Quantitation of BCR-ABL1 with the quantitative reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) is very important in monitoring chronic myeloid leukemia (CML), which relies on an RNA reference material. A genomic RNA reference material (RM) containing the BCR-ABL1 P210 fusion mutation was developed, and an absolute quantitative method based on one-step reverse transcription digital PCR (RT-dPCR) was established for characterizing the RM. The proposed dPCR method demonstrates high accuracy and excellent analytical sensitivity, as shown by the linear relationship (0.94 < slope < 1.04, R2
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The objective of this study was to identify genomic regions and genes associated with resistance to gastrointestinal nematodes in Australian Merino sheep in Uruguay, using the single-step GWAS methodology (ssGWAS), which is based on genomic estimated breeding values (GEBVs) obtained from a combination of pedigree, genomic, and phenotypic data. This methodology converts GEBVs into SNP effects. The analysis included 26,638 animals with fecal egg count (FEC) records obtained in two independent parasitic cycles (FEC1 and FEC2) and 1700 50K SNP genotypes. The comparison of genomic regions was based
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe for the first time, a high-quality genome for a rare human yeast pathogen Candida mucifera, from a patient with chronic suppurative otitis media. This pathogen exhibited reduced azole susceptibility, similar to its close relatives within the Trichomonascus ciferrii species complex.
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Whole genome sequencing (WGS) of Mycobacterium tuberculosis offers valuable insights for tuberculosis (TB) control. High throughput platforms like Illumina and Oxford Nanopore Technology (ONT) are increasingly used globally, although ONT is known for higher error rates and is less established for genomic studies. Here we present a study comparing the sequencing outputs of both Illumina and ONT platforms, analysing DNA from 59 clinical isolates in highly endemic TB regions of Thailand. The resulting sequence data were used to profile the M. tuberculosis pairs for their lineage, drug resistance
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
WHAT IS ALREADY KNOWN ABOUT THIS TOPIC?: Monkeypox, first identified in Africa in 1958, is a zoonotic disease caused by monkeypox virus (MPXV). Since January 2022, a global outbreak of mpox has spread to over 100 non-endemic countries. As of June 30, 2024, there have been 99,176 confirmed cases and 535 probable cases across 116 countries, resulting in 208 deaths.
WHAT IS ADDED BY THIS REPORT?: This report presents an analysis of the whole genome sequences of seven MPXVs from Anhui Province. We discovered that, compared to the reference sequence (NC_063383.1), these genomes exhibit 91 nucleoti
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enteroviruses contain conserved RNA structures at the extreme 5' end of their genomes that recruit essential proteins 3CD and PCBP2 to promote genome replication. However, the high-resolution structures and mechanisms of these replication-linked RNAs (REPLRs) are limited. Here, we determined the crystal structures of the coxsackievirus B3 and rhinoviruses B14 and C15 REPLRs at 1.54, 2.2 and 2.54 Å resolution, revealing a highly conserved H-type four-way junction fold with co-axially stacked sA-sD and sB-sC helices that are stabilized by a long-range A•C•U base-triple. Such conserved features o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extracellular vesicles (EVs) such as exosomes have been shown to play physiological roles in cell-to-cell communication by delivering various proteins and nucleic acids. In addition, several studies revealed that the EVs derived from the cells that are infected with certain viruses could transfer the full-length viral genomes, resulting in EVs-mediated virus propagation. However, the possibility cannot be excluded that the prepared EVs were contaminated with infectious viral particles. In this study, the cells that harbor subgenomic replicon derived from the Japanese encephalitis virus and den
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rabies, caused by lyssavirus rabies (Rabies lyssavirus, RABV), is a fatal disease among humans and almost all warm-blooded animals. In this study, we found that RABV infection induces the up-regulation of receptor transporter protein 4 (RTP4) in mouse brains and different cells of nervous tissue. Over-expression of RTP4 reduces the viral titer of RABV in different neuronal cells. Furthermore, a recombinant RABV expressing RTP4, named rRABV-RTP4, was constructed and displayed a lower viral titer in different neuronal cells due to the expression of RTP4. Moreover, the survival rates of mice infe
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bats are mammals with high biodiversity and wide geographical range. In Brazil, three haematophagous bat species are found. Desmodus rotundus is the most documented due to its role as a primary host of rabies virus in Latin America. Bats are known to harbor various emerging viruses causing severe human diseases. Beyond zoonotic viruses, these animals also harbor a diversity of non-zoonotic viruses. Papillomaviruses are circular double-stranded deoxyribonucleic acid (dsDNA) viruses that infect the epithelial and mucosal cells of many vertebrates, occasionally causing malignant lesions. High-thr
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infectious disease is the result of interactions between host and pathogen and can depend on genetic variations in both. We conduct a genome-to-genome study of paired human and Mycobacterium tuberculosis genomes from a cohort of 1556 tuberculosis patients in Lima, Peru. We identify an association between a human intronic variant (rs3130660, OR = 10.06, 95%CI: 4.87 - 20.77, P = 7.92 × 10-8) in the FLOT1 gene and a subclavaluee of Mtb Lineage 2. In a human macrophage infection model, we observe hosts with the rs3130660-A allele exhibited stronger interferon gene signatures. The interacting strai
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/OBJECTIVES: Listeria monocytogenes is a foodborne pathogen that can infect both humans and animals and cause noninvasive gastrointestinal listeriosis or invasive listeriosis. The objectives of this study were to determine the genetic diversity of L. monocytogenes; the genes associated with its resistance to antibiotics, benzalkonium chloride (BC), and cadmium chloride (CdCl2); and its biofilm formation.
METHODS: A total of 132 fresh fruits (44 samples) and vegetables (88 samples) were selected for this study. The genetic diversity of the isolates and the genes associated with their
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance (AMR) poses an escalating global public health threat. Canals are essential in Thailand, including the capital city, Bangkok, as agricultural and daily water sources. However, the characteristic and antimicrobial-resistance properties of the bacteria in the urban canals have never been elucidated. This study employed whole genome sequencing to characterize 30 genomes of a causal pathogenic bacteria, Salmonella enterica, isolated from Bangkok canal water between 2016 and 2020. The dominant serotype was Salmonella Agona. In total, 35 AMR genes and 30 chromosomal-mediated
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Invasive nontyphoidal Salmonella (iNTS) causes significant concern with ~15% morbidity, affecting populations mainly in African countries. However, iNTS infections among the Chinese pediatric population remain largely unknown. Here, we conducted a genomic investigation to study pediatric iNTS infections in a Chinese hospital. iNTS isolates accounted for 15.2% (18/119) of all nontyphoidal Salmonella (NTS) strains. Compared to non-iNTS isolates, iNTS isolates harbored a lower prevalence of antimicrobial-resistant genes of fluoroquinolones and β-lactams, as well as disinfectant determinants and p
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica serovar Gallinarum (S. Gallinarum) is an avian-specific pathogen responsible for fowl typhoid, a severe systemic disease with high mortality in chickens. This disease poses a substantial burden to the poultry industry, particularly in developing countries like China. However, comprehensive genome datasets on S. Gallinarum are lacking. Here, we present the most extensive S. Gallinarum genome dataset, comprising 574 well-collated samples. This dataset consists of 366 genomes sequenced in our laboratory and 208 publicly available genomes, collected from various continents over
DatasetСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid expansion of broiler chicken production in Brazil has presented significant sanitation challenges within the poultry industry. Among these challenges, Salmonella enterica subsp. enterica serotype Heidelberg stands as a contributor to global salmonellosis outbreaks. This study analyzed 13 draft genomes of Salmonella Heidelberg isolated from the pre-slaughter broiler chickens farms in Brazil. By conducting in silico analysis of these genomes, the study investigated genome similarity based on single nucleotide polymorphisms (SNPs) and identified genes encoding resistance to antimicrobia
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonellosis is one of the important bacterial infectious diseases affecting the health of pigeons. Heretofore, the epidemiological charact … virulence genes, antimicrobial resistance genes, and plasmid replicons and constructed phylogenetic genomics to determine the epidemiological correlation among these isolates. All strains belonged to Salmonella Typhimurium var. Copenhagen and exhibited five antimicrobial resistance genes and more than 150 Salmonella virulence genes. Moreover, each isolate …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The seventh cholera pandemic started in 1961 in Indonesia and spread across the world in three waves in the decades that followed. Here, we utilised genomic evidence to detail the first wave of the seventh pandemic. Genomes of 22 seventh pandemic Vibrio cholerae isolates from 1961 to 1979 were completely sequenced. Together with 152 publicly available genomes from the same period, they fell into seven phylogenetic clusters (CL1-CL7). By multilevel genome typing (MGT), all were assigned to MGT2 ST1 (Wave 1) except three isolates in CL7 which were typed as MGT2 ST2 (Wave 2). The Wave 1 seventh p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This report presents the first genomes from positive cases of cholera in Sudan. Genomic analysis of 10 Vibrio cholerae isolates, profiled as serogroup O1, reveals evidence of antimicrobial resistance genes and a 139-kb IncC plasmid with 99.74% identity to the multidrug-resistant plasmid pCNRVC190243 previously reported in Yemen and Lebanon.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although the biological utilities of endogenous RNAi (endo-RNAi) have been largely elusive, recent studies reveal its critical role in the non-model fruitfly Drosophila simulans to suppress selfish genes, whose unchecked activities can severely impair spermatogenesis. In particular, hairpin RNA (hpRNA) loci generate endo-siRNAs that suppress evolutionary novel, X-linked, meiotic drive loci. The consequences of deleting even a single hpRNA (Nmy) in males are profound, as such individuals are nearly incapable of siring male progeny. Here, comparative genomic analyses of D. simulans and D. melano
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The overall survival of patients who received genomically matched therapy was not significantly longer than that of patients receiving treatment only other than genomically matched therapy in the breast invasive ductal carcinoma (A), colorectal adenocarcinoma (B), and pancreatic adenocarcinoma (C) cohorts.
Письмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования