BACKGROUND: Carcinomas of esophagus, mostly squamous cell carcinomas, occur throughout the world. There are a number of suspected genetic or environmental etiologies. Human papilloma virus (HPV) is said to be a major etiology in areas with high incidence of esophageal carcinoma, while it is hardly detectable in low incidence regions. This study was designed to evaluate the prevalence of HPV in esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) cases diagnosed in Pathology Department, Medical School, Shiraz University of Medical Sciences.
METHODS: DNA material for PCR amplification of HPV genome was ex
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Five cases of poliomyelitis due to type 2 or 3 recombinant vaccine-derived polioviruses (VDPVs) were reported in the Toliara province of Madagascar in 2005.
METHODS: We sequenced the genome of the VDPVs isolated from the patients and from 12 healthy children and characterized phenotypic aspects, including pathogenicity, in mice transgenic for the poliovirus receptor.
RESULTS: We identified 6 highly complex mosaic recombinant lineages composed of sequences derived from different vaccine polioviruses and other species C human enteroviruses (HEV-Cs). Most had some recombinant genome
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Unrepaired DNA double-strand breaks (DSBs) cause genetic instability that leads to malignant transformation or cell death. Cells respond to DSBs with the ordered recruitment of signalling and repair proteins to the site of lesion. Protein modification with ubiquitin is crucial for the signalling cascade, but how ubiquitylation coordinates the dynamic assembly of these complexes is poorly understood. Here, we show that the human ubiquitin-selective protein segregase p97 (also known as VCP; valosin-containing protein) cooperates with the ubiquitin ligase RNF8 to orchestrate assembly of signallin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genome-wide association studies prove to be a powerful approach to identify the genetic basis of different human diseases. We studied the relationship between seven diseases characterized in a previous genome-wide association study by the Wellcome Trust Case Control Consortium. Instead of doing a horizontal association of SNPs to diseases, we did a vertical analysis of disease associations by comparing the genetic similarities of diseases. Our analysis was carried out at four levels - the nucleotide level (SNPs), the gene level, the protein level (through protein-protein interactio
СтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Staphylococcus aureus is commonly carried asymptomatically in the human anterior nares and occasionally enters the bloodstream to cause invasive disease. Much of the global diversity of S. aureus remains uncharacterised, and is not clear how disease propensity varies between strains, and between host populations.
METHODOLOGY: We compared 147 isolates recovered from five kindergartens in Chengdu, China, with 51 isolates contemporaneously recovered from cases of pediatric infection from the main hospital serving this community. The samples were characterised by MLST, the presence/ab
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autoimmune myasthenia gravis (MG) is a multifactorial disease, markedly influenced by genetic factors, even though it shows limited heritability. The clinically typical form of autoimmune MG with thymus hyperplasia shows the most reproducible genetic associations, especially with the A1-B8-DR3 (8.1) haplotype of the major histocompatibility complex (MHC). However, because of strong linkage disequilibrium, the causative polymorphism in this region is not known yet. Increasing the density of genetic markers has nevertheless recently revealed the complex, but highly significant contribution of th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To determine the spatial and temporal dynamics of influenza A virus during a single epidemic, we examined whole-genome sequences of 284 A/H1N1 and 69 A/H3N2 viruses collected across the continental United States during the 2006-2007 influenza season, representing the largest study of its kind undertaken to date. A phylogenetic analysis revealed that multiple clades of both A/H1N1 and A/H3N2 entered and co-circulated in the United States during this season, even in localities that are distant from major metropolitan areas, and with no clear pattern of spatial spread. In addition, co-circulating
Историческая статьяСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For genome-wide association studies, it has been increasingly recognized that the popular locus-by-locus search for DNA variants associated with disease susceptibility may not be effective, especially when there are interactions between or among multiple loci, for which a multi-loci search strategy may be more productive. However, even if computationally feasible, a genome-wide search over all possible multiple loci requires exploring a huge model space and making costly adjustment for multiple testing, leading to reduced statistical power. On the other hand, there are accumulating data sugges
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human adenovirus type 4 is one of the major serotypes isolated from patients with adenoviral conjunctivitis. In 2001 we encountered nosocomial infections with epidemic conjunctivitis in the ophthalmology ward of one hospital in Sapporo, which is in the northern part of Japan. Adenoviruses were isolated from the patients with this nosocomial infection and identified as adenovirus type 4 (AdV-4) by a neutralization test with serotype-specific antiserum. When the cleavage patterns of the isolates were compared with the full viral genome with BamHI and SmaI, the cleavage patterns of the isolates w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bardet-Biedl syndrome (BBS) is an autosomal recessive disorder predominantly characterized by obesity, retinal dystrophy, polydactyly, learning difficulties, hypogenitalism and renal malformations, with secondary features that include diabetes mellitus, endocrinological dysfunction and behavioural abnormalities. Despite an initial expectation of genetic homogeneity due to relative clinical uniformity, five BBS loci have been reported, with evidence for additional loci in the human genome; however, no genes for BBS have yet been identified. We performed a genome screen with BBS families from Ne
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral infections have been implicated in the pathogenesis of several malignancies. A high incidence of the Epstein-Barr virus (EBV) genome and increased EBV-specific antibody titers were frequently observed in Hodgkin's disease. Some epidemiologic and clinical similarities have been demonstrated between Hodgkin's disease and human testicular germ-cell carcinoma. However, we investigated testicular biopsies from 16 patients with testicular cancer and 16 noncancer controls for the presence of EBV, cytomegalovirus (CMV), and herpes simplex virus (HSV) genomes with in situ hybridization and evalua
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The non-pathogenic human parvovirus, adeno-associated virus (AAV) is helper virus-dependent. However, it integrates into the cellular genome in the absence of its helper viruses. Therefore it could become a useful vector for gene therapy. Previous studies and our own results have shown that 40 to 80% of adults are seropositive for AAV and that seroconversion occurs during the first few years of life, but little is known about the route of natural infection with the virus. We used the polymerase chain reaction to detect the AAV-2 genome and identify AAV sequences within peripheral blood leukocy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microorganisms inhabiting cold environments have gained increasing attention in recent decades due to their unique adaptation mechanisms that enable survival under extreme conditions. Growing evidence indicates that some cold-adapted bacteria possess phenotypic and genomic traits linked to pathogenicity, raising concerns about their potential environmental and public health relevance. Here, we characterized three culturable bacteria isolated from human-impacted snow in the French Alps (Chamrousse) and coastal Greenland (Nuuk). Snow samples were cultured on R2A medium, and isolates were identif
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance (AMR) is a major global challenge to human and animal health. The genomic element (e.g. chromosome, plasmid, and genomic islands) and neighbouring genes associated with an AMR gene play a major role in its function, regulation, evolution, and propensity to undergo lateral gene transfer. Therefore, characterizing these genomic contexts is vital for effective AMR surveillance, risk assessment, and stewardship. Metagenomic sequencing is widely used to identify AMR genes in microbial communities but fragmentary short-read data do not directly provide this critical contextu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pigs (Sus scrofa domesticus) are used as biomedical and preclinical models for their comparable anatomy, physiology, and neurodevelopment to humans. Angelman syndrome is a rare genetic neurodevelopmental disorder, caused by the loss of the maternal Ubiquitin protein ligase E3A (UBE3A) allele, that was recently modeled and characterized in Yorkshire/Landrace pigs. The paternal UBE3A allele is intact but silenced in neurons of the central nervous system by the long non-coding RNA and polycistronic transcription unit Small Nuclear Host Gene 14 (SNHG14). Targeting SNHG14 to reactivate the paternal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Common bean (Phaseolus vulgaris L.) is an economically important grain legume for the human diet and sustainable agricultural development. Snap bean, a vegetable-type common bean cultivated for edible immature pods, serves as a crucial dietary source of essential vitamins, minerals and proteins. However, its evolutionary and domestication history remains poorly characterized. Here, we assembled and characterized the complete chloroplast genome of snap bean using PacBio HiFi sequencing technology. The chloroplast genome formed a single circular molecule of 150,248 bp, consisting of a pair of in
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antibiotics are used to treat severe bacterial infections. However, owing to excessive antibiotic use, bacteria under high selective pressure for antibiotics develop resistance through spontaneous mutation or by acquiring antibiotic-resistance genes (ARGs) through horizontal gene transfer (HGT). Horizontal transfer of ARGs among bacteria in the environment can lead to the emergence of multidrug-resistant (MDR) bacteria that infect animals and humans, thus causing disease outbreaks. In this study, MDR strain FN1 was isolated from a feces-contaminated soil sample from a chicken farm under pressu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Weissella viridescens has been proposed as a probiotic candidate, but strain-level multi-omics evidence remains limited. The complete genome of the human-derived W. viridescens strain Wv2365 was sequenced through a hybrid assembly of Illumina and PacBio sequencing reads and compared with eight publicly available W. viridescens genomes. Pangenome analysis and functional annotation were performed, and metabolites were profiled by broadly targeted metabolomic analysis. In addition, the acid and bile tolerance, auto-aggregation and cell surface hydrophobicity, and antioxidant activity of the strai
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Klebsiella pneumoniae is a free-living bacterium found anywhere, including soil, water, and various types of plants, animals, and humans. Due to identical biochemical test results, Klebsiella quasipneumoniae, a member of the Klebsiella pneumoniae complex, is often misidentified as Klebsiella pneumoniae. This distinct species can be accurately identified solely through whole-genome sequencing. This bacterium poses a significant public health threat due to its increasing antibiotic resistance, ability to cause severe disease, and potential for community-acquired and hospital-acquired
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer is a disease rooted in genomic alterations and has long stood as one of the most formidable foes for humanity since its inception. A patient's survival often hinges on the specific genomic mutations present and the corresponding immune system response. As each genomic alteration has its deleterious damage, identification of potential drivers of cancer progression may risk yielding false positives without a mutation-specific approach. To advance our understanding of tumor biology, there is a need for a systematic computational framework that combines both bulk RNA-seq and single-cell RNA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования