anatomical, and neurophysiological data from the Egyptian fruit bat (Rousettus aegyptiacus) with analyses of the genomes of 215 placental mammals. First, we identified a set of proteins evolving more slowly in vocal learners. Then, we discovered a vocal motor cortical region in the Egyptian fruit bat, an emergent vocal learner, and leveraged that knowledge to identify active cis-regulatory elements in th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infection with human and simian immunodeficiency viruses (HIV/SIV) requires binding of the viral envelope glycoprotein (Env) to the host protein CD4 on the surface of immune cells. Although invariant in humans, the Env binding domain of the chimpanzee CD4 is highly polymorphic, with nine coding variants circulating in wild populations. Here, we show that within-species CD4 diversity is not unique to chimpanzees but found in many African primate species. Characterizing the outermost (D1) domain of the CD4 protein in over 500 monkeys and apes, we found polymorphic residues in 24 of 29 primate sp
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis C virus (HCV) has a high rate of genetic variability, with eight genotypes and 91 subtypes. The genetic diversity of HCV genotype 6 (HCV-6) is the highest with 31 subtypes, and this genotype is prevalent in Southeast Asia. In this study, we investigated 160 individuals with chronic hepatitis C in Yunnan Province, China. Using reverse transcription (RT)-PCR and Sanger sequencing, 147 cases were successfully amplified and genotyped as 3b (4.9%), 3a (19.73%), 6n (12.24%), 1b (7.48%), 2a (6.12%), 6a (2.04%), 1a (0.68%), 6v (0.68%), and 6xa (0.68%), with eight sequences remaining unclassi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients with hematological malignancies or undergoing hematopoietic stem cell transplantation are vulnerable to colonization and infection with multidrug-resistant organisms, including vancomycin-resistant Enterococcus faecium (VREfm). Over a 10-y period, we collected and sequenced the genomes of 110 VREfm isolates from gastrointestinal and blood cultures of 24 pediatric patients undergoing chemotherapy or hematopoietic stem cell transplantation for hematological malignancy at St. Jude Children's Research Hospital. We used patient-specific reference genomes to identify variants that arose ove
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.