Adaptation to various stresses during infection is important for Salmonella Typhimurium virulence, while the fitness determinants under infection-relevant stress conditions remain unknown. Here, we simulated conditions Salmonella encountered within the host or in the environment by 15 individual stresses as well as two model cell lines (epithelium and macrophage) to decipher the genes and pathways required for fitness. By high-resolution Tn-seq analysis, a total of 1242 genes were identified as essential for fitness under at least one stress condition. The comparative analysis of fitness deter
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Azithromycin resistance in bacterial pathogens has increased worldwide, and Klebsiella pneumoniae (K. pneumoniae) carries a variety of azithromycin resistance encoding genes.
METHODS: Genomic DNA of K. pneumoniae strain 16HN-12 was subjected to whole-plasmid sequencing using both the 150-bp paired-end Illumina NextSeq 500 platform and the long-read Oxford Nanopore Technologies MinION platform. Transferability of the azithromycin-resistance plasmid and the virulence plasmid was assessed by performing the conjugation assay.
RESULTS: This study identified an IncB/O/K/Z conjugative
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alternative lengthening of telomeres (ALT) is a homologous recombination-based telomere maintenance mechanism activated in 10-15% of human cancers. Although significant progress has been made, the key regulators of the ALT pathway and its role in cancer development remain elusive. Bioinformatics methods were used to predict novel telomere-associated proteins (TAPs) by analysis of large-scale ChIP-Seq data. Immunostaining and fluorescence in situ hybridization experiments were applied to detect the subcellular location of target genes and telomeres. Western blot and reverse transcription-polyme
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oncogenic fusion genes as the result of chromosomal rearrangements are important for understanding genome instability in cancer cells and developing useful cancer therapies. To date, the mechanisms that create such oncogenic fusion genes are poorly understood. Previously we reported an unappreciated RNA-driven mechanism in human prostate cells in which the expression of chimeric RNA induces specified gene fusions in a sequence-dependent manner. One fundamental question yet to be addressed is whether such RNA-driven gene fusion mechanism is generalizable, or rather, a special case restricted to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The chromatin organization of the gonadotropin gene promoters in the pituitary gonadotropes plays a major role in determining how these gene are activated, but is difficult to study because of the low numbers of these cells in the pituitary gland. Here, we set out to create a cell model to study gonadotropin chromatin, and found that by optimizing cell culture conditions, we can maintain stable proliferating cultures of primary non-transformed gonadotrope cells over weeks to months. Although expression of the gonadotropin genes drops very low, these cells are enriched in gonadotrope markers an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Redondoviridae is a family of DNA viruses recently identified in the human oro-respiratory tract. However, the characteristics of this new virus family are not yet fully understood. The aim of the present study was to investigate the relationship between redondoviruses and chronic periodontitis. In addition, the complete circular genome, phylogenetic relationship, and biological characteristics of novel redondoviruses were analyzed. The gingival tissues of healthy individuals (n = 120) and periodontitis patients (n = 120) were analyzed using nested polymerase chain reaction assays. The prevale
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Zika virus (ZIKV) has been declared a public health emergency that requires development of an effective vaccine, as it might represent an international threat.
METHODS: Here, two novel DNA-based (pVAXzenv) and fowlpox-based (FPzenv) recombinant putative vaccine candidates were constructed that contained the cPrME genes of ZIKV. The env gene inserted into the fowlpox vector was verified for correct transgene expression by Western blotting and by immunofluorescence in different cell lines. The production of virus-like particles as a result of env gene expression was also demonstrate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In 1917, sex chromosomes in plants were discovered in a liverwort with hetermorphic U and V chromosomes. Such heteromorphy is unexpected because, unlike the XY chromosomes in diploid-dominant plants, in haploid-dominant plants the female U and the male V chromosomes experience largely symmetrical potential recombination environments. Here we use molecular cytogenetics and super-resolution microscopy to study Frullania dilatata, a liverwort with one male and two female sex chromosomes. We applied a pipeline to Illumina sequences to detect abundant types of repetitive DNA and developed FISH prob
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Short stature is a frequent disorder in the pediatric population and can be caused by multiple factors. In the last few years, the introduction of Next Generation Sequencing (NGS) in the molecular diagnostic workflow led to the discovery of mutations in novel genes causing short stature including heterozygous mutations in ACAN gene. It encodes for aggrecan, a primary proteoglycan component specific for the structure of the cartilage growth plate, articular and intervertebral disc. We report a novel ACAN heterozygous pathogenic variant in a family with idiopathic short stature, early-onset oste
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Плазмидная трансформация хламидии создала новые возможности для изучения взаимодействия хостинг-микроб во время хламидиальных инфекций; однако все еще существуют ограничения. Плазмидная трансформация требует репликона, полученного из местного плазмида хламидии, и эти преобразования зависят от конкретного вида. Мы изучили полезность широкого плазмида хост-диапазона PBBR1MCS-4 для преобразования хламидии с целью упрощения процесса преобразования. Плазмид был модифицирован для содержания хромосомной ДНК из C. trachomatis, чтобы облегчить гомологическую рекомбинацию. Вектор PBR1MCS-4 был клонирова
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПолный текст не найденМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Colorectal cancer (CRC) patients diagnosed with Lynch syndrome (LS) are recommended genetic testing. Increasing numbers of germline variants involved in homologous recombination have been identified in suspected LS patients. This study compared phenotypic the characteristics of suspected LS patients carrying BRCA and BRCA-like variants with those of LS patients.
METHODS: Forty-two patients carrying pathogenic variants of DNA mismatch repair (MMR) genes (MMR group), 9 carrying BRCA variants, and 11 carrying BRCA-like variants (BRCA/BRCA-like group) who met LS clinical criteria were
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
JC polyomavirus (JCPyV, JCV) causes progressive multifocal leukoencephalopathy (PML) in immunocompromised hosts. JCPyV replicates in oligodendrocytes within the brain tissue of patients with PML. The JCPyV genome encodes a microRNA (miRNA) in the region encoding the large T antigen. JCPyV-encoded miRNA (miR-J1) has been detected in the tissue and cerebrospinal fluid samples of patients with PML; however, there are no reports describing the localization of polyomavirus-encoded miRNA in histological samples of patients with virus-associated diseases. In the present study, we detected high miR-J1
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Psoriasis is a chronic inflammatory systemic disease caused by deregulation of the interleukin-23/-17 axis that allows the activation of Th17 lymphocytes and the reprogramming of keratinocytes proliferative response, thereby inducing the secretion of cyto-/chemokines and antimicrobial peptides. Beside cell-to-cell contacts and release of cytokines, hormones and second messengers, cells communicate each other through the release of extracellular vesicles containing DNA, RNA, microRNAs and proteins. It has been reported the alteration of extracellular vesicles trafficking in several diseases, bu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pediatric myelodysplastic syndromes (MDS) display clonal genomic instability that can lead to acquisition of other hematological disorders, usually by loss of heterozygosity. Immunodeficiency caused by uniparental disomy (UPD) has not previously been reported.
METHODS: We investigated a 13-year-old boy who suffered from recurrent infections and pancytopenia for 1 year. Both the comet assay and chromosome breakage analysis were normal, but the bone marrow showed evidence of dysplasia characteristic of MDS. With his normal sister as donor, he underwent failed hematopoietic stem cell
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herpes Simplex Virus type 2 (HSV-2) is a neurotropic human pathogen. Upon de novo infection, the viral infected cell protein 0 (ICP0) is immediately expressed and interacts with various cellular components during the viral replication cycle. ICP0 is a multifunctional regulatory protein that has been shown to be important for both efficient viral replication and virus reactivation from latency. In particular, as previously demonstrated in transfected tissue culture models, ICP0 interacts with the cellular E3 ubiquitin ligase SIAH-1, which targets ICP0 for proteasomal degradation. However, the c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cutaneous beta human papillomavirus (HPV) types are suspected to be involved, together with ultraviolet (UV) radiation, in the development of non-melanoma skin cancer (NMSC). Studies in in vitro and in vivo experimental models have highlighted the transforming properties of beta HPV E6 and E7 oncoproteins. However, epidemiological findings indicate that beta HPV types may be required only at an initial stage of carcinogenesis, and may become dispensable after full establishment of NMSC. Here, we further investigate the potential role of beta HPVs in NMSC using a Cre-loxP-based transgenic (Tg)
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Olaparib (Lynparza™) is a PARP inhibitor approved for advanced BRCA-mutated (BRCAm) ovarian cancer. PARP inhibitors may benefit patients whose tumours are dysfunctional in DNA repair mechanisms unrelated to BRCA1/2. We report exploratory analyses, including the long-term outcome of candidate biomarkers of sensitivity to olaparib in BRCA wild-type (BRCAwt) tumours.
METHODS: Tumour samples from an olaparib maintenance monotherapy trial (Study 19, D0810C00019; NCT00753545) were analysed. Analyses included classification of mutations in genes involved in homologous recombination repai
Клиническое исследование II фазыСтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral nervous necrosis caused by nervous necrosis virus (NNV) is one of the most severe diseases resulting in high fish mortality rates and high economic losses in the giant grouper industry. Various NNV vaccines have been evaluated, such as inactivated viruses, virus-like particles (VLPs), recombinant coat proteins, synthetic peptides of coat proteins, and DNA vaccines. However, a cheaper manufacturing process and effective protection of NNV vaccines for commercial application are yet to be established. Hence, the present study developed a novel subunit vaccine composed of a carrier protein,
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
LC16m8 (m8), a highly attenuated vaccinia virus (VAC) strain, was developed as a smallpox vaccine, and its safety and immunogenicity have been confirmed. Here, we aimed to develop a system that recovers infectious m8 from a bacterial artificial chromosome (BAC) that retains the full-length viral genomic DNA (m8-BAC system). The infectious virus was successfully recovered from a VAC-BAC plasmid, named pLC16m8-BAC. Furthermore, the bacterial replicon-free virus was generated by intramolecular homologous recombination and was successfully recovered from a modified VAC-BAC plasmid, named pLC16m8.8
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inhibitor of DNA binding (Id) proteins play important roles in regulating cardiac development via paracrine signaling. Id1/Id3 knockout mice die at mid-gestation with multiple cardiac defects. Single Id knockout studies have not reported cardiomyopathies. To bypass embryonic lethality we used Tie2CRE-mediated recombination to conditionally delete Id1 against global Id3 ablation (Id cDKOs), which develops adult-onset dilated cardiomyopathy. We confirm upregulation of thrombospondin-1 (TSP1) in Id cDKO hearts. Colocalization studies reveal increased TSP1 expression in the vicinity of endothelial
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования