In this study, a mixing of pharmacophore-based screening, molecular docking virtual screening, molecular dynamic simulation, and quantitative electrostatic potential map analysis was performed at the binding cavity of the CDK6 target. The generated pharmacophore model has five features. After the validation of the model, a virtual screening process was conducted on the natural coconut database. The screened ligands were selected for molecular docking virtual screening. 800 ligands were docked, and the ligands were selected based on the docking scores and main interactions. The first four top-r
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fibrin networks, the structural framework of thrombi, undergo fatigue failure under pulsatile blood flow, posing risks of embolic events like stroke, pulmonary embolism. While fibrin's fracture behavior under monotonic loading has been intensively explored, its fatigue mechanism that governs thrombus embolization is understudied. Multiscale experiments, modeling of condensed fibrin networks, reveal a paradoxically low fatigue threshold despite high fracture energy. Mechanistically, cyclic loading induces irreversible α-to-β transitions in fibrin's molecular chains, causing molecular creep that
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS), particularly perfluorooctane sulfonate (PFOS), persist in humans and have been associated with cardiovascular outcomes, but cardiac-specific molecular responses remain incompletely characterized. We integrated transcriptomic screening, ensemble machine learning, molecular docking and 100-ns molecular dynamics, cross-species cardiac single-cell atlases with virtual knockout, and a time-stratified mouse exposure study (approximately 5 μg/kg/d for 4-8 weeks) to prioritize candidate molecular nodes associated with PFOS-related cardiac remodeling. Robustn
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Global minima of molecular clusters are one of the acute and long-standing problems in the computational chemistry domain. It is important to understand the lowest energy geometry isomer of a given compound for further investigation of physical and chemical properties. The exponential growth of local minima with increasing cluster size makes the problem more relevant. The existing ab initio methods are accurate but very expensive in terms of computational resources. It opens the gap to find more efficient and reliable solutions for rapid exploration. On the other side, neural network potential
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Studying native protein structures at near-atomic resolution in a crowded environment presents challenges. Consequently, understanding the structural intricacies of proteins within pathologically affected tissues often relies on mass spectrometry and proteomic analysis. Here, we utilized cryoelectron microscopy (cryo-EM) and the Build and Retrieve (BaR) method to investigate protein complexes' structural characteristics such as post-translational modification, active site occupancy, and arrested conformational state in Alzheimer's disease (AD) using brain lysate from a rat model (TgF344-AD). O
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stereo and structural isomerism of the copper(II) chelate complexes define their biological activity. At the same time, the identification of the geometric isomers of such complexes is a nontrivial task of modern coordination chemistry. In the presented work we have studied the trans- and cis-isomers of chelates bis(S-valinato)copper(II), (R,S-valinato)copper(II) and other mixed ligand copper(II) amino acid complexes with the joint use of experimental by ATR-FTIR spectroscopy and DFT simulations. Using DFT simulations (method M06/6 311+G(d)) the optimum conformers of the geometric isomers of c
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this work, two oligophenyleneimines type pentamers with terminal aldehydes, designated as DAFCHO (4,4'-((((((2,5-bis(octyloxy)-1,4-phenylene)bis(methanylylidene))bis(azanyl ylidene))bis(9H-fluorene-7,2-diyl))bis(azanylylidene))bis(methanylylidene))bis(2,5-bis(octyloxy) benzaldehyde)) and FDACHO (4,4'-((((((2,5-bis(octyloxy)-1,4-phenylene)bis(methanylylidene))bis (azanylylidene))bis(4,1-phenylene))bis(azanylylidene))bis(methanylylidene))bis(2,5-bis(octyloxy) benzaldehyde)) were synthesized by mechanochemistry method using 2,5-bis(octyloxy) terephtal aldehyde and 2,7-diaminofluorene or 1,4-ph
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Half-Heusler and Heusler compounds have been of great interest for several decades for thermoelectric, magnetic, half-metallic and many other interesting properties. Among these systems, Zr-Ni-Sn compounds are interesting thermoelectrics which can go from semiconducting half-Heusler (HH) limit, ZrNiSn, to metallic Heusler (FH) limit, ZrNi2Sn. Recently Makongo et al (2011 J. Am. Chem. Soc. 133 18843) found that dramatic improvement in the thermoelectric power factor of HH can be achieved by putting excess Ni into the system. This was attributed to an energy filtering mechanism due to the presen
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Because of discrepancies in the available experimental data, an extensive theoretical investigation of the formation of the Vilsmeier-Haack (VH) complex has been carried out. The barriers to complex formation calculated using eight different density functional methods (BLYP, B2-PLYP, B3LYP, B3PW91, MPW1K, M06-2X, and PBE1PBE), MP2, and extrapolation techniques (CBS-QB3, G3B3) with several basis sets (6 - 31 + G, 6 - 311++G, 6 - 311 + (3df,2p), aug-cc-pVDZ, and aug-cc-pVTZ) were compared with experimental data. For the overall reaction, MP2/aug-cc-pVDZ and M06-2X/6-31 + G(d,p) perform best comp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial Type II secretion systems (T2SS) and type IV pili (T4P) biogenesis machineries share the ability to assemble thin filaments from pilin protein subunits in the plasma membrane. Here we describe in detail the calculation strategy that served to determine a detailed atomic model of the T2SS pilus from Klebsiella oxytoca (Campos et al., PNAS 2010). The strategy is based on molecular modeling with generalized distance restraints and experimental validation (salt bridge charge inversion; double cysteine substitution and crosslinking). It does not require directly fitting structures into an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell adhesion molecules at neuronal synapses regulate diverse aspects of synaptic development, including axo-dendritic contact establishment, early synapse formation, and synaptic maturation. Recent studies have identified several synaptogenic adhesion molecules. The NGL (netrin-G ligand; LRRC4) family of synaptic cell adhesion molecules belongs to the superfamily of leucine-rich repeat (LRR) proteins. The three known members of the NGL family, NGL-1, NGL-2, and NGL-3, are mainly localized to the postsynaptic side of excitatory synapses, and interact with the presynaptic ligands, netrin-G1, ne
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rift Valley fever virus (RVFV) is a member of the Bunyaviridae virus family (genus Phlebovirus) and is considered to be one of the most important pathogens in Africa, causing viral zoonoses in livestock and humans. Here, we report the characterization of the three-dimensional structural organization of RVFV vaccine strain MP-12 by cryoelectron tomography. Vitrified-hydrated virions were found to be spherical, with an average diameter of 100 nm. The virus glycoproteins formed cylindrical hollow spikes that clustered into distinct capsomeres. In contrast to previous assertions that RVFV is pleom
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The photo-induced charge transfer in four series of Prussian blue (PB) analogues was studied from photoacoustic spectra. In cobalticyanides the observed signals were assigned to a metal-to-ligand charge transfer, which appears as a shoulder below 450 nm, and to d-d transitions for Co(II), Ni(II) and Cu(II) complex salts. No evidence of metal-to-metal charge transfer was observed for this series, which is probably due to the high stability of low spin cobalt(III) in the hexacyanide complex. Photoacoustic spectra for ferricyanides are broad bands, which result particularly intense up to 750 nm.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Experimental partition coefficients were determined for a series of volatile organic compounds (VOCs) (acetonitrile, n-butylamine, n-octane tetrachloroethene, and toluene) for the interaction with 2,3,9,10,16,17,23,24-octakis(octyloxy)-phthalocyaninato complexes, PcM(OR)(8), with varying central metal atoms [M=H(2) (metal-free), Ni, Pd, Cu, Zn]. Large partition coefficients for toluene were observed in the case of the nickel and palladium phthalocyanines, whereas for the corresponding zinc-containing compound, interaction with n-butylamine resulted in a high value for the partition coefficient
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the search for new orally active antithrombotic drugs that are metabolically stable, we explored the synthesis of 1-C-(5-thio-D-xylosyl) derivatives, examining radical and nucleophilic methods. Thus synthesized were aryl, benzyl, alkylcarboxymethylenyl, arylsulfonylmethylenyl and alkylaminocarboxymethylenyl C-linked analogues of 5-thio-D-xylopyranosides.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The adsorption of the trigonal connector, 1,3,5-tris[10-(3-ethylthiopropyl)dimethylsilyl-1,10-dicarba-closo-decaboran-1-yl]benzene (1), from acetonitrile/0.1 M LiClO(4) on the surface of mercury at potentials ranging from +0.3 to -1.4 V (vs. aqueous Ag/AgCl/1 M LiCl) was examined by voltammetry, Langmuir isotherms at controlled potentials, and impedance measurements. No adsorption is observed at potentials more negative than approximately -0.85 V. Physisorption is seen between approximately -0.85 and 0 V. At positive potentials, adsorbate-assisted anodic dissolution of mercury occurs and an or
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Botulinum toxin is an unusually potent substance that acts on the nervous system to produce the clinical outcome of flaccid paralysis. To produce this effect, the toxin ordinarily proceeds through two separate but essential sequences of events. During the first, the toxin is ingested, it traverses a portion of the gastrointestinal system and then it is transcytosed from the lumen of the gut to the general circulation. During the second, circulating toxin binds to peripheral cholinergic nerve endings, it is endocytosed and then it acts as a metalloendoprotease to cleave polypeptides that are es
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many ethical and technical challenges hinder exploration of molecular mechanisms, including epigenetic processes underlying neuropsychiatric disorders in humans. Therefore, there is a need for animal models for such disorders that will allow a better understanding of disease mechanisms. Here, we explore the use of animal models with construct validity for such disorders. The chapter emphasizes the importance of construct validity of the models and highlights key considerations, including the temporal dynamics of disorders, relevant tissues and brain regions, and the need for genetic and enviro
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although it has been more than a century since endometriosis was initially described in the literature, understanding the etiology and natural history of the disease has been challenging. However, the broad utility of murine and rat models of experimental endometriosis has enabled the elucidation of a number of potentially targetable processes which may otherwise promote this disease.
OBJECTIVE: To review a variety of studies utilizing rodent models of endometriosis to illustrate their utility in examining mechanisms associated with development and progression of this disease.
RE
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования