The role of mitofusin 2 (Mfn2) in mitochondrial metabolism and neurodegeneration is largely unknown. The current study probes the role of Mfn2 in mitochondrial biogenesis and metabolism in SH-SY5Y neuronal cells using multi-omics strategies. Mfn2 knockdown (KD) by siRNA treatment resulted into diverse proteomic and metabolomic changes. Furthermore, a battery of cellular and molecular analyses associated Mfn2-KD with increased oxidative stress, perturbed mitochondrial membrane potential and reduced mtDNA copy numbers in the neuronal cells. In addition, Mfn2-KD induced dramatic alterations in ce
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The ACCESS randomized double-blind controlled trial in hospitalized adults with community-acquired pneumonia (CAP) showed that adding clarithromycin to standard-of-care therapy accelerated clinical recovery within the first 72 hours after the commencement of treatment and reduced progression to organ dysfunction.
RESEARCH QUESTION: Does clarithromycin treatment modulate the circulating inflammatory protein profile in CAP, and can inflammatory endotypes identify patient subgroups with distinct clinical responses?
STUDY DESIGN AND METHODS: Serum samples obtained from ACCESS trial p
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Parkinson's Disease (PD) is the second most common neurodegenerative disease, with many cases being attributed to environmental … Parkinsonism that not only affects the brain but also systemically. Using integrated metabolomics, proteomics, and genome-scale metabolic modeling, we demonstrate that purine metabolism is dysregulated across models. Reverse genetic screening of key enzymes in this pathway mitigates locomotor deficits induced by neurotoxic pesticide exposure in Drosophila . …
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many traits divert resources from reproduction and are costly due to the physiological trade-offs organisms face. These traits might require the allocation of different resources, e.g., energy expenditure or production of macromolecules, and it is unclear how their costs can be compared given their different units. Moreover, the effect of environmental conditions and genetic background on the cost of traits is not well understood. Two different frameworks have been proposed to quantify the resource costs of traits, focusing on either energy allocation or proteome allocation. These frameworks i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: While eosinophils are established pathogenic drivers and therapeutic targets in asthma, their role in chronic obstructive pulm … MR indicated a unidirectional effect of eosinophils on COPD but bidirectional causality for asthma. Proteomics revealed a broader protein interaction network in COPD (378 proteins) than in asthma (70 proteins). Exploratory mediation analyses, assuming an eosinophil-to-protein direction, estimated that the eosinophil-associated proteomic signature statistical …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Interstitial fluid (ISF) within the brain parenchyma contains secreted factors related to brain function, metabolism, and neurodegenerative disorders. Cerebrospinal fluid (CSF) is commonly sampled due to its accessibility in well-defined spaces, but it does not fully capture the diversity of the brain secreted proteome. The brain is remarkably heterogeneous on a millimeter scale or smaller, and the secreted proteome likely reflects that heterogeneity. Traditional methods like cerebral microdialysis suffer from recovery loss and tissue damage due to semipermeable membranes and large probe sizes
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Burkholderia, particularly the Burkholderia cepacia complex (Bcc), encompasses Gram-negative bacteria of recognized ecological, biotechnological, and clinical relevance. Accurate identification of species within this complex is challenging due to high phenotypic and genetic similarity, impacting clinical diagnostics and epidemiological surveillance. This review addresses phenotypic, proteomic, and molecular methods for species- and clone-level identification, highlighting their advantages and limitations. Classical methods, including selective media, Burkholderia cepacia selective ag
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: Coffee consumption has been linked to a reduced risk of liver disease, but large-scale prospective studies integrating imaging biomarkers, proteomics, and intake patterns remain limited. The effects of coffee type, additives, and metabolic modifiers are also unclear.
METHODS: We analyzed 354,957 UK Biobank participants without baseline cirrhosis or hepatocellular carcinoma. Coffee consumption, type (caffeinated/decaffeinated), and additives (sugar/sweeteners) were assessed by questionnaire. Incident cirrhosis, hepatocellular carcinoma, and liver-related mortality were ascer…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genome-wide association studies (GWAS) have identified loci associated with alcohol-related hepatocellular carcinoma (ALD-HCC); however, most risk variants lie in noncoding regions and the downstream regulatory architecture remains incompletely characterized. Integrating genetically predicted transcriptomic and circulating proteomic signals may facilitate target prioritization and biomarker discovery.
METHODS: An integrative analytic framework combining transcriptome-wide association study (TWAS), cross-tissue sparse canonical correlation analysis with the aggregate Cauchy associa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Plasma and cerebrospinal fluid are complementary sources of biomarkers for neurodegenerative diseases. The wide dynamic range of protein abundances, particularly in plasma, hampers detection of low-abundance proteins. Depletion of high-abundance proteins and efficient enzymatic digestion can improve proteome coverage but must be carefully optimized for reproducibility, throughput, and cost-efficiency for use in large-scale clinical proteomic studies. METHODS: We developed a scalable sample preparation workflow for plasma and cerebrospinal fluid (CSF) that integrates depletion of hi
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD) is a heterogeneous condition where overlapping cardiometabolic risk factors challenge accurate prognostic prediction.
OBJECTIVES: We aimed to define the molecular heterogeneity underlying MASLD clinical presentation, resolving disease patterns and identifying sub-phenotypes that account for prognostic differences in the general population.
DESIGN: We applied latent class analysis (LCA) to 48 806 UK Biobank participants with MRI-based proton density fat fraction (MRI-PDFF) data to define phenotypic subtypes over a >1
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Coronary atherosclerosis (CA) can remain subclinical for decades before clinical onset, while the complex pathophysiological mechanisms underlying its progression remain poorly understood. Proteomics offers a novel perspective for elucidating its pathogenic mechanisms and improving risk prediction.
METHODS: The plasma proteomic data were from 29,020 UK Biobank participants comprising 2,907 Olink-measured proteins. 1,000 iterations of resampling-based univariable Cox regression were performed to identify robust CA-associated proteins. Locally estimated scatterplot smoothing was use…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Feed intake determines nutrient utilization and production efficiency in poultry, yet hepatic mechanisms underlying responses to acute nutritional challenges remain insufficiently characterized. This study aimed to identify the liver proteins and pathways associated with feed intake regulation in Japanese quails (Coturnix japonica) subjected to different nutritional challenges. Eighteen 12-wk-old male quails (245.20 g ± 0.213) were housed individually and allocated to ad libitum control, 24 h feed-deprived, or 24 h low metabolizable energy groups (n = 6/group). The basal diet contained 18% cru
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Large-scale plasma proteomics offers opportunities to characterize disease susceptibility and improve prospective risk prediction, but transferring proteomic predictors across datasets remains challenging because measured protein sets differ across cohorts, study phases and assay configurations. Here we developed a self-supervised protein-token Transformer that maps the proteins observed in each sample to a fixed-dimensional participant representation, allowing unavailable proteins to be omitted rather than imputed. Using plasma proteomic profiles from 53,014 participants in the UK Biobank Pha…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neuro-related proteins are promising biomarkers and therapeutic targets for Parkinson's disease (PD), yet their specific roles remain uncertain.
METHODS: We conducted Mendelian randomisation by integrating protein quantitative trait loci with genome-wide association study data from 33,647 patients with PD and 449,056 controls for risk, 28,568 patients for age at onset (AAO), and 4093 patients for progression. Subsequent analyses included genetic colocalisation, protein-protein interaction, functional enrichment, tissue and cell-specific expression profiling, and druggability asses
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dental caries is a prevalent oral health problem that significantly reduces an individual's quality of life; although, it can be effectively … eth. Following biological evaluations, we examined proteomes of these DPSCs by conducting a shotgun proteomics approach. Our findings show that DPSCs from decayed teeth exhibit a significantly higher proportion of senescent cells. Proteomic profiling revealed upregulation of inflammatory signaling, extracellular matrix remodeling, and senescence-associated s …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION/BACKGROUND: Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is associated with increased lung adenocarcinoma (LUAD) risk, but the cellular and molecular programs linking chronic inflammatory remodeling to malignancy remain incompletely defined. Transcriptomic overlap alone cannot distinguish potential upstream contributors from downstream remodeling events.
MATERIALS AND METHODS: We integrated lung single-cell RNA sequencing datasets from COPD (GSE196638) and LUAD (GSE131907) with two-sample Mendelian randomization (MR) to prioritize shared genes with supportive genetic evidence. Ce
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) plasma and cerebrospinal fluid (CSF) proteomics can distinguish AD from cognitively normal controls, but the generalizability of machine learning performance and the recurrence of biological signals across datasets require cautious interpretation. We developed an explainable artificial intelligence framework spanning two fluids and four ADNI proteomic datasets, covering 2082 modality specific samples, all analysed internally within ADNI. Phase 1 analysed plasma using a 119 analyte NULISA and targeted UPENN panel (n = 727; 216 CE, 511 controls). Phase 2 extended the ana…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Ischemic stroke (IS) is a severe neurological disease with limited treatment options. Subcutaneous adipose tissue-derived small extracellular vesicles (SAT-sEVs), which are readily accessible and abundant, have emerged as promising biomarkers and therapeutic agents in various diseases. The objective of this research is to uncover the roles and regulatory mechanisms of proteins and miRNAs contained within SAT-sEVs in middle cerebral artery occlusion (MCAO) rats, aiming to discover innovative approaches and insights for IS treatment.
EXPERIMENTAL DESIGN: To evaluate the therapeutic eff
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloid deposits, composed of insoluble cross-β-sheet fibrils, are pathological hallmarks of many neurodegenerative diseases. However, their structural heterogeneity and extreme insolubility hinder characterization of their molecular composition and deposition mechanisms. Here, an orthogonal ionic liquid-based extraction strategy (Orth-iEA) was developed to selectively enrich amyloid aggregates from complex biological samples. Systematic screening identified tetramethylguanidine tetrafluoroborate (TMGBF4) as a potent ionic liquid capable of disrupting hydrogen bonds within cross-β-sheet struct
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования